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Heatmap: Cluster_226 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
2 h after light
6 h after light
10 h after light
14 h after light
18 h after light
2 h after dark
0.08 -0.09 -0.18 -0.07 0.07 0.16
0.15 -0.1 -0.19 -0.03 0.06 0.08
0.19 -0.04 -0.28 -0.15 0.07 0.15
-0.09 -0.14 -0.12 0.08 0.04 0.2
-0.09 -0.14 -0.12 0.08 0.04 0.2
0.17 -0.09 -0.3 -0.06 0.2 0.01
0.1 -0.09 -0.18 0.01 0.21 -0.08
0.08 -0.24 -0.15 0.04 0.09 0.14
0.1 -0.3 -0.2 -0.02 0.27 0.07
0.01 -0.05 -0.22 -0.01 0.12 0.13
0.02 -0.32 -0.13 0.0 0.12 0.25
-0.08 -0.17 -0.05 0.07 0.06 0.15
-0.01 -0.19 -0.1 -0.01 0.01 0.26
0.12 -0.06 -0.12 -0.04 0.17 -0.09
0.16 -0.24 -0.14 -0.02 0.19 0.0
0.04 -0.07 -0.26 0.04 0.13 0.09
-0.14 -0.23 -0.16 0.02 0.05 0.37
0.0 -0.21 -0.19 0.06 0.09 0.21
0.14 -0.01 -0.26 -0.06 -0.01 0.16
0.12 -0.37 -0.26 0.02 0.11 0.27
0.16 -0.1 -0.2 0.0 0.17 -0.07
-0.06 -0.12 -0.13 0.07 0.16 0.05
0.1 -0.18 -0.33 -0.02 0.32 0.02
0.26 -0.13 -0.2 -0.06 0.13 -0.05
0.12 -0.2 -0.19 0.01 0.09 0.15
0.28 -0.03 -0.34 -0.15 -0.12 0.25
0.08 -0.23 -0.23 0.06 0.06 0.21
0.25 -0.15 -0.29 -0.02 0.04 0.1
0.27 -0.27 -0.41 -0.2 0.29 0.16
0.03 -0.09 -0.23 0.04 0.05 0.17
0.14 -0.13 -0.28 -0.1 -0.0 0.3
0.03 -0.07 -0.23 0.11 -0.03 0.17
0.02 0.01 -0.44 -0.05 0.29 0.08
0.13 -0.31 -0.34 -0.03 0.17 0.27
0.11 -0.19 -0.18 -0.02 0.08 0.17
0.14 -0.09 -0.3 -0.0 0.09 0.12
0.17 -0.22 -0.21 -0.12 0.23 0.08
0.16 -0.2 -0.16 0.01 0.12 0.04
0.06 -0.12 -0.12 0.04 0.01 0.11
0.16 -0.35 -0.17 0.05 0.14 0.09
-0.07 -0.26 -0.26 -0.11 0.07 0.48
0.09 -0.25 -0.19 -0.04 0.07 0.25
0.08 -0.02 -0.26 0.04 0.04 0.09
0.06 -0.17 -0.15 -0.02 0.08 0.17
0.16 -0.24 -0.17 0.04 0.3 -0.18
0.16 -0.25 -0.13 0.13 0.09 -0.04
0.38 -0.15 -0.36 0.06 0.32 -0.46
0.09 -0.32 -0.15 0.04 0.12 0.17
0.13 -0.41 -0.37 0.05 0.13 0.32
0.1 -0.16 -0.17 0.0 0.07 0.13
0.14 -0.06 -0.19 -0.07 0.0 0.14
0.05 -0.06 -0.29 0.02 0.02 0.22
-0.01 -0.25 -0.09 -0.09 0.1 0.28
0.17 -0.22 -0.18 0.05 0.09 0.04
0.16 -0.02 -0.36 -0.12 -0.01 0.27
-0.02 -0.16 -0.15 -0.03 -0.04 0.34
-0.02 -0.14 -0.21 -0.0 0.11 0.23
0.04 -0.09 -0.29 0.03 0.05 0.21
0.11 -0.07 -0.13 -0.13 0.21 -0.01
0.12 -0.14 -0.34 -0.04 -0.0 0.32
0.15 -0.18 -0.31 0.03 0.22 0.03
0.12 -0.1 -0.32 -0.05 0.06 0.22
-0.03 -0.13 -0.12 -0.03 0.0 0.27
-0.0 -0.07 -0.29 0.08 -0.02 0.25
0.04 -0.25 -0.13 -0.02 0.14 0.18
0.09 -0.18 -0.2 0.04 0.02 0.19
0.08 -0.0 -0.49 -0.08 0.28 0.11
0.04 -0.21 -0.37 -0.02 0.13 0.32
0.17 -0.4 -0.35 0.01 0.16 0.27
0.04 0.07 -0.16 -0.05 0.01 0.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.