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Heatmap: Cluster_124 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
2 h after light
6 h after light
10 h after light
14 h after light
18 h after light
2 h after dark
0.07 0.34 0.23 -0.06 -0.06 -0.73
0.08 -0.0 -0.01 0.01 0.11 -0.21
0.34 -0.15 -0.48 0.01 0.41 -0.35
-0.05 0.06 -0.42 -0.36 0.66 -0.17
0.13 -0.23 -0.07 -0.06 0.08 0.12
0.01 -0.13 -0.02 0.07 0.03 0.04
-0.74 0.05 -0.83 0.02 1.08 -0.55
-0.08 0.06 -0.1 0.03 0.13 -0.05
-0.7 -0.95 -0.6 0.7 0.52 0.19
-0.03 -0.16 -0.08 -0.01 0.11 0.15
-0.13 -0.13 0.05 0.14 0.05 0.01
0.06 -0.09 -0.06 -0.06 0.05 0.08
0.16 -0.03 -0.11 -0.1 -0.09 0.15
-1.68 -1.12 0.68 -0.99 1.29 -0.58
-0.02 -0.09 -0.1 -0.08 0.21 0.05
-0.06 0.12 -0.18 0.23 0.12 -0.3
-0.05 -0.11 0.02 0.05 0.14 -0.06
-0.07 0.04 -0.05 0.11 0.02 -0.06
0.46 -0.56 -0.27 -0.15 0.36 -0.1
0.03 0.16 -0.12 0.03 -0.05 -0.07
0.02 -0.18 0.03 0.08 0.09 -0.06
-0.06 0.02 -0.0 0.05 0.09 -0.12
0.01 0.19 0.05 -0.09 -0.04 -0.14
- - 1.51 1.66 - -
-0.95 -0.48 0.44 -0.47 0.72 0.06
0.21 -0.16 -0.21 0.11 0.23 -0.26
-0.03 -0.08 -0.04 -0.09 0.04 0.18
0.01 -0.08 -0.1 -0.04 0.08 0.12
0.2 -0.05 -0.09 -0.02 0.06 -0.12
0.03 -0.06 0.02 0.01 -0.02 0.02
-0.04 -0.07 -0.06 0.05 0.15 -0.04
-0.09 -0.15 0.11 0.02 0.18 -0.11
-0.16 0.04 0.06 0.05 0.2 -0.23
0.15 -0.14 -0.25 -0.06 0.17 0.09
0.08 -0.11 -0.16 0.0 0.2 -0.04
-0.03 -0.14 -0.17 0.12 0.44 -0.35
-0.19 0.38 -0.01 -0.23 0.23 -0.31
0.09 -0.04 0.02 0.07 -0.12 -0.03
- - - 1.84 - 1.27
-1.47 -1.43 0.06 1.18 -0.11 0.04
- 0.84 0.01 0.66 -0.36 -0.25
0.06 -0.12 -0.09 -0.07 0.05 0.14
0.12 -0.73 0.25 0.44 -0.29 -0.09
-0.13 -0.11 0.1 0.06 0.15 -0.11
0.16 -0.22 -0.07 -0.03 0.16 -0.03
-0.03 -0.08 0.04 0.04 -0.0 0.03
-0.01 -0.22 -0.04 0.09 0.18 -0.03
0.19 -0.08 -0.11 0.03 -0.01 -0.03
0.43 0.68 - -0.57 0.43 0.05
-0.21 0.63 0.12 -0.22 -0.46 -0.13
-0.07 0.07 0.07 -0.09 0.14 -0.13
0.13 -0.5 0.03 0.1 0.05 0.1
0.26 -0.19 -0.16 -0.23 0.18 0.06
-0.2 -0.07 0.67 -0.36 -0.18 -0.11
-0.67 - 0.76 0.86 -0.08 -0.13
-0.09 -0.54 -1.18 -0.07 0.94 0.09
0.05 0.08 -0.11 -0.17 0.07 0.05
-0.01 -0.37 -0.04 0.08 0.19 0.09
-0.02 0.06 0.16 -0.08 0.01 -0.16
-0.22 0.5 0.32 -0.21 -0.06 -0.6
0.01 -0.26 -0.04 0.06 0.47 -0.39
-0.09 -0.14 0.08 0.08 0.06 -0.0
0.1 -0.13 -0.03 -0.0 0.16 -0.13
0.11 -0.31 -0.1 -0.05 0.31 -0.05
0.12 -0.11 -0.09 -0.09 0.07 0.09
- - 1.06 1.21 0.68 -
-0.37 -0.13 -1.27 0.06 1.05 -0.36
0.02 -0.22 -0.02 -0.01 0.09 0.11
-1.0 -0.46 0.13 0.5 0.34 -0.0
0.01 -0.19 -0.17 0.03 0.19 0.1
-0.19 0.29 0.13 -0.91 0.69 -0.62
- - -0.03 1.62 -0.41 0.26
0.14 0.3 0.28 -0.45 -0.26 -0.19
-0.12 0.23 0.08 0.17 -0.09 -0.35
-1.16 -0.57 0.46 0.75 0.15 -0.48
0.12 -0.22 -0.1 -0.05 0.12 0.1
-0.21 0.22 -0.93 0.83 -0.63 0.04
0.13 - 0.93 1.58 - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.