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Heatmap: Cluster_47 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
2 h after light
6 h after light
10 h after light
14 h after light
18 h after light
2 h after dark
0.45 -0.38 -0.17 0.03 -0.36 0.24
0.31 -0.59 0.13 0.2 -0.7 0.31
0.55 -0.03 -0.02 -0.07 -0.36 -0.24
-0.82 0.29 -0.17 0.07 -0.44 0.62
0.53 0.13 -0.02 0.17 -0.49 -0.66
0.11 -0.14 0.02 0.02 -0.03 0.0
0.28 -0.22 -0.04 -0.08 -0.32 0.27
0.14 -0.18 0.14 0.0 -0.33 0.16
0.54 -0.38 -0.28 0.02 -0.37 0.22
2.03 - - - - 0.95
-0.04 -0.55 0.12 -0.26 -0.08 0.56
0.42 0.04 0.58 0.19 -1.16 -0.86
0.42 -0.31 -0.23 0.05 0.04 -0.09
0.1 1.27 0.73 -1.34 -2.67 -1.7
0.57 -0.42 -0.1 0.09 -0.37 -0.01
0.4 0.09 0.05 -0.75 -0.35 0.27
0.69 -0.44 -0.13 0.01 -0.45 -0.03
0.27 0.05 0.03 -0.23 -0.22 0.04
1.45 -0.42 -1.57 -1.13 - 0.78
0.26 0.17 -0.26 -0.29 -0.09 0.13
-0.13 -0.4 0.09 0.28 -0.37 0.35
0.66 -0.19 -0.28 -0.44 0.16 -0.21
0.74 -0.3 -0.25 -0.17 -0.76 0.26
0.19 -0.1 0.11 0.03 -0.32 0.04
0.57 -0.02 0.17 -0.02 -0.37 -0.63
0.33 -0.77 -0.37 0.01 -0.39 0.69
0.29 -0.17 0.07 0.17 -0.05 -0.41
0.18 -0.03 -0.1 0.01 -0.11 0.03
0.19 0.02 -0.05 -0.01 -0.24 0.06
0.12 0.21 -0.12 -0.24 -0.32 0.26
0.32 -0.48 -0.01 0.05 -0.16 0.15
0.31 -0.81 -0.14 0.19 -0.45 0.49
1.53 0.18 - - - 0.98
0.54 -0.45 -0.26 -0.07 0.2 -0.2
0.51 -0.26 -0.13 -0.0 -0.27 -0.01
0.74 -0.54 0.01 0.09 -0.48 -0.24
0.23 -0.1 -0.08 0.03 -0.11 -0.01
0.35 -0.09 0.08 -0.08 -0.07 -0.26
0.09 -0.52 0.12 -0.0 -0.07 0.27
-0.22 -0.17 0.25 0.09 -0.01 0.01
0.47 -0.09 -0.21 -0.22 0.03 -0.1
0.29 -0.01 0.21 -0.27 -0.21 -0.1
-0.72 -0.28 0.25 0.25 0.17 0.09
-0.06 -0.27 0.11 0.01 -0.0 0.18
-0.01 -0.26 0.32 0.09 -0.34 0.09
0.16 -0.68 0.12 -0.25 0.05 0.37
-0.22 -1.03 0.19 0.38 0.02 0.26
-0.06 0.0 -0.06 0.03 0.3 -0.28
-0.2 -0.36 0.19 0.17 -0.13 0.23
-0.1 -0.45 0.17 -0.41 0.06 0.5
0.43 -0.6 0.36 -0.09 -0.16 -0.2
-0.04 -0.0 0.28 -0.02 -0.16 -0.09
-0.84 -0.57 0.59 0.42 0.04 -0.17
-0.12 -0.58 0.05 0.11 0.04 0.35
0.04 -0.38 0.05 -0.12 -0.23 0.48
0.57 -0.49 -0.27 -0.11 0.3 -0.29
0.4 -0.15 -0.03 -0.05 -0.07 -0.19
0.21 -0.43 -0.09 -0.08 -0.1 0.36
0.35 -0.23 0.01 0.08 -0.05 -0.25
0.39 -0.32 0.24 0.19 -0.06 -0.72
0.62 -0.66 -0.2 -0.43 -0.29 0.49
0.16 -0.56 0.02 -0.02 -0.01 0.27
-0.09 -0.31 0.17 -0.14 0.02 0.27
-0.18 -0.01 0.37 -0.02 0.06 -0.32
0.02 -0.34 0.23 0.04 0.02 -0.04
-0.11 -0.86 0.19 0.31 -0.09 0.26
0.93 -0.58 -0.55 -0.4 -0.25 0.19
0.16 -0.45 -0.07 0.21 0.05 0.01
0.17 -0.16 0.07 -0.14 -0.18 0.19
0.2 -0.29 0.03 -0.15 0.12 0.03
0.52 -0.59 0.16 -0.11 -0.22 0.0
0.19 -0.27 0.09 -0.01 -0.08 0.05
0.18 -0.55 0.09 0.17 0.39 -0.53
0.36 -0.43 -0.1 -0.1 -0.17 0.28
0.08 -0.53 0.04 0.04 -0.31 0.47
0.23 -0.24 0.01 -0.02 -0.16 0.13
-0.3 -0.41 0.25 0.12 0.05 0.16
0.05 -0.37 0.1 -0.14 0.23 0.06
0.25 -0.82 -0.54 0.1 0.36 0.27
0.37 -0.23 0.02 -0.0 -0.26 0.02
0.01 -0.34 0.18 -0.06 -0.18 0.29
0.19 -0.29 -0.06 -0.1 -0.05 0.24
0.13 -0.29 0.08 -0.01 -0.17 0.2
0.22 -0.48 0.02 0.11 0.05 -0.01
0.39 -0.32 -0.23 -0.23 0.14 0.12
0.39 -0.29 -0.12 -0.16 -0.04 0.12
0.35 -0.33 -0.39 0.09 0.2 -0.05
0.32 -0.12 -0.18 -0.18 0.02 0.06
0.38 -0.13 -0.12 -0.33 -0.23 0.28
0.22 -0.3 0.23 0.13 -0.01 -0.39
0.02 -0.31 -0.06 0.06 0.12 0.12
0.27 -0.42 -0.05 -0.09 0.14 0.06
0.63 -0.4 -0.19 -0.21 -0.15 0.08
0.12 -0.04 -0.05 -0.21 -0.05 0.19
0.22 0.39 -0.08 -0.26 -0.22 -0.17
0.37 0.54 -0.01 -0.13 -0.41 -0.74
1.4 0.08 -0.94 - - 0.84
0.24 -0.2 -0.13 0.12 -0.13 0.05
0.13 -0.07 -0.09 0.04 -0.26 0.21
0.34 -0.26 0.08 -0.11 0.05 -0.18
0.31 -0.24 -0.11 -0.03 -0.23 0.2
0.16 -0.01 -0.17 0.08 -0.1 0.01
0.1 0.06 0.18 -0.05 -0.19 -0.13
-0.02 -0.12 0.08 0.2 0.09 -0.28
0.13 0.11 -0.03 0.02 0.03 -0.3
0.01 0.14 -0.15 0.32 -0.64 0.14
0.13 -0.27 -0.04 -0.01 -0.06 0.2
0.23 -0.35 -0.04 0.1 -0.23 0.19
0.84 0.06 -0.81 -0.17 -0.96 0.26
0.09 0.17 0.13 0.08 -0.31 -0.25
0.16 -0.02 0.08 0.12 -0.25 -0.14
0.43 -1.15 -0.5 -0.02 -1.5 1.11
0.19 -0.07 -0.13 -0.03 -0.21 0.2
0.18 -0.29 0.13 0.2 -0.35 0.03
0.4 -0.16 -0.1 0.04 -0.19 -0.08
0.18 -0.22 -0.01 0.01 -0.21 0.2
0.05 0.31 -0.06 0.18 -0.43 -0.17
0.21 -0.11 -0.03 0.03 -0.22 0.08
0.64 -0.08 -1.54 -0.56 -0.18 0.67
0.18 -0.07 -0.13 0.06 -0.15 0.08
0.43 -0.08 -0.22 -0.19 -0.17 0.11
0.21 - 0.27 - -0.2 1.47
0.32 -0.34 -0.06 0.13 -0.48 0.25
0.06 0.16 -0.09 -0.14 -0.17 0.14
-0.41 0.39 -0.12 0.32 -0.11 -0.25
0.09 -0.09 0.04 0.05 -0.21 0.1
0.35 -0.29 -0.1 -0.02 0.11 -0.15
-0.55 -0.56 0.32 0.2 -0.13 0.4
0.29 0.23 0.04 -0.12 -0.13 -0.44
0.15 0.23 -0.09 -0.17 -0.2 0.03
0.26 -0.03 0.17 0.13 -0.18 -0.46
0.03 0.13 0.01 -0.0 -0.17 -0.01
0.06 -0.08 -0.02 -0.16 0.24 -0.07
0.37 -0.23 -0.25 -0.15 0.01 0.14
0.64 -0.57 -0.21 0.02 -0.7 0.35
0.99 - - - 0.55 1.35
0.25 -1.32 -0.32 -0.04 -0.63 0.99
0.09 -0.87 -0.0 0.4 0.24 -0.16
0.22 -0.02 0.0 0.01 -0.14 -0.11
-0.19 - 0.26 0.37 0.0 0.7
0.33 -0.11 -0.19 -0.06 -0.27 0.2
0.35 -0.32 -0.05 0.15 -0.13 -0.11
1.91 - - - -0.3 0.51
0.34 -0.19 -0.18 0.06 -0.27 0.15
0.12 -0.12 -0.07 -0.02 -0.13 0.2
0.48 -0.08 -0.37 0.12 0.24 -0.7
-0.46 0.51 -0.32 -0.51 -0.2 0.57
0.09 -0.17 0.19 -0.14 0.11 -0.12
1.01 -0.07 -1.52 0.06 -0.0 -0.62
0.34 0.11 0.08 -0.09 -0.28 -0.27
0.14 0.04 0.05 0.41 -0.66 -0.2
0.32 -0.47 -0.05 0.22 -0.69 0.35
0.05 -0.15 -0.07 0.04 -0.02 0.13
0.42 -0.79 -0.33 -0.11 -0.86 0.86
0.65 -0.67 -0.04 -1.36 -1.36 1.04
0.07 -0.0 0.11 0.1 -0.37 0.04
0.38 -0.75 0.08 -0.46 -0.66 0.76
0.69 -0.5 -0.51 -0.02 0.27 -0.35
-0.13 0.26 0.18 0.17 -0.36 -0.23
0.09 -0.3 0.16 -0.04 0.18 -0.15
0.56 -0.88 -0.03 -0.08 -0.5 0.43
0.54 -0.3 -0.02 0.09 -0.04 -0.49

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.