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Heatmap: Cluster_22 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
2 h after light
6 h after light
10 h after light
14 h after light
18 h after light
2 h after dark
0.2 0.01 -0.21 -0.29 0.0 0.22
0.04 0.08 -0.12 -0.03 -0.03 0.06
0.24 -0.1 -0.28 -0.14 -0.07 0.27
-0.01 0.02 -0.19 -0.14 0.06 0.23
0.32 0.06 -0.41 -0.19 0.1 0.02
0.25 0.11 -0.38 -0.19 -0.2 0.28
0.4 0.04 0.13 -0.66 -0.54 0.3
0.31 0.27 -0.13 -0.55 -0.42 0.27
0.33 0.13 -0.28 -0.33 -0.02 0.06
0.37 0.1 -0.17 -0.34 -0.09 0.03
0.33 0.09 -0.37 -0.1 0.04 -0.08
0.29 0.18 -0.15 -0.25 -0.16 0.02
0.5 0.15 -0.34 -0.49 -0.21 0.15
-0.01 0.16 -0.09 -0.22 0.08 0.05
0.38 0.29 -0.16 -0.42 -0.25 -0.02
0.21 -0.16 -0.42 0.05 0.1 0.13
0.3 0.18 -0.17 -0.25 -0.19 0.05
0.55 0.39 -0.16 -0.96 -0.17 -0.1
0.02 0.02 -0.17 -0.13 0.04 0.2
0.27 0.25 -0.32 -0.38 -0.17 0.2
0.07 -0.03 -0.17 -0.07 0.02 0.16
0.17 0.11 -0.11 -0.09 -0.11 0.01
0.23 -0.12 -0.18 -0.05 -0.14 0.21
0.33 -0.08 -0.31 -0.21 -0.07 0.23
0.25 0.09 -0.19 -0.19 -0.12 0.09
0.09 0.28 -0.23 -0.41 -0.14 0.27
0.07 0.21 -0.15 -0.29 -0.1 0.18
0.35 0.16 -0.24 -0.26 -0.19 0.08
0.35 0.17 -0.3 -0.52 -0.28 0.34
0.13 -0.08 -0.34 -0.03 0.18 0.09
0.32 -0.2 -0.39 -0.1 -0.04 0.28
0.36 0.11 -0.12 -0.29 -0.39 0.19
0.43 0.6 -0.13 -0.73 -0.58 -0.07
0.28 0.16 -0.24 -0.33 -0.09 0.13
0.18 0.25 -0.23 -0.32 -0.23 0.22
0.2 0.06 -0.21 -0.14 -0.0 0.06
0.22 -0.13 -0.3 -0.19 0.03 0.28
0.29 0.01 -0.33 -0.33 0.08 0.17
0.21 0.15 -0.19 -0.11 -0.07 -0.03
0.31 0.02 -0.31 -0.19 -0.19 0.25
0.22 0.2 -0.21 -0.22 0.02 -0.09
0.4 0.05 -0.35 -0.39 -0.16 0.27
0.14 0.17 -0.11 -0.13 -0.03 -0.06
-0.03 -0.05 -0.01 -0.07 -0.26 0.35
0.47 0.22 -0.31 -0.4 -0.19 0.01
0.3 -0.02 -0.41 -0.18 0.12 0.09
0.26 0.04 -0.22 -0.21 -0.12 0.17
0.07 -0.01 -0.19 -0.06 0.06 0.11
0.43 0.04 -0.74 -0.18 0.02 0.17
0.2 0.08 -0.29 -0.14 0.06 0.04
0.2 0.16 -0.17 -0.12 -0.18 0.05
-0.03 -0.08 -0.22 0.05 -0.2 0.4
0.34 0.11 -0.26 -0.39 -0.23 0.27
0.3 0.0 -0.35 -0.25 -0.2 0.35
0.36 0.37 -0.23 -0.51 -0.39 0.15
0.05 0.26 -0.19 -0.0 -0.07 -0.1
0.29 0.18 -0.21 -0.35 -0.13 0.12
0.2 0.03 0.03 -0.2 -0.16 0.06
0.32 0.4 -0.09 -0.61 -0.73 0.3
0.37 0.02 -0.51 -0.56 -0.0 0.4
0.43 0.11 -0.13 -0.37 -0.36 0.16
0.22 0.18 -0.25 -0.22 -0.06 0.06
0.15 0.29 -0.32 -0.14 -0.14 0.07
0.26 0.05 -0.27 -0.25 -0.08 0.2
0.29 0.05 -0.25 -0.37 -0.22 0.35
0.28 0.02 -0.15 -0.35 -0.25 0.31
0.43 0.6 -0.13 -0.73 -0.58 -0.07
0.24 0.02 -0.36 -0.04 0.02 0.06
0.2 0.03 -0.18 -0.13 -0.01 0.05
-0.08 -0.11 -0.07 0.03 -0.13 0.32
0.02 0.15 -0.2 -0.1 0.05 0.06
0.16 -0.06 -0.23 -0.26 -0.2 0.44
0.23 0.15 -0.34 -0.16 0.07 -0.03
0.19 0.16 -0.32 -0.07 0.01 -0.01
0.04 0.13 -0.21 -0.14 0.04 0.11
0.41 0.12 -0.18 -0.31 -0.18 0.03
0.19 0.06 -0.25 -0.25 -0.07 0.23
0.15 0.09 -0.2 -0.22 -0.08 0.2
0.17 -0.06 -0.39 -0.18 0.0 0.34
0.28 -0.23 -0.24 0.08 0.08 -0.04
0.25 0.18 -0.22 -0.17 -0.2 0.08
0.45 0.32 -0.41 -0.64 -0.22 0.17
0.11 0.08 -0.26 -0.24 0.0 0.24
0.51 0.08 -0.4 -0.45 -0.39 0.34
0.37 0.14 -0.07 -0.33 -0.29 0.06
0.3 -0.0 -0.24 -0.49 0.01 0.28
0.1 0.09 -0.39 -0.2 0.05 0.25
0.34 0.17 -0.29 -0.21 -0.21 0.08
0.12 -0.03 -0.2 -0.03 0.1 0.02
0.24 0.51 0.0 -0.55 -0.66 0.1
0.29 0.18 -0.33 -0.28 -0.02 0.05
0.23 0.1 -0.33 -0.29 0.03 0.17
0.13 -0.05 -0.34 0.01 -0.03 0.21
0.14 0.22 -0.12 -0.17 -0.16 0.04
-0.0 -0.03 -0.23 0.04 -0.12 0.29
-0.03 1.45 -0.75 - -1.76 0.48
0.18 -0.12 -0.26 -0.02 0.05 0.12
0.17 0.14 -0.2 -0.18 0.09 -0.07
0.05 -0.0 -0.12 -0.08 -0.11 0.23
0.23 0.11 -0.14 -0.21 -0.1 0.06
0.19 -0.12 -0.3 0.02 0.12 0.04
0.02 -0.05 -0.08 -0.06 0.03 0.12
0.25 0.18 -0.1 -0.32 -0.14 0.05
0.22 0.04 -0.23 -0.26 -0.14 0.28
0.15 -0.07 -0.31 -0.14 0.09 0.21
0.3 0.15 -0.15 -0.27 -0.12 0.01
0.29 0.16 -0.23 -0.45 -0.05 0.15
0.2 0.13 -0.26 -0.19 -0.05 0.11
0.15 -0.02 -0.32 -0.09 0.08 0.16
0.18 -0.06 -0.25 -0.07 0.15 0.0
0.14 0.01 -0.25 -0.05 0.06 0.05
0.27 0.16 -0.14 -0.31 -0.17 0.11
0.23 0.19 -0.28 -0.26 -0.2 0.22
0.34 0.16 -0.12 -0.31 -0.26 0.07
0.33 0.04 -0.24 -0.27 0.03 0.03
0.09 0.1 -0.23 -0.13 -0.01 0.14
0.35 -0.09 -0.48 -0.34 0.01 0.35
0.12 -0.16 -0.08 0.03 -0.08 0.15
0.19 -0.2 -0.33 -0.14 -0.03 0.38
0.11 -0.08 -0.3 -0.17 0.0 0.35
0.3 0.06 -0.37 -0.41 -0.19 0.4
0.22 0.17 -0.05 -0.24 -0.16 0.01
0.16 -0.05 -0.25 -0.12 0.08 0.13
0.23 0.01 -0.44 -0.38 0.04 0.37
-0.17 0.32 -0.11 -0.11 0.14 -0.16
0.3 0.19 -0.39 -0.3 -0.04 0.11
0.29 0.27 -0.06 -0.38 -0.27 0.02
0.26 0.18 -0.31 -0.31 -0.01 0.1
0.15 0.02 -0.31 -0.12 0.04 0.18
0.36 0.37 -0.17 -0.47 -0.21 -0.07
0.08 0.24 -0.3 -0.42 -0.07 0.32
0.28 -0.0 -0.14 -0.23 -0.13 0.15
0.2 0.09 -0.31 -0.22 0.01 0.16
0.14 -0.07 -0.36 -0.07 0.2 0.09
0.33 0.12 -0.21 -0.3 -0.06 0.02
0.07 -0.03 -0.19 -0.13 -0.0 0.25
0.47 0.03 -0.38 -0.41 -0.14 0.23
0.39 -0.03 -0.36 -0.31 -0.09 0.24
0.25 0.08 -0.17 -0.2 -0.24 0.19
0.09 0.04 -0.16 -0.11 -0.05 0.16
0.2 0.12 -0.16 -0.34 -0.09 0.19
0.3 0.29 -0.51 -0.22 -0.08 0.04
-0.01 -0.06 -0.29 -0.19 -0.01 0.44
0.39 0.01 -0.31 -0.55 -0.09 0.33
0.33 0.14 -0.16 -0.27 -0.11 -0.01
0.08 -0.26 -0.46 -0.0 0.2 0.31
0.15 0.15 -0.08 -0.16 -0.05 -0.04
0.11 0.15 -0.1 -0.16 -0.04 0.02
0.05 0.21 -0.18 -0.13 0.05 -0.03
0.43 0.19 -0.32 -0.51 0.0 0.0
0.09 -0.19 -0.11 -0.1 0.07 0.21
0.21 -0.1 -0.22 -0.09 -0.02 0.17
0.27 -0.19 -0.38 -0.1 0.05 0.25
0.27 0.27 -0.19 -0.55 -0.37 0.32
0.21 0.03 -0.21 -0.19 -0.08 0.18
0.21 -0.01 -0.32 -0.24 -0.07 0.32
0.33 -0.02 -0.26 -0.22 -0.01 0.09
0.61 0.15 -0.77 -0.59 -0.13 0.27
0.17 -0.07 -0.35 -0.24 0.01 0.36
0.22 0.03 -0.22 -0.22 -0.05 0.17
0.2 0.23 -0.12 -0.19 -0.28 0.09
0.15 0.07 -0.13 -0.18 -0.01 0.07
0.43 0.6 -0.13 -0.73 -0.58 -0.07
0.32 0.05 -0.58 -0.28 -0.01 0.29
0.45 0.14 -0.18 -0.34 -0.37 0.12
0.08 0.14 -0.24 -0.13 -0.01 0.12
0.29 0.01 -0.29 -0.29 0.03 0.16
0.15 0.16 -0.23 -0.32 -0.0 0.17
0.61 0.31 -0.29 -0.81 -0.37 0.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.