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Heatmap: Cluster_95 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
2 h after light
6 h after light
10 h after light
14 h after light
18 h after light
2 h after dark
-0.34 -0.5 -1.52 0.6 -0.25 0.85
0.28 -0.02 0.02 0.11 -0.13 -0.34
-0.7 0.13 -0.18 0.17 0.52 -0.22
0.18 0.94 -1.46 -0.72 -2.43 0.84
0.33 0.29 -0.35 0.1 -0.37 -0.17
-0.5 -0.15 -0.41 -0.3 0.53 0.46
-0.02 -2.01 0.99 -0.53 0.14 -0.01
0.12 -0.69 -0.57 0.5 -0.1 0.35
0.0 0.01 0.02 -0.09 0.12 -0.08
-0.93 0.4 -0.29 0.71 -0.54 0.02
-0.21 0.54 -0.16 0.17 -0.11 -0.44
0.3 -0.5 0.74 -0.37 -0.66 -0.03
-0.22 -0.04 -0.31 0.12 0.2 0.17
-0.06 0.17 -1.78 0.43 0.31 0.05
0.96 -0.13 -0.22 -0.35 - 0.59
1.47 -0.22 - -0.43 -0.68 -0.01
-0.11 0.75 -0.47 0.18 -0.09 -0.73
1.12 0.36 - 0.3 0.39 -
0.99 0.42 -0.93 -0.56 0.56 -
1.24 0.03 - 0.91 -0.43 -
0.13 -0.29 -0.07 0.22 0.13 -0.19
0.43 -0.0 -0.33 -0.31 0.19 -0.13
0.99 - - 0.05 0.93 0.11
0.38 -0.91 -0.37 0.46 0.23 -0.26
-0.01 -0.04 -0.12 0.18 0.07 -0.11
0.19 -0.0 -0.08 0.09 -0.38 0.1
-0.42 -0.04 -0.18 0.15 0.09 0.29
-0.0 -0.02 0.08 0.04 -0.08 -0.02
-0.08 -0.55 -0.71 0.47 0.28 0.22
0.35 -0.37 -0.34 0.01 0.38 -0.23
0.36 0.69 - 0.21 -0.15 0.07
0.14 -0.93 -0.51 0.25 0.36 0.26
1.41 - 0.04 0.48 -0.14 -
0.36 -0.37 0.26 0.23 0.01 -0.8
-0.01 0.25 0.09 -0.45 0.67 -1.2
-0.29 -0.51 -0.46 0.62 0.22 0.08
0.42 -0.37 -0.02 0.04 -0.19 -0.01
-0.07 -0.12 -0.03 0.08 0.06 0.06
0.37 0.24 -0.17 -0.14 0.18 -0.74
0.4 0.29 - 1.36 -0.17 -
0.39 -0.95 -0.69 -0.26 0.36 0.52
0.05 -0.23 0.05 0.32 0.14 -0.47
0.68 -0.58 0.17 0.01 -0.62 -0.08
-0.25 -0.24 -0.35 0.06 0.22 0.4
-0.29 0.38 -0.7 0.25 0.0 0.11
-0.14 0.55 - 1.19 0.43 -
-1.09 -1.01 -0.77 0.34 0.54 0.79
1.1 -1.96 -0.26 -0.02 -1.06 0.38
0.26 0.65 -0.8 0.51 -1.34 -0.27
0.53 -0.39 -0.22 -0.37 0.09 0.14
0.11 -0.33 -1.14 -0.73 0.8 0.4
-0.07 -0.23 0.22 0.19 0.13 -0.34
1.27 -0.59 -0.11 0.45 -2.2 -1.29
2.03 - - -0.28 - 0.14
-0.11 0.23 0.49 -0.03 -0.11 -0.77
-0.37 0.2 -0.52 0.36 -0.08 0.2
-0.06 -0.05 -0.04 0.37 -0.04 -0.24
0.47 0.22 0.02 -0.19 -0.3 -0.42
-0.02 -0.15 -0.22 0.01 0.08 0.26
1.54 - - 1.63 - -
-0.18 0.59 - 0.68 0.09 -0.08
0.08 0.02 0.03 0.03 0.1 -0.3
-0.08 -0.3 0.07 0.18 -0.09 0.15
0.17 -0.27 -0.01 -0.24 -0.14 0.37
-0.37 1.13 -0.03 -0.55 -0.29 -0.86
-1.0 0.43 -1.35 1.52 -0.18 -
- -0.41 0.57 0.23 0.46 0.28
0.39 0.02 -0.3 -0.02 0.37 -0.79
1.49 0.28 - - 0.98 -
1.02 -0.16 0.66 - 0.02 -1.06
0.39 -0.82 -0.26 -0.13 -0.03 0.48
- - - -0.31 1.52 1.22
0.03 0.06 0.22 0.02 -0.07 -0.31
-0.16 0.89 -1.02 0.24 0.02 -0.85
-0.17 0.48 -0.94 0.47 0.67 -2.23
0.07 0.7 -0.67 -0.12 -0.29 -0.05
0.79 0.82 - -1.17 -0.15 0.22
0.08 -0.27 -0.53 0.14 -0.34 0.61
-0.06 0.53 -0.65 0.08 0.37 -0.74
1.54 - - 1.63 - -
0.33 -0.13 -0.07 -0.22 0.01 0.01
0.42 0.11 -0.48 1.03 -0.66 -2.35
-0.18 0.07 -0.01 -0.04 0.14 0.01
-0.09 0.02 -0.2 0.28 0.06 -0.1
-0.41 -0.02 -0.25 0.12 0.13 0.31
-0.25 -0.19 0.24 0.16 -0.28 0.21
0.08 0.24 -0.4 0.18 0.01 -0.22
0.89 -0.45 - 0.8 - 0.74
0.07 -0.02 -0.12 0.16 0.1 -0.23
-0.3 -3.24 0.14 0.12 0.59 0.47
-0.06 -1.22 0.42 0.06 0.32 -0.02
0.21 0.11 -0.3 -0.04 -0.24 0.18
-0.04 -0.06 -0.23 -0.01 0.18 0.14
-0.43 -0.06 -0.07 0.5 0.04 -0.15
-0.41 0.09 -1.72 0.26 0.85 -0.18
-0.93 0.37 -0.15 -0.07 0.61 -0.32
0.04 -0.19 -0.04 0.03 0.11 0.03
0.2 -0.37 0.19 0.1 -0.1 -0.11
0.52 -0.3 0.09 -0.1 -0.01 -0.41
-0.03 -0.11 -0.02 0.09 0.1 -0.04
-0.23 -0.34 -0.44 0.3 0.02 0.46
-0.28 -1.46 -0.09 0.01 0.55 0.49
-1.26 1.28 -0.71 -0.11 -1.2 0.25
0.74 0.21 -0.71 -0.12 -1.09 0.22
0.92 -0.07 -0.34 0.56 -0.67 -1.92
1.07 - - 1.16 - 0.73
1.24 0.03 -1.75 -0.48 0.0 -0.74
-0.02 0.74 -0.48 -0.32 -0.13 -0.13
0.46 -0.88 - 1.29 -0.12 -0.49
-1.23 -1.34 0.02 0.3 0.12 0.88
1.04 0.85 - 0.14 0.05 -
1.12 - - 1.21 0.59 -
0.15 -0.44 -0.39 -0.09 0.34 0.24
-0.13 -0.02 -0.03 0.17 0.12 -0.14
-0.3 -0.58 -0.41 0.42 0.63 -0.19
-0.24 0.6 0.11 -0.06 -0.3 -0.34
0.85 0.35 -1.58 -0.32 -0.03 -0.32
0.88 -0.05 0.09 -0.42 -1.29 -0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.