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Heatmap: Cluster_20 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
2 h after light
6 h after light
10 h after light
14 h after light
18 h after light
2 h after dark
-0.75 1.04 -0.13 -0.12 -0.2 -0.63
-1.43 1.37 -0.53 -0.09 0.49 -
- 1.28 -1.3 -1.08 1.12 -0.98
-0.57 0.81 -0.05 -0.3 0.08 -0.43
0.35 0.63 -0.17 -0.42 -0.36 -0.41
-0.15 0.71 0.01 -0.19 -0.13 -0.59
0.3 0.56 -0.1 -0.36 -0.3 -0.38
-0.41 0.68 -0.34 0.18 -0.03 -0.43
-0.02 0.41 -0.09 -0.07 -0.49 0.11
-0.31 0.61 -0.1 -0.28 -0.01 -0.12
-1.88 1.26 0.16 0.49 -0.54 -3.09
-0.06 0.57 -0.6 -0.07 0.13 -0.24
-0.25 0.41 0.0 -0.09 0.06 -0.24
-0.15 0.45 -0.02 -0.17 -0.08 -0.12
-1.69 1.12 -0.09 -0.08 -0.02 -0.62
-0.56 0.92 0.12 -0.0 -0.21 -1.06
- 1.75 - 0.11 0.64 -
-0.29 1.04 0.08 -0.51 -0.22 -1.0
-0.26 0.7 -0.2 -0.32 -0.28 0.06
0.22 1.0 0.96 - -0.17 -
-0.57 1.31 -0.34 -0.97 -0.21 -0.56
-1.44 0.49 0.04 0.27 0.69 -1.42
-0.0 0.37 -0.01 -0.19 0.09 -0.38
- 2.17 -0.61 -2.28 -0.63 -
- 1.99 -1.29 -1.22 0.26 -
- 1.67 - - 1.5 -
- 1.56 0.46 -0.27 -0.23 -
-1.31 1.18 0.12 0.18 -0.74 -0.94
-0.45 0.75 -0.0 -0.17 0.01 -0.52
-0.48 0.97 -0.09 -0.42 -0.11 -0.5
-0.61 1.01 0.16 0.32 -0.44 -2.09
-0.64 0.84 0.13 -0.74 -0.44 0.19
-1.09 1.12 0.04 0.01 -0.28 -1.02
- 2.17 -1.73 -1.95 -0.15 -4.2
-0.9 0.97 0.03 0.01 -0.16 -0.79
-0.31 0.65 0.05 -0.21 -0.13 -0.31
0.02 0.93 -0.47 -0.53 -0.15 -0.39
- 1.67 - - 1.5 -
- 1.75 -0.04 -0.21 -1.73 -1.02
-0.35 1.04 0.12 -0.28 -0.56 -0.81
-0.51 0.66 -0.04 -0.0 0.12 -0.59
- 1.63 -1.04 0.02 0.5 -
-1.65 1.21 0.03 0.08 -0.06 -1.62
-0.55 1.08 -0.45 -0.09 0.13 -1.18
-2.32 1.59 -0.6 0.15 -0.11 -3.48
-1.43 0.97 0.18 0.02 -0.64 -0.19
-0.74 0.84 -0.15 -0.06 0.62 -2.26
-2.4 2.16 -1.52 -1.99 -1.27 -1.57
0.08 0.58 -0.36 -0.45 -0.17 0.07
0.03 0.43 -0.28 -0.28 -0.13 0.09
-1.36 0.66 0.6 0.17 -0.22 -0.9
-0.33 0.92 0.03 -0.41 -0.04 -0.84
-2.51 1.0 -0.01 0.97 -0.49 -2.65
-0.59 0.87 0.13 -0.23 -0.12 -0.64
-2.54 1.46 -0.04 -0.32 0.39 -
- 1.23 0.06 0.74 -0.09 -
-2.04 1.03 0.14 0.25 0.5 -
-0.2 0.41 -0.01 0.04 0.09 -0.48
-0.21 0.69 -0.16 -0.17 -0.06 -0.35
-0.18 0.97 -0.59 0.07 0.23 -1.87
-1.03 1.16 0.36 -0.02 -0.68 -1.39
-2.31 1.08 -0.1 0.31 0.36 -2.08
-0.69 0.82 0.25 -0.21 -0.06 -0.73
-1.09 0.79 0.36 0.31 -0.46 -0.87
-0.25 0.75 -0.23 -0.26 -0.29 -0.05
0.0 0.42 -0.04 -0.08 -0.11 -0.3
-0.14 0.56 -0.04 -0.06 -0.08 -0.45
-0.53 0.82 -0.81 -0.05 -0.31 0.27
-3.31 1.54 -0.34 -0.1 0.15 -2.57
-0.2 0.31 -0.2 0.11 -0.16 0.06
-0.03 0.33 -0.12 -0.08 -0.09 -0.07
-1.49 1.24 -0.33 -0.3 0.01 -0.59
-0.84 1.14 0.16 -0.41 -0.05 -1.32
-0.87 1.03 0.17 -0.24 -0.51 -0.45
-0.32 1.33 -0.1 -1.24 0.1 -1.96
-2.41 1.16 0.19 0.9 -0.79 -
0.23 0.32 -0.12 -0.07 0.07 -0.59
-1.2 1.07 0.21 0.19 -0.75 -0.8
- 1.67 - - 1.5 -
-0.4 1.09 -0.3 -0.46 -0.35 -0.34
0.05 0.45 -0.04 -0.13 -0.17 -0.28
-2.08 1.57 -0.85 0.23 -0.23 -2.17
0.01 1.27 -1.33 0.41 -1.1 -1.39
-4.94 1.73 -1.16 -0.31 0.35 -3.06
-1.16 1.15 -0.2 0.16 -0.64 -0.53
-0.55 1.0 -0.27 -0.15 -1.12 0.16
- 1.92 - - 1.15 -
-0.42 0.52 0.23 -0.01 0.06 -0.7
- 2.21 -1.29 -1.55 -0.65 -
-1.54 1.4 0.12 0.03 -0.92 -1.41
0.28 0.37 0.18 0.18 -0.04 -1.96
-0.03 0.56 -0.1 -0.17 0.06 -0.57
-0.15 0.7 0.01 -0.2 -0.11 -0.57
-1.0 1.04 0.03 0.29 -0.51 -1.0
-0.09 0.62 -0.24 -0.22 -0.16 -0.12
0.17 0.44 -0.32 -0.18 0.16 -0.49
-0.05 0.53 -0.37 -0.05 -0.04 -0.19
0.4 1.18 - - 1.27 -
-0.2 0.57 -0.09 -0.16 0.06 -0.37
-1.37 1.29 0.53 -0.29 -0.3 -3.53
-0.71 0.86 -0.35 -0.09 0.2 -0.51
-0.23 0.86 -0.07 -0.07 -0.21 -0.83
-0.73 1.46 -0.4 -0.28 -0.32 -1.89
-0.24 0.84 -0.35 -0.39 -0.11 -0.17
-0.81 0.8 -0.16 -0.43 -0.06 0.12
-0.11 0.67 -0.13 -0.18 -0.22 -0.26
-2.25 1.48 -0.03 0.03 -0.44 -1.96
-0.22 0.67 -0.19 -0.0 -0.05 -0.5
-1.19 1.68 -0.44 -0.56 -0.84 -1.38
-2.03 1.48 0.15 0.27 -1.16 -2.32
-0.98 1.01 -0.16 -0.01 -0.02 -0.74
-0.21 1.35 -0.38 - 0.87 -
-3.41 1.88 -0.39 -0.75 -0.39 -3.11
-0.09 0.69 -0.16 -0.51 0.18 -0.47
-0.65 0.75 -0.19 0.0 -0.43 0.08
-0.26 0.59 0.05 -0.36 0.12 -0.41
-0.61 1.22 -0.05 0.19 -0.73 -1.72
-2.91 1.44 -0.51 0.57 -0.41 -2.21
-2.04 1.16 0.23 0.11 0.01 -1.91
-0.46 0.97 0.06 -0.56 -0.04 -0.66
-0.85 0.98 0.01 -0.29 0.22 -1.06
-0.18 0.66 -0.33 -0.06 0.0 -0.36
- 2.06 - - 0.88 -
-0.01 0.53 -0.18 -0.16 -0.1 -0.23
- 1.49 - 0.24 0.58 -0.96
-1.12 1.49 0.14 -0.73 -0.24 -2.54
-0.83 1.01 0.33 0.03 -0.55 -1.14
- 2.22 - 0.43 - -
-2.01 1.23 0.0 -0.39 0.2 -1.01
-0.53 1.56 -0.79 -0.19 -0.35 -3.2
-0.2 0.74 0.09 -0.33 -0.18 -0.48
0.01 0.48 -0.05 -0.24 -0.07 -0.26
-0.04 0.63 -0.16 -0.15 0.07 -0.67
-1.63 0.94 -0.57 0.43 0.49 -1.59
-0.31 0.73 -0.18 -0.41 -0.3 0.11
-1.5 0.92 0.41 -0.0 -0.0 -1.24
-0.11 0.82 -0.2 -0.47 -0.23 -0.23
-1.22 1.04 -0.36 0.45 -0.15 -1.11
-0.28 0.63 0.04 -0.23 0.15 -0.65
-0.41 0.57 0.17 -0.08 0.01 -0.53
-1.15 1.49 -0.12 -0.47 -0.62 -1.16
-0.31 0.86 0.04 -0.11 -0.08 -1.05
- 1.98 -0.75 -0.02 -2.63 -1.66
- 1.36 0.22 - 1.18 -
-0.36 0.68 -0.08 -0.21 0.04 -0.34
-1.1 1.24 -0.03 0.32 -0.27 -3.1
- 1.65 1.2 - -0.83 -
-0.34 0.95 -0.15 -0.07 -0.21 -0.83
-0.35 0.56 -0.72 0.18 -0.14 0.13
-0.41 0.58 0.02 0.09 -0.4 -0.12
-1.06 0.69 0.21 0.1 -0.4 -0.12
-0.9 0.4 -0.05 0.19 0.63 -1.03
0.13 0.46 -0.19 0.06 -0.07 -0.62
0.04 0.64 -0.49 -0.35 0.12 -0.27
-0.76 1.24 -2.15 0.09 0.71 -2.98
-1.42 0.93 -0.19 0.42 0.46 -2.98
-0.61 1.17 -0.03 -0.47 -0.17 -0.98
- 1.37 0.51 -0.77 0.49 -
0.2 1.23 -0.7 0.27 -1.33 -1.79
-1.0 0.7 0.32 -0.2 0.05 -0.48
-0.1 0.6 -0.16 -0.2 -0.26 -0.07
-0.4 0.79 -0.08 -0.67 0.05 -0.15
-0.56 0.75 0.19 -0.14 -0.03 -0.72
- 2.39 - - -0.37 -
0.04 0.55 -0.2 -0.36 -0.05 -0.18
-0.97 0.4 0.47 0.3 0.57 -3.85
-0.54 0.38 0.35 -0.07 -0.08 -0.25
-0.03 0.54 -0.13 -0.15 -0.03 -0.37
- 1.49 -0.53 0.6 -0.01 -
-0.19 0.49 -0.13 -0.21 0.02 -0.1
-0.28 0.84 -0.07 -0.1 -0.15 -0.73
-0.7 0.83 0.25 -0.78 -0.34 0.06
-2.07 1.15 0.65 -0.06 -0.13 -3.33
-1.86 1.51 -1.4 -0.33 0.45 -1.58
-1.11 0.87 0.19 0.09 0.02 -1.03
-0.29 0.67 0.03 -0.14 -0.08 -0.47
0.44 0.26 -0.58 -0.03 -0.08 -0.23
-0.26 0.57 -0.08 -0.13 0.03 -0.32
-0.42 1.43 -0.42 -0.55 -0.02 -2.84
- 1.68 0.38 -1.83 0.27 -
-0.06 0.94 0.26 -0.61 0.07 -2.19
-1.69 1.66 -0.04 -0.22 -1.17 -1.92
- 0.29 0.87 0.38 0.72 -
-0.16 0.62 -0.06 -0.26 -0.43 0.05
0.01 0.84 -0.96 0.03 -0.26 -0.28
-0.62 0.88 -0.18 -0.38 -0.12 -0.1
-1.26 1.28 0.08 -0.18 -0.6 -0.86
- 1.61 -1.18 0.3 -0.27 -1.18
-0.34 0.55 0.07 0.16 -0.05 -0.71
-0.4 0.53 0.2 0.06 0.22 -1.17
-0.25 0.51 -0.28 0.12 -0.23 -0.03
0.16 0.43 -0.36 -0.46 0.04 0.0
- 1.24 0.17 -1.96 1.0 -2.02
-0.69 1.01 -0.01 -0.28 0.25 -1.48
-0.46 0.95 -0.03 -0.39 0.13 -0.99
-1.7 1.19 -0.0 -0.17 -0.06 -0.81
-2.2 1.15 -0.39 0.05 0.67 -2.48
-0.88 1.04 -0.36 0.17 -0.67 -0.2
-0.63 0.93 0.19 -0.25 0.34 -2.26
-1.81 1.41 0.3 0.0 -0.84 -1.87
-1.78 1.17 -0.21 0.38 -0.59 -0.65
-1.09 0.91 0.55 0.34 -0.41 -2.53
-1.27 0.96 0.2 0.29 -0.03 -1.81
- 2.3 - - 0.12 -
- 1.44 -0.4 0.25 0.42 -
-0.01 0.7 -0.18 -0.35 -0.01 -0.46
- 1.05 0.32 0.71 -0.4 -1.83
-1.44 1.36 -0.04 -0.15 -0.33 -1.35
-0.45 1.18 0.06 -0.27 -0.47 -1.27
-0.31 0.66 -0.05 -0.09 -0.04 -0.45
-0.9 1.03 -0.07 -0.72 0.89 -
-1.52 1.43 0.46 -0.24 -1.03 -1.98
-0.61 0.65 0.13 0.07 0.11 -0.85
-0.22 1.13 -0.2 -0.34 -0.39 -0.94
-1.04 0.71 -0.04 0.13 0.23 -0.64
-0.5 0.63 0.18 -0.13 -0.08 -0.41
-0.78 0.78 0.02 0.09 -0.05 -0.61
-0.39 0.46 -0.16 -0.12 0.12 -0.06
-0.73 0.66 -0.14 0.12 0.3 -0.76
-1.92 1.14 -0.13 0.69 -0.36 -2.12
-0.2 1.18 0.88 -0.87 -1.04 -
-2.76 1.29 0.48 0.05 -0.67 -1.51
-5.02 1.22 0.53 0.31 -0.25 -3.07
-0.34 0.66 0.23 -0.3 0.04 -0.69
-1.64 0.99 0.23 0.34 0.05 -2.2
- 2.43 -1.98 -1.45 - -
-0.6 1.92 - -0.93 0.06 -
-0.39 0.7 -0.09 -0.17 0.26 -0.8
-0.44 1.3 -0.49 -0.41 -0.28 -0.95
-1.48 0.68 0.09 0.03 0.01 -0.09
- 1.67 - - 1.5 -
-2.4 1.73 -0.32 -0.43 -0.2 -3.58
-0.54 1.25 -0.46 0.08 -0.63 -1.01
-0.55 0.96 -1.12 0.22 0.8 -
-0.56 0.8 -0.06 -0.43 0.1 -0.29
-0.75 1.05 0.07 -0.57 -0.32 -0.3
-0.03 0.94 -0.47 -0.22 -0.24 -0.58
-1.26 0.52 -0.05 -0.07 0.27 0.03
-1.37 0.91 0.03 0.12 -0.48 -0.15
-1.48 1.31 -0.12 -0.07 0.01 -1.84
- 2.41 -3.5 - -0.71 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.