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Heatmap: Cluster_59 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
2 h after light
6 h after light
10 h after light
14 h after light
18 h after light
2 h after dark
0.33 -0.42 -0.12 0.04 0.19 -0.15
0.41 -0.78 -0.2 0.73 0.16 -1.16
0.39 -0.28 -0.28 0.12 0.26 -0.4
0.18 -0.22 -0.18 0.05 0.16 -0.04
0.17 -0.31 -0.23 0.05 0.27 -0.03
0.45 -0.33 -0.26 0.0 0.18 -0.19
0.34 -0.18 -0.18 -0.11 0.02 0.04
0.18 -0.15 -0.2 0.02 0.21 -0.1
0.11 -0.05 -0.07 0.22 0.04 -0.29
0.14 -0.46 -0.16 0.31 0.37 -0.41
0.19 -0.29 -0.07 0.29 0.28 -0.61
0.32 -0.33 -0.04 0.13 0.2 -0.44
0.25 -0.42 0.05 0.2 0.38 -0.79
0.0 -0.03 0.09 0.26 0.43 -1.28
0.25 -0.55 -0.06 0.28 0.48 -0.85
0.29 -0.43 -0.35 0.07 0.32 -0.08
0.3 -0.36 -0.12 -0.02 0.21 -0.12
0.29 -0.19 -0.23 0.07 0.21 -0.26
-0.04 -0.2 -0.12 0.32 0.35 -0.49
0.23 -0.25 -0.01 0.24 0.27 -0.74
0.12 -0.31 -0.03 0.29 0.31 -0.57
0.19 -0.27 -0.24 0.01 0.21 0.03
-0.01 -0.24 -0.12 0.27 0.42 -0.51
0.08 -0.22 0.01 0.09 0.45 -0.63
0.18 -0.19 -0.15 0.02 0.11 -0.01
0.24 -0.33 -0.27 0.12 0.34 -0.26
0.36 -0.4 -0.21 0.09 0.15 -0.13
0.21 -0.41 -0.14 0.12 0.3 -0.21
0.19 -0.21 -0.07 0.18 0.17 -0.36
0.3 -0.25 -0.03 -0.05 0.07 -0.1
0.33 -0.39 -0.24 0.09 0.19 -0.11
0.27 -0.22 -0.17 -0.01 0.16 -0.09
0.29 -0.4 -0.15 0.11 0.18 -0.13
0.42 -0.27 -0.3 0.04 0.22 -0.27
0.13 -0.21 -0.13 0.09 0.35 -0.33
0.18 -0.3 -0.07 0.28 0.21 -0.45
0.42 -0.3 -0.19 0.09 0.17 -0.37
0.36 -0.11 -0.03 0.27 0.19 -1.11
0.22 -0.32 -0.13 0.24 0.28 -0.47
0.2 -0.37 -0.11 0.14 0.23 -0.19
0.26 -0.15 -0.27 0.01 0.12 -0.04
0.38 -0.29 -0.41 0.08 0.32 -0.28
0.2 -0.38 -0.24 0.3 0.22 -0.25
0.28 -0.13 -0.21 0.04 0.11 -0.16
0.26 -0.21 -0.12 0.01 0.16 -0.15
0.42 -0.4 -0.36 0.04 0.13 -0.0
0.16 -0.17 -0.21 0.02 0.23 -0.09
0.17 -0.03 -0.08 0.17 0.35 -0.87
0.15 -0.25 -0.24 0.15 0.43 -0.41
0.16 -0.09 0.03 0.14 0.15 -0.49
0.32 -0.4 -0.24 0.12 0.2 -0.13
0.34 -0.48 -0.16 0.12 0.25 -0.23
0.28 -0.33 -0.13 -0.05 0.21 -0.07
0.16 -0.24 -0.09 0.22 0.18 -0.31
0.35 -0.39 -0.36 0.02 0.22 0.0
0.47 -0.52 -0.12 0.19 0.41 -0.91
0.27 -0.36 -0.21 -0.02 0.46 -0.33
0.28 -0.5 0.17 0.17 0.26 -0.66
0.28 -0.27 -0.2 0.05 0.32 -0.32
0.32 -0.25 -0.21 0.01 0.13 -0.07
0.17 -0.35 0.03 0.54 0.3 -1.42
0.23 -0.21 -0.27 0.06 0.16 -0.03
0.23 -0.29 -0.18 0.17 0.21 -0.24
0.11 -0.13 0.09 0.35 0.33 -1.25
0.36 -0.33 -0.05 0.07 0.15 -0.31
0.24 -0.21 -0.23 0.12 0.37 -0.46
0.34 -0.47 -0.09 0.15 0.31 -0.45
0.2 -0.27 -0.18 0.04 0.23 -0.09
-0.26 -0.08 -0.11 0.2 0.35 -0.19
0.2 -0.27 -0.21 0.0 0.12 0.09
0.27 -0.3 0.0 0.2 0.27 -0.68
0.46 -0.26 -0.09 0.02 0.23 -0.6
0.31 -0.13 -0.24 0.1 0.16 -0.31
0.19 -0.32 -0.15 0.4 0.22 -0.57
0.23 -0.21 -0.14 0.08 0.13 -0.15
0.25 -0.27 -0.0 0.26 0.1 -0.48
0.27 -0.43 -0.28 0.06 0.23 0.01
0.12 -0.43 -0.11 0.23 0.35 -0.32
0.27 -0.19 -0.18 -0.06 0.04 0.06
0.26 -0.3 -0.21 0.18 0.32 -0.43
0.28 -0.28 -0.23 0.12 0.3 -0.34
0.23 -0.27 -0.19 0.02 0.18 -0.04
0.36 -0.12 -0.07 0.03 0.08 -0.38
0.23 -0.11 -0.12 0.16 0.17 -0.43
0.22 -0.28 -0.08 0.18 0.2 -0.35
0.25 -0.39 -0.21 0.26 0.33 -0.45
0.01 -0.08 -0.17 0.22 0.29 -0.37
-0.25 -0.14 -0.15 0.18 0.36 -0.1
0.38 -0.14 -0.43 0.03 0.39 -0.48
0.19 -0.49 0.19 0.44 0.3 -1.25
0.39 -0.36 -0.29 0.24 0.25 -0.47
0.07 -0.41 -0.1 0.2 0.33 -0.22
0.35 -0.52 -0.24 0.14 0.36 -0.33
0.1 -0.15 -0.09 0.11 0.25 -0.28
0.22 -0.24 -0.09 0.19 0.3 -0.53
0.04 -0.22 -0.1 0.12 0.39 -0.34
0.22 -0.21 -0.19 0.08 0.18 -0.15
0.35 -0.26 -0.2 -0.0 0.16 -0.14
0.33 -0.21 -0.25 0.07 0.08 -0.11
0.31 -0.09 0.02 0.25 0.24 -1.19
0.24 -0.38 -0.04 0.19 0.17 -0.29
0.29 -0.4 -0.24 0.08 0.27 -0.14
0.14 -0.14 -0.1 -0.02 0.26 -0.2
0.13 -0.37 -0.09 0.2 0.32 -0.32
0.23 -0.31 -0.13 0.03 0.16 -0.05
0.2 -0.14 -0.31 0.06 0.31 -0.22
0.73 -0.55 -0.35 0.21 0.46 -1.57
0.29 -0.08 -0.21 0.09 0.15 -0.34
0.59 -0.48 -0.35 0.09 0.4 -0.71
0.12 -0.19 -0.16 0.02 0.06 0.12
0.35 -0.29 -0.25 -0.06 0.11 0.04
0.12 0.0 -0.08 0.05 0.13 -0.26
0.29 -0.21 -0.26 -0.05 0.11 0.03
0.31 -0.23 -0.2 0.08 0.24 -0.32
0.17 -0.34 -0.07 0.35 0.32 -0.73
0.17 -0.24 -0.16 0.1 0.22 -0.15
0.17 -0.03 -0.08 0.19 0.12 -0.47
0.22 -0.24 -0.07 0.02 0.01 0.02
0.26 -0.32 -0.12 0.24 0.18 -0.38
0.25 -0.3 -0.14 0.19 0.27 -0.45
0.29 -0.2 -0.2 0.1 0.16 -0.24
0.16 -0.41 -0.18 0.22 0.19 -0.09
0.18 -0.29 -0.22 0.24 0.31 -0.38
0.12 -0.34 0.05 0.3 0.36 -0.81
0.37 -0.33 -0.17 0.2 0.23 -0.51
0.19 -0.27 -0.14 -0.02 0.15 0.05
0.21 -0.36 -0.11 0.36 0.31 -0.7
0.21 -0.16 -0.07 0.21 0.21 -0.56
0.12 -0.08 0.03 0.1 0.16 -0.4
0.25 -0.34 -0.21 0.14 0.27 -0.24
0.29 -0.52 -0.01 0.18 0.29 -0.45
0.47 -0.28 -0.15 0.19 0.25 -0.84
0.18 -0.32 -0.06 0.25 0.16 -0.33
0.47 -0.58 0.01 0.4 0.27 -1.28
0.19 -0.16 -0.09 0.2 0.31 -0.64
0.23 -0.14 -0.1 -0.01 0.19 -0.22
0.19 -0.34 -0.15 0.21 0.29 -0.35
0.23 -0.32 -0.01 0.18 0.25 -0.48
0.19 -0.23 -0.15 -0.04 0.1 0.09
0.18 -0.18 -0.09 0.05 0.05 -0.03
0.12 -0.09 -0.01 0.02 0.48 -0.83
0.34 -0.32 -0.17 0.09 0.23 -0.31
0.17 -0.19 -0.21 0.03 0.15 0.01
0.34 -0.34 -0.38 0.12 0.2 -0.09
0.25 -0.3 -0.27 0.05 0.09 0.09
0.27 0.17 -0.4 0.11 0.43 -1.02
0.11 -0.11 -0.05 0.24 0.12 -0.39
0.46 -0.25 -0.3 0.02 0.28 -0.45
0.32 -0.41 0.24 0.2 0.2 -0.93
0.26 -0.24 -0.23 0.23 0.36 -0.63
0.37 -0.36 -0.16 0.15 0.16 -0.3
0.48 -0.45 -0.33 0.18 0.2 -0.34
0.09 -0.32 -0.19 0.21 0.31 -0.21
0.31 -0.29 -0.23 0.12 0.09 -0.09
0.2 -0.2 -0.26 -0.02 0.16 0.05
0.29 -0.19 -0.04 -0.09 0.13 -0.15
0.13 -0.09 -0.16 0.13 0.39 -0.57
0.1 -0.39 0.03 0.31 0.34 -0.64
0.25 -0.2 -0.0 0.22 0.32 -0.92
0.57 -0.29 -0.12 -0.1 -0.01 -0.23
0.62 -0.15 -0.31 0.01 0.35 -1.09
0.22 -0.3 -0.19 0.04 0.23 -0.08
0.14 -0.38 -0.1 0.17 0.25 -0.18
-0.26 -0.12 -0.01 0.22 0.42 -0.42
0.17 -0.18 -0.04 0.18 0.26 -0.55
0.22 -0.24 -0.33 0.02 0.26 -0.03
0.22 -0.22 -0.17 0.03 0.13 -0.05
0.39 -0.38 -0.27 0.05 0.31 -0.29
0.25 -0.53 0.06 0.2 0.45 -0.84
0.35 -0.24 -0.07 -0.03 0.02 -0.11
0.2 -0.2 -0.16 0.14 0.22 -0.29
0.23 -0.28 -0.23 0.05 0.16 -0.0
0.31 -0.26 -0.14 0.13 0.18 -0.35

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.