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Heatmap: Cluster_80 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
2 h after light
6 h after light
10 h after light
14 h after light
18 h after light
2 h after dark
-1.55 -1.47 0.63 0.12 0.59 0.21
- - 1.64 - 0.22 0.78
-0.53 -0.2 0.45 0.21 -0.57 0.3
-1.02 0.02 0.86 0.01 -0.35 -0.17
1.9 - 0.11 -0.58 - -0.99
0.57 -0.63 0.07 0.28 0.3 -1.44
-0.52 0.69 -0.66 0.96 - 0.15
0.88 1.39 - 0.63 - -
-0.24 0.56 0.08 -0.07 0.52 -2.12
-0.33 -0.68 0.1 0.36 0.48 -0.26
-0.19 -0.37 -0.03 0.18 0.08 0.24
0.26 -0.8 -0.62 -1.08 0.47 0.78
0.68 0.53 -0.63 -0.84 0.12 -0.61
- -0.41 0.82 -0.07 0.49 0.17
0.42 -0.07 -0.31 -0.07 -0.12 0.05
- 0.43 0.15 0.58 1.04 -
0.51 -0.66 -0.21 0.18 0.16 -0.27
0.25 -0.75 -0.31 0.33 0.5 -0.44
-0.19 -0.25 0.06 0.13 0.24 -0.05
0.42 0.41 -0.53 0.91 -0.39 -
-0.69 0.18 -0.11 0.53 0.38 -0.8
0.17 -0.32 -0.5 0.06 -0.07 0.46
0.4 -0.33 -0.35 0.35 0.28 -0.71
- 1.07 -0.52 0.87 -1.94 0.16
-0.18 0.1 -0.36 0.49 -0.35 0.11
0.08 -1.75 0.33 0.8 -2.6 0.57
0.58 0.34 -0.36 0.1 0.08 -1.57
0.54 -0.36 0.01 0.12 -0.02 -0.53
0.01 0.04 -0.13 -0.07 0.1 0.05
2.58 - - - - -
0.13 -1.0 0.02 -0.25 0.21 0.47
-1.44 -0.46 0.08 0.5 0.31 0.25
- - 1.49 1.67 - -
0.3 -0.47 -0.91 0.51 0.2 -0.08
0.11 0.14 -0.01 -0.19 -0.03 -0.05
0.48 -0.84 -1.05 0.28 0.68 -0.41
-0.42 1.16 0.26 0.35 -0.87 -
0.14 -0.35 -0.09 0.11 -0.18 0.27
- 0.94 0.96 1.1 - -
-0.34 0.25 -0.36 0.56 0.26 -0.81
0.89 - - 0.86 -0.7 0.77
-0.39 1.23 -0.59 0.5 - -0.29
0.9 0.61 - 0.57 0.15 -
0.35 -0.46 -0.76 -0.63 0.58 0.35
0.22 0.12 -0.09 0.35 -0.0 -0.89
0.78 0.18 -0.28 -0.43 -0.06 -0.68
0.74 -1.94 -1.95 0.35 0.81 -0.36
0.13 -0.71 -0.95 -0.09 0.64 0.36
0.73 0.18 -0.06 -0.48 -0.67 -0.16
1.04 0.44 -0.55 -1.07 -0.2 -0.84
0.9 0.24 -1.1 -0.91 0.29 -0.45
1.0 -0.6 -0.81 0.03 -0.0 -0.4
-0.08 -0.2 -0.17 0.53 -0.02 -0.21
0.29 -0.3 -0.81 0.69 0.34 -0.97
0.49 -0.45 -0.26 0.57 0.35 -1.91
1.26 -3.09 -1.29 -0.35 -0.37 0.6
-0.48 0.27 0.32 0.31 -0.49 -0.19
-0.07 0.02 -0.31 -0.3 0.06 0.46
0.01 0.71 -0.19 -0.11 -0.67 -0.12
0.35 -0.47 -0.54 -0.34 0.5 0.14
-1.0 -0.38 -1.42 0.28 0.56 0.74
-0.07 -0.97 -0.86 -0.15 -0.22 1.15
0.56 0.93 -1.29 0.15 - 0.14
0.31 -0.24 -0.27 0.3 -0.46 0.18
- -0.14 - 1.45 0.47 -0.04
0.06 -0.27 -0.18 -0.02 0.21 0.13
0.05 -0.05 0.13 -0.07 -0.48 0.31
0.76 0.87 -2.08 0.24 -0.18 -2.48
0.32 0.03 0.82 0.12 -1.13 -1.25
0.12 -1.07 0.09 -0.81 0.6 0.36
1.13 -0.07 -0.15 -0.47 -0.45 -0.99
-0.33 0.79 0.67 0.57 - -1.34
0.76 0.15 -0.25 -0.35 -0.3 -0.39
-0.25 -0.51 -0.6 0.59 0.66 -0.5
0.92 0.29 -1.36 -0.27 0.1 -0.73
-0.01 -0.29 0.07 0.28 0.14 -0.29
0.47 -1.11 -1.53 -0.13 0.47 0.59
0.01 - - 1.31 0.62 -0.04
0.38 -0.29 -0.45 0.39 0.42 -0.99
-0.62 0.06 -0.08 0.23 0.36 -0.16
- 0.72 - 0.88 1.33 -
1.25 - - 1.0 - 0.69
-0.25 -0.74 -0.0 0.33 0.1 0.31
0.75 -0.98 -1.15 0.83 -0.06 -0.68
0.6 -1.39 -1.0 -0.03 0.47 0.31
0.51 -0.1 -0.74 0.54 -0.58 -0.12
0.18 0.09 -0.21 0.36 -0.55 -0.04
0.14 -0.5 -0.44 0.44 -0.02 0.15
0.15 0.09 -0.18 -0.07 0.32 -0.45
0.23 0.21 0.11 -0.18 0.17 -0.76
0.47 -0.88 0.18 0.02 -0.07 -0.05
-0.39 -0.37 -0.03 0.4 0.08 0.14
0.24 -0.11 0.03 -0.03 0.1 -0.28
0.83 -1.12 -1.37 0.91 -0.39 -0.45
0.77 0.02 -0.08 -0.25 0.1 -1.25
- - 1.04 0.24 0.7 0.18
0.25 -0.05 -0.23 -0.02 0.06 -0.06
0.06 -0.16 -0.34 0.1 0.19 0.09
0.37 -1.03 0.01 -0.09 0.5 -0.23
0.59 -1.05 0.02 0.58 -0.08 -0.88
-1.53 -0.09 0.13 0.52 0.33 -0.12
0.3 -1.03 0.2 0.42 0.18 -0.62
0.3 - -1.27 1.56 -1.14 -0.07
0.82 -0.03 -0.33 -1.03 -0.17 0.1
0.44 -0.3 0.1 0.11 -0.33 -0.17
0.09 -0.1 -0.05 0.13 -0.03 -0.05
1.19 - -0.22 1.07 -0.4 -
-0.4 -0.29 -0.57 -0.13 1.11 -0.56
1.04 - - 1.5 -0.43 -1.4
-0.14 -0.17 0.05 0.05 0.2 -0.01
0.22 0.16 0.27 0.34 -0.14 -1.56
0.99 -0.07 -0.3 -0.56 -0.26 -0.44
0.02 0.02 -0.01 0.27 -0.17 -0.18
0.25 -0.2 -0.68 -0.21 0.17 0.41
0.23 -0.33 -0.17 -0.01 0.23 -0.04
-0.61 0.55 0.14 0.55 -1.7 0.01
0.47 1.33 -1.1 0.28 -1.28 -
0.24 -0.12 -0.25 -0.04 -0.4 0.4
-0.3 -0.45 0.33 0.19 -0.32 0.34
- 1.03 0.75 1.19 - -
0.19 -0.02 -0.23 0.04 -0.01 -0.02
0.24 -0.51 -0.62 0.38 0.65 -0.74
-0.27 -0.36 -0.22 0.23 0.41 0.04
0.49 -0.03 -0.73 0.25 -0.07 -0.2
0.1 0.03 -0.19 -0.2 0.1 0.12
-0.11 -0.82 0.89 0.16 -0.47 -0.3
-0.24 -0.07 0.27 0.15 0.12 -0.33
-0.0 -0.28 -0.05 0.13 -0.38 0.43
0.81 -0.69 -0.6 0.57 -0.22 -0.71
-0.01 -1.14 - 1.2 -0.23 0.48
0.4 -0.16 - 1.02 -0.21 -0.16
0.18 -0.27 -0.48 0.11 0.28 0.04
0.77 0.22 -0.09 -0.48 -0.26 -0.65
0.99 -0.45 0.5 -0.26 0.05 -
-0.1 -1.84 -1.04 0.48 1.09 -0.36
-0.57 -1.31 -0.07 0.7 0.8 -0.74
-1.3 0.13 -0.08 0.08 0.32 0.33
1.5 - - 0.77 -0.46 -0.42
0.64 0.42 0.41 -1.0 -0.71 -0.59
- -0.23 0.25 0.9 -0.11 0.23
-0.48 -0.74 0.06 0.43 -0.74 0.76
2.03 - - 0.93 - -
1.22 -0.43 0.22 0.42 -2.25 -2.2
0.83 0.54 0.36 -0.68 - -0.22
0.0 0.02 -0.22 -0.41 -0.25 0.62
0.15 -0.33 -0.11 -0.1 0.03 0.28
0.33 0.05 - 1.14 0.58 -
0.74 -0.2 -0.3 0.25 -0.04 -1.07
-1.05 -1.34 -0.84 1.02 1.05 -1.13
-0.1 -0.37 0.23 0.12 0.1 -0.05
0.26 -0.37 -0.09 0.03 0.23 -0.16
0.12 -0.14 -0.24 -0.21 0.2 0.2
- 0.11 1.28 1.32 - -
0.05 -0.13 -0.25 -0.04 0.14 0.18
0.11 -0.58 0.2 0.3 0.16 -0.39

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.