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Heatmap: Cluster_1 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
2 h after light
6 h after light
10 h after light
14 h after light
18 h after light
2 h after dark
0.03 -0.13 -0.27 -0.21 -0.1 0.53
-0.06 -0.31 -0.29 -0.19 -0.24 0.76
-0.18 -0.23 -0.46 -0.29 -0.17 0.88
-0.17 -0.14 -0.17 -0.11 -0.29 0.65
-0.08 -0.17 -0.3 -0.23 -0.21 0.71
0.02 -0.23 -0.21 -0.27 -0.27 0.69
-0.13 -0.22 -0.28 -0.17 -0.15 0.68
-0.06 -0.38 -0.2 -0.16 -0.22 0.72
0.12 -0.09 -0.33 -0.33 -0.22 0.61
0.05 -0.46 -0.4 -0.37 -0.17 0.86
0.08 -0.09 -0.23 -0.44 -0.29 0.67
0.03 -0.31 -0.21 -0.2 -0.08 0.58
-0.11 -0.2 -0.44 -0.27 -0.23 0.83
-0.38 -0.17 -0.17 -0.2 -0.3 0.82
0.06 0.01 -0.32 -0.35 -0.11 0.52
-0.29 -0.23 -0.43 -0.1 -0.37 0.9
-0.12 -0.19 -0.27 -0.11 -0.02 0.55
0.06 -0.16 -0.34 -0.24 -0.08 0.57
-0.08 -0.38 -0.32 -0.2 -0.26 0.83
0.04 -0.13 -0.36 -0.16 -0.07 0.52
-0.06 -0.22 -0.3 -0.26 -0.1 0.68
0.1 -0.32 -0.3 -0.2 -0.14 0.62
0.06 -0.28 -0.27 -0.26 -0.09 0.61
-0.16 -0.43 -0.36 -0.27 -0.34 0.97
-0.04 -0.29 -0.28 -0.25 -0.1 0.69
-0.1 -0.05 -0.35 -0.28 -0.31 0.75
0.06 -0.49 -0.63 -0.41 -0.35 1.04
0.12 -0.22 -0.38 -0.28 -0.18 0.66
-0.14 -0.27 -0.26 -0.06 -0.08 0.61
-0.01 -0.36 -0.17 -0.17 -0.25 0.69
-0.09 -0.54 -0.26 -0.11 -0.15 0.78
-0.16 -0.14 -0.36 -0.2 -0.16 0.72
-0.31 -0.41 -0.25 -0.07 -0.08 0.77
-0.06 -0.12 -0.17 -0.19 -0.25 0.6
0.07 -0.32 -0.28 -0.09 -0.2 0.6
-0.02 -0.28 -0.33 -0.26 -0.05 0.68
-0.15 -0.43 -0.15 -0.19 -0.22 0.78
-0.04 -0.27 -0.26 -0.16 -0.13 0.64
-0.15 -0.19 -0.32 -0.08 -0.17 0.66
-0.02 -0.13 -0.18 -0.22 -0.2 0.58
0.09 -0.23 -0.35 -0.28 -0.15 0.65
-0.28 -0.61 -0.28 -0.13 -0.27 0.97
-0.02 -0.26 -0.38 -0.35 -0.33 0.87
-0.12 -0.44 -0.39 -0.13 -0.34 0.91
-0.12 -0.25 -0.16 -0.1 -0.11 0.57
-0.0 -0.25 -0.52 -0.45 -0.18 0.89
-0.61 -0.09 -0.2 -0.06 -0.1 0.72
-0.05 -0.36 -0.22 -0.18 -0.21 0.72
0.09 -0.33 -0.22 -0.09 -0.27 0.6
-0.04 -0.12 -0.14 -0.4 -0.19 0.65
0.02 -0.17 -0.06 -0.18 -0.14 0.42
-0.28 -0.14 -0.29 -0.34 -0.27 0.87
0.09 -0.32 -0.43 -0.25 -0.07 0.68
-0.05 -0.3 -0.24 -0.05 -0.03 0.52
0.1 -0.28 -0.19 -0.29 -0.24 0.65
-0.17 -0.3 -0.29 -0.16 -0.07 0.71
-0.02 -0.35 -0.33 -0.24 -0.19 0.77
0.05 -0.24 -0.33 -0.06 -0.03 0.47
-0.07 -0.19 -0.22 -0.28 -0.17 0.68
-0.05 -0.11 -0.29 -0.27 -0.08 0.6
-0.07 -0.09 -0.26 -0.18 -0.06 0.52
0.01 -0.2 -0.28 -0.16 -0.19 0.62
0.0 -0.21 -0.24 -0.2 -0.12 0.58
0.05 -0.23 -0.27 -0.21 -0.11 0.58
-0.12 -1.0 -1.03 -0.4 -0.74 1.45
0.05 -0.1 -0.27 -0.19 -0.09 0.47
0.05 -0.23 -0.25 -0.24 -0.26 0.68
-0.14 -0.15 -0.3 -0.16 -0.06 0.61
-0.08 -0.15 -0.24 -0.27 -0.18 0.68
-0.02 -0.31 -0.37 -0.23 -0.07 0.71
-0.06 -0.18 -0.31 -0.18 -0.07 0.6
0.02 -0.25 -0.2 -0.14 -0.2 0.58
-0.06 -0.11 -0.37 -0.28 -0.09 0.66
0.07 -0.13 -0.31 -0.16 -0.01 0.42
-0.25 -0.41 -0.32 -0.08 -0.05 0.76
-0.08 -0.33 -0.32 -0.29 -0.49 0.94
0.05 -0.13 -0.24 -0.3 -0.28 0.65
-0.19 -0.25 -0.15 -0.24 -0.22 0.74
0.18 -0.17 -0.38 -0.34 -0.1 0.57
0.02 -0.2 -0.27 -0.17 -0.11 0.56
0.02 -0.28 -0.42 -0.3 -0.24 0.81
-0.38 -0.04 -0.37 -0.11 -0.08 0.69
-0.01 -0.27 -0.24 -0.1 -0.12 0.56
-0.09 -0.06 -0.25 -0.12 -0.09 0.49
-0.02 -0.13 -0.33 -0.14 -0.09 0.55
0.02 -0.2 -0.29 -0.12 -0.21 0.59
0.04 -0.08 -0.23 -0.31 -0.26 0.62
-0.07 -0.18 -0.3 -0.26 -0.16 0.7
0.05 -0.38 -0.37 -0.15 -0.06 0.64
0.02 -0.13 -0.41 -0.43 -0.02 0.67
0.01 -0.2 -0.19 -0.23 -0.34 0.69
0.1 -0.16 -0.34 -0.23 -0.2 0.6
0.06 -0.33 -0.25 -0.13 -0.04 0.52
-0.03 -0.25 -0.32 -0.13 -0.03 0.57
-0.04 -0.43 -0.4 -0.27 -0.21 0.88
-0.13 -0.42 -0.21 -0.11 -0.04 0.66
-0.03 -0.26 -0.37 -0.18 -0.14 0.69
0.0 -0.07 -0.29 -0.16 -0.08 0.47
-0.36 -0.38 -0.28 -0.4 -0.3 1.04
0.04 -0.3 -0.2 -0.2 -0.14 0.6
0.08 -0.23 -0.3 -0.23 -0.09 0.57
-0.04 -0.39 -0.36 -0.08 -0.18 0.73
0.02 -0.16 -0.28 -0.17 -0.31 0.65
0.04 -0.57 -0.54 -0.4 -0.25 1.01
0.09 -0.41 -0.39 -0.3 -0.16 0.78
0.05 -0.15 -0.41 -0.35 -0.28 0.77
-0.24 -0.35 -0.13 -0.12 -0.17 0.72
-0.11 -0.2 -0.34 -0.08 -0.07 0.6
0.09 -0.18 -0.28 -0.24 -0.19 0.59
-0.01 -0.24 -0.34 -0.16 -0.11 0.63
-0.17 -0.4 -0.27 -0.29 -0.47 0.99
0.02 -0.15 -0.23 -0.17 -0.17 0.54
0.02 -0.35 -0.3 -0.23 -0.2 0.73
-0.05 -0.28 -0.39 -0.25 -0.19 0.79
0.12 -0.12 -0.3 -0.23 -0.24 0.57
-0.35 -0.28 -0.54 -0.22 -0.18 0.97
-0.19 -0.21 -0.25 -0.1 -0.27 0.73
0.08 -0.14 -0.31 -0.2 -0.14 0.54
-0.21 -0.35 -0.34 -0.14 -0.06 0.77
-0.02 -0.18 -0.41 -0.24 -0.21 0.73
-0.02 -0.25 -0.2 -0.29 -0.27 0.73
-0.01 -0.22 -0.29 -0.11 -0.1 0.55
0.01 -0.11 -0.22 -0.16 -0.11 0.47
-0.03 -0.26 -0.43 -0.27 -0.21 0.81
-0.26 -0.42 -0.45 -0.22 -0.15 0.95
0.02 -0.19 -0.33 -0.13 -0.05 0.52
-0.31 -0.25 -0.13 -0.18 -0.17 0.73
-0.15 -0.17 -0.31 -0.28 -0.07 0.7
-0.0 -0.48 -0.39 -0.05 -0.1 0.7
-0.07 -0.35 -0.29 -0.18 -0.23 0.78
0.09 -0.15 -0.26 -0.26 -0.23 0.59
0.11 -0.34 -0.36 -0.32 -0.32 0.81
-0.16 -0.3 -0.22 -0.09 -0.22 0.7
0.1 -0.23 -0.33 -0.18 -0.11 0.55
-0.09 -0.66 -0.83 -0.48 -0.32 1.23
-0.03 -0.45 -0.55 -0.4 -0.41 1.07
0.04 -0.38 -0.34 -0.4 -0.43 0.93
0.03 -0.18 -0.4 -0.35 -0.1 0.7
0.04 -0.3 -0.38 -0.25 -0.21 0.76
-0.01 -0.15 -0.26 -0.28 -0.22 0.67
-0.06 -0.49 -0.39 -0.1 -0.27 0.85
-0.02 -0.2 -0.36 -0.3 -0.12 0.71
0.05 -0.38 -0.33 -0.16 -0.13 0.67
-0.03 -0.29 -0.2 -0.22 -0.29 0.73
0.05 -0.11 -0.35 -0.34 -0.25 0.7
-0.0 -0.18 -0.34 -0.17 -0.01 0.53
0.02 -0.09 -0.33 -0.22 -0.09 0.55
0.09 -0.29 -0.31 -0.15 -0.15 0.59
0.06 -0.32 -0.41 -0.32 -0.1 0.74
0.09 -0.35 -0.44 -0.14 -0.01 0.6
-0.4 -0.28 -0.24 -0.18 -0.24 0.88
-0.08 -0.25 -0.27 -0.14 -0.14 0.65
-0.12 -0.43 -0.33 -0.08 -0.1 0.74
-0.29 -0.05 -0.43 -0.07 -0.02 0.63
-0.11 -0.22 -0.37 -0.24 -0.43 0.89
-0.17 -0.25 -0.41 -0.21 -0.05 0.76
-0.07 -0.31 -0.51 -0.48 -0.37 1.03
-0.09 -0.46 -0.57 -0.42 -0.34 1.09
-0.16 -0.43 -0.16 -0.03 -0.23 0.71
-0.22 -0.2 -0.2 -0.22 -0.19 0.74
0.05 -0.23 -0.21 -0.19 -0.06 0.5
0.08 -0.28 -0.48 -0.49 -0.31 0.92
0.0 -0.25 -0.28 -0.15 -0.17 0.63
-0.09 -0.09 -0.37 -0.24 -0.12 0.66
0.08 -0.4 -0.45 -0.21 -0.02 0.68
-0.31 -0.27 -0.15 -0.23 -0.37 0.88
-0.11 -0.2 -0.18 -0.15 -0.08 0.56
0.03 -0.16 -0.36 -0.24 -0.21 0.67
-0.34 -0.06 -0.34 -0.18 -0.1 0.72
0.05 -0.16 -0.29 -0.19 -0.15 0.56
-0.08 -0.4 -0.31 -0.21 -0.23 0.83
0.02 -0.23 -0.25 -0.19 -0.24 0.65
0.05 -0.38 -0.55 -0.38 -0.3 0.95
-0.12 -0.61 -0.31 -0.38 -0.47 1.09
-0.12 -0.5 -0.17 -0.08 -0.19 0.73
-0.02 -0.26 -0.2 -0.16 -0.05 0.53
-0.16 -0.2 -0.26 -0.23 -0.23 0.76
0.07 -0.13 -0.41 -0.23 -0.14 0.61
-0.12 -0.14 -0.48 -0.51 -0.54 1.05
-0.22 -0.36 -0.29 -0.24 -0.24 0.89
0.11 -0.13 -0.27 -0.31 -0.15 0.55
-0.48 -0.42 -0.29 -0.17 -0.29 1.01
0.1 -0.19 -0.22 -0.21 -0.11 0.49
-0.06 -0.21 -0.34 -0.09 -0.01 0.54
-0.02 -0.24 -0.26 -0.2 -0.09 0.61
-0.71 -0.45 -0.27 -0.19 -0.28 1.09
-0.22 -0.62 -0.48 -0.16 -0.21 1.01
-0.14 -0.18 -0.23 -0.23 -0.11 0.67
0.08 -0.21 -0.27 -0.18 -0.15 0.55
0.09 -0.37 -0.32 -0.13 -0.12 0.61
0.01 -0.15 -0.36 -0.29 -0.15 0.67
-0.07 -0.33 -0.54 -0.19 -0.01 0.76
-0.12 -0.42 -0.33 -0.25 -0.11 0.82
-0.08 -0.24 -0.29 -0.24 -0.27 0.77
-0.11 -0.22 -0.13 -0.13 -0.15 0.57
0.01 -0.29 -0.38 -0.36 -0.32 0.87
-0.07 -0.29 -0.15 -0.13 -0.36 0.71
0.09 -0.16 -0.54 -0.28 -0.03 0.64
0.03 -0.36 -0.26 -0.27 -0.24 0.75
-0.03 -0.18 -0.34 -0.24 -0.15 0.68
-0.07 -0.16 -0.15 -0.13 -0.05 0.46
0.07 -0.18 -0.25 -0.2 -0.07 0.49
-0.23 -0.09 -0.23 -0.16 -0.12 0.63
0.07 -0.22 -0.2 -0.19 -0.17 0.54
-0.07 -0.2 -0.25 -0.11 -0.05 0.54
-0.52 -0.02 -0.17 0.01 -0.08 0.56
0.12 -0.23 -0.46 -0.35 -0.16 0.72
0.05 -0.29 -0.42 -0.23 -0.14 0.72
0.08 -0.24 -0.35 -0.24 -0.12 0.62
-0.06 -0.15 -0.34 -0.21 -0.13 0.65
-0.09 -0.17 -0.17 -0.09 -0.04 0.46
-0.42 -0.13 -0.23 -0.35 -0.15 0.85
-0.04 -0.34 -0.65 -0.37 -0.45 1.06
0.13 -0.19 -0.32 -0.23 -0.16 0.57
-0.11 -0.39 -0.27 -0.04 -0.13 0.67
0.19 -0.55 -0.44 -0.28 -0.42 0.9
-0.02 -0.29 -0.44 -0.22 0.04 0.65
0.06 -0.21 -0.34 -0.21 -0.2 0.65
-0.25 -0.48 -0.39 -0.09 -0.16 0.88
-0.31 -0.61 -0.22 0.06 -0.19 0.82
0.05 -0.23 -0.3 -0.24 -0.15 0.64
-0.3 -0.28 -0.53 -0.3 -0.29 1.04
-0.35 -0.03 -0.14 -0.16 -0.2 0.65
0.08 -0.15 -0.32 -0.45 -0.33 0.77
-0.6 -0.65 -0.25 0.05 -0.13 0.93
0.05 -0.26 -0.3 -0.25 -0.13 0.65
-0.17 -0.11 -0.39 -0.32 -0.19 0.8
-0.17 -0.3 -0.28 -0.06 -0.14 0.68
-0.03 -0.14 -0.19 -0.14 -0.19 0.54
-0.15 -0.42 -0.23 -0.11 -0.09 0.71
0.05 -0.29 -0.35 -0.26 -0.31 0.78
-0.11 -0.26 -0.39 -0.23 -0.09 0.76
0.04 -0.15 -0.31 -0.3 -0.16 0.64

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.