1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_60 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
2 h after light
6 h after light
10 h after light
14 h after light
18 h after light
2 h after dark
0.02 0.04 0.02 0.05 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
4.85 3.33 5.16 5.56 4.38 4.22
8.79 6.25 5.77 8.85 11.25 10.43
0.09 0.0 0.04 0.13 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01
47.68 34.09 37.88 41.38 39.6 31.24
2.0 1.6 0.49 1.12 1.17 1.91
0.89 0.55 1.25 1.43 1.57 1.02
5.63 2.82 3.29 4.12 4.27 3.28
0.06 0.06 0.03 0.04 0.08 0.06
0.0 0.0 0.01 0.04 0.03 0.0
0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.57 0.86 0.97 1.32 1.17 0.77
1.04 0.6 0.83 1.1 1.25 1.01
0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
0.03 0.02 0.03 0.05 0.05 0.01
0.14 0.12 0.17 0.17 0.08 0.09
0.45 0.4 0.5 0.57 0.45 0.42
0.15 0.05 0.05 0.0 0.11 0.12
0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0
0.38 0.0 0.32 0.81 0.35 0.0
0.76 0.12 0.22 0.26 0.4 0.31
0.97 0.6 0.82 0.85 0.99 0.55
0.95 0.36 0.66 0.82 0.79 0.47
0.0 0.13 0.23 0.51 0.58 0.15
6.4 4.54 4.19 6.1 6.25 4.26
0.15 0.13 0.06 0.0 0.0 0.07
3.31 2.04 1.8 2.88 2.28 2.43
0.33 0.0 0.13 0.3 0.11 0.29
0.04 0.04 0.0 0.0 0.03 0.04
3.61 2.8 2.48 2.35 3.59 1.97
1.81 1.01 1.58 1.53 1.85 0.82
0.76 0.47 0.41 0.5 0.56 0.65
0.28 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.13 0.03 0.03 0.27 0.22 0.0
0.25 0.19 0.46 0.36 0.42 0.43
0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
2.34 1.6 3.01 2.9 3.3 2.85
0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.05 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0
0.62 1.11 0.81 0.76 0.83 0.69
0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.0
0.47 0.0 0.22 0.48 0.21 0.0
0.24 0.2 1.19 1.02 0.77 0.24
0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.08 0.17 0.23 0.22 0.18 0.15
0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.0
1.88 0.74 0.94 1.57 1.44 3.35
0.28 0.19 0.23 0.3 0.24 0.29
12.41 12.34 15.8 14.7 14.91 12.47
0.09 0.0 0.43 0.17 0.09 0.0
3.83 0.5 0.52 4.02 1.37 0.66
0.0 0.44 0.0 1.03 0.44 0.0
1.45 1.23 1.96 1.74 1.38 1.12
1.8 0.98 1.17 2.0 1.52 1.08
1.44 0.98 1.15 1.32 1.01 0.9
0.13 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
11.52 8.26 7.22 7.55 9.94 9.44
0.0 0.04 0.02 0.04 0.03 0.02
0.0 0.0 0.1 0.12 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06
5.25 2.24 3.87 4.28 5.27 2.32
29.15 29.29 19.37 19.92 37.48 20.35
0.0 0.02 0.0 0.03 0.02 0.0
2.85 2.78 2.41 3.09 2.86 3.03
0.0 0.79 1.4 1.68 0.3 0.65
0.08 0.21 0.14 0.18 0.08 0.0
0.28 0.31 0.92 0.91 0.75 0.82
0.02 0.04 0.04 0.05 0.08 0.03
10.65 7.56 6.88 7.24 6.89 8.58

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)