Heatmap: Cluster_37 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
2 h after light
6 h after light
10 h after light
14 h after light
18 h after light
2 h after dark
0.35 0.35 -0.21 -0.79 0.45 -0.62
0.44 0.32 0.08 -0.5 -0.11 -0.5
0.49 0.36 -0.34 -0.27 0.17 -0.84
0.3 1.53 0.36 -2.06 -1.62 -4.89
-0.14 0.83 0.3 0.05 -0.32 -2.04
-0.15 0.63 0.6 -0.36 -0.84 -0.52
0.31 0.43 0.02 -0.27 -0.06 -0.71
0.22 0.21 0.27 -0.17 -0.16 -0.56
0.54 0.55 0.05 -0.56 -0.56 -0.53
0.34 0.38 -0.02 -0.45 -0.12 -0.33
-0.25 1.19 0.44 0.08 -1.98 -2.19
0.4 0.45 0.21 -0.42 -0.07 -1.12
1.0 0.79 - -0.74 0.74 -
0.7 0.77 -0.46 -0.78 0.17 -2.07
0.22 0.12 -0.31 0.03 0.27 -0.46
1.14 0.19 -0.73 -1.66 -0.45 -0.0
0.18 0.27 -0.09 -0.07 0.12 -0.55
0.24 0.22 0.4 0.2 -0.46 -1.1
0.4 0.35 -0.12 0.17 0.04 -1.64
0.86 0.62 0.06 -0.94 -0.7 -1.09
0.9 1.09 -0.23 -0.93 -1.25 -2.25
0.38 0.71 -0.36 -0.06 -0.71 -0.48
-0.35 1.22 0.82 -1.24 -1.18 -1.93
0.24 1.01 -0.22 -0.33 -0.27 -1.65
0.2 0.26 0.15 -0.2 -0.22 -0.31
0.22 0.73 0.15 -0.57 -0.04 -1.25
1.43 0.17 -0.29 -0.83 -0.4 -4.23
0.33 0.03 -0.23 -0.21 0.07 -0.07
0.73 -0.15 -0.58 -0.03 0.01 -0.36
0.87 0.49 -0.59 -0.28 0.21 -2.99
0.47 0.85 -0.29 -0.97 -0.39 -0.46
0.06 1.08 0.16 -1.07 -0.32 -1.16
-1.11 0.76 0.8 -0.06 -0.32 -1.53
0.46 0.28 0.25 0.28 -0.56 -1.62
0.11 0.33 -0.18 -0.17 0.11 -0.3
0.05 0.5 0.31 -0.26 -0.0 -1.08
1.2 1.14 -1.13 -2.95 -1.03 -1.25
0.94 1.03 0.01 -0.36 -1.96 -
1.51 0.77 -1.08 -0.83 -1.26 -
0.85 0.52 0.4 -0.57 -0.53 -3.85
0.96 1.14 -0.52 -1.01 -0.93 -2.83
0.19 0.29 0.27 0.04 -0.11 -1.06
0.78 0.78 -0.56 -0.49 -0.17 -1.81
0.79 0.37 0.22 -0.25 -0.2 -3.43
0.44 0.08 0.07 -0.34 0.15 -0.66
-0.32 0.51 0.37 -0.34 -0.07 -0.45
-0.05 0.27 0.49 0.07 -0.22 -0.97
0.14 0.47 -0.42 -0.63 0.45 -0.41
0.72 0.51 -0.12 -1.08 -0.79 -0.07
0.33 1.2 -0.42 -1.25 -0.75 -0.55
0.85 0.64 0.11 -0.83 -0.88 -1.12
-0.7 1.27 0.64 -0.5 -2.29 -1.01
-0.19 0.88 1.01 -0.15 -1.44 -
0.31 0.71 0.93 -0.4 -1.12 -
0.22 1.38 0.35 -1.24 -1.39 -2.61
1.06 0.51 0.03 -0.9 -0.83 -1.47
0.36 0.08 -0.18 -0.25 0.0 -0.1
-0.1 0.67 -0.09 -0.17 -0.04 -0.57
0.45 0.2 -0.09 0.25 0.06 -1.67
0.03 0.18 0.29 -0.08 -0.01 -0.53
0.59 1.24 -0.21 -1.04 -1.33 -1.42
0.73 0.36 -0.45 -0.37 -0.39 -0.34
0.13 0.32 0.55 0.13 -0.37 -1.59
0.4 0.34 -0.9 -0.3 0.37 -0.36
0.29 1.17 -1.33 -1.17 -0.47 -0.05
0.8 0.89 -0.36 -1.67 -0.52 -0.72
0.1 0.41 0.1 -0.28 -0.2 -0.27
0.09 0.99 0.18 -0.88 -1.38 -0.16
1.66 1.5 - - - -
0.35 0.84 0.82 -0.71 -1.34 -2.62
0.56 0.29 -0.28 -0.42 0.04 -0.5
0.6 0.35 -0.51 -0.54 -0.08 -0.2
-0.24 0.83 0.12 0.24 -0.03 -2.96
0.18 0.44 0.21 -0.37 -0.13 -0.58
0.36 0.35 -0.14 -0.27 -0.19 -0.28
0.05 0.83 -0.12 -0.59 -0.18 -0.49
0.01 0.82 0.42 -0.43 -0.39 -1.38
0.45 0.66 0.47 -0.64 -0.68 -1.33
0.72 0.32 0.59 -0.15 -0.53 -
0.2 0.94 0.08 -0.87 -0.43 -0.79
0.7 0.63 -0.05 -0.73 -0.24 -1.28
-0.38 0.92 0.86 -1.22 -0.79 -0.94
-0.04 0.21 0.26 -0.12 -0.06 -0.32
0.51 0.43 0.15 -0.12 -0.14 -1.81
0.33 0.16 0.38 -0.14 -0.07 -1.12
0.77 -0.22 -0.3 -0.12 0.11 -0.7
1.66 1.5 - - - -
0.38 0.43 -0.02 -0.57 -0.12 -0.38
0.41 0.1 -0.0 -0.01 0.0 -0.72
-0.39 1.13 -0.13 -0.01 -0.9 -0.71
0.63 0.56 -0.02 -0.8 -0.43 -0.56
0.67 0.73 -0.67 -0.09 -0.27 -1.5
0.28 0.97 0.49 -0.94 -0.64 -1.98
1.2 -0.0 0.08 -0.32 -0.42 -3.31
0.63 0.56 -0.31 -0.59 -0.2 -0.65
0.24 0.74 -0.09 -0.18 -0.55 -0.65
0.61 1.07 -0.7 -0.53 -0.22 -2.23
0.84 0.51 -0.21 -0.51 -0.14 -1.67
0.91 0.95 -0.82 -1.6 -0.53 -0.74
0.99 0.45 -0.56 -0.71 -0.23 -0.96
-0.58 0.46 0.3 0.05 -0.06 -0.44
0.53 0.53 -0.07 -0.1 -0.17 -1.55
0.74 0.47 -0.1 0.04 -0.29 -2.6
0.37 0.91 0.51 -0.55 -1.13 -1.97
-0.07 0.72 0.42 -0.55 -0.55 -0.52
0.79 0.28 0.27 -0.36 -0.08 -3.02
0.04 0.52 0.05 -0.1 -0.13 -0.62
0.7 0.42 0.19 -0.49 -0.54 -1.03
0.99 1.27 -0.61 -2.35 -2.27 -0.89
0.42 0.61 0.4 -0.46 -0.54 -1.34
-0.01 0.37 -0.45 0.05 0.17 -0.29
0.59 0.42 -0.02 -0.37 -0.08 -1.14
0.52 1.16 -0.3 -0.74 -0.63 -1.85
-0.11 0.9 0.06 -0.77 -0.12 -0.59
0.22 0.12 0.11 0.29 -0.19 -0.81
0.18 0.97 -0.13 -0.67 -0.15 -1.12
0.63 0.8 0.07 -0.45 -0.43 -2.47
0.26 0.09 -0.02 -0.2 -0.06 -0.11
0.76 -0.17 -0.29 -0.64 0.06 -0.13
0.23 0.66 0.51 -0.34 -0.63 -1.35
0.09 0.19 -0.02 -0.04 0.17 -0.52
0.28 0.62 0.47 -0.5 -0.35 -1.4
-1.21 1.56 0.21 -0.38 -0.55 -
0.21 0.34 0.1 -0.18 -0.13 -0.48
0.5 0.38 -0.45 -0.14 0.03 -0.68
0.2 0.93 0.15 -0.49 -0.42 -1.42
0.47 1.2 -0.74 - 0.15 -0.73
-0.11 0.28 0.09 0.02 0.1 -0.5
0.05 0.29 0.3 -0.13 -0.07 -0.63
0.18 0.05 -0.13 -0.07 -0.03 -0.02
0.23 0.5 0.36 -0.14 -0.07 -1.97
0.45 0.69 -0.13 -0.81 -0.55 -0.22
-1.88 1.4 0.96 -0.2 - -1.88
0.98 0.57 0.3 -0.61 -1.01 -2.56
0.02 0.11 -0.19 0.04 0.26 -0.3
0.35 0.13 0.05 0.1 -0.12 -0.72
0.66 0.64 0.57 -0.36 -1.24 -2.48
0.17 0.79 -0.03 -0.73 -0.39 -0.32
0.12 0.57 0.51 -0.02 -0.7 -1.31
0.46 0.4 0.16 -0.32 -0.14 -1.06
0.42 0.6 -0.16 -0.31 -0.06 -1.04
0.18 0.89 0.5 -0.45 -0.85 -1.7
0.6 0.24 -0.24 -0.5 0.36 -1.13
0.22 0.97 0.54 -0.55 -1.06 -1.9
0.2 0.55 0.12 -0.24 -0.14 -0.89
0.27 0.01 0.21 0.16 -0.02 -0.9
-0.15 0.39 -0.08 -0.1 -0.09 -0.05
0.4 0.04 0.37 -0.13 -0.15 -0.88
0.36 0.3 0.07 -0.19 0.01 -0.84
0.41 0.41 0.09 -0.44 -0.12 -0.72
0.2 0.38 0.24 -0.26 0.26 -1.54
0.54 0.49 -0.16 -0.68 -0.28 -0.33
-0.16 0.68 0.23 -0.4 0.09 -0.97
0.59 -0.29 0.7 -0.85 -0.13 -0.78
0.31 0.92 0.19 -0.8 -0.54 -1.11
0.18 0.38 0.22 -0.18 -0.16 -0.67
0.74 0.59 0.31 -0.85 -0.85 -1.1
-0.05 0.64 0.56 -0.17 -0.63 -1.08
1.92 1.15 - - - -
-0.43 0.84 0.35 -0.99 -0.08 -0.43
0.1 0.38 0.46 -0.44 -0.07 -0.84
-0.02 1.34 0.08 -0.99 -0.6 -1.98
-0.68 0.63 0.7 0.12 -0.54 -1.27
0.37 0.59 0.04 -0.37 -0.15 -1.02
0.47 0.39 -0.02 -0.33 -0.2 -0.62
0.41 0.26 0.3 -0.13 0.07 -1.83
0.81 -0.48 -0.48 -0.21 0.25 -0.41
0.13 0.42 0.21 -0.33 -0.2 -0.42
0.7 0.55 -0.12 -0.75 -0.57 -0.47
-0.21 0.95 0.79 -0.41 -0.83 -2.6
0.39 0.53 -0.35 -0.15 -0.05 -0.75
1.24 -0.31 -1.39 -0.06 0.1 -1.26
2.06 0.87 - - - -
0.03 0.12 0.48 -0.13 -0.09 -0.64
0.39 0.51 -0.25 -0.5 -0.2 -0.25
0.58 0.22 0.06 -0.68 -0.05 -0.49
0.19 0.55 0.54 0.17 -0.49 -3.15
0.01 1.23 0.09 -0.86 -0.7 -1.27
0.62 0.36 0.02 -0.51 0.01 -1.13
0.58 0.27 0.27 -0.21 -0.22 -1.41
0.67 0.73 -0.18 -0.76 -0.32 -1.08
-0.21 0.24 -0.14 0.1 0.41 -0.63
1.01 0.67 -0.4 -0.69 -0.22 -2.69
0.47 -0.07 -0.86 0.2 0.54 -0.98
0.55 0.7 -0.34 -0.94 -0.55 -0.11
0.78 1.31 -0.21 -2.36 -1.28 -1.57
0.3 -0.12 -0.15 0.05 0.05 -0.18
0.04 0.51 -0.04 -0.05 -0.24 -0.39
0.55 0.53 0.41 -0.33 -0.25 -3.07
0.21 1.32 0.25 -1.32 -1.08 -1.83
-0.09 0.31 0.03 -0.22 -0.03 -0.05
0.63 0.6 0.07 -0.83 -0.27 -1.02
0.49 0.69 0.43 -0.71 -1.36 -0.67
0.76 -0.24 -0.75 -0.31 0.2 -0.13
0.02 0.9 0.27 -0.3 -0.43 -1.48
0.0 0.42 0.23 -0.21 0.17 -1.02
0.08 0.73 0.42 -0.24 -0.34 -1.71
0.77 0.64 -0.44 -0.63 -0.33 -0.85
0.46 0.32 -0.2 -0.38 -0.24 -0.17
-0.27 0.83 0.23 -0.38 -0.48 -0.43
0.52 1.18 0.45 -0.89 -2.16 -2.6
1.17 0.23 -0.26 -1.34 -0.06 -1.39
1.09 -0.1 -1.5 0.14 0.23 -1.69
0.63 0.74 0.1 -0.89 -0.24 -1.63
0.39 0.43 0.39 -0.2 -0.14 -1.95
0.63 0.54 0.06 -0.76 -0.48 -0.62
1.02 0.59 -0.32 -0.62 -0.89 -1.09
0.63 0.46 0.16 -0.83 -0.15 -1.02
-0.08 0.94 0.12 0.08 -1.02 -1.0

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.