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Heatmap: Cluster_345 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-1.69 0.26 0.53 0.46 -0.32 -0.2
-0.47 -0.11 0.57 0.28 -0.06 -0.52
-0.78 0.27 0.72 0.22 -0.19 -0.92
-0.43 0.05 0.67 0.34 -0.24 -0.95
-0.92 -0.03 0.21 0.19 0.02 0.25
-1.48 0.26 0.83 0.26 -0.09 -0.93
-0.48 -0.02 0.42 0.61 -0.89 -0.15
-0.36 -0.07 0.28 0.31 0.09 -0.41
-0.13 -0.39 0.28 0.47 -0.18 -0.24
-1.08 0.08 0.21 0.36 0.18 -0.16
-0.77 -0.06 0.2 0.28 0.12 0.01
-0.48 -0.04 0.2 0.19 0.04 -0.01
-0.32 -0.01 0.5 0.09 -0.09 -0.34
-0.39 -0.13 0.27 0.37 -0.1 -0.16
-1.47 0.27 0.91 0.42 -0.61 -0.82
-1.48 0.41 0.87 0.53 -1.1 -0.79
-2.59 -0.2 1.1 0.63 -0.39 -0.96
-0.33 0.01 0.53 0.26 -0.41 -0.32
-0.24 -0.76 0.26 0.65 -0.09 -0.21
-0.38 -0.23 0.51 0.34 -0.13 -0.36
-0.63 0.16 0.65 0.44 -0.44 -0.82
-0.45 -0.14 0.33 0.42 -0.14 -0.23
-0.05 0.0 0.26 0.35 -0.47 -0.25
-0.63 0.47 0.63 -0.01 -1.0 -0.12
-0.21 -0.02 0.16 0.48 -0.06 -0.57
-0.58 0.07 0.36 0.32 -0.01 -0.39
-0.87 -0.04 0.45 0.28 0.06 -0.23
-0.78 -0.41 0.38 0.64 -0.05 -0.26
-1.96 0.29 0.65 0.12 0.25 -0.56
-0.74 0.02 0.49 0.22 -0.24 -0.04
-0.5 0.12 0.33 0.14 -0.07 -0.17
-0.4 -0.21 0.57 0.44 -0.23 -0.55
-0.7 0.09 0.54 0.57 -0.43 -0.63
-1.15 -0.25 1.06 1.07 - -0.97
-0.39 -0.1 0.32 0.11 0.03 -0.06
-1.16 0.25 0.62 0.41 -0.3 -0.56
-0.81 0.12 0.36 0.3 0.07 -0.37
-0.09 -0.15 0.74 -0.03 -0.43 -0.36
-0.22 -0.02 0.22 0.36 -0.15 -0.32
-0.56 -0.04 0.53 0.28 -0.03 -0.48
-0.83 -0.26 0.59 0.43 -0.03 -0.38
-0.03 -0.2 0.37 0.17 0.02 -0.47
-0.74 0.06 0.4 0.25 0.09 -0.34
-4.06 0.41 0.61 0.87 -1.52 -0.16
-0.36 -0.58 0.62 0.43 -0.0 -0.57
-0.34 -0.02 0.27 0.28 -0.04 -0.27
-1.91 0.05 0.76 0.2 -0.03 -0.19
-1.31 0.33 0.82 0.65 -0.73 -1.3
-0.2 -0.03 0.35 0.15 -0.08 -0.28
-1.17 -0.17 0.45 0.8 -0.29 -0.42
-0.4 -0.0 0.28 0.29 -0.12 -0.17
-0.43 -0.15 0.46 0.35 -0.09 -0.39
-0.77 0.2 0.46 -0.06 -0.14 0.04
-0.53 -0.12 0.58 0.31 -0.37 -0.19
-1.53 -0.57 0.41 0.9 0.18 -0.61
-1.33 0.53 1.13 0.19 -1.46 -1.1
-0.96 0.07 0.54 0.45 -0.02 -0.67
-0.67 -0.07 0.44 0.1 0.16 -0.19
-0.6 0.11 0.39 0.18 -0.1 -0.18
-0.69 0.03 0.53 0.27 -0.18 -0.26
-0.5 -0.06 0.46 0.73 -0.82 -0.45
-1.45 0.03 0.81 0.26 -0.03 -0.56
-0.7 -0.16 0.46 0.36 0.03 -0.3
-0.14 -0.06 0.35 0.31 -0.11 -0.54
-0.73 -0.02 0.4 0.39 -0.19 -0.15
-2.9 0.1 1.27 0.31 -0.53 -1.14
-1.47 -0.15 0.73 0.33 0.27 -0.69
-0.18 -0.15 0.47 0.23 -0.04 -0.55
-0.8 -0.14 0.65 0.27 0.09 -0.57
-0.59 0.08 0.34 0.05 -0.02 -0.01
-0.57 0.28 0.51 0.15 -0.31 -0.37
-0.41 -0.04 0.24 0.16 -0.03 -0.0
-0.72 0.05 0.59 0.38 0.04 -0.92
-0.24 -0.16 0.3 0.4 -0.2 -0.26
-1.01 -0.13 0.76 0.2 -0.13 -0.27
-0.91 0.29 0.81 0.64 -0.41 -2.51
-0.48 -0.27 0.15 0.22 0.08 0.17
-0.68 -0.13 0.71 0.34 -0.28 -0.43
-0.21 -0.13 0.31 0.42 -0.06 -0.53
-0.27 -0.2 0.44 0.22 -0.01 -0.35
-2.21 0.47 0.99 0.37 -0.9 -0.78
-0.28 -0.34 0.52 0.43 -0.15 -0.51
-0.96 -0.0 0.7 0.36 -0.24 -0.45
-1.52 0.05 0.38 0.48 0.31 -0.56
-0.74 -0.12 0.26 0.32 -0.05 0.09
-0.54 -0.22 0.61 0.29 -0.35 -0.12
-0.62 0.06 0.52 0.32 -0.13 -0.48
-0.7 -0.21 0.53 0.4 0.14 -0.61
-0.64 -0.08 0.47 0.16 -0.11 -0.03
-1.56 -0.12 0.58 0.23 0.39 -0.38
-0.6 0.05 0.47 0.29 -0.14 -0.34
-0.67 0.17 0.52 0.14 -0.33 -0.13
-0.87 0.02 0.63 0.17 0.04 -0.45
-0.57 0.21 0.88 0.31 -1.18 -0.62
-0.39 -0.14 0.76 0.26 -0.41 -0.53
-2.04 0.29 0.56 0.53 -0.32 -0.31
-0.48 -0.16 0.65 0.39 -0.23 -0.61
-0.29 0.13 0.22 0.47 -0.24 -0.51
-0.57 -0.09 0.38 0.24 0.03 -0.18
-2.13 0.13 0.63 0.69 -0.68 -0.16
-0.36 0.09 0.61 0.4 -0.33 -0.93
-0.69 0.0 0.28 0.22 -0.03 0.04
-0.57 -0.15 0.51 0.46 -0.03 -0.64
-0.65 0.01 0.48 0.24 -0.08 -0.27
-0.36 0.0 0.45 0.15 -0.13 -0.27
0.04 -0.21 0.26 0.32 -0.13 -0.41
-0.65 0.12 0.3 0.29 -0.07 -0.2
-2.2 0.41 0.82 0.67 -0.17 -2.24
-0.71 -0.2 0.89 0.52 -0.23 -1.4
-1.64 0.26 0.73 0.87 -1.15 -0.88
-0.33 0.02 0.28 0.17 0.02 -0.27
-0.93 0.63 0.78 -0.11 -0.53 -0.76
-0.41 0.05 0.62 0.29 -0.2 -0.78
-1.27 -0.06 0.77 0.26 0.09 -0.6
-0.95 0.2 0.48 0.45 -0.26 -0.46
-0.48 -0.17 0.21 0.16 0.14 0.03
-0.66 -0.05 0.34 0.31 -0.02 -0.13
-0.18 -0.35 0.63 0.44 -0.28 -0.71
-0.23 -0.28 0.32 0.47 -0.15 -0.33
-0.56 -0.01 0.45 0.15 0.03 -0.26
-1.89 0.26 0.4 0.41 0.01 -0.19
-1.0 -0.42 0.82 -0.04 0.04 -0.02
-0.25 -0.11 0.04 0.14 0.13 0.01
-0.35 0.13 0.34 0.19 -0.15 -0.32
-0.62 -0.22 0.52 0.36 -0.05 -0.3
-1.43 -0.13 0.44 0.73 0.04 -0.55
-0.67 -0.14 0.57 0.32 -0.08 -0.34
-0.35 -0.23 0.35 0.14 0.0 -0.03
-1.83 -0.19 0.45 0.41 0.57 -0.58
-0.21 -0.04 0.18 -0.02 -0.0 0.06
-0.39 -0.15 0.38 0.23 0.08 -0.31
-0.47 0.05 0.43 0.37 -0.02 -0.7
-0.84 -0.2 0.25 0.26 0.08 0.17
-0.33 0.07 0.12 0.14 -0.09 0.04
- 0.56 0.73 1.23 -2.55 -1.53
-0.81 0.08 0.49 0.43 -0.09 -0.55
-0.31 0.01 0.53 0.34 -0.17 -0.75
-0.85 0.03 0.55 0.2 -0.15 -0.16
-2.99 0.17 0.81 0.68 -0.37 -0.67
-0.79 -0.19 0.34 0.23 0.04 0.1
-0.65 -0.09 0.71 0.46 -0.55 -0.46
-0.66 -0.23 0.49 0.22 0.21 -0.33
-0.77 0.11 0.5 0.3 -0.32 -0.16
-0.66 -0.32 0.35 0.29 0.09 0.01
-1.01 0.15 0.57 0.04 0.16 -0.39
-1.06 0.44 0.43 0.62 -0.92 -0.41
-0.25 -0.09 0.11 0.1 0.05 0.05
-0.85 -0.29 0.34 0.7 -0.07 -0.35
-0.65 -0.08 0.29 0.14 -0.0 0.13
-0.48 -0.01 0.41 0.39 0.0 -0.62
-1.31 -0.01 0.71 0.46 0.17 -1.08
-0.6 -0.1 0.62 0.4 -0.38 -0.35
-0.36 -0.15 0.34 0.25 0.05 -0.27
-1.16 0.14 0.59 0.46 0.17 -1.16
-0.86 0.27 0.27 0.35 0.16 -0.62
-0.41 -0.04 0.47 0.23 -0.17 -0.27
-0.4 -0.07 0.57 0.32 -0.11 -0.67

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.