Heatmap: Cluster_441 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.34 -0.48 -0.01 0.28 0.27 0.11
-0.26 -0.38 -0.17 0.3 0.19 0.2
-0.93 -0.42 0.1 0.4 0.32 0.12
-0.7 -0.58 -0.08 0.53 0.38 0.04
0.14 -0.82 -0.05 0.2 0.16 0.13
-0.42 -0.83 -0.04 0.37 0.34 0.2
-0.28 -0.71 -0.29 0.22 0.42 0.32
-0.51 -0.26 0.29 0.46 -0.42 0.16
-0.41 -0.42 0.04 0.28 0.24 0.1
-0.39 -0.98 0.0 0.47 0.26 0.2
-0.37 -0.43 0.13 0.24 0.24 0.04
-0.24 -0.42 -0.2 0.27 0.22 0.23
-0.55 -0.57 -0.21 0.57 0.41 -0.05
-0.35 -0.27 -0.06 0.37 0.19 0.0
-0.68 -1.16 -0.08 0.55 0.5 0.14
-0.34 -0.57 -0.21 0.38 0.33 0.16
-0.34 -0.42 0.05 0.35 0.09 0.11
-0.56 -0.56 -0.11 0.38 0.36 0.18
-0.53 -0.46 0.08 0.33 0.33 0.01
-0.98 -0.59 0.02 0.57 0.16 0.27
-0.03 -0.4 -0.01 0.23 -0.01 0.13
-0.47 -0.64 -0.1 0.28 0.42 0.21
-0.37 -0.55 -0.02 0.33 0.37 0.02
-0.24 -0.78 -0.29 0.3 0.25 0.41
-0.23 -0.36 -0.13 0.25 0.13 0.23
-0.37 -0.51 -0.04 0.42 0.25 0.03
-0.18 -0.44 -0.22 0.47 0.05 0.14
-0.59 -0.73 0.06 0.37 0.29 0.23
-1.06 -0.66 0.33 0.46 0.27 0.08
-0.45 -0.42 0.02 0.29 0.19 0.19
-0.5 -0.71 -0.03 0.29 0.41 0.2
-0.44 -0.58 -0.13 0.35 0.3 0.23
-0.54 -0.51 0.22 0.26 0.27 0.05
-0.16 -0.33 -0.16 0.27 0.17 0.11
-0.8 -0.72 -0.2 0.6 0.42 0.13
-0.57 -0.89 -0.08 0.4 0.41 0.25
-0.46 -0.4 -0.16 0.32 0.2 0.29
-0.43 -0.48 0.02 0.4 0.31 -0.05
-0.26 -0.41 0.06 0.29 0.09 0.11
-0.48 -0.46 -0.11 0.4 0.32 0.09
-0.29 -0.6 0.03 0.36 0.15 0.16
-0.33 -0.36 -0.33 0.42 0.19 0.2
-0.43 -0.41 -0.12 0.33 0.22 0.21
-0.73 -0.59 0.0 0.59 0.21 0.1
-0.44 -0.86 -0.2 0.51 0.35 0.2
-0.73 -0.95 0.1 0.56 0.24 0.2
-0.47 -0.51 0.22 0.25 0.32 -0.04
-0.6 -0.5 0.01 0.44 0.21 0.14
-0.39 -0.56 -0.19 0.41 0.4 0.05
-0.2 -0.3 -0.25 0.37 0.15 0.11
-0.5 -0.57 -0.04 0.38 0.22 0.24
-0.08 -0.7 -0.26 0.46 0.08 0.23
-0.31 -0.52 -0.16 0.36 0.24 0.19
-0.35 -0.51 -0.21 0.54 0.15 0.12
-1.15 -1.12 0.03 0.59 0.38 0.33
-0.4 -0.32 -0.12 0.31 0.24 0.15
-0.02 -0.43 -0.07 0.21 0.08 0.13
-0.37 -0.66 -0.2 0.45 0.26 0.21
-0.26 -0.38 0.01 0.35 0.19 -0.04
-0.27 -0.65 0.0 0.26 0.21 0.24
-0.49 -0.53 0.08 0.34 0.35 -0.0
-0.27 -0.59 -0.22 0.25 0.31 0.28
-0.26 -0.32 -0.19 0.26 0.23 0.16
-0.33 -0.52 -0.24 0.33 0.31 0.22
-0.4 -0.38 -0.13 0.32 0.24 0.18
-0.15 -0.41 -0.03 0.27 0.05 0.18
-0.39 -0.51 -0.19 0.51 0.35 -0.07
-0.28 -0.54 0.01 0.41 0.12 0.1
-0.54 -0.67 -0.37 0.35 0.45 0.35
-0.5 -0.4 0.18 0.5 -0.23 0.18
-0.16 -0.41 0.02 0.22 0.25 -0.02
-0.26 -0.34 -0.16 0.4 0.16 0.06
-0.62 -0.86 -0.07 0.38 0.45 0.24
-0.46 -0.57 -0.07 0.24 0.37 0.23
-0.11 -0.5 -0.03 0.29 0.21 0.0
-0.26 -0.35 -0.21 0.33 0.27 0.07
-0.57 -0.64 0.09 0.33 0.3 0.18
-0.32 -0.63 -0.28 0.31 0.39 0.23
-0.41 -0.31 -0.07 0.37 0.21 0.05
-0.58 -0.87 -0.39 0.48 0.54 0.22
-0.58 -1.14 -0.17 0.54 0.44 0.23
-0.37 -0.32 -0.01 0.29 0.22 0.06
-0.25 -0.32 -0.2 0.28 0.24 0.13
-0.4 -0.66 -0.27 0.26 0.4 0.34
-0.54 -0.49 0.05 0.41 0.32 -0.02
-0.5 -0.59 0.05 0.48 0.23 0.04
-0.22 -0.35 -0.04 0.26 0.16 0.09
-0.37 -0.38 -0.08 0.37 0.2 0.1
-0.26 -0.41 -0.15 0.35 0.3 0.01
-0.63 -0.6 -0.22 0.29 0.44 0.33
-0.39 -0.63 -0.06 0.33 0.23 0.27
-0.38 -0.38 -0.08 0.26 0.33 0.09
-0.33 -0.38 -0.07 0.21 0.17 0.26
-0.41 -0.57 -0.18 0.29 0.38 0.21
-0.46 -0.42 -0.21 0.34 0.33 0.18
-0.52 -0.44 -0.02 0.47 0.33 -0.1
-0.17 -0.45 -0.12 0.2 0.27 0.14
-0.39 -0.7 -0.15 0.34 0.39 0.19
-0.27 -0.67 -0.15 0.45 0.47 -0.16
-0.38 -0.44 -0.03 0.34 0.15 0.19
-0.46 -0.49 -0.17 0.23 0.35 0.29
-0.34 -0.41 -0.1 0.34 0.19 0.16
-0.46 -0.41 -0.1 0.32 0.15 0.3
-0.53 -0.48 -0.05 0.32 0.31 0.2
-0.65 -0.65 -0.21 0.38 0.49 0.21
-0.36 -0.3 -0.12 0.37 0.1 0.18
-0.47 -0.49 -0.1 0.26 0.29 0.28
-0.52 -0.42 0.12 0.28 0.22 0.12
-0.77 -0.16 -0.03 0.35 0.3 0.04
-0.3 -0.38 -0.24 0.3 0.23 0.23
-0.52 -0.69 -0.25 0.28 0.44 0.36
-0.31 -0.43 -0.3 0.36 0.3 0.17
-0.35 -0.61 -0.39 0.33 0.38 0.31
-0.12 -0.34 -0.08 0.33 0.08 0.03
-0.91 -0.77 0.03 0.48 0.41 0.19
-0.3 -0.58 -0.04 0.4 0.12 0.19
-0.55 -0.7 -0.26 0.27 0.49 0.33
-0.62 -0.47 0.16 0.37 0.24 0.05
-0.42 -0.58 -0.22 0.36 0.33 0.24
-0.37 -0.31 -0.16 0.29 0.2 0.2
-0.38 -0.62 -0.11 0.41 0.35 0.06
-0.46 -0.41 0.01 0.34 0.25 0.08
-0.41 -0.44 -0.03 0.33 0.15 0.21
-0.35 -0.63 -0.07 0.45 0.3 0.03
-0.57 -0.51 0.05 0.43 0.17 0.16
-0.46 -0.76 0.09 0.33 0.36 0.11
-0.4 -0.78 -0.19 0.27 0.36 0.37
-0.33 -0.34 -0.15 0.34 0.2 0.14
-0.18 -0.68 -0.18 0.25 0.16 0.38
-0.8 -0.33 -0.01 0.49 0.27 0.03
-0.47 -0.43 -0.3 0.42 0.31 0.19
-0.67 -0.42 0.18 0.39 0.17 0.08
-0.15 -0.51 -0.16 0.35 0.29 0.01
-0.53 -0.71 -0.27 0.24 0.44 0.41
-0.64 -0.57 0.07 0.36 0.25 0.22
-0.36 -0.99 -0.12 0.37 0.4 0.23
-0.19 -0.37 -0.08 0.23 0.2 0.11
-0.32 -0.37 0.06 0.32 -0.02 0.2
-0.31 -0.48 -0.02 0.27 0.24 0.14
-0.24 -0.48 -0.16 0.36 0.2 0.15
-0.49 -0.79 -0.18 0.42 0.33 0.3
-0.68 -0.48 -0.35 0.48 0.3 0.33
-0.5 -0.6 0.02 0.45 0.29 0.05
-0.3 -0.67 -0.14 0.42 0.39 0.01
-0.35 -0.48 -0.15 0.43 0.36 -0.06
-0.37 -0.34 -0.2 0.41 0.23 0.08
-0.23 -0.42 -0.14 0.31 0.26 0.08
-0.43 -0.27 -0.28 0.35 0.24 0.2
-0.46 -0.48 0.06 0.34 0.21 0.12
-0.44 -0.57 -0.17 0.24 0.4 0.27
-0.4 -0.55 -0.23 0.33 0.31 0.28
-0.36 -0.36 -0.15 0.39 0.26 0.05
-0.31 -0.54 0.04 0.3 0.15 0.18
-0.42 -0.28 -0.11 0.37 0.22 0.07
-0.11 -0.57 -0.13 0.31 0.26 0.07
-0.61 -0.64 -0.26 0.43 0.41 0.25
-1.02 -1.13 -0.03 0.67 0.44 0.17
-0.52 -1.05 -0.14 0.23 0.48 0.43
-0.57 -0.51 -0.06 0.41 0.37 0.07
-0.31 -0.79 0.18 0.36 0.22 0.05
-0.39 -0.39 0.14 0.24 0.19 0.08
-0.48 -0.55 -0.26 0.32 0.38 0.28
-0.64 -0.53 -0.02 0.34 0.3 0.23
-0.18 -0.48 -0.12 0.34 0.22 0.07
-0.58 -0.4 0.05 0.34 0.29 0.07
-0.67 -0.46 0.04 0.46 0.22 0.11
-0.34 -0.27 -0.12 0.4 0.18 0.01
-0.33 -0.35 -0.15 0.34 0.32 0.01
-0.32 -0.56 0.02 0.3 0.17 0.21
-0.64 -0.51 0.11 0.37 0.29 0.07
-0.19 -0.35 0.0 0.2 0.21 0.04
-0.5 -0.54 0.11 0.48 0.04 0.14
-0.41 -0.54 0.07 0.39 0.21 0.06
-0.33 -0.37 0.11 0.33 0.05 0.09
-0.22 -0.52 -0.04 0.41 0.12 0.08
-0.41 -0.33 -0.21 0.37 0.25 0.15
-0.33 -0.59 0.07 0.38 0.17 0.1
-0.46 -0.55 -0.0 0.37 0.26 0.14
-0.4 -0.73 -0.23 0.47 0.18 0.34
-0.3 -0.33 -0.01 0.27 0.24 0.03
-0.61 -0.57 0.17 0.52 0.17 -0.02
-0.63 -0.38 0.04 0.34 0.29 0.09
-2.87 -0.95 0.11 0.72 0.36 0.43
-0.27 -0.34 -0.09 0.26 0.1 0.22
-0.39 -0.25 -0.07 0.37 0.22 -0.02
-0.22 -0.37 -0.1 0.33 0.2 0.04
-0.7 -0.73 -0.05 0.6 0.19 0.21
-0.31 -0.45 -0.11 0.37 0.19 0.14
-0.34 -0.31 -0.12 0.21 0.16 0.28
-0.43 -0.7 -0.22 0.48 0.44 0.03
-0.39 -0.28 -0.2 0.23 0.22 0.27
-0.3 -0.52 0.01 0.24 0.32 0.07
-0.4 -0.49 -0.08 0.4 0.26 0.1
-0.49 -0.51 -0.05 0.31 0.37 0.12
-0.56 -0.59 -0.06 0.42 0.3 0.18
-0.34 -0.5 -0.01 0.41 0.27 -0.04
-0.5 -0.84 0.16 0.45 0.12 0.22
-0.8 -0.69 -0.2 0.52 0.49 0.14
-0.3 -0.61 -0.3 0.32 0.35 0.26
-0.42 -0.47 -0.08 0.47 0.16 0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.