Heatmap: Cluster_409 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.08 -0.75 -0.48 0.21 0.13 0.47
-0.2 -0.79 -0.39 0.24 0.35 0.41
-0.13 -0.77 -0.49 0.15 0.31 0.52
0.18 -0.65 -0.55 -0.01 0.14 0.54
-0.16 -0.35 -0.31 0.13 0.19 0.36
-0.18 -0.51 -0.11 0.1 0.11 0.43
-0.36 -0.7 -0.6 0.17 0.37 0.61
0.04 -0.54 -0.51 -0.2 0.35 0.52
-0.11 -0.49 -0.27 0.14 0.24 0.32
-0.01 -0.52 -0.29 0.02 0.16 0.44
-0.03 -0.5 -0.25 0.05 0.28 0.29
-0.15 -0.55 -0.43 0.28 0.26 0.34
0.01 -0.99 -0.43 0.06 0.29 0.57
-0.19 -0.87 -0.68 0.26 0.35 0.56
-0.21 -0.39 -0.17 0.13 0.21 0.3
-0.04 -0.68 -0.14 0.15 0.21 0.3
-0.19 -0.44 -0.36 0.07 0.25 0.46
-0.18 -0.62 -0.16 0.21 0.21 0.32
-0.27 -0.68 -0.07 0.3 0.24 0.24
-0.02 -0.56 -0.28 0.14 0.21 0.33
-0.17 -0.45 -0.18 0.2 0.18 0.28
-0.34 -0.45 -0.1 0.24 0.18 0.3
0.03 -0.86 -0.13 0.26 0.22 0.21
-0.24 -0.36 -0.22 0.19 0.18 0.31
-0.22 -0.49 -0.09 0.05 0.19 0.4
-0.05 -0.69 -0.22 0.05 0.33 0.33
-0.24 -0.51 -0.39 0.26 0.17 0.45
-0.08 -0.78 -0.4 0.08 0.3 0.52
-0.07 -0.97 -0.45 0.13 0.35 0.52
-0.11 -0.67 -0.14 0.17 0.2 0.33
-0.22 -0.55 -0.43 0.19 0.26 0.46
-0.08 -0.54 -0.3 0.07 0.18 0.45
-0.1 -0.53 -0.45 0.16 0.15 0.51
-0.2 -0.56 -0.21 0.19 0.28 0.31
-0.11 -0.82 -0.37 0.17 0.24 0.51
-0.07 -0.43 -0.35 0.15 0.03 0.47
-0.13 -0.75 -0.6 0.22 0.25 0.57
-0.05 -0.54 -0.85 0.25 0.33 0.42
0.07 -0.35 -0.78 -0.18 0.2 0.63
-0.16 -0.69 -0.24 0.16 0.36 0.31
-0.28 -0.44 -0.35 0.22 0.26 0.37
-0.03 -0.76 -0.34 0.24 0.16 0.42
-0.28 -0.45 -0.19 0.2 0.35 0.2
-0.03 -0.49 -0.08 0.13 0.12 0.24
-0.23 -0.78 -0.34 0.17 0.32 0.48
-0.16 -0.38 -0.11 0.21 0.16 0.18
0.09 -0.71 -0.62 0.04 0.26 0.53
-0.04 -0.42 -0.32 0.12 0.22 0.3
-0.16 -0.55 -0.32 0.17 0.31 0.32
-0.29 -0.45 -0.15 0.13 0.14 0.43
0.14 -0.63 -0.4 -0.06 0.16 0.51
-0.01 -0.72 -0.35 0.19 0.1 0.49
-0.31 -0.52 -0.21 0.15 0.19 0.46
-0.03 -0.78 -0.38 0.24 0.3 0.33
-0.2 -0.62 -0.17 0.2 0.32 0.26
-0.08 -0.4 -0.48 0.12 0.25 0.39
-0.23 -0.68 -0.35 0.22 0.34 0.4
-0.24 -0.59 -0.32 0.28 0.23 0.38
-0.11 -0.58 -0.37 0.2 0.3 0.32
-0.19 -0.65 -0.26 0.27 0.22 0.35
-0.01 -0.73 -0.45 0.18 0.31 0.37
-0.08 -0.64 -0.43 0.17 0.21 0.47
-0.3 -0.7 -0.05 0.13 0.19 0.45
-0.18 -0.46 -0.46 0.21 0.26 0.38
-0.13 -0.53 -0.44 0.32 0.16 0.37
-0.14 -0.57 -0.32 0.13 0.32 0.36
-0.51 -1.16 -0.34 0.29 0.48 0.53
-0.22 -0.49 -0.21 0.26 0.3 0.18
-0.03 -0.63 -0.24 0.1 0.31 0.28
0.01 -0.72 -0.16 0.18 0.23 0.24
-0.4 -0.6 -0.4 0.27 0.31 0.47
-0.17 -0.48 -0.4 0.19 0.17 0.45
-0.32 -0.88 -0.34 0.18 0.49 0.41
-0.18 -0.57 -0.28 0.28 0.25 0.29
-0.15 -0.46 -0.14 0.26 0.1 0.26
-0.1 -0.5 -0.24 0.11 0.13 0.42
-0.36 -0.48 -0.08 -0.01 0.31 0.41
-0.09 -0.54 -0.39 0.14 0.16 0.48
-0.06 -0.56 -0.3 0.19 0.23 0.31
-0.47 -0.68 -0.75 0.28 0.36 0.65
-0.28 -0.52 -0.26 0.19 0.29 0.35
-0.24 -0.59 -0.23 0.24 0.2 0.38
-0.17 -0.45 -0.47 0.19 0.25 0.41
-0.11 -0.58 -0.21 0.07 0.13 0.49
-0.06 -0.52 -0.55 0.3 0.24 0.32
-0.17 -0.52 -0.45 0.32 0.24 0.32
-0.27 -0.36 -0.23 0.16 0.09 0.44
-0.16 -0.45 -0.35 0.06 0.26 0.43
-0.06 -0.63 -0.4 0.26 0.24 0.34
-0.21 -0.68 -0.39 0.08 0.4 0.45
-0.15 -0.4 -0.13 0.13 0.13 0.31
-0.27 -0.94 -0.33 0.33 0.31 0.45
0.02 -0.43 -0.27 0.0 0.15 0.39
-0.17 -0.76 -0.34 0.31 0.17 0.45
-0.23 -0.6 -0.55 0.23 0.24 0.54
-0.41 -0.86 -0.17 0.09 0.44 0.47
-0.01 -0.64 -0.55 0.27 0.29 0.32
-0.53 -0.39 -0.08 0.18 0.06 0.51
0.13 -0.81 -0.64 0.25 0.21 0.43
-0.29 -0.65 -0.1 0.16 0.27 0.37
-0.1 -0.67 -0.22 0.18 0.28 0.29
-0.24 -0.66 -0.37 0.28 0.25 0.42
-0.11 -0.73 -0.18 0.12 0.33 0.32
-0.12 -0.51 -0.29 0.2 0.27 0.27
-0.13 -0.59 -0.32 0.22 0.17 0.41
-0.13 -0.56 -0.29 0.21 0.21 0.34
-0.21 -0.87 -0.36 0.25 0.37 0.41
-0.29 -0.84 -0.36 0.12 0.51 0.41
-0.11 -0.63 -0.32 0.06 0.16 0.55
-0.11 -0.46 -0.14 0.21 0.17 0.21
-0.08 -0.47 -0.21 0.1 0.24 0.27
-0.25 -0.6 -0.37 0.25 0.31 0.38
-0.14 -0.51 -0.54 0.39 0.13 0.37
-0.08 -0.52 -0.29 0.12 0.23 0.36
-0.12 -0.65 -0.24 0.12 0.3 0.35
-0.41 -0.81 -0.34 0.24 0.42 0.45
-0.25 -0.59 -0.11 0.07 0.22 0.43
-0.01 -0.68 -0.25 0.23 0.13 0.35
-0.3 -0.48 -0.38 0.29 0.23 0.4
-0.18 -0.4 -0.25 0.17 0.17 0.34
-0.31 -0.87 -0.32 0.2 0.4 0.46
0.01 -0.46 -0.49 -0.18 0.22 0.6
-0.05 -0.5 -0.13 -0.02 0.32 0.25
-0.06 -0.68 -0.21 0.14 0.31 0.29
0.01 -0.67 -0.22 0.25 0.15 0.27
0.01 -0.64 -0.29 0.16 0.24 0.3
-0.21 -0.42 -0.21 0.12 0.21 0.36
-0.39 -0.62 -0.66 0.26 0.31 0.6
-0.32 -0.49 -0.14 0.21 0.29 0.27
-0.45 -0.45 -0.1 0.24 0.02 0.5
-0.05 -0.75 -0.35 0.17 0.25 0.42
-0.26 -0.47 -0.41 0.19 0.23 0.45
-0.3 -0.34 -0.21 0.11 0.21 0.37
-0.08 -0.55 -0.2 0.06 0.2 0.39
-0.33 -0.45 -0.27 0.17 0.19 0.46
-0.18 -0.64 -0.43 0.27 0.25 0.43
-0.07 -0.54 -0.19 0.15 0.13 0.35
-0.27 -0.45 -0.19 0.02 0.23 0.46
-0.23 -0.91 -0.15 0.18 0.32 0.41
-0.23 -0.63 -0.14 0.17 0.16 0.44
-0.25 -0.62 -0.61 0.38 0.34 0.36
-0.18 -0.65 -0.37 0.29 0.23 0.38
-0.21 -0.38 -0.4 0.17 0.31 0.31
-0.08 -0.49 -0.26 0.19 0.14 0.34
-0.18 -0.5 -0.26 0.17 0.23 0.35
-0.17 -0.51 -0.1 0.2 0.04 0.38
-0.1 -0.59 -0.44 -0.0 0.32 0.5
-0.16 -0.66 -0.22 0.19 0.21 0.4
-0.26 -0.63 -0.24 0.18 0.24 0.45
-0.21 -0.43 -0.33 0.15 0.12 0.48
-0.27 -0.44 -0.19 0.28 0.09 0.36
-0.05 -0.76 -0.29 0.2 0.24 0.37
-0.36 -0.43 -0.24 0.17 0.21 0.44
-0.16 -0.61 -0.12 -0.01 0.31 0.38
0.09 -0.86 -0.56 0.14 0.23 0.52
-0.16 -0.45 -0.34 0.17 0.15 0.42
-0.21 -0.52 -0.1 0.16 0.18 0.32
-0.18 -0.44 -0.1 0.07 0.3 0.23
-0.49 -0.35 -0.09 0.19 0.12 0.42
-0.22 -0.44 -0.08 0.14 0.16 0.3
-0.23 -0.45 -0.33 0.07 0.39 0.34
-0.09 -0.44 -0.12 0.03 0.22 0.29
-0.24 -0.43 -0.36 0.11 0.3 0.4
-0.7 -0.46 -0.05 0.07 0.22 0.56
-0.46 -0.41 -0.1 0.14 0.16 0.46
-0.14 -0.49 -0.1 0.16 0.08 0.34
-0.01 -0.86 -0.26 0.18 0.31 0.32
-0.14 -0.55 -0.33 0.1 0.28 0.41
-0.33 -0.46 -0.22 0.1 0.29 0.4
-0.03 -0.57 -0.29 0.08 0.23 0.37
-0.02 -0.72 -0.42 0.13 0.29 0.43
-0.14 -0.59 -0.27 0.19 0.22 0.38
-0.02 -0.57 -0.44 0.26 0.22 0.32
-0.03 -0.57 -0.54 0.29 0.29 0.29
-0.08 -0.54 -0.28 0.18 0.12 0.4
-0.11 -0.47 -0.49 0.27 0.23 0.34
-0.25 -0.47 -0.31 0.26 0.1 0.45
-0.44 -0.47 -0.25 0.17 0.29 0.43
-0.21 -0.55 -0.09 0.18 0.13 0.36
-0.21 -0.92 -0.29 0.35 0.24 0.42
-0.33 -0.39 -0.3 0.26 0.32 0.25
0.01 -0.62 -0.43 0.14 0.21 0.42
-0.22 -0.55 -0.44 0.19 0.3 0.42
-0.32 -0.47 -0.35 0.24 0.37 0.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.