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Heatmap: Cluster_9 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.21 -0.9 -0.95 0.04 1.13 -0.21
-0.21 -0.07 -0.66 0.32 0.56 -0.28
-0.37 -0.37 0.03 0.3 0.38 -0.18
1.27 0.17 -1.38 -0.7 0.27 -1.9
0.17 0.37 -1.77 0.17 0.31 -0.11
1.09 -2.92 0.12 -1.04 0.57 -0.56
0.03 -0.71 -1.01 0.05 0.66 0.33
0.11 -0.45 -0.49 -0.16 0.31 0.42
0.03 -0.43 -0.32 0.19 0.18 0.22
0.91 -0.22 -0.73 -1.26 0.49 -0.26
0.46 -0.44 -1.73 0.32 0.45 -0.03
0.72 -0.07 -1.49 -0.32 -0.11 0.39
-0.18 -0.61 -0.22 0.22 0.39 0.17
0.56 0.11 -0.88 0.24 0.38 -1.27
-0.55 -1.09 -0.41 -0.28 1.35 -0.46
0.3 -0.89 -0.0 -0.62 0.91 -0.51
-0.07 -0.32 -0.13 0.29 0.15 -0.01
0.08 -0.76 -0.29 0.45 0.72 -0.95
0.78 -0.83 -1.77 -1.32 1.02 -0.01
0.21 -0.19 -0.23 -0.19 0.24 0.07
0.42 -1.48 0.12 0.23 0.16 -0.1
0.62 -0.98 -0.77 -0.7 0.54 0.37
0.62 -2.59 -1.23 -0.5 0.94 0.31
-0.59 -0.29 -1.39 0.09 0.98 0.13
0.21 -0.5 -0.08 -0.25 0.58 -0.23
0.3 -0.83 0.07 -0.01 0.52 -0.45
-0.46 -1.28 -0.11 0.8 0.78 -1.06
1.16 -1.04 -2.12 -0.39 0.61 -0.39
0.11 -0.63 -0.49 0.19 0.45 0.08
-0.08 -0.93 -0.54 0.25 0.63 0.15
0.22 -0.28 -0.01 0.03 0.44 -0.64
0.73 -0.74 -0.63 -0.25 0.54 -0.31
1.13 0.42 -1.16 -1.27 0.27 -1.3
0.52 -0.47 -1.05 -0.12 0.07 0.47
-0.34 -1.54 -0.03 -0.21 0.65 0.54
1.05 0.57 -0.44 -2.88 0.22 -1.31
0.27 -0.95 0.08 0.11 0.52 -0.5
0.27 -0.67 -0.72 -0.39 0.56 0.4
-0.65 -2.11 -0.13 0.36 0.61 0.48
-0.5 -0.24 0.13 0.49 0.27 -0.41
0.48 -1.61 0.14 -0.08 0.3 -0.0
-0.25 - 0.45 -0.91 1.39 -0.63
-0.04 0.15 -0.87 -0.05 0.48 0.02
-0.1 -0.76 -0.42 0.26 0.94 -0.69
0.98 -0.83 -1.5 -2.94 1.15 -0.38
0.03 -0.19 -0.53 -0.33 0.19 0.56
0.09 -0.04 -0.46 0.1 -0.01 0.23
0.1 -0.49 0.03 0.01 0.28 -0.04
0.22 0.19 -0.61 -0.05 0.19 -0.1
-0.35 -0.83 -0.74 0.08 0.69 0.48
0.74 -0.08 -0.75 -1.83 0.11 0.52
0.06 -0.41 0.0 0.05 0.2 0.02
0.83 -3.02 -1.75 0.19 0.39 0.43
0.55 -0.33 -0.47 -1.02 0.85 -0.47
0.42 -0.69 -0.04 0.15 0.09 -0.15
0.52 -1.59 -0.32 0.29 0.65 -0.64
-0.19 -0.97 -0.04 0.5 0.5 -0.31
0.63 -0.6 -1.24 -0.99 0.22 0.76
0.28 -1.31 -0.64 0.22 0.77 -0.19
-0.18 -0.44 -0.2 0.22 0.37 0.08
1.12 0.41 -2.13 -1.1 0.69 -2.4
0.24 -0.1 -0.72 -0.05 0.52 -0.2
-0.29 -0.34 -0.72 0.17 1.03 -0.69
0.12 -0.46 -0.08 0.36 0.26 -0.4
0.36 -0.86 -0.81 0.64 0.44 -0.57
1.26 - - -1.99 1.75 -
1.23 -1.08 -27.51 - 1.67 -
1.12 -0.85 -0.89 -0.08 0.36 -0.98
0.39 -0.24 -0.35 -0.05 0.01 0.12
0.09 -2.88 -1.38 0.17 1.06 0.28
-0.12 -0.78 -0.93 0.35 0.72 0.08
0.09 -1.08 -1.11 -0.15 0.89 0.31
0.59 0.11 -1.65 -0.56 0.07 0.46
-0.16 -0.44 -0.12 0.16 0.42 -0.02
0.17 -1.06 -1.42 -0.06 0.57 0.66
0.17 -1.21 -1.28 0.35 0.6 0.31
0.49 -0.78 -0.41 0.08 0.28 -0.01
0.6 -1.09 -0.15 -0.85 0.69 -0.08
0.96 -0.03 -0.77 -1.37 0.54 -0.62
0.06 -0.35 -0.15 0.22 -0.08 0.23
0.72 0.49 -0.42 -0.13 0.03 -1.93
-0.77 -0.47 0.12 -0.02 0.41 0.38
-0.04 -0.35 -0.66 0.59 0.57 -0.68
0.11 0.02 -1.43 0.32 0.26 0.13
-0.05 -2.47 -1.7 0.17 1.3 -0.05
-0.25 -0.06 -0.11 -0.36 0.37 0.27
0.3 -0.12 -0.99 -0.25 1.01 -1.02
0.22 -0.45 -0.6 -0.01 0.23 0.36
0.26 -1.6 -0.74 0.47 0.84 -0.52
0.02 -0.81 -0.02 -0.76 0.48 0.54
-0.41 -1.06 0.56 0.22 0.81 -1.46
1.51 - -0.1 -0.97 0.77 -
0.76 -0.83 -1.99 -0.45 0.69 0.18
0.79 - -0.71 - 1.64 -0.89
0.1 -1.23 -0.41 0.26 0.79 -0.28
0.64 -0.75 -0.6 -0.9 0.55 0.25
0.86 -1.77 -0.72 -0.24 0.42 0.13
0.33 -1.89 -0.54 -0.58 1.15 -0.17
0.4 -0.7 -1.58 0.19 0.74 -0.13
0.7 -0.21 -2.88 -0.21 0.58 0.02
0.6 -0.7 -1.89 0.08 0.86 -0.46
0.5 -0.91 -1.63 0.62 0.28 -0.02
0.21 -0.1 -0.21 -0.07 -0.13 0.24
-0.26 -0.75 -0.94 -0.02 0.71 0.51
0.19 -0.18 -0.56 -0.07 0.12 0.34
-0.07 -1.07 -0.15 0.36 0.76 -0.53
0.37 -2.24 -0.65 -0.95 1.12 0.23
0.19 -0.86 -0.77 -0.04 1.36 -2.4
-0.47 -0.32 -0.32 -0.27 0.41 0.6
-0.0 -0.63 -0.19 -0.01 0.57 -0.0
0.42 -0.58 0.1 -0.1 -0.19 0.16
0.04 -0.21 -0.58 0.15 0.25 0.19
0.01 -0.32 -0.77 0.01 0.85 -0.33
-0.55 -0.92 -0.69 0.46 0.64 0.31
-0.15 -0.3 -0.44 0.13 0.27 0.32
0.28 -0.47 -0.75 0.22 0.04 0.35
0.0 -0.02 -1.11 0.05 0.22 0.43
-0.63 -0.91 -0.61 0.37 0.93 -0.04
-0.28 -0.2 -0.57 0.09 0.51 0.2
0.59 -0.45 -1.09 -0.55 1.07 -0.97
-0.23 -0.44 -0.96 0.51 0.67 -0.18
-0.12 -0.63 -1.05 -0.53 1.33 -0.41
-0.39 -3.55 0.19 -0.61 1.02 0.42
0.83 0.58 -1.17 -0.24 -0.09 -1.02
1.0 -2.96 0.19 -0.97 0.69 -0.71
1.13 -2.88 -3.15 - 1.49 -0.41
0.16 -0.35 -0.6 -0.43 0.57 0.27
0.46 -0.29 -0.32 0.08 -0.35 0.22
0.65 -1.82 -0.81 0.12 0.57 0.0
1.6 0.1 -2.92 -0.7 -0.5 -1.15
0.25 -0.45 -0.31 -0.38 0.59 0.0
0.68 -0.07 -1.26 -0.38 0.12 0.24
0.4 -0.52 0.03 0.1 0.32 -0.64
-0.19 -0.73 -0.9 0.31 0.81 -0.02
0.89 0.56 -0.58 0.09 -0.94 -1.26
0.06 -0.16 -0.76 0.33 0.53 -0.38
0.35 -0.99 -0.23 -0.5 0.34 0.48
-0.04 -0.78 -0.45 0.19 0.48 0.23
0.79 -0.2 -1.47 -0.1 0.68 -0.98
0.43 -0.65 -0.86 -0.01 0.36 0.25
0.47 0.1 -0.89 -0.79 0.16 0.39
0.31 -1.0 -0.09 -0.41 0.59 0.1
0.61 -0.44 -0.81 -0.66 0.4 0.27
0.58 -2.58 -1.1 -0.07 0.32 0.74
0.31 -0.37 -0.18 0.36 0.47 -1.19
0.37 -2.75 -0.16 -0.08 0.72 0.1
0.25 -0.73 -0.65 -0.3 0.59 0.33
0.74 0.67 -0.43 -0.03 -0.54 -1.59
0.51 -0.5 0.02 -0.46 -0.18 0.31
0.71 -2.75 -0.86 0.48 0.58 -0.36
0.12 -1.64 -0.73 0.19 0.24 0.74
-0.44 -0.39 -0.28 0.13 0.59 0.11
0.32 -0.6 -0.37 -0.01 0.3 0.14
0.77 -0.95 0.04 0.27 0.39 -2.15
0.55 -0.6 -0.73 -0.1 0.51 -0.12
1.16 -3.09 -0.07 - 0.53 0.32
0.25 -0.49 -0.6 0.1 0.41 0.06
1.01 -1.15 -3.81 -3.37 0.87 0.63
1.03 0.01 -0.48 -0.34 -0.29 -0.66
0.28 -0.71 -0.87 0.11 0.97 -0.77
0.7 -0.24 -1.14 -0.62 0.3 0.26
0.99 -0.38 -1.17 -1.6 0.54 0.02
0.14 -0.47 -0.65 -0.35 0.96 -0.3
-0.21 -0.43 0.2 0.35 0.0 -0.05
0.97 -0.6 -1.87 0.27 0.09 -0.24
0.37 -0.78 -0.98 -0.06 0.82 -0.17
0.04 -0.38 -0.34 -0.05 0.44 0.12
0.59 -0.77 -0.78 -0.29 0.45 0.2
0.46 0.21 -0.81 0.21 0.1 -0.58
0.24 -0.28 -0.38 -0.17 0.16 0.29
-0.03 -0.43 -0.67 0.04 0.71 -0.01
0.64 1.05 -1.37 -0.51 -0.16 -1.37
-0.64 -0.67 -0.71 0.5 0.45 0.43
0.65 -0.63 -0.5 -0.21 0.58 -0.47
-0.17 -0.49 -0.79 0.09 1.08 -0.62
0.15 -0.25 -0.46 -0.12 0.7 -0.36
0.36 -2.06 0.06 -0.13 0.39 0.27
0.27 -0.31 -0.58 0.06 0.25 0.13
-0.38 -1.77 -1.02 0.62 0.5 0.58
0.55 - -0.62 -1.01 1.42 -0.49
1.19 -0.01 - -0.56 1.03 -
-0.33 -0.35 0.39 0.19 0.09 -0.15
-0.06 -2.44 -0.07 0.17 1.04 -0.48
0.51 -1.71 -0.14 -1.13 0.89 0.08
0.42 -0.29 -0.53 0.09 0.25 -0.14
-0.46 -0.43 0.41 0.36 0.14 -0.29
0.39 -0.74 -0.57 0.14 0.26 0.16
1.28 -0.6 -3.13 -1.05 -0.22 0.54
-0.0 -0.42 -1.47 0.11 0.68 0.28
0.11 -0.12 -0.3 0.01 -0.03 0.27
0.87 -0.71 -0.68 -0.56 0.84 -1.07
0.71 -2.91 -2.66 - 2.03 -
0.04 -0.47 -0.2 0.4 0.12 -0.04
0.16 -1.34 0.33 -0.7 0.85 -0.3
-0.04 -0.48 -0.09 -0.0 0.73 -0.49
0.34 -0.84 -0.64 0.26 0.67 -0.43
0.75 0.06 -0.91 -0.39 -0.05 0.02
0.44 -2.33 -2.3 -1.92 1.37 0.48
0.6 -0.26 -0.79 -0.47 0.2 0.26
0.2 -0.83 -1.69 -0.01 0.62 0.54
0.07 -0.64 -0.03 0.03 0.53 -0.21
-0.11 -1.19 -0.56 0.43 0.81 -0.22
0.11 -0.87 0.02 0.14 0.35 -0.03
0.99 -1.0 -0.48 -1.13 0.71 -0.5
0.43 -0.74 -0.96 0.39 0.39 -0.13
0.47 -2.96 -0.08 -0.54 0.81 0.13
1.84 - -1.44 - 1.03 -
0.34 -1.14 -0.2 0.01 0.6 -0.17
0.68 -0.55 -0.9 -0.01 0.03 0.21
0.96 -2.55 - -0.22 1.08 -0.15
0.78 -4.3 -0.94 -0.96 1.07 0.13
0.28 -0.41 -0.16 0.09 0.27 -0.19
0.73 -0.69 -1.22 0.01 0.11 0.27
0.79 - -2.7 0.45 0.28 0.63
0.6 -0.24 -3.55 -0.41 0.92 -0.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.