Heatmap: Cluster_189 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.22 -0.47 -0.37 0.01 0.04 0.68
-0.18 -0.49 -0.33 0.18 0.01 0.56
0.07 -0.7 -0.59 -0.09 0.39 0.51
-0.07 -0.82 -0.57 0.08 0.26 0.64
-0.07 -0.54 -0.43 0.03 0.21 0.53
-0.08 -0.41 -0.43 -0.16 0.31 0.51
-0.0 -0.74 -0.63 0.18 0.17 0.58
0.1 -0.7 -0.49 -0.12 0.11 0.68
-0.01 -0.58 -0.48 -0.11 0.26 0.58
-0.19 -0.49 -0.36 0.2 0.05 0.53
0.14 -0.74 -0.64 0.17 0.07 0.57
-0.03 -0.55 -0.54 0.07 0.11 0.61
0.06 -0.76 -0.52 0.06 0.16 0.6
0.04 -0.44 -0.47 0.1 0.01 0.52
-0.02 -0.72 -0.73 0.16 0.22 0.6
-0.31 -0.76 -0.25 -0.01 0.23 0.67
-0.03 -0.37 -0.29 0.08 0.07 0.39
-0.04 -0.96 -0.68 0.05 0.23 0.75
-0.13 -0.94 -0.59 0.11 0.25 0.71
-0.13 -0.74 -0.58 0.02 0.26 0.68
0.05 -1.0 -0.7 0.11 0.08 0.78
-0.19 -0.61 -0.34 0.02 0.02 0.72
0.01 -0.67 -0.35 0.01 0.15 0.55
-0.02 -0.59 -0.52 -0.08 0.22 0.62
-0.03 -0.5 -0.41 -0.19 0.13 0.67
0.02 -0.78 -0.71 0.07 0.2 0.67
-0.19 -0.83 -0.41 0.09 0.26 0.63
-0.3 -0.82 -0.74 0.34 0.21 0.68
0.15 -0.71 -0.61 0.02 0.07 0.64
0.1 -0.63 -0.6 -0.11 0.16 0.66
-0.42 -0.95 -0.54 0.31 0.15 0.76
-0.18 -0.58 -0.34 0.14 -0.05 0.67
0.03 -0.84 -0.57 0.18 0.2 0.56
0.04 -0.78 -0.61 -0.11 0.23 0.71
0.01 -0.62 -0.61 0.0 0.35 0.5
0.21 -0.74 -0.69 -0.11 0.19 0.64
-0.17 -0.53 -0.33 -0.14 0.11 0.71
-0.2 -0.51 -0.13 -0.23 0.13 0.64
-0.25 -0.79 -0.6 -0.02 0.27 0.79
0.02 -0.89 -0.73 0.04 0.22 0.72
-0.13 -0.92 -0.58 -0.0 0.22 0.79
-0.02 -0.89 -0.43 -0.0 0.18 0.68
-0.04 -0.69 -0.38 0.06 0.2 0.54
-0.1 -0.98 -0.44 -0.03 0.16 0.78
-0.02 -0.68 -0.37 0.03 0.09 0.62
-0.04 -0.53 -0.24 0.11 0.02 0.48
-0.07 -0.6 -0.54 0.01 0.21 0.62
-0.04 -0.64 -0.28 0.01 0.12 0.56
-0.1 -0.44 -0.34 0.11 0.02 0.53
-0.25 -0.48 -0.37 0.24 0.07 0.52
0.1 -0.68 -0.52 0.02 0.22 0.51
-0.05 -0.63 -0.34 0.09 0.05 0.58
0.29 -0.65 -0.53 0.01 -0.0 0.53
-0.05 -0.62 -0.55 0.03 0.26 0.57
0.12 -0.94 -0.83 0.01 0.25 0.71
0.05 -0.87 -0.73 -0.03 0.25 0.71
-0.12 -0.71 -0.69 0.16 0.26 0.62
-0.19 -0.73 -0.23 0.07 0.05 0.66
-0.11 -0.54 -0.42 0.05 0.2 0.55
-0.05 -0.75 -0.59 -0.08 0.28 0.7
-0.07 -0.76 -0.51 -0.0 0.02 0.8
-0.08 -0.81 -0.42 0.15 0.11 0.62
-0.12 -0.79 -0.58 0.15 0.21 0.64
-0.08 -0.75 -0.64 0.06 0.17 0.72
-0.08 -0.61 -0.3 -0.02 -0.08 0.73
-0.15 -0.48 -0.36 0.07 0.11 0.57
0.2 -0.7 -0.59 0.09 0.15 0.48
-0.17 -0.65 -0.56 0.2 0.03 0.7
-0.09 -0.8 -0.49 0.07 0.17 0.68
0.02 -0.73 -0.59 -0.01 0.1 0.72
-0.11 -0.51 -0.41 0.0 0.1 0.63
-0.1 -0.42 -0.43 0.13 0.01 0.56
-0.09 -0.63 -0.34 0.09 0.13 0.55
-0.07 -0.67 -0.51 0.1 0.23 0.56
-0.25 -0.89 -0.49 0.37 0.18 0.57
-0.02 -0.55 -0.41 0.08 0.08 0.55
-0.15 -0.56 -0.37 -0.15 0.19 0.68
-0.04 -0.9 -0.64 0.02 0.35 0.65
-0.17 -0.63 0.03 -0.16 -0.05 0.66
0.08 -0.86 -0.78 -0.03 0.15 0.79
-0.2 -0.69 -0.13 0.09 0.16 0.5
0.02 -0.6 -0.62 0.03 0.2 0.59
-0.09 -0.89 -0.69 0.11 0.27 0.69
-0.14 -0.66 -0.65 0.17 0.28 0.57
0.15 -0.78 -0.56 -0.0 0.15 0.61
0.08 -0.81 -0.52 0.03 0.15 0.63
-0.19 -0.47 -0.31 0.17 0.08 0.5
0.15 -0.56 -0.45 0.0 0.05 0.52
0.21 -0.64 -0.44 -0.08 0.06 0.56
0.13 -0.95 -0.66 0.11 0.19 0.62
0.04 -0.67 -0.38 0.07 0.04 0.59
-0.29 -0.37 -0.52 0.21 0.2 0.49
-0.14 -0.81 -0.43 0.18 0.12 0.64
-0.09 -0.58 -0.43 -0.1 0.25 0.61
-0.05 -0.42 -0.24 0.01 0.07 0.47
-0.18 -0.56 -0.34 0.01 0.22 0.56
0.0 -0.7 -0.63 -0.04 0.27 0.64
-0.25 -0.69 -0.53 0.25 0.14 0.64
-0.13 -0.6 -0.53 0.07 0.02 0.74
-0.11 -0.63 -0.64 0.07 0.24 0.64
0.01 -0.68 -0.62 0.18 0.13 0.57
-0.16 -0.76 -0.82 -0.26 0.27 0.93
-0.0 -0.57 -0.4 0.01 0.08 0.59
-0.08 -0.65 -0.33 0.06 0.19 0.52
-0.05 -0.46 -0.36 0.24 -0.03 0.45
-0.18 -0.85 -0.36 0.08 0.23 0.63
-0.34 -0.55 -0.72 -0.17 0.28 0.86
-0.08 -0.8 -0.71 0.21 0.16 0.68
0.07 -0.61 -0.31 -0.18 0.18 0.56
-0.26 -0.85 -0.57 0.42 0.11 0.6
-0.25 -0.57 -0.38 0.18 0.2 0.52
-0.19 -0.7 -0.32 0.05 0.08 0.69
-0.04 -0.74 -0.32 -0.23 0.19 0.7
0.0 -0.45 -0.39 0.0 0.05 0.55
0.13 -0.82 -0.59 -0.04 0.14 0.68
-0.14 -1.15 -0.18 0.05 0.17 0.67
-0.12 -0.7 -0.2 -0.04 0.01 0.69
-0.01 -0.44 -0.43 0.17 -0.01 0.5
-0.08 -0.56 -0.37 -0.01 0.07 0.64
-0.09 -0.84 -0.82 0.21 0.17 0.72
-0.05 -0.7 -0.31 0.06 0.11 0.58
-0.09 -0.99 -0.47 0.02 0.22 0.73
-0.4 -0.36 -0.07 -0.15 0.22 0.53
-0.04 -0.59 -0.56 0.04 0.18 0.61
-0.01 -0.67 -0.54 0.08 0.26 0.53
-0.07 -0.6 -0.24 0.13 0.01 0.52
0.09 -0.53 -0.33 -0.12 0.13 0.52
0.02 -0.6 -0.35 -0.04 0.02 0.64
-0.1 -0.59 -0.37 0.05 0.05 0.64
-0.21 -0.48 0.03 0.01 0.06 0.43
-0.2 -0.6 -0.66 0.1 0.19 0.7
-0.19 -0.85 -0.55 0.24 0.11 0.7
0.02 -0.94 -0.53 0.08 0.23 0.63
-0.04 -0.83 -0.61 0.13 0.23 0.62
0.03 -0.9 -0.49 -0.01 0.03 0.78
-0.08 -0.76 -0.31 0.11 0.07 0.61
0.09 -0.58 -0.51 -0.07 0.2 0.55
-0.09 -0.61 -0.65 0.11 0.21 0.62
-0.11 -0.61 -0.44 -0.11 0.34 0.58
-0.08 -0.83 -0.48 -0.09 0.26 0.72
-0.11 -0.62 -0.52 0.01 0.22 0.64
0.07 -0.61 -0.26 -0.09 -0.03 0.63
-0.05 -0.84 -0.67 -0.01 0.36 0.65
-0.35 -1.21 -0.71 0.38 0.19 0.8
-0.26 -0.41 -0.45 0.05 0.13 0.63
-0.04 -0.61 -0.43 -0.08 0.32 0.52
0.08 -0.72 -0.6 0.08 0.24 0.52
0.01 -0.75 -0.32 0.0 0.04 0.65
-0.04 -0.72 -0.53 0.09 0.25 0.56
0.16 -0.78 -0.6 -0.22 0.23 0.68
-0.18 -1.09 -0.74 0.1 0.26 0.84
-0.07 -0.77 -0.62 -0.0 0.25 0.7
-0.4 -0.61 -0.28 0.2 0.17 0.57
-0.07 -0.71 -0.35 0.09 0.08 0.62
0.01 -0.87 -0.68 0.07 0.3 0.63
-0.05 -0.96 -0.59 0.1 0.28 0.65
-0.17 -0.5 -0.22 0.12 -0.01 0.54
-0.11 -0.46 -0.49 0.17 -0.09 0.65
-0.24 -0.63 -0.45 0.19 0.13 0.62
-0.04 -0.8 -0.57 0.06 0.25 0.64
-0.2 -0.5 -0.19 -0.19 0.22 0.59
-0.19 -0.6 -0.36 0.2 0.11 0.54
-0.01 -0.52 -0.36 -0.14 0.31 0.47
-0.03 -0.64 -0.42 -0.11 0.09 0.71
0.04 -0.57 -0.63 -0.13 0.17 0.69
0.12 -0.59 -0.61 -0.13 0.2 0.61
0.02 -0.64 -0.5 -0.1 0.15 0.67
-0.02 -0.57 -0.51 0.2 -0.11 0.64

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.