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Heatmap: Cluster_417 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.46 -0.47 -0.34 0.43 0.33 0.21
-0.55 -0.55 -0.36 0.58 0.63 -0.29
-0.29 -0.56 -0.47 0.5 0.53 -0.1
-0.8 -0.69 0.08 0.55 0.49 -0.17
-1.15 -0.94 0.07 0.53 0.45 0.22
-0.69 -0.57 -0.52 0.7 0.59 -0.18
-0.59 -0.31 -0.15 0.45 0.54 -0.31
-0.25 -0.93 0.24 0.31 0.18 0.12
-0.4 -0.62 -0.14 0.43 0.39 0.02
-0.41 -0.44 -0.4 0.4 0.5 0.02
-0.32 -0.59 -0.06 0.4 0.35 -0.03
-1.51 -1.07 -0.05 0.67 0.72 -0.03
-0.59 -0.82 -0.36 0.38 0.58 0.25
-0.63 -0.62 -0.05 0.44 0.48 -0.02
-0.09 -0.27 -0.1 0.41 0.11 -0.16
-0.66 -0.75 -0.1 0.23 0.59 0.22
-0.95 -0.78 -0.41 0.57 0.59 0.21
-0.46 -0.58 -0.23 0.48 0.35 0.12
-0.26 -0.56 -0.11 0.37 0.37 -0.04
-0.64 -0.54 -0.16 0.41 0.43 0.14
-0.23 -0.79 -0.15 0.28 0.48 0.08
-0.92 -0.76 0.32 0.55 0.51 -0.43
-1.54 -1.17 0.23 0.73 0.65 -0.31
-0.48 -0.58 -0.36 0.28 0.56 0.2
-0.46 -0.82 -0.55 0.6 0.66 -0.1
-0.61 -2.3 -0.69 1.13 0.53 -0.17
-0.4 -0.47 -0.25 0.43 0.41 0.01
-0.37 -0.5 -0.21 0.41 0.44 -0.05
-0.42 -0.67 -0.55 0.65 0.58 -0.19
-0.32 -0.63 -0.27 0.45 0.37 0.09
-0.17 -0.51 -0.16 0.39 0.32 -0.05
-0.86 -0.51 -0.01 0.42 0.45 0.06
-0.41 -0.28 -0.02 0.44 0.14 -0.03
-0.44 -0.45 -0.17 0.4 0.47 -0.08
-0.6 -0.85 -0.21 0.46 0.41 0.28
-0.97 -0.75 -0.14 0.54 0.51 0.15
-1.32 -0.73 0.02 0.68 0.64 -0.28
-0.43 -0.45 -0.4 0.29 0.61 0.02
-0.56 -0.85 0.05 0.25 0.54 0.12
-0.38 -0.66 -0.45 0.46 0.59 -0.01
-0.27 -0.64 -0.27 0.46 0.46 -0.08
-0.27 -0.53 -0.24 0.49 0.36 -0.09
-0.31 -0.96 -0.31 0.56 0.53 -0.06
-0.54 -0.55 -0.29 0.24 0.51 0.27
-0.84 -0.51 -0.08 0.41 0.48 0.1
-0.86 -0.79 -0.02 0.48 0.63 -0.09
-0.2 -0.6 -0.21 0.38 0.44 -0.08
-0.53 -0.75 -0.13 0.37 0.52 0.09
-0.85 -0.71 -0.46 0.59 0.53 0.21
-1.25 -0.84 -0.04 0.81 0.71 -0.59
-0.32 -0.46 -0.25 0.34 0.41 0.06
-0.27 -0.8 0.01 0.35 0.37 0.04
-0.31 -0.75 -0.73 0.54 0.8 -0.32
-1.09 -0.5 -0.03 0.54 0.49 -0.02
-0.49 -0.67 -0.04 0.58 0.45 -0.29
-0.16 -0.59 -0.27 0.42 0.27 0.1
-0.29 -1.34 -0.24 0.63 0.41 0.09
-0.23 -0.71 -0.13 0.53 0.39 -0.21
-0.38 -0.41 -0.19 0.43 0.38 -0.08
-0.46 -0.8 -0.65 0.5 0.59 0.19
-0.6 -0.7 -0.06 0.43 0.44 0.1
-0.45 -0.46 -0.13 0.37 0.36 0.08
-0.64 -0.86 -0.5 0.71 0.56 -0.01
-0.62 -1.04 0.09 0.44 0.41 0.16
-0.34 -0.49 -0.11 0.38 0.35 -0.01
-0.52 -0.99 -0.15 0.42 0.59 0.08
-0.19 -0.7 -0.2 0.41 0.33 0.08
-0.8 -0.55 -0.05 0.49 0.47 -0.03
-0.12 -1.56 -0.55 0.4 0.62 0.26
-0.66 -0.46 -0.23 0.56 0.44 -0.07
-1.01 -0.71 0.09 0.62 0.48 -0.16
-0.41 -0.57 -0.18 0.32 0.42 0.14
-0.68 -0.53 -0.31 0.4 0.53 0.15
-0.39 -0.38 -0.41 0.29 0.49 0.13
-0.37 -0.49 -0.15 0.41 0.46 -0.15
-0.56 -0.58 -0.41 0.63 0.55 -0.16
-0.31 -0.75 -0.35 0.4 0.53 0.07
-0.44 -0.57 -0.33 0.46 0.42 0.1
-0.58 -1.44 -0.01 0.51 0.53 0.14
-0.44 -0.57 -0.14 0.33 0.57 -0.09
-0.73 -0.57 -0.37 0.53 0.59 -0.01
-0.29 -0.76 -0.2 0.46 0.39 0.05
-0.34 -1.34 -0.71 0.85 0.63 -0.22
-0.43 -0.49 -0.14 0.32 0.47 0.02
-0.25 -0.51 -0.17 0.41 0.12 0.21
-0.25 -0.52 -0.19 0.24 0.49 -0.0
-0.31 -0.79 -0.19 0.37 0.52 0.01
-0.74 -0.94 -0.46 0.6 0.58 0.2
-0.26 -0.74 -0.5 0.43 0.5 0.13
-0.55 -0.9 -0.21 0.52 0.36 0.27
-0.34 -0.49 -0.14 0.3 0.41 0.03
-0.98 -0.75 -0.23 0.53 0.64 0.06
-0.28 -0.77 -0.21 0.41 0.38 0.13
-0.59 -0.5 -0.24 0.57 0.39 -0.02
-0.65 -0.7 -0.01 0.57 0.42 -0.1
-0.44 -0.35 -0.04 0.37 0.33 -0.06
-0.03 -1.38 -0.31 0.38 0.52 0.14
-0.43 -0.54 -0.12 0.44 0.51 -0.2
-0.57 -1.24 0.13 0.61 0.44 -0.1
-1.31 -1.12 -0.27 0.65 0.63 0.25
-1.04 -0.82 0.0 0.55 0.47 0.13
-0.53 -0.71 -0.16 0.43 0.51 0.05
-0.98 -1.05 -0.23 0.59 0.48 0.33
-0.41 -0.37 -0.3 0.33 0.42 0.09
-0.67 -1.13 0.17 0.56 0.54 -0.21
-0.48 -0.32 0.01 0.31 0.14 0.18
-0.83 -0.48 -0.15 0.57 0.5 -0.13
-0.61 -0.5 -0.06 0.48 0.47 -0.15
-1.3 -0.54 -0.22 0.7 0.53 -0.03
-0.5 -0.58 -0.21 0.33 0.48 0.14
-0.14 -0.25 -0.07 0.25 0.26 -0.13
-0.79 -0.53 -0.06 0.51 0.35 0.1
-1.07 -0.68 -0.17 0.6 0.48 0.13
-0.54 -0.6 -0.18 0.38 0.43 0.17
-0.51 -0.86 -0.17 0.57 0.4 0.09
-1.1 -1.27 0.15 0.77 0.61 -0.35
-0.83 -0.74 0.04 0.35 0.51 0.14
-0.65 -0.98 -0.53 0.73 0.63 -0.05
-0.5 -0.58 -0.28 0.54 0.43 0.0
-0.81 -0.71 -0.14 0.67 0.48 -0.11
-0.63 -1.07 -0.43 0.58 0.51 0.28
-0.68 -0.55 -0.12 0.38 0.45 0.14
-0.29 -0.68 -0.28 0.44 0.34 0.15
-0.39 -0.58 -0.37 0.37 0.48 0.14
-0.52 -1.32 -0.37 0.42 0.61 0.34
-0.55 -0.75 -0.13 0.33 0.52 0.17
-0.3 -0.71 -0.33 0.36 0.51 0.09
-0.22 -0.79 -0.18 0.41 0.25 0.23
-0.26 -0.97 0.02 0.43 0.4 -0.03
-0.49 -0.63 -0.32 0.56 0.49 -0.06
-0.4 -0.97 0.06 0.38 0.47 0.01
-0.54 -0.59 -0.29 0.34 0.55 0.14
-0.77 -0.78 -0.27 0.45 0.67 0.07
-0.55 -0.55 -0.18 0.27 0.56 0.11
-0.75 -0.78 -0.38 0.79 0.53 -0.19
-0.53 -0.92 -0.15 0.6 0.55 -0.16
-0.5 -0.85 -0.08 0.53 0.74 -0.56
-0.55 -0.62 -0.09 0.38 0.51 -0.0
-0.56 -0.92 -0.44 0.63 0.62 -0.04
-0.27 -0.62 -0.28 0.53 0.53 -0.31
-0.18 -0.51 -0.32 0.38 0.41 -0.02
-0.5 -0.48 -0.25 0.37 0.53 -0.0
-0.63 -0.65 0.41 0.45 0.39 -0.49
-0.54 -0.61 -0.08 0.48 0.42 -0.03
-0.28 -0.53 -0.2 0.45 0.36 -0.05
-0.75 -0.87 0.07 0.66 0.44 -0.21
-0.26 -0.4 -0.22 0.3 0.39 0.03
-0.75 -0.93 -0.32 0.4 0.63 0.26
-0.51 -0.65 -0.12 0.45 0.44 0.03
-0.5 -0.72 -0.12 0.47 0.47 -0.01
-0.48 -0.72 -0.12 0.56 0.36 0.0
-0.74 -0.55 -0.04 0.49 0.39 0.04
-0.15 -0.51 -0.38 0.47 0.35 -0.04
-0.46 -0.41 -0.08 0.4 0.38 -0.07
-0.61 -0.47 -0.44 0.48 0.61 -0.05
-0.45 -0.72 -0.14 0.32 0.48 0.14
-0.63 -0.66 -0.19 0.49 0.45 0.09
-0.41 -0.55 -0.07 0.38 0.37 0.03
-0.9 -1.3 0.05 0.7 0.73 -0.44
-0.37 -0.41 -0.2 0.37 0.26 0.15
-0.49 -0.92 -0.09 0.48 0.55 -0.05
-0.39 -0.47 -0.02 0.45 0.37 -0.19
-0.54 -0.75 -0.15 0.48 0.51 -0.01
-0.2 -0.6 -0.02 0.43 0.26 -0.1
-0.18 -0.91 -0.4 0.37 0.51 0.15
-0.45 -0.45 -0.23 0.36 0.46 0.04
-0.37 -0.57 -0.28 0.4 0.38 0.14
-0.99 -1.06 0.08 0.94 0.58 -0.88
-0.48 -0.63 -0.14 0.53 0.52 -0.22
-0.4 -0.59 -0.4 0.38 0.51 0.14
-0.18 -0.67 -0.44 0.5 0.36 0.06
-0.17 -0.53 -0.25 0.43 0.4 -0.13
-0.21 -0.6 -0.3 0.38 0.38 0.09
-0.38 -0.54 -0.13 0.55 0.52 -0.44
-0.54 -0.82 -0.71 0.71 0.47 0.16
-0.75 -1.19 -0.71 0.92 0.56 -0.02
-0.33 -0.54 -0.16 0.34 0.42 0.03
-0.25 -0.72 -0.13 0.37 0.4 0.03
-0.31 -0.52 -0.29 0.36 0.39 0.12
-0.55 -0.39 0.1 0.42 0.25 -0.07
-1.07 -1.04 0.07 0.66 0.5 -0.0
-0.18 -0.47 -0.21 0.43 0.34 -0.12
-0.38 -1.12 0.01 0.6 0.32 0.01
-0.58 -0.56 -0.04 0.46 0.27 0.14
-0.41 -0.8 0.03 0.45 0.43 -0.08
-0.95 -1.05 0.01 0.6 0.61 -0.08
-0.4 -0.47 -0.12 0.5 0.27 -0.01
-0.35 -0.45 -0.16 0.37 0.26 0.14
-0.62 -0.64 -0.33 0.59 0.5 -0.0
-0.62 -0.68 -0.18 0.63 0.55 -0.28
-0.45 -0.75 -0.22 0.48 0.5 0.0
-0.29 -0.74 -0.34 0.49 0.4 0.1
-0.33 -0.5 -0.08 0.31 0.35 0.05
-0.22 -0.65 -0.25 0.38 0.4 0.07

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.