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Heatmap: Cluster_378 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.77 -0.33 0.19 0.25 0.18 0.2
-1.7 0.07 0.41 0.36 -0.07 0.1
-0.33 -0.58 -0.06 0.62 0.04 0.03
-2.57 -0.51 0.4 0.69 0.25 0.02
-1.48 -0.37 0.52 0.35 0.16 0.05
-0.56 -0.19 -0.18 0.51 -0.05 0.24
-0.97 0.14 0.35 0.43 -0.08 -0.28
-0.29 -0.41 -0.11 0.11 0.0 0.51
-0.29 -0.16 -0.44 0.6 -0.41 0.36
-0.44 -0.4 -0.11 0.22 -0.17 0.61
-1.22 -0.23 0.16 0.48 0.2 0.08
-0.24 -0.25 0.12 0.27 -0.14 0.14
-1.16 0.07 0.04 0.59 -0.2 0.13
-0.32 -0.26 0.12 0.32 -0.06 0.09
-0.89 -0.35 -0.06 0.39 -0.29 0.67
-0.4 0.05 -0.0 0.49 -0.19 -0.1
-0.5 -0.39 -0.01 0.19 0.03 0.46
-0.56 -0.56 -0.09 0.33 0.2 0.37
-0.81 0.34 0.36 0.3 -0.3 -0.26
-1.35 -0.19 0.19 0.73 0.18 -0.32
-0.51 -0.13 0.11 0.19 0.26 -0.03
-0.17 -0.23 -0.08 0.33 0.23 -0.18
-0.39 -0.41 -0.06 0.1 -0.03 0.55
-0.39 -0.71 -0.11 0.42 -0.01 0.45
-0.46 -0.28 -0.02 0.25 -0.06 0.4
-1.12 -0.09 0.31 0.13 0.24 0.12
-0.39 -0.06 0.29 0.1 0.13 -0.17
-1.1 -0.16 0.11 0.21 0.2 0.32
-0.24 -0.44 0.07 0.25 0.14 0.1
-0.97 0.01 0.42 0.69 -0.47 -0.31
-0.23 0.24 0.26 0.57 -0.37 -0.97
-0.81 -0.23 0.02 0.37 0.2 0.16
-1.46 -0.28 -0.08 0.77 0.18 0.04
-0.31 -0.19 -0.14 0.53 -0.27 0.18
-0.58 -0.22 0.08 0.29 -0.02 0.27
-1.12 -0.22 0.06 0.33 0.16 0.34
-1.27 -0.3 0.01 0.55 0.12 0.28
-0.82 -0.59 0.08 0.23 -0.02 0.63
-0.17 -0.27 0.15 0.35 -0.16 0.02
-0.82 -0.29 0.11 0.47 -0.0 0.21
-0.26 -0.69 -0.16 0.38 0.01 0.42
-0.39 0.02 0.29 0.25 -0.05 -0.24
-0.32 -0.31 0.13 0.42 0.0 -0.06
-0.83 -0.29 -0.05 0.41 -0.19 0.54
-0.61 -0.24 0.3 0.27 -0.18 0.23
-0.3 -0.42 0.1 0.31 -0.14 0.29
-2.14 0.19 0.77 0.16 -0.24 -0.05
-0.39 -0.09 0.13 0.23 0.09 -0.05
-1.49 0.23 0.16 0.26 -0.13 0.31
-0.92 -0.04 0.31 0.65 -0.29 -0.18
-0.33 -0.08 -0.03 0.3 -0.15 0.2
-1.28 -0.01 0.29 0.29 -0.26 0.4
-0.61 -0.45 -0.01 0.15 -0.08 0.65
-0.46 -0.44 0.08 -0.02 -0.14 0.66
-1.21 -0.29 0.17 0.29 0.24 0.28
-0.97 -0.38 0.28 0.75 -0.39 0.09
-1.88 -0.47 -0.19 0.43 0.24 0.67
-0.37 -0.4 0.03 0.31 -0.05 0.31
-0.32 -0.23 0.05 0.31 0.07 0.03
-0.76 0.31 0.13 0.41 -0.14 -0.26
-0.28 -0.37 -0.32 -0.07 0.03 0.7
-0.49 -0.39 0.12 0.19 0.19 0.21
-0.56 -0.09 -0.2 0.5 0.2 -0.07
-0.47 -0.37 -0.17 0.43 -0.04 0.37
-0.84 -0.39 0.04 0.4 0.21 0.22
-1.01 -0.1 0.32 0.45 0.04 -0.11
-1.01 -0.57 -0.1 0.35 0.27 0.5
-0.61 -0.15 0.17 0.47 -0.18 0.08
-0.65 -0.37 0.08 0.21 -0.1 0.53
-0.41 -0.38 0.12 0.31 -0.06 0.26
-0.91 -0.24 0.22 0.41 -0.19 0.32
-0.77 -0.02 0.34 0.35 -0.2 0.03
-0.68 -0.12 0.04 0.26 0.03 0.27
-1.15 -0.62 0.12 0.57 0.29 0.14
-0.55 -0.11 0.24 0.39 -0.25 0.08
-0.52 -0.23 -0.04 0.21 0.2 0.24
-0.38 0.03 0.2 0.4 -0.27 -0.13
-0.77 -0.22 -0.11 0.48 0.03 0.27
-0.27 -0.29 0.2 0.33 -0.08 0.0
-1.27 -0.16 0.15 0.41 0.18 0.15
-0.33 -0.17 -0.13 0.47 0.24 -0.26
-1.33 0.23 0.36 0.53 -0.59 0.05
-0.34 -0.29 -0.11 0.33 -0.37 0.52
-1.5 -0.3 0.34 0.38 0.35 -0.0
-0.87 -0.47 -0.05 0.36 0.06 0.52
-1.03 -0.18 0.05 0.44 0.04 0.27
-0.4 -0.4 -0.09 0.3 -0.02 0.41
-1.61 -0.06 0.25 0.79 -0.61 0.18
-0.2 -0.25 0.05 0.3 0.12 -0.09
-0.85 -0.64 0.08 0.63 0.26 -0.0
-0.5 -0.01 0.25 0.34 -0.13 -0.11
-0.46 -0.37 0.04 0.49 0.17 -0.08
-1.89 0.13 0.47 0.36 0.18 -0.26
-1.03 -0.26 0.17 0.66 -0.29 0.2
-0.73 -0.33 0.24 0.52 0.12 -0.15
-1.54 0.26 0.21 0.42 -0.2 0.12
-1.09 -0.07 0.12 0.43 -0.1 0.27
-1.04 0.0 0.17 0.58 -0.24 0.05
-0.47 0.02 0.08 0.34 0.08 -0.18
-0.29 -0.27 0.11 0.36 0.02 -0.03
-1.28 0.1 0.26 0.5 -0.01 -0.14
-0.17 -0.36 0.11 0.31 0.06 -0.04
-0.87 -0.3 -0.01 0.45 0.05 0.31
-0.37 -0.3 -0.1 0.33 0.15 0.16
-0.69 -0.11 -0.01 0.28 -0.1 0.4
-0.71 -0.14 0.42 0.22 0.31 -0.44
-0.77 -0.14 -0.03 0.25 -0.0 0.42
-0.91 -0.2 0.26 0.43 0.04 0.04
-0.22 -0.31 -0.02 0.3 -0.02 0.17
-1.28 -0.04 0.01 0.37 -0.16 0.51
-1.12 -0.36 0.3 0.67 -0.14 0.05
-0.23 -0.24 0.29 0.34 -0.19 -0.1
-0.65 -0.23 0.13 0.44 -0.03 0.12
-0.75 -0.45 0.19 0.46 0.07 0.15
-1.33 -0.06 0.09 0.59 -0.12 0.21
-1.86 -0.17 0.36 0.75 -0.17 -0.02
-0.67 -0.0 0.42 0.22 -0.01 -0.17
-0.72 -0.5 -0.14 0.6 0.09 0.26
-0.7 -0.11 -0.07 0.45 0.12 0.08
-0.33 0.14 0.12 0.11 -0.14 0.04
-1.52 0.12 0.47 0.19 0.28 -0.28

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.