Heatmap: Cluster_178 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.27 -0.66 -0.92 0.14 0.27 0.4
0.05 -0.75 -0.56 0.07 0.09 0.66
0.33 -0.58 -0.57 -0.16 0.04 0.57
0.44 -0.4 -0.53 -0.2 -0.18 0.52
0.21 -0.29 -0.42 -0.27 0.03 0.52
0.5 -0.48 -0.47 -0.36 0.08 0.39
0.35 -0.31 -0.4 -0.64 0.04 0.58
0.44 -0.61 -0.31 -0.51 -0.17 0.67
0.43 -0.74 -0.64 -0.16 0.23 0.43
0.43 -0.85 -0.98 -0.35 0.36 0.61
0.41 -0.29 -0.7 -0.67 -0.29 0.84
0.35 -0.63 -1.04 -0.31 0.57 0.38
0.29 -0.63 -1.31 -0.02 0.26 0.63
0.55 -0.84 -0.93 -0.31 0.03 0.7
0.13 -0.86 -0.41 -0.18 0.27 0.59
0.12 -0.31 -1.18 -0.1 0.44 0.46
0.16 -0.52 -0.36 -0.19 -0.12 0.69
0.06 -0.42 -0.25 -0.32 -0.12 0.72
0.45 -0.64 -0.94 -0.45 0.24 0.64
0.34 -0.59 -0.74 -0.14 0.4 0.32
0.38 -0.41 -0.63 -0.28 0.09 0.5
0.42 -1.15 -0.9 -0.24 0.34 0.65
0.15 -0.5 -0.69 -0.29 0.36 0.55
0.36 -0.36 -0.56 -0.17 0.06 0.41
0.3 -0.35 -0.56 -0.25 0.07 0.5
0.23 -0.32 -0.89 -0.19 0.19 0.55
0.52 -0.49 -1.05 -0.28 -0.28 0.78
0.7 -0.63 -0.7 -0.39 -0.19 0.56
0.36 -0.95 -0.78 -0.27 0.31 0.63
0.4 -0.49 -0.78 -0.24 0.25 0.43
0.35 -1.03 -0.7 -0.22 0.24 0.66
0.04 -0.68 -0.27 -0.09 0.08 0.6
0.42 -0.56 -0.66 -0.33 -0.03 0.65
0.55 -0.38 -0.9 -0.47 -0.16 0.69
0.25 -0.38 -0.68 -0.22 0.19 0.5
0.23 -0.89 -0.66 -0.19 0.09 0.77
0.21 -0.53 -0.21 -0.36 0.07 0.54
0.17 -0.36 -1.0 -0.55 0.23 0.8
0.62 -0.29 -1.95 -0.79 0.26 0.69
0.41 -0.62 -0.6 -0.54 0.14 0.64
0.33 -0.53 -1.16 -0.81 0.15 0.94
0.27 -0.85 -0.82 -0.09 0.07 0.75
0.33 -0.08 -1.35 -0.39 0.2 0.58
0.29 -0.7 -0.63 -0.3 0.18 0.65
0.31 -0.55 -0.35 -0.22 0.0 0.51
0.46 -0.93 -1.28 -0.05 0.36 0.52
0.29 -0.65 -0.55 -0.43 0.02 0.76
0.5 -0.84 -1.07 -0.07 0.33 0.43
0.31 -0.15 -0.36 -1.48 -0.02 0.79
0.35 -0.62 -0.29 -0.17 -0.06 0.49
0.38 -0.46 -0.87 -0.67 0.08 0.8
0.47 -0.91 -0.89 -0.43 0.07 0.81
-0.04 -0.68 -0.41 -0.17 0.23 0.67
0.21 -0.45 -0.32 -0.37 -0.0 0.62
0.2 -0.83 -0.61 -0.37 0.05 0.87
0.14 -0.21 -0.39 -0.16 0.09 0.39
0.47 -0.93 -1.0 -0.4 0.04 0.85
0.28 -0.6 -0.42 -0.26 0.07 0.58
0.14 -0.46 -0.29 -0.16 0.22 0.37
0.62 -0.89 -0.89 -0.31 0.07 0.61
0.63 -0.52 -1.43 -0.9 0.11 0.82
0.47 -0.28 -1.11 -0.38 -0.01 0.65
0.36 -0.39 -0.55 -0.35 0.01 0.57
0.51 -0.32 -0.79 -0.42 -0.11 0.6
0.36 -0.42 -0.5 -0.43 -0.52 0.87
0.11 -0.11 -0.41 -0.29 0.04 0.47
0.78 -0.41 -0.97 -0.78 -0.3 0.7
0.47 -0.59 -0.48 -0.23 0.0 0.47
0.46 -0.66 -0.91 -0.46 0.17 0.69
0.44 -1.0 -1.03 -0.68 0.01 1.02
0.23 -0.7 -0.47 -0.17 0.03 0.66
0.51 -0.72 -0.89 -0.28 0.11 0.62
0.41 -0.53 -0.7 -0.39 -0.15 0.76
0.54 -0.81 -0.99 -0.44 0.1 0.74
0.35 -0.54 -0.8 -0.39 -0.03 0.79
0.02 -0.84 -0.17 -0.38 0.43 0.51
0.37 -0.29 -0.98 -0.31 0.12 0.58
0.27 -0.59 -0.68 -0.71 0.17 0.82
0.38 -0.29 -0.74 -0.31 0.29 0.33
0.4 -0.49 -0.83 -0.38 -0.22 0.83
0.13 -0.77 -0.04 -0.44 0.2 0.55
0.3 -0.39 -0.46 -0.24 0.31 0.25
0.12 -0.42 -0.6 -0.04 0.22 0.45
0.37 -0.55 -0.59 -0.15 0.11 0.46
0.25 -0.54 -0.7 -0.46 -0.06 0.87
0.22 0.06 -0.57 -0.85 0.28 0.43
0.45 -0.57 -0.35 -0.39 0.31 0.23
0.2 -0.4 -0.53 -0.21 0.14 0.52
0.39 -0.37 -0.52 -0.52 -0.07 0.64
-0.09 -0.65 -0.54 0.35 0.24 0.35
0.36 -0.61 -0.6 -0.06 0.27 0.32
0.39 -0.96 -1.11 -0.29 0.27 0.76
0.15 -0.56 -0.34 -0.23 0.16 0.55
0.5 -0.55 -1.05 -0.4 -0.18 0.83
0.2 -0.7 -0.45 -0.28 -0.02 0.76
0.67 -0.34 -1.7 -1.77 0.01 1.01
0.11 -0.96 -0.66 0.09 0.07 0.73
0.14 -0.31 -0.49 -0.18 0.14 0.48
0.26 -0.49 -0.33 -0.19 -0.01 0.51
0.05 -0.38 -0.49 -0.32 -0.03 0.76
0.12 -0.63 -0.52 -0.17 0.08 0.7
0.12 -0.41 -0.86 -0.66 0.1 0.93
-0.03 -0.81 -0.31 -0.11 0.29 0.58
0.28 -0.77 -0.42 -0.27 0.2 0.56
0.4 -1.05 -0.89 -0.17 0.31 0.62
0.5 -1.39 -1.78 -0.48 -0.15 1.2
0.16 -0.6 -0.9 0.33 0.28 0.28
-0.0 -0.66 -0.36 -0.32 0.19 0.73
0.2 -0.43 -0.39 -0.27 0.04 0.57
0.24 -0.98 -0.24 -0.25 0.03 0.68
0.31 -0.63 -0.79 -0.78 0.19 0.86
0.23 -0.51 -0.89 -0.52 0.48 0.57
0.09 -0.26 -0.54 0.0 0.17 0.36
0.33 -0.59 -0.87 -0.21 -0.08 0.78
0.34 -0.54 -0.25 -0.22 -0.04 0.46
0.5 -0.63 -1.18 -0.31 0.3 0.54
0.66 -0.6 -0.72 -0.54 -0.1 0.61
0.46 -0.5 -0.43 -0.22 -0.0 0.4
0.48 -0.95 -1.01 -0.27 0.25 0.66
0.2 -0.66 -0.74 -0.03 0.02 0.7
0.52 -0.71 -0.79 -0.34 0.18 0.54
0.41 -0.7 -0.67 -0.1 -0.07 0.63
0.42 -0.53 -0.71 -0.21 0.09 0.52
0.55 -0.48 -1.15 -0.63 -0.12 0.85
0.59 -0.8 -0.86 -0.53 0.03 0.72
0.5 -0.47 -0.64 -0.3 0.05 0.46
0.25 -0.75 -0.86 -0.37 0.05 0.89
-0.05 -0.87 -0.81 -0.22 0.73 0.48
0.46 -0.86 -0.65 -0.25 0.16 0.57
0.64 -0.18 -1.08 -0.79 -0.33 0.77
0.39 -0.73 -0.65 -0.48 0.06 0.76
0.42 -0.64 -0.53 -0.26 0.06 0.54
0.32 -0.77 -0.66 -0.17 0.19 0.59
0.41 -0.45 -0.28 -0.31 0.11 0.3
0.39 -0.96 -0.51 -0.51 0.18 0.72
0.56 -0.47 -0.65 -0.22 -0.09 0.45
0.5 -0.62 -0.61 -0.22 0.09 0.44
0.23 -0.6 -0.7 -0.34 0.08 0.77
0.35 -0.5 -0.66 -0.28 0.28 0.43
0.14 -0.85 -0.4 -0.15 0.12 0.67
0.26 -0.44 -0.64 -0.16 0.23 0.43
0.31 -0.85 -0.66 -0.35 0.15 0.75
0.45 -0.34 -0.86 -0.42 0.18 0.49
0.45 -0.5 -0.17 -0.16 0.13 0.07
0.21 -0.57 -0.34 -0.18 0.03 0.56
0.56 -0.63 -0.36 -0.41 0.05 0.4
0.22 -0.88 -0.49 -0.22 0.04 0.76
0.44 -0.25 -1.33 -0.52 0.11 0.7
0.47 -0.74 -0.81 -0.19 0.19 0.51
0.2 -0.45 -0.57 -0.18 0.08 0.59
0.45 -0.79 -0.78 -0.23 0.11 0.62
0.34 -0.3 -0.59 -0.56 -0.02 0.67
-0.02 -0.74 -0.18 -0.16 0.4 0.4
0.33 -0.79 -0.37 -0.45 0.3 0.51
0.34 -0.43 -0.5 -0.41 0.1 0.55
0.26 -0.59 -0.43 -0.08 0.36 0.22
0.28 -0.84 -0.21 -0.26 0.2 0.46
0.35 -0.4 -0.94 -0.22 0.28 0.45
0.31 -0.2 -1.03 -0.49 0.42 0.43
0.31 -0.71 -0.56 -0.18 -0.03 0.68
0.07 -0.02 -0.97 -0.33 -0.02 0.74
0.24 -1.43 -3.34 -0.18 0.42 1.09
0.4 -0.59 -1.09 -0.12 0.35 0.43
0.52 -0.53 -0.9 -0.34 0.02 0.61
0.84 -0.28 -1.93 -1.36 -0.25 0.92
0.2 -0.46 -0.03 -0.13 0.1 0.22
0.41 -0.39 -1.0 -0.62 0.16 0.71
0.42 -0.42 -0.98 -0.25 0.27 0.45
0.59 -0.43 -1.17 -0.77 0.04 0.76
0.46 -0.81 -1.05 -0.22 0.43 0.45
0.5 -0.45 -1.24 -0.42 0.01 0.74
0.65 -1.78 -1.69 -0.26 0.63 0.53
-0.02 -0.91 -0.34 -0.09 0.27 0.63
0.36 -0.66 -0.66 -0.1 0.22 0.44
0.4 -0.59 -0.92 -0.63 0.38 0.63
0.06 -0.52 -0.34 -0.12 -0.04 0.65
0.45 -0.6 -0.82 -0.1 -0.0 0.56
0.23 -0.34 -0.43 -0.23 0.26 0.32
0.13 -0.25 -0.53 -0.06 0.06 0.45
0.2 -0.64 -0.37 -0.16 0.12 0.54
0.34 -0.43 -0.67 -0.55 0.08 0.7
0.62 -1.12 -1.08 -0.48 0.12 0.79
0.06 -0.71 -0.2 -0.12 0.24 0.46
0.45 -0.69 -0.92 -0.34 0.07 0.73
0.54 -0.96 -0.75 -0.35 0.1 0.66
0.34 -0.86 -0.95 -0.43 0.48 0.61
0.45 -0.49 -0.58 -0.28 -0.01 0.52
0.36 -0.28 -0.77 -0.47 0.05 0.64
0.54 -0.57 -0.98 -0.62 0.13 0.7
0.26 -1.41 -0.66 -0.46 0.18 0.95
0.39 -0.53 -0.76 -0.44 0.04 0.71
0.22 -0.98 -0.47 -0.12 0.15 0.66
0.26 -0.48 -0.41 -0.26 0.02 0.56
0.34 -0.68 -0.68 -0.53 0.26 0.67
0.39 -0.8 -1.08 -0.1 -0.09 0.82
0.3 -0.72 -0.37 -0.49 0.27 0.55
0.22 -0.51 -0.28 -0.19 0.2 0.36
0.27 -0.27 -0.36 -0.42 -0.05 0.56
0.22 -0.44 -0.46 -0.23 0.2 0.45
0.24 -0.22 -0.25 -0.38 0.12 0.35
0.21 -0.47 -0.74 -0.14 0.05 0.67
0.37 -0.44 -0.8 -0.48 0.1 0.69
0.3 -0.77 -1.09 -0.35 0.42 0.67
0.33 -0.82 -0.6 -0.25 0.05 0.71
0.32 -0.66 -0.77 -0.07 0.09 0.6
0.26 -0.68 -0.55 -0.05 0.02 0.6
0.16 -0.55 -0.31 -0.23 0.11 0.55
0.75 -0.73 -0.96 -0.45 -0.2 0.68
0.21 -0.45 -0.55 -0.13 0.01 0.6
0.44 -0.62 -0.56 -0.81 0.19 0.69
0.44 -0.79 -0.86 -0.45 0.05 0.81
0.42 -1.05 -1.25 0.05 0.47 0.42
0.51 -0.22 -0.81 -0.81 -0.26 0.81
0.37 -1.1 -1.17 -0.21 0.26 0.8
0.39 -0.38 -0.8 -0.35 0.22 0.48
0.29 -0.45 -0.67 -0.31 -0.06 0.72
0.37 -1.03 -0.91 -0.15 0.18 0.72
0.15 -0.3 -0.56 -0.71 0.18 0.73
0.43 -1.05 -0.86 -0.14 0.27 0.59
0.61 -1.04 -1.47 -0.44 0.09 0.87
0.35 -0.72 -0.62 -0.1 -0.06 0.66
0.4 -0.52 -0.69 -0.24 -0.05 0.64
0.52 -0.99 -1.29 -0.19 0.26 0.66
0.51 -0.95 -1.03 -0.49 0.19 0.78
0.24 -0.61 -0.78 -0.1 0.18 0.6
0.07 -0.59 -0.37 -0.25 0.18 0.62
0.81 -1.1 -1.25 -0.67 -0.02 0.81
0.29 -0.86 -1.05 -0.53 0.05 1.01
0.57 -0.65 -0.8 -0.27 -0.19 0.67
0.76 -0.43 -1.95 -1.63 0.02 0.98
0.51 -0.52 -1.12 -0.48 0.03 0.75
-0.21 -1.1 -0.56 0.15 0.56 0.49
0.28 -0.59 -0.81 -0.31 0.39 0.52
0.5 -0.62 -0.61 -0.35 0.44 0.19
-0.03 -0.8 -1.55 -0.02 0.58 0.69
0.15 -0.72 -0.25 -0.19 0.21 0.49
0.39 -0.69 -1.14 -0.17 0.25 0.61
0.68 -0.52 -1.01 -0.78 -0.09 0.75
0.29 -0.63 -0.34 -0.26 -0.01 0.59
0.73 -1.6 -1.64 -0.69 -0.03 1.07

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.