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Heatmap: Cluster_32 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
16 h after light
4 h after dark
8 h after dark
-0.6 -0.69 0.17 0.71 0.16 -0.24
-1.75 -0.68 0.1 1.13 0.41 -1.06
-0.59 -0.63 -0.39 1.16 0.02 -0.57
-0.67 -0.46 0.07 0.95 0.11 -0.8
-2.64 -1.68 0.97 1.14 -0.04 -1.35
-1.08 -0.05 0.48 0.69 0.12 -1.09
-0.33 -0.62 0.11 0.76 0.13 -0.55
-0.64 -0.56 -0.15 0.94 0.18 -0.47
-1.03 -0.36 0.68 0.49 0.03 -0.52
-1.03 -1.38 0.79 0.59 0.44 -0.9
-2.11 -1.28 0.69 0.86 0.47 -0.84
-1.31 -0.4 0.18 0.86 0.33 -0.65
-0.75 -1.73 -0.21 1.13 0.51 -0.65
-0.54 -0.3 0.28 0.7 0.0 -0.61
-0.64 -0.34 -0.07 0.86 0.25 -0.71
-0.88 -0.41 -0.08 1.06 0.13 -0.78
-0.23 -0.52 0.38 0.51 0.16 -0.72
-0.4 -0.9 0.24 0.71 0.18 -0.38
-5.21 -1.15 1.45 1.08 -0.9 -2.89
-1.15 0.07 0.66 0.77 -0.69 -0.74
-1.78 -0.67 0.03 0.91 0.53 -0.44
-0.56 -0.88 0.35 0.95 0.08 -0.96
-0.69 -0.62 0.5 0.61 0.35 -0.94
-3.38 -1.04 0.79 1.33 -0.2 -1.75
-0.45 -0.8 -1.07 1.6 -0.38 -1.29
-0.82 -0.62 0.01 1.12 -0.02 -0.69
-0.42 -0.9 0.32 0.65 0.22 -0.46
-0.74 -0.03 0.23 0.79 -0.06 -0.86
-0.08 -0.26 -0.15 0.63 0.08 -0.49
-1.55 -0.75 -0.21 1.29 0.29 -0.89
-0.5 -1.05 0.44 0.81 -0.13 -0.34
-0.34 -0.6 0.04 1.16 -0.29 -1.11
-0.53 -0.09 0.4 0.98 -0.62 -1.25
-1.31 -0.24 0.44 0.69 0.22 -0.71
-0.47 -0.33 -0.23 0.83 0.02 -0.26
-0.57 -0.28 0.44 0.6 0.12 -0.87
-1.2 -0.91 0.3 1.64 -1.13 -2.09
-0.81 -0.38 0.14 0.9 0.0 -0.54
-0.31 -0.22 0.65 0.49 -0.24 -0.97
-1.06 -0.21 0.75 0.71 -0.1 -1.25
-0.33 -0.07 0.14 0.58 0.09 -0.76
-0.87 -1.04 0.33 0.83 0.08 -0.2
-0.71 -0.84 0.88 0.75 -0.26 -1.1
-1.13 -0.26 -0.7 1.34 0.18 -1.19
-0.77 -1.65 -0.51 1.54 -0.21 -0.7
-1.14 -0.12 0.6 0.5 0.05 -0.6
-5.04 -1.53 0.7 1.59 -0.11 -3.83
-0.37 -0.6 -0.29 1.12 -0.16 -0.56
-0.2 -0.06 0.14 0.58 -0.07 -0.7
-2.4 -1.08 0.46 1.14 0.43 -1.28
-1.97 -1.3 0.48 1.14 0.32 -1.03
-2.49 -1.51 0.75 1.25 -0.01 -1.28
-0.67 -0.31 -0.16 0.9 0.17 -0.55
-1.86 -0.4 0.75 0.68 0.13 -0.76
-0.62 -1.82 0.18 0.91 0.59 -0.87
-1.41 -1.74 1.31 0.89 -0.65 -1.53
-0.33 -0.43 -0.16 0.97 -0.3 -0.32
-0.95 -0.77 0.05 0.95 0.21 -0.38
-2.41 -0.45 0.77 0.98 0.0 -1.33
-0.72 -0.51 0.31 0.63 0.12 -0.29
-3.85 -3.94 0.63 1.5 0.13 -1.33
-0.54 -0.33 -0.11 1.08 -0.03 -1.03
-0.37 -0.93 0.09 0.85 0.12 -0.43
-0.46 -0.48 -0.06 1.12 0.02 -1.31
-1.04 -0.5 0.83 0.52 -0.06 -0.66
-0.79 -0.48 0.75 0.65 0.07 -1.29
-1.0 -0.67 0.53 1.17 -0.1 -2.0
-1.96 -1.28 0.82 1.06 0.01 -1.1
-0.31 -0.18 0.18 0.34 0.19 -0.38
-0.23 -0.68 0.26 0.98 -0.19 -1.03
-0.52 -0.26 0.41 0.39 0.2 -0.57
-0.6 -0.3 0.12 0.62 0.18 -0.38
-0.77 0.06 0.24 0.63 0.08 -0.77
-0.32 -0.21 -0.34 0.85 0.15 -0.65
-1.18 -0.69 0.35 1.39 -0.79 -1.07
-0.87 -0.12 0.32 0.56 0.2 -0.6
-1.79 0.0 1.0 0.66 -0.57 -1.14
-0.36 -1.34 -0.32 1.31 -0.23 -0.53
-1.5 -0.47 0.59 0.88 0.21 -1.24
-1.03 -0.25 0.48 1.04 -0.25 -1.35
-0.78 -0.18 0.2 0.71 0.17 -0.69
-0.95 -0.3 0.17 0.62 0.31 -0.39
-0.77 -0.66 0.81 0.46 0.05 -0.68
-0.48 -0.8 0.12 0.74 0.39 -0.66
-1.97 -0.64 0.98 0.81 -0.11 -1.15
-0.14 -0.28 0.05 0.54 0.1 -0.52
-1.32 -0.59 0.23 1.0 0.28 -0.88
-1.06 -0.45 0.44 0.58 0.39 -0.67
-0.66 -0.6 0.36 0.49 0.42 -0.56
-0.38 -0.1 0.25 0.55 -0.0 -0.63
-0.31 -0.59 0.16 0.6 0.09 -0.26
-0.63 -0.77 0.71 0.53 -0.12 -0.39
-0.4 -0.33 -0.08 0.85 0.06 -0.61
-0.16 -0.26 0.04 0.55 0.01 -0.37
-0.27 -0.24 -0.25 0.88 0.06 -0.75
-3.97 0.06 1.11 0.97 -0.62 -2.91
-1.15 -0.28 0.7 0.64 -0.05 -0.8
-0.5 -1.19 0.14 0.82 0.26 -0.36
-0.74 -0.52 0.44 0.62 0.34 -0.86
-0.87 -0.78 0.29 0.82 0.14 -0.37
-0.69 -0.51 0.54 0.68 0.06 -0.8
-1.55 -1.12 1.19 0.77 -0.65 -0.79
-0.86 -0.87 0.05 1.08 0.28 -0.88
-0.43 -0.39 0.0 0.66 0.18 -0.35
-0.46 -0.1 -0.03 0.69 0.08 -0.52
-3.27 -0.86 1.07 1.08 -0.22 -1.87
-0.46 -0.47 0.38 0.64 0.18 -0.82
-1.9 -0.54 0.99 0.83 -0.06 -1.65
-0.8 -0.25 0.05 0.69 0.27 -0.44
-0.37 -1.13 -0.62 1.31 -0.15 -0.45
-0.85 -0.81 0.13 0.83 0.36 -0.47
-0.65 -0.37 0.14 1.16 -0.35 -1.08
-0.03 -0.55 0.14 0.76 -0.32 -0.43
-1.42 -1.37 0.6 1.2 -0.52 -0.46
-0.37 -0.45 0.14 0.96 -0.44 -0.5
-0.68 -0.45 -0.07 0.79 0.41 -0.64
-1.33 -0.44 1.03 0.63 -0.31 -1.09
-0.98 -0.46 0.11 0.76 0.37 -0.51
-0.11 -0.03 0.04 0.43 0.06 -0.59
-0.57 -0.26 0.3 0.69 0.06 -0.73
-0.25 -0.29 0.14 0.79 -0.3 -0.52
-0.79 -0.26 0.37 0.66 0.21 -0.85
-3.88 -0.42 1.06 1.2 -0.62 -2.72
-6.82 -1.08 1.28 1.4 -1.23 -5.89
-1.0 -0.52 0.82 0.62 -0.04 -0.93
-0.21 -0.35 -0.35 0.89 0.1 -0.64
-2.93 -1.23 1.32 0.86 -0.32 -1.6
-0.49 -0.51 -0.12 1.03 -0.36 -0.24
-1.1 -0.77 0.26 0.72 0.5 -0.54
-0.75 -0.34 -0.15 1.34 -0.38 -1.25
-0.46 -0.37 -0.28 1.18 -0.3 -0.73
-0.6 -0.6 0.39 0.69 0.13 -0.6
-0.51 -0.45 0.3 0.49 0.28 -0.49
-1.26 -0.56 0.46 0.82 0.39 -1.15
-0.22 -0.52 -0.19 0.83 0.22 -0.67
-0.84 -0.69 0.44 0.85 0.14 -0.84
-1.34 -0.37 0.6 0.91 -0.0 -1.2
-0.5 -1.74 0.11 1.26 -0.27 -0.53
-0.59 -0.28 0.2 1.07 -0.39 -0.98
-1.59 -0.79 0.28 0.63 0.65 -0.42
-0.56 -0.37 0.3 0.61 0.22 -0.69
-0.85 -0.03 0.89 0.7 -0.91 -1.12
-0.62 -0.6 0.15 0.82 0.18 -0.55
-0.42 -0.2 0.17 0.56 0.17 -0.62
-1.02 -0.48 -0.51 1.34 0.19 -1.28
-1.4 -1.72 -1.46 1.65 0.22 -0.62
-0.93 -0.59 0.91 0.46 0.03 -0.87
-0.51 -0.39 -0.02 0.53 0.38 -0.33
-1.2 -0.55 0.56 0.5 0.3 -0.4
-0.42 -0.05 0.31 0.43 -0.02 -0.48
-1.81 -0.4 0.69 0.7 0.43 -1.44
-0.87 -1.25 -0.15 1.4 -0.17 -0.71
-0.5 -0.08 0.09 0.62 0.08 -0.55
-2.45 -0.21 1.12 0.86 -0.5 -1.99
-0.62 -0.56 -0.0 0.72 0.43 -0.56
-1.25 -0.17 0.84 0.62 -0.16 -1.07
-0.59 -1.35 0.45 0.7 0.42 -0.69
-0.74 -0.71 0.25 1.03 0.07 -0.97
-0.32 -0.33 -0.1 0.81 0.08 -0.58
-0.29 -0.53 -0.15 0.64 0.31 -0.34
-0.38 -0.66 -0.07 0.84 0.24 -0.58
-0.51 0.04 0.24 0.52 0.02 -0.63
-0.49 -1.68 -0.09 1.24 -0.13 -0.38
-2.5 -3.1 -0.68 1.71 0.29 -0.79
-0.88 -0.71 0.27 0.65 0.42 -0.45
-0.33 -1.02 -0.09 1.04 0.06 -0.57
-1.81 -1.06 0.8 0.91 0.06 -0.82
-0.92 -0.73 0.61 0.41 0.33 -0.4
-1.92 -0.26 1.08 0.66 -0.08 -1.92
-0.49 -0.53 0.47 0.46 0.17 -0.49
-1.56 -1.85 0.38 1.08 0.45 -0.75
-0.51 -0.13 0.52 0.24 0.22 -0.72
-0.41 -1.12 0.39 0.87 0.14 -0.89
-0.16 0.05 -0.0 0.67 -0.17 -0.74
-0.17 -0.26 -0.09 0.64 0.05 -0.43
-0.25 -0.08 -0.15 0.73 -0.23 -0.32
-0.35 -0.11 0.08 0.84 -0.12 -0.95
-0.84 -0.08 0.43 0.87 -0.3 -0.99
-0.66 -0.1 0.12 0.86 -0.04 -0.85
-1.04 0.05 0.19 0.35 0.27 -0.22
-0.85 0.17 0.39 0.52 0.33 -1.66
-0.2 -0.24 -0.04 0.6 0.07 -0.43
-1.01 -0.28 0.52 0.53 0.2 -0.61
-0.17 -0.18 -0.29 0.68 0.08 -0.42
-1.48 -0.32 0.49 1.05 -0.29 -0.84
-0.67 -0.86 0.32 1.08 -0.52 -0.41
-0.27 -0.48 -0.05 0.94 -0.06 -0.71
-0.73 -0.85 0.58 0.93 -0.1 -0.98
-1.02 -0.67 0.12 0.84 0.18 -0.2
-0.3 -0.68 0.03 0.63 0.36 -0.49
-2.59 -0.51 1.04 0.77 -0.22 -0.99
-2.6 -0.27 1.04 0.77 -0.17 -1.51
-1.38 -0.56 0.45 1.44 -0.54 -2.45
-2.17 -0.09 0.94 0.63 -0.14 -1.09
-1.47 -0.06 0.45 0.83 -0.12 -0.68
-1.4 -1.69 -0.49 1.37 0.49 -0.7
-1.12 -0.48 0.41 0.77 0.11 -0.49
-0.57 -0.2 -0.26 1.2 -0.2 -1.15
-0.75 -0.32 0.24 0.83 0.06 -0.72
-1.16 -2.19 -0.17 1.27 0.43 -0.56
-1.03 -0.49 0.06 0.87 0.4 -0.71
-0.92 0.0 0.3 0.91 -0.07 -1.29
-0.42 -0.19 -0.13 0.76 0.1 -0.52
-2.16 -0.4 1.07 0.62 0.04 -1.49
-0.93 -0.62 0.06 1.07 0.12 -0.75
0.08 -0.48 -0.14 0.67 -0.22 -0.19
-1.33 0.09 0.3 0.67 0.16 -0.75
-1.43 -0.44 0.4 0.93 0.06 -0.69
-2.12 -0.17 0.81 1.09 -0.74 -1.35
-0.5 -0.03 0.35 0.79 -0.27 -1.05
-0.48 -1.86 -0.17 1.31 0.07 -0.77
-0.65 -0.46 -0.06 1.31 -0.36 -1.22
-1.41 -0.07 0.54 0.59 0.34 -1.18
-1.18 -2.06 -1.15 1.42 0.44 -0.26
-1.82 -0.61 0.66 1.02 0.12 -1.45
-0.93 -0.95 -0.31 1.18 -0.05 -0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.