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Heatmap: Cluster_46 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
16 h after light
4 h after dark
8 h after dark
-0.08 -0.27 -0.42 -0.13 0.61 0.05
0.06 -0.67 -0.57 -0.25 0.8 0.11
-0.22 -1.2 -0.81 -0.38 0.86 0.64
0.13 -1.37 -0.81 -0.03 0.7 0.42
0.03 -0.41 -1.26 -0.24 0.97 0.02
0.21 -1.47 -0.58 -0.05 0.79 0.17
0.24 -0.59 -0.74 -0.16 0.8 -0.12
0.27 -0.9 -0.32 -0.29 0.47 0.33
0.16 -0.21 -0.74 -0.75 0.77 0.17
0.3 -1.37 -1.12 -0.05 0.97 -0.01
-0.15 -0.69 -0.98 -0.24 0.97 0.22
0.41 -0.44 -0.83 -0.56 0.83 -0.12
0.42 0.03 -1.99 -1.46 1.05 -0.06
0.49 -0.38 -0.87 -0.9 0.73 0.12
0.14 -0.46 -0.77 -0.77 0.65 0.52
0.16 -0.58 -0.93 -0.23 0.77 0.17
-0.09 -1.31 -0.5 -0.31 0.91 0.34
-0.01 -0.34 -1.25 -0.25 0.88 0.16
0.13 -1.26 -0.8 -0.55 1.11 0.11
-0.19 -1.75 -1.11 -0.42 1.27 0.26
0.25 -2.59 -4.07 -0.91 1.13 0.9
-0.14 -0.34 -1.05 -0.5 0.89 0.32
-1.32 -1.69 -2.29 -1.31 1.59 0.74
0.03 -0.89 -1.05 -0.04 0.78 0.34
-0.13 -0.38 -0.65 -0.39 0.93 0.01
-0.18 -1.25 -0.69 -0.17 0.99 0.26
-0.09 -0.46 -0.61 -0.58 0.63 0.55
-0.03 -0.1 -1.27 -1.01 1.18 -0.14
0.24 -1.15 -1.82 -0.23 0.78 0.59
-0.04 -1.64 -3.98 -3.6 1.82 0.05
-0.54 -1.58 -1.41 -0.45 1.05 0.85
0.15 -0.04 -1.04 -0.43 0.68 0.14
-0.32 -0.38 -0.92 -0.24 0.89 0.26
-0.56 -1.09 -1.05 -0.25 1.22 0.27
-0.34 -0.2 -0.98 -0.33 0.88 0.26
0.13 -0.65 -0.61 -0.38 0.73 0.25
-0.37 -0.61 -0.62 -0.36 1.0 0.19
-0.33 -0.92 -1.32 -1.28 1.17 0.69
-0.27 -0.81 -0.69 -0.89 1.18 0.24
0.13 -1.58 -0.87 0.16 0.7 0.36
0.02 -0.47 -0.54 -0.14 0.52 0.31
0.33 -0.98 -0.61 -0.13 0.68 0.09
-0.58 -1.28 -1.47 -0.33 1.33 0.32
0.04 -0.98 -0.69 -0.28 0.83 0.32
-0.1 -0.64 -0.95 -0.69 0.99 0.37
0.17 -0.79 -0.96 -0.09 0.71 0.27
-0.5 -1.05 -1.01 -0.09 1.09 0.32
0.47 -0.34 -1.66 -0.96 1.1 -0.25
-0.12 -1.05 -0.77 -0.64 1.23 0.03
-0.26 -0.3 -0.42 -0.15 0.73 0.07
0.19 -1.11 -0.39 -0.05 0.67 0.1
-0.04 -1.51 -1.76 -1.5 1.45 0.37
0.48 -0.37 -0.98 -0.87 0.83 0.01
-0.22 -0.75 -1.78 -0.23 1.12 0.29
0.03 -1.25 -0.61 -0.4 1.09 0.01
0.15 -0.89 -2.21 0.19 1.04 -0.09
-0.73 -2.64 -1.93 -0.09 1.34 0.59
0.28 -0.39 -0.72 -0.14 0.7 -0.18
-0.23 -0.33 -0.46 -0.33 0.8 0.12
0.21 -0.56 -0.8 -0.78 0.81 0.32
0.33 -1.46 -0.8 -0.11 0.73 0.29
-0.02 -1.29 -1.05 -0.14 0.83 0.53
0.07 -0.62 -0.9 -0.49 1.06 -0.05
0.37 -0.63 -0.8 -0.58 0.65 0.32
-0.28 -0.79 -0.62 -0.17 0.95 0.18
0.04 -0.5 -1.51 -0.76 1.16 0.12
0.09 -1.31 -1.77 -0.12 1.12 0.19
0.17 -1.77 -0.84 -0.48 1.17 0.09
0.07 -1.19 -0.86 -0.09 0.85 0.28
0.02 -0.62 -0.52 -0.59 0.92 0.12
0.24 -0.54 -0.38 -0.27 0.43 0.26
-0.24 -1.87 -1.29 -0.16 1.15 0.43
-0.07 -0.29 -1.13 -0.23 0.76 0.3
0.06 -1.15 -1.6 -1.21 1.34 0.28
0.38 -0.46 -1.08 -0.72 0.87 0.08
0.15 -1.25 -0.73 -0.4 0.83 0.42
-0.35 -0.45 -1.5 -1.55 1.21 0.56
-0.24 -0.82 -0.88 0.02 0.94 0.15
0.08 -0.36 -0.37 -0.28 0.42 0.3
0.34 -0.9 -0.51 -0.45 0.72 0.15
0.27 -0.24 -1.44 -0.52 0.68 0.35
-0.15 -0.51 -0.35 -0.49 0.61 0.46
-0.09 -0.6 -0.26 -0.18 0.64 0.16
-0.05 -0.84 -0.36 -0.46 0.62 0.52
0.12 -1.07 -0.59 -0.13 0.94 -0.09
-0.08 -0.6 -1.6 -0.28 0.83 0.55
0.17 -0.59 -0.37 -0.08 0.62 -0.08
0.05 -0.38 -0.46 -0.42 0.76 0.04
-0.03 -0.31 -0.41 -0.61 0.93 -0.14
0.57 -0.97 -1.73 -1.29 0.99 0.38
-0.11 -0.91 -0.49 -0.46 0.83 0.4
0.57 -0.24 -1.38 -1.19 0.98 -0.2
-0.15 -2.22 -1.91 -0.55 1.3 0.55
0.07 -1.41 -0.78 -0.15 0.88 0.32
0.3 -0.4 -1.11 -0.95 0.96 0.11
0.19 -1.28 -0.53 0.14 0.57 0.22
0.38 -0.37 -1.12 -0.52 0.75 0.12
0.25 -0.17 -1.8 -1.13 1.17 -0.12
0.26 -0.06 -1.59 -0.76 1.01 -0.14
0.16 -1.02 -0.75 -0.13 0.94 -0.05
-0.2 -1.4 -0.97 -0.03 1.02 0.3
-0.17 -0.77 -0.32 -0.31 0.93 0.01
0.09 -1.5 -0.71 -0.42 1.05 0.2
-0.47 -1.79 -1.46 -0.14 1.25 0.41
-0.19 -0.47 -0.72 -0.06 0.79 0.15
-0.01 -1.21 -0.92 -0.45 1.0 0.39
-0.18 -1.52 -1.72 -1.88 1.5 0.45
0.17 -0.99 -1.86 -0.93 0.99 0.66
0.09 -0.82 -0.59 -0.67 1.05 0.02
-0.04 -0.63 -0.37 -0.22 0.64 0.25
0.01 -0.76 -0.36 -0.2 0.65 0.25
0.15 -0.65 -0.92 -0.26 0.61 0.45
0.06 -2.07 -1.79 -0.81 1.22 0.62
-0.36 -0.96 -1.53 -0.09 1.08 0.39
-0.2 -0.46 -0.56 -0.31 0.91 0.06
0.27 -0.73 -0.74 -0.34 0.82 0.06
0.13 -0.54 -0.78 0.13 0.86 -0.47
0.57 -0.88 -1.35 -1.05 1.1 -0.06
0.07 -0.72 -0.37 -0.35 0.83 0.02
-0.15 -1.26 -0.47 -0.64 1.07 0.29
-0.19 -0.33 -0.66 -0.74 0.98 0.17
0.21 -0.49 -0.73 -0.2 0.88 -0.29
0.1 -0.45 -0.11 -0.4 0.54 0.08
0.33 -0.92 -1.48 -0.34 0.91 0.25
0.33 -0.72 -0.56 -0.45 0.87 -0.15
0.36 -1.17 -0.61 0.06 0.6 0.08
0.09 -0.23 -0.51 -0.17 0.46 0.15
0.05 -0.42 -0.99 -0.61 1.05 -0.03
0.3 -0.76 -0.85 -0.39 0.65 0.37
-0.14 -1.03 -2.35 -0.56 1.1 0.67
0.34 -0.93 -1.64 -0.64 1.12 0.11
-0.27 -0.86 -0.53 -0.16 0.71 0.49
0.23 -0.74 -0.96 -1.66 1.26 0.0
0.41 -0.25 -3.11 -1.43 0.92 0.54
0.29 -1.14 -2.29 -0.45 0.87 0.65
0.03 -0.54 -0.95 -0.18 0.72 0.32
-0.24 -0.63 -0.23 -0.95 1.04 0.11
0.43 -1.01 -1.51 -1.03 1.1 0.22
-0.4 -1.63 -0.79 -0.51 1.18 0.46
-0.31 -1.19 -0.72 -0.35 0.98 0.47
0.03 -0.4 -0.81 -0.14 0.54 0.36
0.26 -1.07 -0.99 -0.29 0.93 0.14
0.16 -1.66 -1.22 -0.45 1.17 0.21
-0.14 -1.42 -0.98 -0.41 1.07 0.44
-0.34 -0.84 -1.04 -0.17 0.86 0.55
-0.36 -1.36 -0.89 -0.44 1.19 0.35
-0.12 -1.73 -2.15 0.01 1.29 0.14
-0.0 -0.84 -1.75 -0.89 1.36 0.05
-0.11 -0.93 -0.3 -0.26 0.88 0.08
-0.18 -1.71 -2.11 0.11 1.11 0.42
0.18 -0.36 -1.2 -0.09 0.78 0.01
-0.34 -0.38 -1.34 -1.49 1.36 0.16
-0.17 -1.78 -1.55 -0.32 1.28 0.33
0.25 -0.09 -1.18 -0.41 0.73 0.03
-0.14 -0.77 -1.75 -0.31 0.95 0.55
0.05 -0.79 -0.86 -0.18 0.87 0.18
0.07 -1.61 -1.45 -0.01 0.8 0.61
-0.1 -0.18 -1.2 -1.0 1.2 -0.08
0.08 -0.87 -0.39 -0.17 0.61 0.29
0.39 -0.23 -1.13 -1.88 0.93 0.26
-0.09 -0.83 -0.43 -0.28 0.71 0.37
-0.29 -1.34 -0.71 -0.83 1.11 0.54
0.1 -0.77 -0.79 -0.79 0.87 0.44
-0.7 -1.15 -1.36 -0.69 1.29 0.56

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.