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Heatmap: Cluster_35 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
16 h after light
4 h after dark
8 h after dark
0.68 -0.04 -0.54 -0.29 0.08 -0.22
0.46 0.13 -1.0 0.12 0.08 -0.18
0.93 0.2 -1.23 -1.17 0.24 -0.16
0.81 0.01 -0.68 -0.43 -0.18 -0.02
0.13 0.29 -0.77 0.1 0.09 -0.07
0.75 -0.09 -1.1 -0.45 0.59 -0.56
0.53 0.14 -0.46 -0.16 -0.02 -0.24
0.98 0.46 -0.62 -0.8 -0.23 -0.81
0.38 -0.02 -0.6 -0.07 0.23 -0.12
0.5 0.34 -1.25 -0.53 0.38 -0.15
0.76 0.1 -1.06 -0.2 0.13 -0.34
0.6 -0.02 -0.54 -0.08 0.24 -0.54
0.78 0.25 -1.75 -1.04 0.75 -0.67
0.42 0.23 -0.35 -0.33 0.09 -0.25
0.44 0.32 -2.83 -4.31 1.09 0.12
0.13 0.15 -0.76 0.19 0.26 -0.2
0.86 0.09 -1.29 -0.79 0.44 -0.35
0.47 0.14 -0.51 -0.06 -0.03 -0.19
0.43 0.16 -0.47 -0.4 0.35 -0.35
0.42 0.35 -0.73 0.13 -0.29 -0.19
0.35 0.42 -0.94 -0.49 0.39 -0.24
0.93 -0.6 -0.53 -0.94 -0.0 0.3
0.45 0.32 -1.24 -0.47 0.19 0.14
0.18 0.26 -0.69 0.34 -0.2 -0.14
0.47 0.1 -0.9 -0.02 0.0 0.02
0.69 0.16 -0.83 -0.33 -0.06 -0.07
0.61 -0.1 -1.03 -0.38 0.28 0.1
1.17 0.27 -0.87 -0.96 -0.21 -0.7
0.7 0.4 -0.32 -0.56 -0.39 -0.3
0.65 0.22 -0.95 -0.58 0.05 0.05
-0.02 0.82 0.0 -0.35 -1.01 -0.05
0.45 0.16 -0.66 -0.22 0.09 -0.07
0.35 0.05 -0.59 0.1 -0.02 -0.06
0.88 0.33 -1.01 -0.67 0.02 -0.4
0.54 0.14 -0.73 -0.45 -0.02 0.16
0.65 0.38 -1.15 -0.9 -0.09 0.26
0.44 0.17 -0.7 -0.26 0.05 0.04
0.6 -0.12 -0.88 -0.36 0.29 0.02
0.53 0.43 -0.78 -0.28 -0.15 -0.15
-0.12 0.68 -0.93 -0.53 -0.67 0.71
0.48 -0.09 -0.99 0.19 -0.11 0.12
0.65 0.33 -1.71 -1.86 0.86 -0.37
0.76 0.3 -1.11 -0.88 0.23 -0.17
0.39 0.01 -0.69 -0.23 0.25 0.02
0.33 0.87 -0.81 -0.56 -0.61 0.02
0.37 0.15 -0.93 0.13 -0.02 -0.01
0.46 0.12 -0.98 -0.23 0.18 0.07
0.73 0.19 -1.3 -0.57 0.07 0.1
0.86 0.12 -2.3 -1.45 0.38 0.29
0.16 0.1 -0.22 -0.17 0.13 -0.04
0.09 0.16 -0.69 0.39 0.06 -0.25
0.59 0.55 -1.23 -1.03 -0.09 0.23
0.47 0.23 -1.15 -0.64 0.08 0.36
0.59 0.02 -0.53 -0.12 -0.01 -0.19
0.25 0.04 -0.59 -0.1 0.23 0.02
1.04 -0.02 -0.78 -0.36 0.05 -0.83
0.24 0.23 -1.13 -0.54 0.64 -0.08
1.0 -0.31 -1.22 -1.26 0.62 -0.31
0.74 0.5 -1.98 -2.24 0.43 0.14
0.8 0.23 -1.5 -1.16 -0.11 0.44
0.27 0.31 -0.65 -0.12 -0.15 0.13
0.83 0.14 -0.64 -0.62 0.19 -0.54
1.03 0.3 -1.13 -0.57 -0.36 -0.28
1.12 -0.25 -2.43 -1.68 0.07 0.52
0.84 0.03 -0.79 -0.24 0.26 -0.81
0.57 0.19 -0.35 -0.13 -0.25 -0.26
0.36 0.23 -0.61 0.26 -0.18 -0.31
0.32 0.72 -1.83 -0.77 -0.96 0.79
0.39 0.25 -0.82 0.1 -0.04 -0.18
0.51 -0.15 -0.87 0.13 0.2 -0.18
0.65 0.2 -0.61 -0.7 0.39 -0.52
0.35 0.08 -0.49 0.26 -0.04 -0.34
0.67 -0.19 -0.56 -0.24 0.21 -0.23
0.57 0.39 -0.57 -0.26 -0.11 -0.39
0.43 0.03 -0.9 -0.06 0.05 0.14
1.03 -0.01 -1.94 -1.62 0.04 0.44
0.17 0.28 -0.63 0.01 -0.21 0.19
0.18 0.08 -0.57 0.05 0.12 0.02
0.31 0.9 -0.95 -0.39 -1.1 0.2
0.33 0.21 -0.57 0.35 -0.2 -0.4
0.82 0.29 -0.45 -0.46 -0.38 -0.34
0.82 0.37 -0.58 -0.38 -0.35 -0.46
0.55 0.36 -0.58 -0.28 -0.16 -0.21
0.4 0.16 -0.69 -0.27 0.11 0.05
0.36 0.77 -2.54 -0.59 0.07 0.17
0.6 0.06 -0.57 -0.11 -0.04 -0.21
0.18 0.18 -0.69 0.16 -0.08 0.08
0.3 0.48 -1.27 -1.23 0.28 0.4
0.13 0.33 -0.4 0.23 -0.28 -0.15
0.56 0.16 -0.8 -0.87 0.57 -0.32
0.28 0.4 -0.65 -0.01 -0.17 -0.07
0.83 0.14 -0.3 -0.62 -0.14 -0.42
1.06 0.25 -2.97 -2.6 0.07 0.47
0.57 0.67 -2.09 -1.2 0.23 0.11
0.33 0.02 -0.61 -0.26 0.49 -0.25
0.56 0.06 -0.24 -0.27 -0.07 -0.23
0.42 0.08 -0.61 0.09 -0.15 -0.02
0.39 1.19 -1.02 -0.93 -0.81 -0.28
0.34 0.34 -0.83 0.04 -0.01 -0.17
0.3 0.6 -0.88 -0.55 -0.36 0.32
0.95 -0.21 -1.33 -0.87 0.92 -1.44
1.09 0.2 -1.33 -0.36 -0.03 -0.84
0.09 0.6 -0.78 -0.05 -0.47 0.2
0.72 -0.13 -0.71 -0.38 0.19 -0.13
0.65 0.29 -1.27 -0.04 -0.21 -0.06
0.29 0.07 -0.31 0.27 -0.03 -0.45
0.64 1.26 -1.81 -1.97 -0.91 -0.05
0.56 0.1 -0.47 -0.51 0.53 -0.78
0.88 -0.05 -1.81 -0.89 0.76 -0.57
0.61 0.01 -0.74 -0.52 0.06 0.18
0.53 0.22 -0.38 -0.12 -0.19 -0.29
0.75 0.24 -0.73 -0.68 -0.2 0.06
0.23 -0.03 -0.55 0.07 0.24 -0.1
0.11 0.09 -0.67 0.15 0.19 -0.05
0.4 0.6 -0.88 -0.15 -0.43 -0.04
0.18 0.67 -2.67 -3.24 0.48 0.69
0.24 0.22 -0.48 0.37 -0.1 -0.48
0.43 0.16 -0.46 -0.43 0.37 -0.37
0.69 0.34 -1.4 -0.35 -0.33 0.21
0.58 0.29 -0.77 -0.17 -0.03 -0.27
0.42 -0.07 -0.65 -0.17 0.11 0.14
0.26 0.29 -0.7 0.13 -0.16 -0.04
0.58 0.12 -1.31 -0.45 0.32 0.06
0.35 0.2 -1.63 -0.57 0.67 -0.01
0.63 0.02 -0.94 -0.01 -0.11 -0.01
0.41 0.27 -1.12 0.09 0.09 -0.19
0.64 -0.06 -1.42 -0.34 0.54 -0.22
0.12 0.42 -1.17 0.28 -0.04 -0.09
0.48 0.02 -0.76 0.23 -0.29 0.02
0.52 0.56 -1.94 -1.82 0.04 0.6
0.29 0.12 -0.47 0.29 -0.2 -0.19
0.68 0.18 -0.98 -0.35 -0.03 -0.01
0.31 0.14 -1.36 -0.42 0.51 0.13
0.64 0.18 -0.86 -0.64 0.03 0.13
0.78 0.09 -0.88 -0.56 0.09 -0.1
0.24 0.18 -0.36 -0.18 0.11 -0.08
0.43 0.39 -0.62 0.01 -0.78 0.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.