Heatmap: Cluster_17 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
16 h after light
4 h after dark
8 h after dark
-0.04 -0.45 -0.77 0.74 0.18 -0.13
0.06 -0.43 -1.09 0.58 -0.04 0.35
0.23 -0.72 -0.77 0.47 -0.11 0.4
0.23 -0.27 -0.82 0.19 0.27 0.12
-0.02 -0.53 -1.06 -0.06 0.33 0.7
0.29 -0.15 -0.83 0.25 0.04 0.14
0.16 -0.39 -0.71 0.32 0.29 0.05
-0.54 -0.69 0.14 -0.18 0.42 0.46
0.06 0.16 -1.09 0.25 -0.03 0.25
0.04 -0.04 -0.61 0.3 0.14 0.02
0.24 -0.11 -0.8 0.25 0.2 -0.02
0.31 -0.66 -1.08 0.25 0.4 0.2
-0.59 -0.68 -0.6 -0.04 0.64 0.6
0.29 -0.11 -0.79 0.26 0.03 0.08
0.3 -0.17 -0.76 0.25 0.03 0.1
0.31 -0.17 -0.73 0.31 0.01 0.03
0.26 -0.22 -0.51 0.25 0.24 -0.2
-0.03 -0.42 -1.35 0.92 0.27 -0.36
0.43 -0.51 -0.63 0.29 -0.36 0.38
0.34 -0.25 -0.66 0.3 0.1 -0.06
0.3 -0.1 -0.7 0.3 0.01 -0.02
-0.56 -0.94 0.12 -0.25 0.78 0.21
0.31 -0.01 -0.75 0.26 0.07 -0.11
0.33 -0.52 -0.79 -0.22 0.15 0.58
0.55 -1.49 -2.88 0.18 0.22 0.81
0.26 -0.16 -0.75 0.27 0.1 0.04
0.34 -0.25 -0.47 0.14 0.25 -0.19
0.35 -0.14 -0.47 0.34 0.03 -0.31
0.3 -0.19 -0.49 0.28 -0.01 -0.03
0.13 -0.08 -0.19 0.39 -0.45 0.07
0.05 -0.77 -0.11 0.23 0.11 0.26
0.29 -0.23 -0.83 0.52 -0.04 -0.06
0.18 -0.26 -0.85 0.16 0.04 0.41
0.55 -0.54 -0.74 -0.05 -0.36 0.58
0.1 -0.36 -0.96 0.3 -0.12 0.57
0.25 -0.46 -0.72 0.41 0.11 0.1
0.39 -0.3 -0.82 0.26 0.25 -0.11
0.19 -0.2 -0.79 0.2 -0.08 0.39
-0.04 -0.58 -0.55 0.12 0.31 0.43
0.19 -0.81 -0.86 1.03 -0.55 0.01
-0.87 -1.02 -0.16 0.24 0.37 0.67
0.51 -0.46 -1.08 -0.05 -0.35 0.7
0.32 -0.15 -0.77 0.29 0.13 -0.08
0.28 -0.22 -0.71 0.41 -0.01 -0.0
0.06 -0.59 -0.38 -0.14 0.45 0.33
0.06 -0.38 -0.92 0.63 -0.22 0.33
-0.21 -0.69 -0.34 0.12 0.62 0.14
0.13 -0.44 -0.82 0.62 -0.17 0.24
0.32 -0.21 -0.76 0.25 -0.01 0.15
0.15 -0.33 -0.89 0.58 -0.16 0.22
0.23 -0.75 -1.01 0.06 0.63 0.2
0.12 -0.29 -1.06 -0.17 0.29 0.59
0.35 -0.11 -0.68 0.3 0.03 -0.12
0.31 -0.49 -0.99 0.52 -0.04 0.18
-0.45 -1.27 -0.43 0.11 0.25 0.88
0.34 -0.13 -0.7 0.33 0.03 -0.1
0.25 -0.2 -0.78 0.2 0.24 0.04
-0.03 -0.5 -1.11 0.3 0.52 0.25
-0.05 -0.23 -0.53 -0.01 0.44 0.2
0.18 -0.08 -0.33 0.27 -0.13 0.01
0.06 -0.47 -0.91 0.03 -0.22 0.87
0.09 -0.29 -0.85 0.54 0.09 0.07
0.1 -0.36 -0.93 0.33 0.4 0.08
0.31 -0.16 -0.78 0.3 0.18 -0.12
0.16 -0.02 -0.74 0.11 -0.15 0.39
-0.0 -0.69 -0.18 -0.01 0.66 -0.11
0.26 -0.34 -0.84 0.85 0.26 -1.14
0.34 -0.32 -0.93 0.27 0.26 0.0
0.26 -0.2 -0.67 0.25 -0.1 0.23
0.13 -0.17 -0.87 0.2 0.04 0.37
-0.24 0.03 -0.93 0.51 -0.11 0.33
-0.07 -0.47 -0.94 0.85 -0.47 0.35
0.27 -0.29 -0.86 0.19 -0.14 0.46
-0.38 -1.16 -0.29 0.25 0.41 0.54
0.35 -0.11 -0.68 0.33 -0.02 -0.1
-0.06 -0.33 -2.65 0.3 -0.92 1.22
0.14 -0.32 -0.34 0.33 -0.18 0.23
-0.34 -1.22 -1.69 0.9 0.34 0.41
0.27 -0.53 -0.88 0.23 0.34 0.16
0.53 -0.54 -1.15 -0.07 -0.38 0.76
0.26 -0.24 -0.84 0.22 -0.06 0.35
-0.29 -0.78 -1.27 0.85 -0.31 0.65
0.4 -0.8 -0.98 0.54 0.13 0.07
0.32 -0.15 -0.73 0.28 -0.07 0.11
-0.66 -0.23 0.08 -0.41 0.44 0.43
0.22 -0.24 -0.41 0.23 0.29 -0.24
0.19 -0.29 -0.59 0.15 -0.0 0.34
0.2 -0.02 -0.78 0.19 0.19 -0.01
0.29 -0.17 -0.38 0.27 -0.01 -0.1
0.34 -0.15 -0.64 0.28 0.05 -0.09
0.08 -0.47 -1.13 0.7 -0.01 0.19
0.23 -0.25 -0.84 0.17 0.18 0.22
0.29 -0.31 -0.89 0.08 0.47 -0.01
0.16 -0.45 -0.37 0.18 0.15 0.17
0.11 -0.4 -1.0 0.35 0.14 0.36
0.08 -0.37 -0.7 0.1 -0.21 0.7
0.34 -0.19 -0.69 0.3 0.03 -0.02
0.17 -0.36 -0.26 0.11 -0.02 0.26
0.21 -0.21 -0.75 0.19 0.42 -0.13
0.26 -0.16 -0.62 0.22 0.26 -0.15
0.26 -0.14 -0.76 0.24 0.23 -0.06
0.16 -0.14 -0.56 0.15 0.49 -0.35
0.27 -0.11 -0.71 0.27 -0.03 0.09
0.07 -0.14 -0.9 0.63 -0.19 0.11
0.23 -0.21 -0.89 0.2 -0.13 0.44
0.24 -0.26 -0.86 0.16 -0.13 0.49
0.23 -0.21 -0.82 0.2 0.09 0.23
-0.07 -0.19 -0.23 0.45 -0.01 -0.08
0.35 -0.48 -0.44 -0.12 -0.24 0.59
0.11 -0.35 -0.93 0.33 0.13 0.34
0.12 -0.25 -0.82 0.11 -0.08 0.57
0.75 -1.51 -1.66 -0.58 0.35 0.77
0.33 -0.12 -0.64 0.32 -0.03 -0.07
0.33 0.03 -0.72 0.28 -0.0 -0.14
0.38 -0.15 -0.75 0.32 -0.04 -0.03
0.14 -0.65 -0.94 0.65 0.29 -0.09
-0.06 -0.14 -0.28 -0.13 0.29 0.23
0.02 -0.17 -0.81 0.02 0.01 0.59
0.46 -0.34 -0.86 0.34 -0.11 0.12
0.27 -0.14 -0.67 0.29 0.19 -0.16
0.32 -0.26 -0.57 0.26 0.13 -0.08
-0.01 -0.06 -0.27 0.1 0.34 -0.19
0.46 -0.49 -1.08 -0.06 -0.13 0.64
0.76 -0.52 -0.93 -0.07 0.16 0.02
0.16 -0.21 -0.8 0.16 0.07 0.35
-0.1 -0.73 0.0 -0.27 0.75 -0.07
0.31 -1.08 -2.12 0.1 0.55 0.61
0.23 -0.23 -0.81 0.25 0.04 0.26
-0.62 -1.22 -0.27 0.02 0.56 0.68
0.39 -0.15 -0.75 0.33 0.04 -0.15
0.24 -0.29 -0.86 0.38 -0.11 0.29
0.33 -0.21 -0.69 0.26 0.0 0.09
0.41 -0.35 -1.9 0.29 -0.57 0.78
0.22 -0.24 -0.66 0.24 0.04 0.2
0.14 -0.11 -0.84 0.13 0.05 0.35
-0.04 -0.5 -0.52 -0.06 0.26 0.55
0.63 -0.94 -1.69 -0.01 0.05 0.68
0.2 -0.12 -0.75 0.18 -0.01 0.28
-0.13 -0.72 -1.21 0.12 -0.18 1.06
0.26 -0.17 -0.77 0.25 0.03 0.16
0.35 -0.14 -0.7 0.35 0.03 -0.13
0.29 -0.02 -0.81 0.25 0.09 -0.05
0.72 -0.33 -0.89 0.09 -0.15 0.06
0.27 -0.22 -0.81 0.3 -0.04 0.21
0.11 -0.36 -0.81 0.06 -0.21 0.74
0.19 -0.24 -0.82 0.19 -0.02 0.4
0.16 -0.29 -0.84 0.18 0.27 0.22
0.05 -0.56 -1.16 0.41 0.36 0.3
0.28 -0.14 -0.8 0.22 0.05 0.13
-0.14 -0.43 -0.02 -0.11 0.39 0.18
0.34 -0.14 -0.75 0.32 0.15 -0.18
0.29 -0.31 -0.54 0.09 -0.21 0.43
0.33 -0.22 -0.67 0.28 0.05 0.01
0.07 0.3 -1.01 0.08 0.19 0.03
0.19 -0.14 -0.4 0.16 -0.07 0.18
0.77 -0.71 -2.6 -0.4 0.57 0.35
-0.01 -0.6 -0.25 0.11 0.16 0.38
0.22 -0.29 -0.52 0.23 0.15 0.06
0.38 -0.66 -1.44 0.17 0.55 0.14
0.01 -0.19 -0.52 -0.02 0.18 0.38
0.17 -0.32 -0.94 0.13 -0.02 0.57
0.2 -0.25 -0.86 0.17 -0.09 0.48
-0.01 -1.08 -0.04 0.45 -0.18 0.4
0.14 -0.3 -0.88 0.14 -0.12 0.6
0.24 -0.17 -0.58 0.37 -0.02 -0.02
0.23 -0.29 -0.82 0.21 0.24 0.14
0.29 -1.07 -0.82 0.24 0.14 0.53
-0.44 -0.68 -1.09 0.35 0.17 0.82
0.26 -0.16 -0.55 0.25 -0.01 0.06
0.19 -0.19 -0.64 0.23 0.2 0.03
0.14 -0.31 -0.33 0.1 0.11 0.2
0.34 -0.58 -1.05 -0.11 0.29 0.52
0.1 -0.54 -0.07 -0.07 0.45 -0.04
0.24 -0.14 -0.72 0.54 -0.05 -0.17
0.3 -0.2 -0.82 0.33 0.16 -0.05
0.28 -0.56 -1.37 0.64 -0.77 0.65
0.87 -0.69 -1.1 -0.05 -0.14 0.28
0.21 -0.24 -0.53 0.33 0.05 0.02
0.34 -0.27 -0.85 0.23 0.18 0.05
0.22 -0.13 -0.71 0.25 0.16 0.0
0.3 -0.16 -0.75 0.34 -0.01 0.02
0.22 -0.18 -0.48 0.22 -0.09 0.17
0.25 -0.26 -0.6 0.19 -0.05 0.27
-0.42 -0.9 0.1 -0.41 0.8 0.2
0.08 -0.52 -1.18 0.58 -0.42 0.65
0.12 -0.35 -0.5 0.07 -0.09 0.52
0.24 -0.3 -0.83 0.18 -0.1 0.47
0.24 -0.62 -0.7 0.3 0.18 0.25
0.25 -0.19 -0.71 0.23 0.28 -0.11
0.25 -0.16 -0.46 0.25 0.03 -0.03
0.25 -0.03 -0.8 0.25 -0.04 0.12
0.52 -1.18 -1.98 0.05 0.63 0.37
0.22 -0.26 -0.45 0.19 0.45 -0.39
0.24 0.07 -0.56 0.18 0.01 -0.07
0.17 -0.01 -0.59 0.36 0.08 -0.18
0.32 -0.0 -0.61 0.26 0.01 -0.17
0.26 -0.08 -0.75 0.33 -0.02 0.03
0.93 -1.01 -2.55 0.55 -0.54 0.34
0.15 -0.8 -0.53 -0.51 0.18 0.84
0.17 -0.34 -0.84 0.55 0.02 0.06
0.25 -0.16 -0.75 0.26 -0.04 0.2
0.32 -0.15 -0.57 0.27 0.03 -0.08
0.22 -0.15 -0.74 0.24 -0.07 0.26
-0.16 -0.6 -0.63 0.39 0.42 0.2
0.25 -0.23 -0.84 0.23 -0.09 0.37
0.19 -0.11 -1.24 0.35 -0.38 0.55
0.14 -0.36 -0.88 0.11 -0.17 0.68
0.17 -0.32 -0.88 0.43 0.31 -0.09
0.22 -0.23 -0.82 0.45 -0.06 0.12
-0.15 -0.93 -0.08 -0.28 0.53 0.45
0.24 0.1 -0.67 0.18 -0.08 0.06
0.32 -0.17 -0.72 0.31 0.0 0.03
0.22 -0.31 -0.62 0.18 0.38 -0.08
0.35 -0.16 -0.73 0.3 0.04 -0.04
-0.39 -0.89 -1.13 -0.11 0.78 0.67
0.22 -0.27 -0.32 0.16 0.33 -0.27
0.12 -0.31 -0.89 0.15 -0.15 0.63
0.17 -0.38 -0.81 0.55 -0.1 0.18
0.15 -0.09 -0.59 0.33 -0.14 0.16
0.33 -0.28 -0.81 0.17 0.26 0.03
-0.73 -0.77 -0.11 0.32 0.25 0.52
0.34 -0.09 -0.57 0.3 0.02 -0.19
0.44 -0.61 -0.93 -0.15 -0.09 0.7
0.25 -0.22 -0.76 0.27 -0.06 0.25
0.04 -0.34 -0.57 0.06 0.39 0.21
0.28 -0.14 -0.72 0.25 -0.02 0.14
-0.71 -0.72 -0.2 0.03 0.48 0.59
0.59 -1.06 -2.03 0.09 0.11 0.7
0.21 -0.55 -1.11 -0.11 0.86 -0.07
0.12 -0.5 -1.27 -0.17 0.34 0.71
0.24 -0.13 -0.73 0.26 -0.06 0.2
0.17 -0.28 -0.86 0.16 -0.03 0.49
0.32 0.06 -0.72 0.26 0.01 -0.15
0.33 -0.27 -0.65 0.29 0.1 -0.01
0.17 -0.05 -0.73 0.2 -0.1 0.3
0.36 -1.0 -0.31 0.22 0.16 0.17
0.29 -0.22 -0.6 0.22 -0.02 0.15
0.33 -0.2 -0.74 0.26 -0.0 0.11
0.33 -0.01 -0.78 0.3 0.01 -0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.