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Heatmap: Cluster_74 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.21 0.13 0.25 0.12 0.2 0.04 0.02 0.0 -0.09 -0.16 -0.21 -0.21
-0.65 -0.26 -0.54 0.8 0.8 -0.17 -1.1 -0.65 -0.4 -0.04 0.37 0.43
-0.37 0.69 0.81 0.41 0.11 -0.52 -0.92 -0.12 -0.3 -0.4 -0.1 -0.32
-0.05 0.1 0.08 0.45 0.29 0.09 -0.12 -0.06 -0.13 -0.22 -0.43 -0.22
-0.2 0.05 0.14 0.29 0.1 0.27 -0.1 -0.19 -0.04 -0.08 -0.17 -0.19
-0.62 0.27 0.27 0.86 0.23 -0.0 0.05 -0.15 -0.9 -0.42 0.03 -0.51
-1.31 -0.41 -0.37 0.39 0.37 0.2 0.23 0.37 0.02 -0.08 -0.08 -0.08
-0.09 0.06 -0.23 0.56 0.54 -0.21 -0.21 0.53 0.04 -0.71 -0.29 -0.74
-0.11 0.23 -0.17 0.28 0.31 0.2 -0.04 -0.2 -0.11 -0.13 -0.28 -0.14
- -2.9 -1.61 0.14 0.65 0.29 0.97 0.88 0.06 0.48 -0.24 -0.85
-0.42 -0.5 -0.32 0.35 0.02 0.18 0.04 0.3 0.29 0.01 -0.04 -0.2
-2.02 -0.98 -0.22 0.22 0.35 0.64 0.35 0.57 0.18 -0.1 -0.09 -0.7
-0.97 0.13 -0.19 0.45 0.5 0.04 -0.63 0.04 -0.2 0.1 0.19 -0.08
-1.86 0.04 -0.02 0.6 0.73 0.17 -0.14 0.33 0.1 -0.43 -0.7 -0.28
0.21 0.55 0.27 0.77 0.62 -0.33 -0.55 -0.08 -0.49 -1.33 -0.83 -0.25
-0.01 0.4 0.23 0.29 0.3 -0.07 -0.39 -0.16 -0.11 -0.13 -0.32 -0.32
-0.36 0.06 -0.16 0.06 0.23 -0.04 -0.16 0.11 0.04 0.07 0.26 -0.23
-0.72 0.15 0.15 0.57 0.62 0.19 -0.16 0.2 -0.46 -0.55 -0.26 -0.46
-1.6 -0.41 -0.44 0.34 0.1 0.56 0.14 -0.08 0.42 0.15 0.33 -0.72
-0.92 0.19 -1.19 0.03 1.1 -0.53 -0.15 0.1 0.32 0.45 -1.03 -0.04
0.57 0.62 0.11 0.43 0.5 -0.0 -0.19 0.26 -0.58 -1.43 -1.08 -0.85
0.11 0.64 0.22 0.44 0.63 -0.04 -0.46 0.42 -0.59 -1.48 -0.53 -0.85
0.4 0.66 0.13 0.41 0.54 -0.2 -0.41 0.29 -0.48 -1.08 -0.78 -0.74
-0.2 0.47 0.22 0.75 0.13 -0.58 -0.5 -0.2 -0.0 -0.16 -0.42 -0.13
0.08 0.19 0.35 0.43 0.01 0.22 -0.6 0.03 -0.32 -0.16 -0.04 -0.61
-0.58 0.79 0.35 0.74 0.33 -0.24 -0.42 -0.04 -0.27 -0.61 -0.51 -0.64
-0.52 0.76 0.28 0.56 0.52 -0.56 -0.44 0.24 -0.42 -0.55 -0.25 -0.68
- - - 0.06 1.97 0.12 -0.89 -0.45 0.99 0.09 0.06 -0.79
-0.93 -0.22 -0.52 0.21 0.2 -0.17 0.13 0.41 -0.04 0.02 0.32 0.12
-0.6 -0.37 -0.42 0.38 0.11 0.03 0.13 0.28 0.17 -0.02 0.05 -0.06
-0.06 0.31 0.32 0.34 0.05 -0.19 0.11 -0.09 -0.09 -0.11 -0.43 -0.43
-0.59 -0.01 -0.08 0.46 0.27 0.1 0.09 0.16 -0.04 -0.21 -0.13 -0.3
-0.3 -0.3 -0.22 0.17 0.15 -0.03 -0.33 0.24 -0.14 0.09 0.27 0.21
-0.72 -0.0 0.32 0.36 0.4 0.1 -0.28 0.1 -0.06 -0.13 -0.13 -0.33
-0.66 -0.44 -0.31 0.36 0.32 0.01 0.1 0.38 0.13 -0.09 -0.02 -0.17
-0.12 0.43 0.19 0.79 0.53 -0.15 -0.4 0.1 -0.3 -0.48 -0.5 -1.18
-0.61 0.19 0.05 0.28 0.38 0.12 -0.19 0.06 -0.08 -0.11 -0.22 -0.13
-0.16 0.57 -0.16 0.57 0.48 -0.77 -0.6 0.06 -0.26 -0.22 -0.01 -0.21
-0.31 0.28 0.19 0.31 0.22 -0.05 -0.26 -0.11 -0.05 -0.08 -0.18 -0.13
-0.31 -0.24 -0.2 0.16 0.06 -0.16 -0.24 0.3 0.04 0.11 0.28 0.01
-0.21 0.37 0.21 0.31 0.18 0.02 0.14 -0.38 -0.19 -0.31 -0.47 0.02
-0.08 0.18 0.21 0.24 0.2 -0.02 -0.24 0.13 -0.21 -0.19 -0.11 -0.24
-0.25 0.26 0.05 0.18 0.27 0.06 -0.19 -0.01 -0.12 -0.02 -0.15 -0.2
-0.31 0.21 0.19 0.32 0.33 0.02 -0.14 -0.11 -0.03 -0.12 -0.25 -0.32
-0.81 0.23 0.41 0.64 0.22 -0.29 -0.28 0.0 0.04 -0.08 -0.34 -0.33
-6.48 -2.72 -1.07 0.52 0.21 0.13 0.78 0.59 0.54 0.39 -0.18 -0.3
-0.32 0.2 0.04 0.32 0.26 -0.08 -0.13 -0.02 -0.03 -0.07 -0.18 -0.13
-1.04 0.19 0.34 0.19 0.24 0.14 -0.08 -0.03 -0.16 -0.02 -0.15 -0.03
-0.42 0.27 0.16 0.29 0.45 -0.05 -0.33 0.13 -0.1 -0.04 -0.27 -0.4
0.26 0.36 0.18 0.31 0.17 -0.31 -0.27 0.03 -0.05 -0.19 -0.35 -0.41
-0.59 0.31 0.42 0.58 0.29 -0.05 -0.07 -0.09 -0.08 -0.14 -0.78 -0.45
-0.03 0.2 0.18 0.44 0.02 -0.47 -0.36 -0.14 0.23 0.12 -0.32 -0.15
0.21 0.16 -0.17 0.05 0.13 -0.15 -0.25 0.11 0.03 -0.01 -0.05 -0.14
-1.24 -0.42 -0.8 0.35 -0.04 0.28 -0.07 0.25 0.42 0.02 0.35 0.04
0.34 0.25 -0.12 0.25 0.23 -0.18 -0.22 0.03 -0.01 -0.18 -0.32 -0.27
-0.89 -0.09 0.17 0.5 0.44 0.02 -0.34 0.21 -0.09 -0.06 -0.09 -0.29
-1.69 0.16 0.49 0.31 0.14 0.12 -0.04 -0.19 -0.56 -0.16 0.02 0.39
-0.45 0.53 0.46 0.63 0.54 -0.48 0.21 -0.02 -0.77 -0.84 -0.54 -0.41
0.28 0.27 -0.21 0.05 0.1 -0.24 -0.39 0.09 -0.07 0.14 -0.09 -0.09
-0.47 0.23 -0.03 0.18 0.17 -0.11 -0.09 0.02 0.03 0.09 0.04 -0.19
0.06 0.2 -0.3 0.59 0.42 -0.1 -0.31 0.15 -0.19 -0.22 -0.25 -0.46
0.33 -1.32 -1.51 0.27 0.87 0.57 - 0.16 -2.27 -0.37 1.1 0.3
-0.49 0.32 0.36 0.1 0.06 0.0 -0.21 0.07 -0.18 -0.12 0.03 -0.15
0.17 0.47 0.11 0.58 0.15 -0.47 -0.32 0.17 -0.18 -0.3 -0.28 -0.63
-2.84 -0.27 -0.36 0.22 0.97 -0.07 -0.89 -0.01 -0.5 0.71 0.38 -0.0
-1.28 0.22 -0.34 -0.3 0.68 -0.38 -0.92 0.23 0.42 0.41 0.15 -0.05
0.16 0.12 -0.06 0.27 0.41 0.06 -0.09 0.18 -0.22 -0.43 -0.19 -0.5
-0.28 0.37 0.2 0.3 0.11 -0.28 -0.25 0.02 -0.2 -0.07 -0.19 0.07
-0.11 0.6 0.46 0.31 0.0 -0.12 0.38 0.21 -0.47 -1.02 -0.45 -0.69
-1.64 -0.3 -0.24 0.47 0.26 0.13 0.04 0.23 0.0 0.1 0.11 -0.01
-0.1 0.05 -0.01 0.4 0.26 0.19 0.0 0.18 -0.15 -0.19 -0.35 -0.55
-0.44 -0.0 0.21 0.61 0.32 0.01 -0.26 0.07 -0.07 -0.38 -0.19 -0.24
0.49 0.71 1.22 0.91 - 0.94 -1.07 -0.87 -1.19 - 0.46 -
-1.53 -0.35 -1.1 0.44 0.93 -0.29 -0.78 -0.31 -0.04 0.48 0.46 0.25
0.16 0.43 -0.11 0.33 0.25 -0.21 -0.29 0.21 -0.13 -0.29 -0.09 -0.61
-0.57 -0.3 0.0 0.45 0.39 0.01 -0.03 0.26 -0.04 -0.07 -0.23 -0.2
-0.34 -0.04 -0.08 0.23 0.28 0.01 -0.17 0.05 0.03 0.11 -0.01 -0.18
-0.4 0.16 -1.28 -0.1 0.18 0.27 -1.8 -0.76 -0.51 0.4 1.28 0.16
-0.17 -0.07 -0.34 0.46 0.29 0.03 -0.31 0.09 -0.08 0.02 -0.09 -0.03
-0.11 0.07 -0.02 0.21 0.21 -0.08 0.15 0.05 -0.06 -0.01 -0.28 -0.23
-0.16 0.18 -0.29 0.08 0.13 -0.15 -0.39 0.12 0.03 0.09 0.25 -0.03
0.5 0.36 -0.28 0.29 0.15 -0.55 -0.52 0.07 0.08 -0.09 -0.21 -0.25
-1.28 0.28 0.23 0.16 0.51 0.04 -0.22 0.05 0.12 -0.2 -0.12 -0.23
-0.15 0.86 0.65 0.92 -0.07 -0.75 -0.43 -0.6 0.07 -0.46 -1.21 -0.59
-1.35 -0.15 -0.13 0.21 0.34 0.19 -0.07 0.1 0.01 0.24 0.15 -0.14
-0.36 0.42 -0.08 0.44 0.26 0.17 0.05 -0.24 -0.17 -0.06 -0.44 -0.35
-0.19 -0.22 -0.21 0.1 0.06 -0.06 -0.14 0.19 0.02 0.01 0.32 -0.0
-0.14 0.26 0.29 -0.05 0.1 -0.17 -0.13 0.0 -0.08 -0.03 -0.05 -0.1
- - 0.82 - 1.32 - - 1.69 1.13 1.23 - -
-0.1 0.32 -0.38 0.63 0.6 -0.8 -0.78 -0.02 -0.3 0.1 0.04 -0.1
0.11 0.16 -0.16 0.6 0.55 -0.6 -0.74 -0.05 -0.19 -0.09 0.02 -0.18
1.01 0.42 - 1.38 0.75 -0.55 -0.29 0.12 -2.06 -1.0 -0.98 -0.91
-0.55 0.68 0.42 0.41 0.3 0.12 0.01 -0.28 -0.33 -0.41 -0.56 -0.57
0.41 0.23 -0.04 -0.09 0.23 -0.2 -0.29 0.25 -0.08 -0.12 -0.3 -0.21
-0.17 0.37 -0.06 0.09 0.31 -0.15 -0.21 0.32 -0.01 -0.21 -0.28 -0.22
-1.33 -0.49 0.33 0.2 0.24 0.7 0.4 -0.4 -1.22 -0.6 0.21 0.44
-0.03 0.7 -0.04 0.56 0.45 -0.65 -0.89 0.1 -0.4 -0.28 0.04 -0.45
-0.17 0.18 0.22 0.17 0.2 -0.07 -0.08 -0.01 -0.03 -0.06 -0.2 -0.25
-0.5 0.02 0.18 0.23 0.33 0.1 -0.13 0.28 -0.23 -0.21 -0.05 -0.27
- - - 0.79 0.91 0.54 0.84 - 0.72 0.82 0.79 -
-0.42 0.21 -0.41 -0.04 0.23 -0.52 -0.31 0.21 0.11 0.11 0.39 0.08
-0.32 0.02 0.02 0.36 0.24 0.04 -0.1 0.15 -0.01 -0.11 -0.22 -0.22
0.17 0.6 -0.23 0.49 0.24 -0.78 -0.32 0.04 -0.13 -0.21 -0.14 -0.28
0.28 0.21 -0.2 0.39 0.22 -0.17 -0.39 0.06 0.03 -0.15 -0.27 -0.25
0.03 0.4 -0.18 0.67 0.05 -0.19 0.04 0.3 -0.34 -0.1 -0.58 -0.69
-1.87 -0.21 -0.23 0.2 0.76 -0.5 -0.35 0.58 -0.08 0.16 0.35 -0.24
-1.69 -0.33 -0.26 0.49 0.43 0.04 0.02 0.41 0.17 0.09 0.01 -0.44
-0.25 0.05 0.37 0.19 0.35 0.26 -0.21 -0.01 -0.04 -0.29 -0.3 -0.4
-0.55 0.67 0.39 0.45 0.07 -0.26 -0.26 -0.24 0.1 0.17 -0.92 -0.4
-0.27 -0.06 -0.08 0.36 0.3 -0.0 -0.05 0.24 -0.03 -0.2 -0.1 -0.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.