Heatmap: Cluster_45 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.78 0.18 -0.07 -0.04 -0.07 -0.12 -0.11 -0.16 -0.24 -0.39 -0.3 0.14
0.11 0.0 -0.07 -0.24 -0.1 0.03 0.07 0.25 0.17 0.03 -0.09 -0.25
0.39 0.11 -0.24 -0.36 -0.11 -0.1 0.05 0.29 0.12 -0.09 -0.12 -0.12
-1.26 0.98 0.67 0.37 0.62 -0.21 -0.91 -0.14 -0.19 -0.51 -0.72 -0.51
0.55 0.14 0.02 -0.15 -0.11 -0.14 -0.14 0.17 -0.26 -0.43 -0.05 0.14
0.4 -0.06 -0.18 -0.13 -0.29 -0.05 0.19 0.16 0.16 0.08 -0.27 -0.18
-2.4 0.99 -0.17 -0.18 0.28 0.33 -0.06 -0.62 -0.69 -0.2 0.3 0.32
0.76 0.13 0.19 0.11 -0.13 0.06 0.13 -0.03 -0.36 -0.67 -0.46 -0.29
0.57 0.56 0.44 -0.1 -0.26 -0.02 0.14 -0.1 -0.34 -0.8 -0.58 -0.22
0.63 0.3 0.19 -0.2 -0.15 -0.21 -0.07 -0.05 -0.09 -0.46 -0.17 -0.03
0.15 -3.19 -0.54 -1.13 -1.25 1.65 1.01 0.58 0.65 -3.46 -0.79 -1.58
- - 0.0 -0.58 -0.5 1.58 1.02 -0.55 0.47 0.34 0.35 -
0.5 0.33 0.01 -0.12 -0.25 -0.11 -0.05 -0.41 -0.19 -0.14 -0.06 0.23
0.53 0.02 -0.19 -0.12 0.05 0.24 0.04 0.15 -0.54 -0.57 -0.08 0.11
0.17 0.39 0.32 -0.17 -0.21 -0.45 -0.25 0.16 0.09 -0.06 -0.03 -0.2
0.31 -0.07 0.04 -0.08 -0.17 0.07 0.18 0.28 -0.11 -0.23 -0.12 -0.24
1.29 0.54 0.09 0.39 -0.51 -0.04 0.35 -0.66 -0.91 -0.76 -1.1 -0.84
-0.15 1.86 -0.07 -0.98 -0.52 -1.53 -1.75 -0.23 -0.38 -0.2 0.03 0.21
-2.48 1.38 0.64 -0.24 -0.17 0.84 -0.15 -2.61 - -2.07 0.63 0.37
- 2.36 0.43 -1.15 0.52 0.14 - 0.3 -1.26 -0.16 - -
0.29 0.17 -0.12 -0.2 0.1 0.01 -0.21 0.22 -0.15 -0.08 0.02 -0.17
0.69 0.31 -0.02 -0.27 -0.17 -0.05 0.02 -0.24 -0.22 -0.31 -0.05 -0.02
-1.11 1.04 0.33 0.24 0.68 -0.37 -0.91 -0.28 -0.11 -0.5 -0.55 0.0
-0.16 0.2 -0.31 -0.11 -0.09 0.17 0.09 0.47 0.08 -0.07 -0.3 -0.14
0.16 0.04 -0.03 -0.22 0.25 0.06 -0.21 0.03 -0.12 -0.12 -0.05 0.12
0.54 0.14 0.33 -0.05 -0.4 -0.04 0.02 0.33 -0.21 -0.43 -0.07 -0.58
-0.23 0.02 0.08 -0.07 0.32 -0.0 -0.22 0.13 -0.12 -0.33 0.4 -0.18
1.37 0.56 0.11 -0.22 -0.39 -0.55 -1.2 -0.52 -0.1 -0.78 -0.04 -0.09
0.78 0.38 -0.19 -0.23 -0.55 -0.48 -0.0 -0.48 -0.25 0.09 0.07 0.24
-2.0 1.67 0.05 -0.39 -0.91 -1.55 0.33 0.0 -0.37 -1.01 0.08 0.39
0.37 0.26 0.07 -0.06 -0.16 -0.14 -0.09 0.2 -0.2 -0.28 -0.05 -0.08
0.9 0.47 0.5 -0.17 -0.35 0.02 0.08 0.02 -0.49 -0.95 -0.52 -0.63
0.36 -0.16 -0.37 -0.31 0.04 0.32 -0.38 0.07 0.18 -0.16 0.08 0.09
0.37 0.32 0.23 -0.03 -0.01 0.0 0.13 -0.15 -0.02 -0.3 -0.47 -0.33
0.24 0.09 -0.49 -1.33 -0.65 -0.38 -1.34 0.99 0.38 0.14 0.17 0.4
0.21 0.31 0.31 0.17 0.02 -0.47 -0.48 -0.2 -0.16 -0.09 0.02 0.08
0.74 0.46 0.09 -0.03 -0.4 -0.38 -0.5 -0.17 -0.3 -0.19 0.03 0.12
0.47 0.02 0.18 -0.08 -0.41 -0.17 0.0 0.26 0.02 -0.21 -0.21 -0.09
0.45 0.17 0.14 -0.06 -0.06 0.05 -0.06 0.04 -0.15 -0.26 -0.2 -0.2
0.69 0.31 0.23 -0.48 -0.42 -0.66 -0.36 -0.14 -0.32 0.17 0.51 -0.24
0.31 0.2 0.15 -0.15 -0.18 -0.06 -0.04 0.24 -0.08 -0.11 -0.03 -0.39
0.44 0.0 0.19 -0.24 -0.33 0.22 0.35 0.21 -0.08 -0.55 -0.16 -0.42
0.25 0.15 0.09 -0.1 0.02 0.39 0.03 0.06 -0.22 -0.32 -0.26 -0.3
1.57 0.62 0.1 -0.64 -1.05 -0.65 -0.48 -0.86 -0.4 -0.28 -0.2 -0.07
- 1.72 0.96 -0.45 -0.09 0.4 -2.14 -1.59 -1.74 -1.05 -0.21 0.66
0.37 0.04 -0.19 0.11 0.12 0.32 -0.04 0.02 -0.19 -0.36 -0.34 -0.07
-2.46 1.76 -0.63 -0.08 0.2 0.36 -0.26 -0.31 -1.16 -0.49 -0.65 -0.06
0.34 0.03 -0.24 -0.18 -0.16 0.24 -0.08 0.32 0.06 -0.02 -0.18 -0.32
0.51 0.29 0.02 -0.28 -0.4 -0.41 -0.29 0.12 -0.04 -0.05 0.2 0.01
0.19 0.04 -0.06 -0.22 -0.15 -0.07 -0.19 0.32 -0.02 -0.13 0.19 -0.0
0.38 0.44 0.39 0.26 -0.54 -0.49 -0.62 -0.13 0.01 0.02 -0.05 -0.17
0.57 0.09 0.15 -0.15 0.01 -0.1 -0.31 -0.07 -0.06 -0.4 -0.11 0.13
-5.94 0.59 0.85 0.13 0.15 0.31 0.15 -0.04 -0.66 -0.49 -0.24 -0.07
0.28 0.13 0.17 0.04 -0.07 -0.09 0.02 0.01 -0.15 -0.19 -0.15 -0.07
-1.41 0.63 -0.27 -0.14 0.31 0.12 -0.89 0.35 -0.17 -0.0 0.27 0.15
0.46 0.74 0.48 -0.24 -0.87 -0.03 -0.48 -0.0 -0.39 -0.45 0.14 -0.2
-4.36 0.59 -0.44 -0.29 1.29 -0.02 -1.99 0.15 -0.03 -0.24 0.45 -0.16
0.29 0.07 0.02 -0.06 0.04 0.14 0.1 0.13 -0.12 -0.29 -0.18 -0.26
- 1.58 -0.24 0.51 -0.15 -1.11 -0.91 0.63 -0.93 0.15 0.46 -1.85
-3.65 1.99 -0.42 -0.95 -0.11 -0.65 -1.03 -0.23 0.2 -0.04 -0.66 0.04
0.39 0.29 0.33 -0.1 -0.12 -0.09 0.01 0.11 -0.1 -0.26 -0.28 -0.45
0.04 1.55 -0.06 -0.14 -0.72 -0.08 -1.11 -0.79 0.19 -0.19 -0.85 0.01
0.38 -0.18 -0.09 -0.13 0.09 0.35 0.03 -0.08 -0.11 -0.33 -0.11 0.01
0.25 0.06 0.05 -0.23 0.03 0.16 0.18 0.14 -0.09 -0.16 -0.28 -0.24
-1.22 0.51 -0.03 -0.04 -0.22 -0.16 -0.3 0.33 -0.07 0.31 0.08 0.17
-0.41 -0.28 0.17 0.2 0.34 0.32 -0.19 -0.13 0.07 -0.15 0.14 -0.34
-0.04 1.25 -0.41 -0.13 -0.08 -0.33 -0.58 -0.05 -0.26 -0.41 -0.2 0.21
0.54 0.36 0.15 -0.02 -0.06 -0.05 -0.12 -0.2 -0.38 -0.52 -0.25 0.19
0.32 0.26 0.16 -0.03 -0.1 -0.21 -0.29 0.28 -0.16 -0.19 0.01 -0.25
0.08 0.11 0.19 0.07 0.01 0.05 -0.09 0.08 -0.1 -0.13 -0.02 -0.3
-0.17 0.93 -0.28 -0.41 0.05 -0.22 -0.24 0.22 -0.33 -0.22 0.16 -0.07
-0.02 0.65 0.01 -0.27 -0.02 0.09 0.09 0.38 -0.34 -0.43 -0.16 -0.38
-1.76 0.19 0.02 -0.29 0.04 0.53 0.15 0.14 -0.07 -0.01 -0.1 0.22
0.53 0.26 0.12 0.11 -0.08 -0.22 -0.02 -0.12 -0.17 -0.31 -0.2 -0.14
-2.25 0.99 -0.04 -0.26 0.37 -0.43 -0.26 -0.02 0.04 0.02 -0.22 0.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.