Heatmap: Cluster_11 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.15 0.0
0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.04 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.05 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.04 0.06 0.04 0.04
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.17 0.07 0.0 0.07 0.08 0.0 0.17 0.04 0.08 0.11 0.07
0.07 0.14 0.0 0.09 0.02 0.0 0.07 0.07 0.05 0.0 0.0 0.02
1.02 3.23 2.19 1.95 0.44 0.06 0.07 0.26 0.4 0.48 0.75 0.65
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.47 6.4 3.61 2.58 0.58 0.35 0.24 0.41 0.7 1.42 1.06 1.92
0.86 3.98 1.86 1.14 0.37 0.04 0.16 0.34 0.32 0.46 0.99 0.73
0.49 1.78 0.73 0.44 0.25 0.0 0.07 0.09 0.13 0.23 0.52 0.3
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.07 0.93 0.33 0.0 0.02 0.0 0.2 0.0 0.0 0.02 0.72 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.28 0.12 0.23 0.28 0.16 0.07 0.09 0.09 0.06 0.06 0.05
0.03 0.17 0.06 0.0 0.02 0.02 0.09 0.04 0.0 0.04 0.0 0.02
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.02
0.71 0.94 0.7 0.71 0.91 0.59 0.72 0.71 0.49 0.5 0.85 0.56
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.24 0.56 0.33 0.19 0.19 0.04 0.09 0.11 0.02 0.08 0.1 0.11
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.02 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.98 1.48 0.26 0.28 0.82 0.41 0.45 0.49 0.63 0.25 0.52 0.81
0.0 0.05 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.3 0.07 0.04 0.02 0.03 0.07 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0
0.32 0.73 0.12 0.56 0.61 0.4 0.32 0.27 0.67 0.56 0.39 0.46
0.0 0.32 0.1 0.0 0.02 0.09 0.03 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02
2.25 5.15 2.37 3.94 3.99 3.86 3.22 2.9 2.96 3.11 2.04 2.71
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.03 0.04 0.0 0.04 0.07
1.58 2.45 1.03 0.59 1.0 1.27 2.51 1.68 1.98 1.06 1.14 1.77
0.0 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.16 0.13 0.07 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
2.58 2.74 2.49 2.42 1.67 2.38 2.82 2.66 2.6 1.4 1.89 1.41
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.76 2.91 1.55 1.29 1.12 1.49 1.89 2.4 1.22 1.04 0.78 0.96
1.04 2.67 1.29 1.11 0.82 0.51 1.31 0.68 1.14 0.78 1.17 0.76
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0
0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.13 0.0 0.0 0.0
0.14 0.02 0.03 0.0 0.09 0.04 0.05 0.07 0.21 0.21 0.23 0.14
0.0 0.13 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.55 0.24 0.26 0.2 0.35 0.29 0.23 0.78 0.61 0.66 0.6 0.51
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.04 0.0 0.04 0.04 0.0 0.09 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.13 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.06 0.08 0.0 0.16
0.04 0.08 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
0.0 0.08 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.02
0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04
0.07 0.36 0.04 0.17 0.27 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.15 0.05
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
3.55 4.02 2.67 3.8 3.23 3.12 3.34 3.24 3.16 3.2 3.09 3.63
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.4 0.41 0.33 0.4 0.32 0.34 0.27 0.19 0.09 0.27 0.25 0.21
0.07 0.14 0.0 0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.09
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.04 0.0
0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.32 0.14 0.04 0.17 0.28 0.14 0.23 0.09 0.27 0.19 0.45
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.04 0.02 0.0 0.0
0.1 0.18 0.12 0.11 0.11 0.04 0.07 0.14 0.11 0.18 0.11 0.14
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0
16.91 46.08 32.15 23.27 8.72 1.38 0.71 0.88 0.61 1.24 1.64 2.99
9.38 33.69 22.55 13.46 5.93 0.76 0.56 0.49 0.54 0.75 1.25 2.18
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.15 0.04 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.06 0.07
0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05
0.0 0.58 0.0 0.07 0.02 0.05 0.0 0.07 0.0 0.0 0.04 0.12
0.0 0.18 0.03 0.04 0.09 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 1.26 0.43 0.36 0.26 0.3 0.25 0.44 0.35 0.77 0.9 0.72
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0
0.62 0.76 0.56 0.45 0.77 0.32 0.33 0.48 0.68 0.68 0.54 0.88
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)