Heatmap: Cluster_161 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-2.11 -0.93 -0.56 0.04 0.56 0.37 0.09 0.27 0.33 0.35 0.12 -0.19
-2.06 -1.09 -0.33 0.18 0.41 0.42 0.19 0.32 0.44 0.15 -0.07 -0.19
-1.34 0.03 -0.04 0.35 0.16 0.0 -0.14 -0.09 0.22 0.29 -0.04 0.01
-2.07 -0.63 -0.32 0.24 0.48 0.32 -0.12 0.27 0.26 0.16 0.06 0.01
-5.19 -0.68 -0.51 0.41 0.46 -0.12 -0.19 0.16 0.07 0.53 0.43 0.25
-0.78 -0.12 -0.3 0.18 0.57 0.23 -0.15 0.0 0.04 0.2 -0.07 -0.22
-1.72 -0.66 -0.43 -0.01 0.36 0.26 0.06 0.1 0.31 0.49 0.07 0.05
-2.01 -0.43 -0.12 0.09 0.48 0.22 0.04 0.09 0.13 0.28 0.1 -0.02
-5.37 -2.75 -1.16 0.51 0.82 0.34 0.2 -0.14 0.44 1.13 -0.59 -0.56
-5.06 -1.28 -0.25 0.72 0.63 0.38 0.32 0.11 0.11 0.15 -0.33 -0.12
-3.94 -3.31 -0.96 0.03 0.53 0.67 0.54 0.51 0.5 0.42 -0.03 -0.62
-0.86 -0.42 -0.56 0.27 0.28 0.02 -0.24 -0.02 0.42 0.49 -0.06 0.09
-2.21 -0.94 -0.2 -0.5 -0.08 0.62 0.19 0.21 0.01 0.59 0.42 0.07
-1.73 -0.5 -1.0 0.38 0.77 0.54 0.04 -0.05 -0.02 0.34 -0.17 -0.16
-4.08 -1.52 -1.16 0.26 0.69 0.06 0.3 0.47 0.29 0.44 0.14 -0.01
-1.06 -0.26 -0.55 0.0 0.28 0.22 0.17 0.11 0.37 0.44 -0.23 -0.14
-1.57 -0.03 -0.03 0.29 0.5 0.2 0.0 0.08 0.03 0.05 -0.19 -0.13
-3.12 -0.78 -0.33 0.04 0.45 0.6 0.36 0.17 0.14 0.15 -0.02 -0.02
-3.62 -0.62 -0.42 0.42 0.48 -0.17 0.14 -0.05 0.19 0.72 -0.05 0.11
-2.62 -0.74 -0.3 0.28 0.53 0.19 0.21 0.28 0.35 0.27 -0.2 -0.14
-3.48 -1.18 -0.24 0.13 0.86 0.77 0.36 -0.01 0.29 0.43 -0.55 -1.05
-1.33 -0.3 -0.37 0.41 0.51 0.06 -0.07 0.1 0.17 0.31 -0.1 -0.16
-2.75 -0.95 -0.19 0.42 0.37 0.52 0.29 -0.28 0.35 0.48 -0.38 -0.14
-2.04 -0.73 -0.45 0.04 0.38 0.63 0.62 -0.04 0.34 0.12 -0.25 -0.23
-3.07 -1.28 -0.4 0.05 0.43 0.64 0.52 0.29 0.31 0.2 -0.22 -0.19
-2.72 -0.4 -0.78 0.08 0.35 0.36 0.35 0.04 0.22 0.37 -0.24 0.37
-2.95 -0.45 -0.12 0.22 0.52 0.31 0.03 0.37 0.13 0.2 0.05 -0.34
-0.66 -0.24 -0.29 0.35 0.57 0.11 -0.08 -0.2 -0.02 0.26 -0.1 -0.09
-2.38 -0.28 -0.39 0.16 0.62 -0.16 -0.1 0.27 0.12 0.46 0.18 -0.09
-2.2 -0.62 -0.28 0.21 0.41 0.12 0.19 0.14 0.32 0.43 -0.01 -0.13
-2.99 -0.02 -0.39 0.39 0.53 -0.22 0.08 -0.1 0.53 0.45 -0.36 -0.1
-2.25 -0.57 -0.14 0.29 0.42 0.33 0.27 0.14 0.18 0.15 -0.06 -0.17
-1.24 -0.07 -0.13 0.29 0.42 -0.03 -0.2 0.1 0.11 0.25 0.06 -0.1
-1.65 0.04 -0.87 0.63 0.79 0.59 0.47 -0.3 0.05 -0.07 -1.14 -0.52
-2.0 -0.52 -0.35 0.29 0.57 0.32 0.15 0.14 0.24 0.16 -0.14 -0.17
-0.8 -0.3 -0.43 0.26 0.29 0.17 0.04 -0.03 0.23 0.36 -0.15 -0.05
-3.72 -0.86 -1.26 0.45 1.02 0.74 0.4 0.01 0.2 0.24 -0.8 -0.61
-1.4 -0.13 -0.29 0.28 0.53 0.03 -0.06 -0.05 0.13 0.29 -0.02 -0.04
-1.94 -0.94 -0.82 -0.32 0.27 0.4 0.37 0.24 0.15 0.62 0.13 0.16
-1.64 -0.52 -0.47 -0.12 0.25 0.38 0.29 0.32 0.29 0.31 -0.14 0.01
-3.64 -0.54 -0.8 -0.0 0.36 0.04 0.04 -0.12 0.57 0.81 0.14 0.08
-2.77 -0.6 -1.3 0.19 0.5 0.15 0.47 0.11 0.33 0.8 -0.29 -0.25
-3.74 -0.58 -0.02 0.29 0.8 0.72 0.4 0.07 0.02 -0.34 -0.59 -0.29
-1.74 -0.5 -0.58 -0.2 0.13 0.62 0.14 0.23 0.23 0.37 0.12 -0.02
-1.03 -0.28 -0.37 0.1 0.15 0.13 0.0 0.11 0.43 0.34 0.04 -0.12
-2.14 -0.9 -0.59 0.18 0.42 0.16 0.14 0.1 0.15 0.52 0.15 0.21
-1.42 -0.41 -0.07 0.03 0.29 0.23 0.06 0.14 0.31 0.24 -0.05 -0.04
-0.41 -0.28 -0.1 -0.1 0.15 0.33 0.13 0.24 0.11 0.03 -0.06 -0.22
-1.49 -0.99 -0.78 0.4 0.46 0.23 0.5 0.21 0.36 0.2 -0.26 -0.23
- -1.31 -0.98 0.19 0.53 0.55 0.5 0.42 -0.2 0.63 -0.63 0.28
-1.83 -0.81 -1.17 -0.07 0.48 0.02 0.29 0.36 0.32 0.64 -0.0 0.05
-0.84 -0.12 0.07 0.24 0.18 0.02 -0.06 0.08 0.09 0.27 -0.07 -0.13
-3.68 -0.87 -0.32 0.73 0.89 0.47 0.25 0.15 0.04 -0.14 -0.49 -0.44
-1.79 -0.4 -0.22 0.21 0.65 0.56 0.17 0.15 0.09 0.2 -0.38 -0.55
-1.44 -0.28 -0.14 0.17 0.42 0.26 0.35 -0.23 0.25 0.05 -0.34 0.13
-2.89 -0.96 -0.74 0.56 0.84 -0.12 0.21 0.17 0.14 0.33 -0.13 0.04
-3.75 -1.91 -0.93 0.41 0.5 0.18 0.45 0.04 0.43 0.72 -0.15 -0.06
-4.91 -2.12 -0.62 0.08 0.4 0.45 0.36 0.64 0.01 0.56 0.15 -0.13
-0.39 -0.08 -0.29 0.18 0.43 0.02 -0.15 -0.08 0.06 0.06 -0.02 0.09
-0.9 -0.13 -0.78 0.32 0.32 -0.03 0.04 -0.04 0.15 0.42 0.09 -0.03
-1.11 -0.06 -0.3 0.26 0.56 0.26 0.12 0.1 0.12 0.08 -0.25 -0.42
-3.53 -1.08 -0.51 -0.15 0.35 0.61 0.26 0.18 0.17 0.58 0.07 0.06
-1.73 -0.77 -0.66 0.23 0.54 0.07 -0.01 0.08 0.09 0.31 0.28 0.29
-1.99 -0.21 -0.15 0.36 0.37 0.04 -0.32 -0.11 0.39 0.41 -0.07 0.1
-3.71 -0.89 -0.39 0.11 0.44 0.47 0.26 0.22 0.23 0.46 -0.07 -0.1
-2.14 -1.41 -0.51 0.25 0.67 0.71 0.46 0.17 -0.03 0.08 -0.23 -0.17
-1.95 -0.07 -0.37 0.45 0.16 -0.29 -0.08 0.02 0.34 0.6 -0.29 0.21
-0.7 -0.15 -0.36 0.23 0.42 0.33 0.18 0.08 0.11 0.17 -0.37 -0.38
-1.89 -0.3 -0.17 0.25 0.51 0.25 0.16 0.18 0.04 0.27 -0.22 -0.18
-1.31 -0.28 -0.44 0.31 0.25 0.12 -0.13 0.13 0.38 0.35 -0.05 -0.04
-1.97 -0.01 -0.21 0.53 0.62 -0.15 -0.24 -0.09 0.03 0.29 0.04 -0.1
-1.16 -0.61 -0.3 0.16 0.36 0.25 0.13 -0.27 0.28 0.6 -0.24 -0.02
-1.46 -0.32 -0.27 -0.06 0.13 0.09 0.19 0.11 0.34 0.39 0.08 0.04
-2.03 -0.92 -0.16 0.28 0.45 0.69 0.61 0.06 -0.27 -0.06 -0.25 -0.09
-1.29 -0.23 -0.34 0.4 0.26 -0.02 -0.1 0.04 0.14 0.18 0.15 0.2
-1.44 -0.2 -0.04 0.26 0.48 0.11 0.05 0.08 0.16 0.2 -0.18 -0.2
-0.77 -0.25 -0.58 0.25 0.15 -0.22 0.03 0.15 0.38 0.44 -0.32 0.21
-1.96 -0.59 -0.97 0.24 0.26 -0.26 0.3 -0.06 0.33 0.64 0.09 0.36
-1.71 -0.29 -0.67 0.19 0.45 0.26 0.17 -0.36 0.45 0.27 -0.1 0.19
-2.32 -0.47 -0.44 0.46 0.83 0.29 0.31 -0.23 0.19 0.29 -0.67 -0.19
-2.44 -0.72 -0.4 -0.11 0.28 0.21 0.35 0.26 0.35 0.37 -0.06 0.21
-2.32 -0.29 -0.59 0.49 0.78 0.1 -0.18 -0.08 -0.06 0.21 0.09 0.17
-2.27 -0.36 0.05 0.34 0.57 0.44 0.13 0.21 0.15 0.14 -0.4 -0.63
-2.83 -0.06 -0.68 0.6 0.65 0.33 0.32 -0.49 0.26 0.35 -0.61 -0.23
-1.91 -0.31 -0.35 0.46 0.53 0.25 -0.02 0.04 0.16 0.11 -0.21 0.09
-0.85 -0.21 -0.31 0.25 0.34 0.12 0.04 -0.01 0.13 0.33 -0.09 -0.14
-0.78 -0.32 -0.19 -0.23 0.33 0.54 0.31 0.34 0.04 -0.1 -0.19 -0.27
-1.84 -0.63 -0.28 -0.03 0.28 0.38 0.09 0.22 0.18 0.36 0.2 -0.03
-2.64 -0.48 -1.2 0.07 0.47 0.03 0.11 0.15 0.4 0.86 -0.28 0.11
-1.31 -0.27 -0.15 0.13 0.37 0.25 0.15 0.28 0.28 0.17 -0.23 -0.36
-1.97 -1.44 -0.73 -0.12 0.49 0.84 0.59 0.55 0.17 0.16 -0.28 -0.7
-0.69 -0.45 -1.17 0.04 0.73 0.59 0.32 -0.18 -0.25 0.07 -0.14 0.09
-1.5 -0.37 -0.34 0.2 0.25 0.15 0.28 0.17 0.31 0.27 -0.12 -0.1
-2.64 -0.44 -0.05 0.06 0.4 0.24 0.1 0.19 0.09 0.39 0.13 -0.13
-2.49 -0.49 -0.33 0.37 0.59 0.12 -0.07 0.11 0.12 0.31 0.07 0.05
-0.99 -0.14 0.0 -0.17 0.28 0.26 0.1 0.13 0.13 0.19 0.02 -0.18
-0.65 -0.04 -0.33 0.18 0.54 0.39 0.27 -0.07 -0.07 0.06 -0.38 -0.36
-4.05 -0.81 -0.06 0.38 0.65 0.62 0.23 -0.29 0.06 -0.02 -0.05 0.02
-2.88 -1.14 -0.17 0.3 0.61 0.32 0.4 0.13 0.24 0.2 -0.21 -0.14
-1.76 -0.64 -0.12 0.25 0.5 0.49 -0.03 0.09 0.18 0.27 -0.06 -0.34
-3.22 -0.35 -0.45 0.35 0.63 0.34 0.02 0.28 -0.01 0.26 0.01 -0.21
-3.08 -1.07 -0.13 0.06 0.55 0.72 0.47 0.09 0.05 0.08 -0.29 -0.05
-0.8 -0.23 -0.29 0.2 0.24 0.18 -0.25 0.04 0.13 0.29 0.12 0.02
-1.37 0.02 -0.14 0.34 0.34 0.03 0.02 0.18 0.17 0.18 -0.21 -0.19
-1.79 -1.48 -0.83 -0.22 0.41 0.7 0.76 0.38 0.07 0.14 -0.04 -0.18
-5.31 -2.47 -0.58 0.39 0.59 0.57 0.32 0.34 -0.12 0.53 -0.11 0.03
-2.81 -0.61 -0.83 0.56 0.68 0.42 0.11 -0.12 0.27 0.22 -0.37 0.1
-1.7 -0.28 -0.39 0.19 0.45 0.53 0.27 -0.02 -0.0 0.15 -0.09 -0.11
-4.64 -0.93 -0.85 0.07 0.68 0.18 0.2 0.24 0.36 0.58 0.25 -0.31
-1.73 -0.54 -0.23 0.06 0.23 0.3 0.17 0.25 0.27 0.31 -0.03 -0.05
-0.84 -0.06 -0.18 0.46 0.65 0.23 -0.03 -0.32 -0.17 -0.05 -0.12 -0.11
-1.36 -1.06 -0.53 0.02 0.39 0.74 0.46 -0.11 0.1 0.26 0.01 -0.22
-2.48 -0.7 -0.28 0.38 0.38 -0.28 -0.09 0.31 0.24 0.34 0.21 0.22
-4.82 -0.48 -0.38 0.69 0.7 0.21 0.15 -0.38 0.17 0.26 -0.07 -0.11
-1.64 -0.71 -0.38 0.78 0.63 -0.01 -0.08 -0.4 -0.27 0.47 0.03 0.13
-2.74 -1.04 -0.43 -0.01 0.54 0.36 -0.08 0.36 0.2 0.66 0.17 -0.3
-2.3 -0.32 -0.31 0.41 0.6 0.25 0.26 0.17 0.17 0.33 -0.52 -0.4
-0.59 -0.14 -0.26 0.19 0.39 0.09 -0.05 0.1 0.12 0.32 -0.13 -0.32
-0.6 -0.1 0.01 -0.0 0.24 0.23 0.03 0.13 0.09 0.14 -0.14 -0.23
-4.55 -1.13 -0.53 0.21 0.51 0.48 0.31 0.15 0.42 0.49 -0.13 -0.26
-1.93 -0.36 -0.15 0.12 0.41 0.46 0.08 0.02 0.05 0.23 -0.05 0.02
-1.4 -0.33 -0.14 0.6 0.55 0.09 0.08 0.02 -0.1 0.11 -0.28 -0.05
-2.05 -0.47 -0.47 0.13 0.33 0.56 0.4 0.03 0.27 0.18 -0.22 -0.07
-2.41 -1.22 -0.42 0.13 0.47 0.68 0.36 0.11 0.25 0.19 -0.16 -0.06
-2.97 -0.47 -0.2 0.27 0.59 0.31 0.23 0.16 0.1 0.21 -0.08 -0.21
-6.28 -1.88 -0.73 0.4 0.78 0.35 0.08 0.02 0.32 0.63 0.05 -0.16
-3.0 -1.11 -0.59 -0.01 0.41 0.35 0.38 0.38 0.29 0.35 0.09 -0.04
-1.4 -0.43 -0.55 -0.18 0.34 0.37 0.14 0.38 0.18 0.44 -0.34 0.09
-2.54 -0.64 -0.32 0.51 0.83 0.24 0.1 -0.05 0.07 0.25 -0.15 -0.28
-1.75 -0.44 -0.04 -0.06 0.35 0.42 0.09 0.08 0.18 0.27 0.13 -0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.