Heatmap: Cluster_149 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-3.34 -1.03 -0.21 -0.27 0.3 0.63 0.48 0.42 0.16 0.07 0.16 -0.12
-1.2 -0.57 -0.4 -0.08 0.27 0.4 0.28 0.32 0.29 0.22 -0.07 -0.23
-5.21 -2.49 -0.84 0.36 0.26 0.56 0.22 0.2 0.49 0.54 0.21 -0.07
-2.02 -0.45 -0.39 0.02 0.24 0.57 0.2 0.29 0.36 0.16 -0.1 -0.2
-2.98 -0.9 -0.16 0.05 0.27 0.55 0.37 0.33 0.07 0.06 0.1 0.05
-1.83 -0.72 -0.34 0.14 0.08 0.3 0.24 0.26 0.37 0.36 0.01 -0.05
-2.09 -0.57 -0.21 0.08 0.45 0.49 0.19 0.29 0.12 0.18 -0.05 -0.21
-3.57 -1.44 -0.41 -0.01 0.32 0.35 0.46 0.34 0.31 0.35 0.2 -0.04
-1.49 -0.48 -0.51 -0.16 0.16 0.2 0.18 0.11 0.48 0.35 0.27 -0.03
-1.72 -1.18 -0.28 -0.09 0.27 0.61 0.49 0.2 0.28 0.34 -0.14 -0.29
-3.22 -1.18 -0.62 -0.1 0.32 0.62 0.41 0.45 0.58 0.42 -0.16 -0.57
-4.91 -2.16 -1.03 0.57 0.79 0.32 0.1 -0.06 0.3 0.4 0.22 0.07
-2.17 -0.79 -0.68 0.35 0.38 0.39 0.24 -0.15 0.18 0.36 0.03 0.22
-3.62 -1.43 -0.45 0.24 0.7 0.4 0.37 0.23 0.1 0.37 -0.02 -0.2
-2.32 -1.05 -0.76 0.41 0.43 0.15 0.27 0.18 0.3 0.35 0.02 0.12
-2.48 -1.01 -0.13 0.1 0.45 0.45 0.24 0.13 0.25 0.3 0.0 -0.14
-2.31 -1.06 -0.26 0.23 0.38 0.26 0.12 0.39 0.3 0.32 0.04 -0.13
-6.2 -1.75 -0.5 0.21 0.24 0.35 0.06 0.34 0.41 0.46 0.34 0.15
-1.7 -1.13 -0.57 0.3 0.44 0.52 0.55 0.38 0.18 0.14 -0.22 -0.54
-3.01 -0.91 -0.48 0.09 0.33 0.36 0.37 0.38 0.37 0.31 -0.02 -0.13
-2.23 -1.34 -0.86 0.33 0.46 0.12 0.26 0.01 0.24 0.47 0.2 0.27
-3.02 -1.03 -0.36 0.01 0.3 0.51 0.31 0.48 0.28 0.26 0.08 -0.26
-3.54 -1.0 -0.27 0.11 0.36 0.46 0.5 0.36 0.27 0.02 0.06 -0.17
-2.7 -1.26 -0.68 0.1 0.36 0.63 0.5 0.12 0.25 0.45 -0.1 -0.13
-2.31 -1.11 -0.49 -0.31 0.84 0.76 0.17 0.55 0.0 0.22 -0.23 -0.46
-2.31 -0.81 -0.63 0.03 0.17 0.28 0.06 0.05 0.61 0.44 0.31 0.04
-3.34 -1.8 -0.66 0.31 0.41 0.37 0.38 -0.08 0.24 0.43 0.16 0.29
-2.7 -1.03 -0.53 0.37 0.43 0.52 0.4 0.16 0.33 0.28 -0.08 -0.45
-2.83 -0.71 -0.19 0.24 0.36 0.46 0.46 0.59 0.28 -0.18 -0.25 -0.5
-4.52 -1.58 -0.52 0.11 0.47 0.61 0.42 0.47 0.27 0.2 0.09 -0.35
-2.55 -0.81 -0.2 0.17 0.3 0.28 0.18 0.34 0.24 0.24 0.09 -0.0
-0.55 -0.37 -0.22 0.0 0.17 0.3 0.19 0.26 0.15 0.04 -0.02 -0.22
-1.66 -0.53 -0.24 0.08 0.38 0.42 0.29 0.24 0.2 0.04 0.03 -0.25
-2.89 -1.12 -0.35 0.32 0.41 0.08 0.35 0.34 0.28 0.23 0.04 0.03
-0.85 -0.49 -0.33 0.2 0.41 0.25 -0.02 0.14 0.0 0.17 0.14 -0.06
-3.97 -1.25 -0.38 0.2 0.44 0.46 0.4 0.17 0.24 0.27 0.07 -0.01
-2.44 -1.33 -0.47 0.52 0.52 0.44 0.34 0.17 0.37 0.23 -0.21 -0.39
-2.64 -0.71 -0.48 -0.07 0.4 0.44 0.36 0.12 0.26 0.39 -0.01 0.02
-2.38 -1.08 -0.76 0.38 0.35 0.37 0.6 0.28 0.25 0.38 -0.25 -0.31
-0.98 -0.45 -0.7 -0.2 0.3 0.24 0.31 0.11 0.42 0.39 -0.03 -0.14
-2.55 -1.2 -0.59 -0.11 0.33 0.34 0.22 0.41 0.36 0.42 0.27 -0.07
-2.39 -1.06 -0.82 -0.13 0.39 0.26 0.34 0.34 0.54 0.42 0.19 -0.19
-3.37 -1.37 -0.56 0.23 0.4 0.28 0.29 0.38 0.49 0.47 -0.02 -0.26
-1.97 -1.36 -0.51 0.39 0.43 0.33 0.18 0.41 0.41 0.26 -0.08 -0.33
-3.55 -1.75 -0.82 0.44 0.7 0.54 0.49 0.42 0.21 0.23 -0.25 -0.5
-5.4 -1.27 -0.26 -0.02 0.59 0.48 0.32 0.28 0.25 0.14 0.26 -0.17
-3.99 -0.64 -0.24 -0.07 0.25 0.55 0.58 0.75 0.23 0.03 -0.24 -0.67
-2.45 -1.05 -0.34 0.1 0.47 0.46 0.21 0.18 0.28 0.4 0.15 -0.35
-3.1 -1.63 -1.31 0.1 0.59 0.69 0.5 0.24 0.23 0.38 -0.03 -0.11
-3.08 -1.41 -0.38 0.07 0.31 0.48 0.34 0.35 0.45 0.4 -0.0 -0.24
-4.59 -2.83 -0.75 0.14 0.4 0.8 0.52 0.39 0.39 0.3 0.02 -0.39
-5.84 -1.49 -0.33 0.07 0.48 0.71 0.39 0.21 0.33 0.25 -0.0 -0.25
- -5.03 -1.41 -0.13 0.45 0.21 0.12 0.31 0.66 0.68 0.48 0.32
-1.2 -0.8 -0.24 0.07 0.21 0.45 0.28 0.28 0.23 0.18 -0.03 -0.21
-4.15 -1.88 -0.34 0.24 0.37 0.44 0.34 0.11 0.31 0.35 0.13 0.15
-1.71 -0.96 -0.43 0.12 0.55 0.62 0.4 0.31 0.0 0.02 -0.1 -0.24
-1.17 -0.57 -0.33 0.03 0.31 0.3 0.21 0.14 0.05 0.33 0.03 0.03
-2.74 -1.63 -1.43 -0.42 0.38 0.74 0.51 0.68 0.51 0.26 -0.1 -0.22
-3.43 -1.54 -0.47 0.23 0.43 0.34 0.45 0.34 0.39 0.32 -0.08 -0.13
-1.49 -1.44 -0.69 0.18 0.43 0.3 0.15 0.14 0.23 0.38 0.14 0.2
-2.93 -1.15 -0.6 0.01 0.4 0.61 0.32 0.42 0.42 0.24 -0.2 -0.1
-2.06 -0.72 -0.26 -0.03 0.3 0.49 0.1 0.19 0.31 0.42 0.14 -0.33
-2.43 -1.14 -0.94 -0.22 0.39 0.47 0.36 0.47 0.46 0.47 0.06 -0.28

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.