Heatmap: Cluster_166 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.06
0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.02
10.98 14.73 16.06 12.05 14.45 15.54 15.91 13.21 13.83 13.61 12.09 11.84
3.08 2.33 1.83 1.47 3.45 3.79 4.92 3.18 2.23 4.52 4.03 5.4
4.23 4.69 4.34 4.94 4.72 3.68 3.35 3.36 3.95 4.16 4.28 4.14
3.49 3.46 4.32 3.24 2.51 2.56 2.63 2.62 3.75 4.01 3.79 3.76
0.27 0.88 0.49 0.31 0.29 0.46 0.4 0.62 0.51 0.86 0.55 1.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.19 0.24
35.69 36.39 36.97 28.29 25.25 22.53 26.92 28.0 30.7 33.08 35.89 44.4
0.03 0.04 0.05 0.02 0.0 0.04 0.02 0.05 0.06 0.06 0.06 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0
0.07 0.59 0.25 0.04 0.13 0.21 0.16 0.04 0.11 0.23 0.27 0.38
0.0 0.09 0.07 0.02 0.02 0.04 0.02 0.02 0.08 0.06 0.02 0.09
2.28 5.66 2.38 2.89 3.67 3.39 4.03 2.07 3.74 2.89 3.6 4.15
0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02
5.78 5.2 2.24 4.87 3.35 3.62 2.44 2.34 4.03 5.51 4.47 5.69
0.0 0.44 0.07 0.13 0.19 0.12 0.09 0.19 0.04 0.13 0.19 0.23
48.12 62.1 72.42 70.33 71.43 66.07 51.23 52.87 58.41 67.43 70.24 73.84
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.04 0.13
0.0 0.23 0.02 0.07 0.12 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.15 0.11
0.03 0.41 0.17 0.0 0.29 0.18 0.06 0.21 0.04 0.15 0.26 0.24
0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.04
22.21 29.82 37.37 35.08 30.36 26.71 18.37 21.82 24.09 27.68 29.61 28.12
5.22 9.0 5.9 7.48 5.3 3.59 2.74 3.17 4.52 5.84 6.04 7.19
0.0 0.08 0.07 0.04 0.05 0.06 0.0 0.0 0.07 0.04 0.11 0.13
25.36 21.77 15.87 16.02 17.43 19.9 24.18 27.15 25.81 21.55 26.4 22.69
9.87 15.18 18.03 16.39 14.54 16.96 12.92 11.75 12.14 14.28 16.83 15.39
1.39 0.58 0.47 1.05 1.02 0.75 0.48 0.38 1.19 0.69 1.59 1.67
53.4 79.16 90.1 81.28 90.68 90.56 76.07 78.38 81.27 80.43 89.32 87.04
2.41 3.07 4.15 2.71 2.36 1.5 0.86 1.57 1.93 2.48 3.2 1.85
2.72 4.03 4.19 3.72 4.58 5.66 5.52 4.76 3.58 3.75 3.91 2.96
0.13 0.32 0.32 0.35 0.31 0.39 0.37 0.29 0.31 0.36 0.4 0.44
0.04 0.0 0.03 0.07 0.04 0.02 0.02 0.03 0.04 0.0 0.09 0.06
5.19 7.59 5.08 5.78 4.95 4.36 4.84 5.35 5.01 6.36 6.13 7.26
58.17 86.63 100.04 94.88 91.11 76.61 73.46 78.24 76.56 78.22 73.73 77.4
43.35 40.87 42.38 52.97 49.81 51.8 41.52 36.12 44.29 51.23 50.0 59.5
190.99 160.84 193.22 210.26 190.78 214.73 164.49 121.79 154.9 158.61 199.26 239.35
28.97 27.79 27.27 27.48 25.39 22.29 26.78 21.51 25.0 31.04 30.22 36.77
19.9 12.24 9.23 11.72 7.66 9.28 12.86 9.6 11.64 11.04 11.49 18.13
1.06 1.33 0.77 1.01 0.97 0.61 0.49 0.73 0.59 0.63 0.58 0.81
6.19 6.28 9.17 8.7 7.5 11.87 7.06 5.99 5.93 5.87 7.77 7.68
0.0 0.09 0.05 0.0 0.17 0.02 0.05 0.15 0.0 0.06 0.08 0.07
0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.04 0.02
1.15 1.94 3.31 2.74 2.16 1.95 1.57 1.54 1.58 1.89 2.46 2.7
5.81 11.31 14.98 13.02 13.41 15.79 10.18 8.35 10.38 11.69 9.97 8.42
63.54 66.38 66.96 48.03 42.73 42.47 56.97 55.22 62.97 58.49 59.66 60.29
5.42 6.83 6.2 3.59 3.9 2.84 3.28 5.97 6.46 6.39 6.58 7.91
0.0 0.04 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.05 0.02 0.06 0.04
0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02
75.78 62.44 58.91 64.26 48.37 54.33 68.29 59.82 74.97 69.32 69.18 64.65
0.14 0.25 0.13 0.33 0.43 0.53 0.57 0.57 0.55 0.56 0.32 0.81
9.8 12.83 15.31 13.8 12.56 12.09 11.86 11.81 12.03 10.86 11.49 10.3
40.72 47.1 50.65 40.46 39.82 50.19 46.51 37.81 39.2 39.21 45.32 49.62
2.09 1.54 1.8 2.62 1.71 1.2 0.71 0.37 0.68 0.69 1.16 1.17
0.07 0.47 0.55 0.17 0.02 0.08 0.12 0.03 0.05 0.27 0.32 0.34
0.81 0.39 0.54 0.97 1.29 2.01 1.28 1.5 0.65 1.75 2.38 2.39
0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.04 0.0 0.0 0.04 0.04 0.08 0.04
0.36 0.31 0.39 0.0 0.18 0.15 0.16 0.15 0.09 0.33 0.28 0.48
582.63 634.09 594.33 591.5 587.04 673.13 607.81 618.47 567.25 555.31 599.07 584.95
18.8 23.69 22.21 19.04 12.51 11.36 15.27 16.3 18.92 18.42 16.61 15.85
0.11 0.73 0.42 0.13 0.34 0.53 0.83 0.36 0.5 0.88 0.32 1.2
8.25 14.98 6.86 7.45 7.34 6.01 6.07 7.23 8.24 11.75 11.77 13.95
4.54 6.44 5.19 3.69 4.42 4.57 4.72 4.19 3.76 5.32 6.74 7.03
0.44 0.73 0.92 0.86 1.16 0.26 0.47 0.99 0.75 0.81 0.89 1.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02
12.13 15.16 16.24 16.04 16.12 13.68 10.18 12.72 14.23 11.97 13.81 16.68
0.44 0.86 0.53 0.31 0.34 0.79 0.26 0.24 0.36 0.71 0.47 0.85
7.78 9.95 8.98 8.24 7.89 7.05 9.06 6.29 10.19 8.59 8.35 9.51
0.0 0.05 0.02 0.04 0.06 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.06 0.0
7.8 11.69 12.16 9.23 9.49 13.45 12.87 9.24 8.82 7.93 5.74 5.11
0.0 0.04 0.0 0.02 0.14 0.15 0.02 0.02 0.06 0.08 0.15 0.22
0.0 0.14 0.13 0.02 0.05 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.11 0.13
0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
7.62 7.21 5.18 3.13 4.19 5.98 5.58 5.17 5.23 5.36 4.03 8.41
0.17 0.22 0.27 0.13 0.05 0.19 0.06 0.15 0.08 0.19 0.19 0.37
44.93 40.16 37.64 38.47 33.91 35.55 42.67 35.07 40.93 40.44 35.91 46.79
25.05 25.4 30.48 17.14 11.92 13.33 18.04 18.25 21.8 20.19 24.13 25.82
0.14 0.27 0.29 0.57 0.24 0.2 0.21 0.15 0.45 0.56 0.83 0.94
0.03 0.09 0.16 0.24 0.23 0.27 0.49 0.12 0.22 0.17 0.34 0.2
3.31 2.59 3.47 2.71 2.11 1.37 2.49 2.03 2.38 3.94 3.49 4.26
3.05 3.27 4.34 2.4 1.31 2.92 3.28 0.72 1.84 2.19 3.1 5.35
0.04 0.07 0.11 0.0 0.11 0.19 0.0 0.12 0.05 0.09 0.06 0.19
0.07 0.79 0.16 0.15 0.2 0.06 0.05 0.21 0.21 0.32 0.49 0.5
0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06
17.06 29.88 36.86 35.7 33.89 30.68 30.15 30.26 31.03 36.62 38.89 36.74
1.11 2.03 1.67 1.51 1.42 1.13 0.84 1.22 1.21 1.24 1.63 1.67
15.42 17.16 14.96 17.56 14.07 16.31 20.41 17.5 20.72 17.87 20.07 23.14
5.26 8.59 14.06 16.12 16.37 18.49 14.94 11.54 10.48 13.78 17.69 17.69
0.0 0.04 0.03 0.04 0.08 0.04 0.0 0.06 0.0 0.17 0.17 0.0
10.39 9.41 9.15 11.37 10.85 13.01 13.41 14.67 12.78 11.06 12.62 10.3
0.24 0.25 0.18 0.25 0.25 0.14 0.07 0.18 0.19 0.13 0.09 0.11

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)