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Heatmap: Cluster_65 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.41 0.3 -0.4 -0.47 -0.15 -0.65 -0.17 -0.38 0.03 0.49 0.39 0.68
-0.19 -0.57 -0.96 -0.33 -0.84 -0.43 -0.19 0.05 -0.36 0.61 0.78 0.94
-1.57 -0.55 -2.29 -0.86 -1.26 -0.87 -0.23 -0.28 0.08 0.64 1.14 1.46
-2.9 -1.05 -2.49 -1.52 -0.49 -0.68 0.95 0.11 0.4 1.01 0.7 0.63
-0.74 -0.51 -1.15 -0.3 0.32 -0.1 -0.86 -1.01 0.28 0.88 0.48 0.81
-0.65 -0.06 -1.45 -2.18 -1.8 -1.97 -1.46 0.09 0.4 0.97 0.92 1.42
-0.41 -0.18 -0.43 -0.43 -0.41 -0.38 -0.2 -0.23 0.29 0.66 0.25 0.72
0.11 0.14 -0.67 -0.61 -0.32 -0.66 -0.48 -0.06 0.07 0.62 0.42 0.58
-1.23 -0.31 -0.89 -0.35 0.02 -0.05 -0.01 0.1 0.42 0.94 0.25 -0.08
-1.28 -0.7 -0.71 -0.17 -0.48 -0.44 -0.14 -0.14 0.38 0.79 0.51 0.81
-1.05 -0.04 -0.1 0.16 0.18 0.12 -0.17 0.02 0.1 0.29 0.05 0.05
-1.85 -0.82 -0.97 -0.66 -0.45 -0.44 -0.34 0.76 -0.01 0.81 0.55 0.89
-1.13 -0.76 -1.54 -0.38 -0.34 -0.2 -0.18 -0.32 0.15 0.9 0.68 0.94
-0.08 -0.31 -0.23 0.02 -0.18 -0.38 -0.22 -0.07 0.16 0.33 0.19 0.48
-0.31 0.02 -0.48 -0.21 -0.34 -0.62 -0.58 -0.19 0.18 0.56 0.53 0.64
-0.18 -0.26 -1.08 -0.23 -0.29 -0.72 -0.64 -0.12 0.0 0.32 0.83 0.96
-4.78 -0.49 -0.68 -0.71 0.05 0.09 -0.24 -0.04 0.53 0.84 0.53 0.51
-1.5 -1.63 - - - - -0.74 0.01 -0.04 1.48 1.62 1.53
-1.52 -1.89 -4.17 -3.09 - -3.92 -1.45 0.14 -0.42 1.75 1.56 1.39
-1.15 -0.97 -3.69 -1.31 -1.61 -1.68 -0.63 -0.66 -0.31 1.27 1.35 1.52
-2.82 -1.12 -2.4 -3.32 -1.28 -1.8 0.02 -3.38 -0.61 1.54 1.22 1.76
-0.6 -1.09 -2.62 -2.25 -2.05 -0.78 -1.1 -0.27 0.68 1.48 1.04 0.94
-1.99 -0.6 -0.64 -0.18 0.34 0.19 -0.0 -0.08 0.18 0.58 0.33 0.41
-2.25 -1.16 -1.6 -0.67 -0.22 0.09 -2.15 -1.44 0.13 0.87 1.2 1.41
-0.3 0.1 -0.53 -0.38 -0.81 -1.39 -0.48 -0.31 0.21 0.69 0.45 1.03
-2.34 -0.58 -0.99 -0.41 -0.51 -0.57 -0.02 0.27 0.91 0.94 0.53 0.1
-0.7 -0.85 -1.29 -0.74 -0.23 0.12 -0.08 -0.1 -0.03 0.55 0.91 0.74
-0.53 -0.47 -1.79 -1.08 -3.35 -5.09 -1.01 -0.02 0.37 1.2 1.23 1.19
-1.52 -3.03 -0.82 -1.14 -2.12 - -2.16 -1.83 0.74 0.83 1.8 1.51
-0.82 -0.29 -0.71 -1.45 -1.21 -1.98 -1.38 -0.57 -0.1 1.05 1.22 1.36
-1.8 -0.61 -1.53 -1.34 -1.37 -2.35 -1.7 -1.36 0.29 1.01 1.21 1.8
-0.15 -0.21 -0.64 -1.33 -1.53 -1.41 -0.63 -0.08 0.38 0.92 0.74 1.01
-0.7 -0.14 -0.63 -0.32 -0.14 -0.36 -0.42 0.18 0.44 0.67 0.35 0.31
-0.35 -0.34 -0.75 -0.13 -0.2 -0.04 -0.22 -0.21 0.18 0.35 0.39 0.7
-0.89 -0.47 -0.6 -0.15 -0.37 -0.82 -0.24 -0.04 0.24 0.71 0.36 0.94
-2.14 -0.29 -0.34 0.03 0.19 0.34 -0.15 -0.04 0.23 0.45 0.31 0.12
-0.72 -0.44 -1.38 -1.9 -1.1 -0.92 -0.29 -0.41 0.23 1.25 0.97 0.95
-0.6 -0.25 -1.34 -0.62 -0.61 -0.53 -0.61 -0.42 -0.21 0.99 0.88 1.0
-0.87 -0.49 -0.51 -0.07 -0.42 -0.69 -0.41 -0.57 0.19 0.66 0.66 0.99
-1.57 -1.34 -2.92 -4.08 -4.35 -4.48 -1.65 -0.23 0.71 1.55 1.37 1.41
-1.02 -0.26 -0.44 -0.83 -0.56 -0.5 -0.49 -0.33 0.08 0.84 0.59 1.09
-0.68 0.14 -0.57 -0.44 -1.47 -1.75 -0.62 -0.79 0.27 0.88 0.71 1.19
-0.48 0.5 -0.28 -1.31 -1.67 -2.68 -2.75 -0.29 -0.04 0.96 0.71 1.4
-0.28 0.09 -0.3 -0.3 -0.27 -0.31 -0.31 -0.01 0.23 0.39 0.29 0.42
0.35 0.15 -0.86 -1.07 -1.12 -1.35 -1.22 -0.42 -0.01 0.76 0.96 0.94
0.41 -0.04 -1.24 -0.93 -1.17 -1.47 -0.38 -0.31 -0.35 0.86 0.67 1.12
-1.51 -0.46 -0.53 -0.23 -0.21 -0.94 -0.83 -0.32 0.21 0.7 0.97 0.91
-0.29 -0.17 -0.36 -0.38 -0.25 -0.35 -0.49 0.05 0.41 0.59 0.36 0.32
-0.74 -0.33 -1.2 -0.36 -0.45 -0.56 -0.09 -0.73 -0.24 0.88 0.73 1.07
- - - - -3.6 -3.78 -0.55 -3.58 1.08 1.53 1.33 1.84
-2.37 -3.28 -1.26 -1.98 -1.95 -3.53 -1.11 -0.7 0.33 1.6 1.48 1.34
-1.02 -0.1 -0.62 -0.14 -0.99 -1.44 -0.94 -0.85 0.35 0.91 0.65 1.23
-0.91 -1.21 -3.13 -3.82 -3.2 -1.22 -0.18 -0.25 0.54 1.44 0.86 1.38
-1.03 -1.0 -0.7 -0.25 -0.82 -0.07 -0.04 0.0 0.04 0.83 0.35 0.98
-0.81 -0.16 -0.4 -0.24 -0.77 -1.2 -0.41 -0.74 0.1 0.77 0.7 1.11
-1.78 -0.02 -1.33 -0.98 -1.15 -2.25 -1.09 -0.81 0.64 1.35 0.84 1.14
-0.46 -0.05 -0.7 -0.27 -0.1 -0.27 -0.3 -0.33 0.18 0.61 0.38 0.62
-1.02 -0.54 -0.52 -0.3 -0.26 -0.07 -0.04 -0.18 0.27 0.54 0.42 0.73
0.15 -0.37 -0.68 -0.53 -0.16 -0.45 -0.4 -0.48 0.14 0.5 0.58 0.75
-0.7 -0.16 -0.6 -0.35 -0.22 -0.69 -0.1 -0.39 0.21 0.66 0.63 0.66
-2.3 -1.16 -1.6 -0.72 -0.46 -0.22 -0.16 0.02 0.36 1.09 0.64 0.96
- -1.74 -0.11 -0.45 - -2.18 -2.23 - -0.03 1.5 0.99 1.93
-0.5 -0.7 -0.93 -0.82 -0.61 -0.72 -0.51 -0.04 0.27 0.89 0.82 0.86
-0.11 -0.01 -0.48 -0.65 -1.29 -2.14 -1.37 -0.48 0.11 0.69 0.8 1.35
-2.6 -1.02 -3.54 -3.36 -2.72 -2.1 -1.97 -2.21 0.28 1.33 1.66 1.77
-1.64 -0.46 -2.88 -3.64 -3.34 -2.33 -2.1 -1.93 0.32 1.4 1.44 1.74
-0.61 -0.52 -1.78 -0.31 -1.06 -1.21 -0.96 -0.58 0.04 1.47 0.55 1.13
0.02 -0.14 -0.84 -0.7 -0.54 -1.08 -1.13 -0.42 -0.05 0.7 0.91 1.05
-1.58 -0.67 -1.02 -0.31 0.22 -0.07 -0.28 -0.52 -0.25 0.79 0.63 0.99
-0.7 -0.52 -1.33 -0.73 -1.2 -1.67 -1.21 -0.36 0.67 1.33 0.83 0.89
-1.62 -1.36 -1.24 -0.76 -0.47 -0.41 0.21 -0.04 0.63 0.97 0.47 0.83
-1.02 -0.44 -0.42 -0.43 -0.23 0.02 0.13 0.17 0.01 0.4 0.26 0.74
-0.78 -0.2 -0.9 -0.2 -0.07 -0.26 -1.1 -0.78 -0.25 0.67 0.79 1.09
-1.03 -1.03 -1.4 -0.73 -0.19 -0.63 -0.51 -0.23 0.3 0.92 0.9 0.98
-0.1 -0.22 -0.4 -0.01 -0.18 -0.25 -0.18 -0.08 0.04 0.3 0.35 0.45
-2.39 -1.75 -1.78 -1.0 -0.97 -1.17 -0.65 -0.5 0.37 1.19 1.24 1.31
-0.71 -0.45 -0.53 -0.48 0.0 0.18 -0.14 0.04 0.24 0.43 0.34 0.46
-0.79 -0.48 -0.77 -0.96 -1.5 -1.93 -0.38 0.03 0.63 1.07 0.72 0.93
-1.03 -0.62 -1.15 -0.43 -0.4 -0.3 -0.06 -0.17 0.43 0.87 0.4 0.8
-2.76 -0.98 -1.48 -0.35 -0.17 -0.35 -0.29 -0.42 0.31 1.01 0.59 1.14
-0.85 -0.13 -0.63 -0.19 -0.32 -0.34 -0.43 -0.27 0.03 0.64 0.65 0.76
-0.89 -1.2 -1.38 -0.73 -0.59 -0.45 0.14 -0.16 0.11 0.72 0.69 1.2
-2.2 -2.33 -2.36 -0.76 -0.21 -0.43 -0.23 -0.44 0.25 1.09 0.89 1.28
-1.99 -0.11 -0.74 -0.75 -0.3 -0.78 -0.28 -0.1 0.66 0.8 0.52 0.79
-0.96 -0.32 -1.51 -0.6 -0.36 -0.96 -0.65 -0.1 0.35 0.96 0.79 0.9
-0.67 -0.37 -1.15 -0.39 -0.0 -0.47 -0.32 -0.28 0.25 0.76 0.48 0.82
-0.24 -0.44 -1.36 -0.84 -0.79 -1.02 -0.58 -0.08 0.32 0.98 0.75 0.91
- -1.07 -0.63 -0.14 -0.02 0.12 -0.22 0.01 -0.05 0.89 0.73 0.64
-1.55 -1.28 -2.07 -0.12 -0.25 -0.44 0.27 -0.08 0.1 0.86 0.7 0.89
-1.0 -0.07 -0.93 -0.52 -0.66 -0.82 -0.63 -0.04 0.49 0.96 0.51 0.8
-0.54 -0.33 -0.42 -0.08 -0.15 -0.17 -0.38 -0.24 -0.15 0.34 0.59 0.8
-1.29 -0.49 -0.9 -0.35 -0.14 -0.48 0.15 -0.14 0.32 0.46 0.4 0.98
-4.04 -0.24 -0.93 -0.76 -0.57 -1.25 -0.55 -0.09 0.58 1.15 0.83 0.82
-0.82 0.11 -0.59 -0.03 -0.27 -1.58 -1.38 -0.6 -0.05 0.74 0.93 0.98
-0.76 -0.97 -1.74 -0.64 -0.18 -0.17 -0.34 0.09 0.33 0.72 0.69 0.87
-0.44 -0.31 -1.61 -0.52 -0.0 -0.44 -0.59 -0.3 -0.0 0.7 0.7 0.97
-1.41 -0.23 -1.26 -0.06 -0.16 0.03 -0.07 -0.2 0.4 0.67 0.39 0.52
-3.91 -1.23 -4.48 -1.43 -1.21 -2.89 -1.4 -2.75 -0.84 1.7 1.64 1.62
-0.74 -0.09 -0.26 -0.66 -1.05 -1.53 -0.45 0.04 0.32 0.75 0.57 0.99
-0.82 -0.06 -0.54 -0.56 -0.39 -0.57 -0.41 0.04 0.58 0.83 0.32 0.44
-0.49 0.01 -0.31 -0.24 -0.52 -0.81 -0.48 -0.08 0.21 0.57 0.51 0.71
-1.5 -1.32 -1.41 -1.65 -0.64 -0.43 0.26 0.08 0.4 1.05 0.72 0.91
-0.63 -0.17 -0.57 -0.75 -1.41 -2.45 -0.63 -0.04 0.27 0.84 0.83 1.16
-0.05 -0.17 -0.75 -0.35 -0.44 -0.54 -0.42 -0.22 0.2 0.48 0.63 0.71
-0.19 -0.16 -0.32 -0.67 -0.73 -0.4 -0.16 -0.27 0.01 0.48 0.63 0.81
-0.61 -0.14 -0.5 -0.18 0.08 -0.07 -0.28 -0.14 0.01 0.43 0.39 0.53
-1.06 -0.62 -0.46 -0.2 -0.23 -0.18 -0.08 -0.19 0.33 0.69 0.48 0.54
-1.27 -1.31 -1.99 -2.83 -1.99 -1.83 -0.66 -0.27 0.38 1.41 1.23 1.32
- -1.71 - -2.43 -5.13 - -2.27 -0.41 0.68 1.87 1.36 1.43
-0.81 -0.31 -0.59 -0.33 -0.31 -0.32 -0.27 -0.01 0.46 0.66 0.43 0.52
-0.13 -0.16 -0.74 -0.64 -0.62 -0.43 -0.76 -0.1 0.22 0.61 0.8 0.68
-0.46 -0.25 -0.79 -0.29 -0.01 -0.4 -0.45 -0.14 0.11 0.53 0.59 0.68
-3.06 -1.54 -1.43 0.06 0.07 -0.67 0.4 -0.21 0.18 0.94 0.5 0.86
-1.41 -1.0 -0.45 -0.04 -0.48 -1.23 -1.16 -0.66 0.15 0.82 0.85 1.33
-1.24 -0.3 -1.0 -0.69 0.07 0.02 -0.15 0.02 0.11 0.63 0.42 0.76
-1.25 -0.45 -0.63 -1.37 -0.96 -1.16 -0.33 0.04 0.46 1.13 0.71 0.87
-2.89 -0.87 -0.74 -0.25 -0.95 -1.33 -0.2 -0.43 0.21 0.89 0.95 1.27
-4.82 -1.61 -1.19 -0.92 0.41 0.37 -0.26 0.07 0.32 0.97 0.71 0.4
-0.01 -0.0 -0.44 -0.22 0.05 -0.19 -0.5 -0.25 -0.08 0.34 0.36 0.53
-0.71 -0.45 -0.81 -0.18 -0.01 -0.13 -0.09 -0.09 0.01 0.45 0.59 0.62
-1.97 -1.04 -1.58 -0.66 -0.25 -0.2 -1.13 -0.76 0.13 1.19 1.01 1.1
-1.23 -0.35 -0.89 -0.11 -0.46 -2.26 -1.19 -0.65 -0.03 1.07 0.65 1.41
-0.17 -0.36 -0.59 -0.15 -0.17 -0.3 -0.22 -0.43 0.09 0.42 0.41 0.79
-3.23 -3.81 -1.75 -1.52 -1.58 -3.67 -1.08 -0.5 -0.07 1.59 1.61 1.35
-0.56 -0.2 -0.48 -0.08 -0.28 -0.38 -0.08 -0.31 0.13 0.48 0.42 0.7
-0.4 -0.02 -0.31 -0.27 -0.5 -0.62 -0.26 -0.44 0.24 0.51 0.51 0.73
-2.16 -0.76 -2.19 -1.16 -1.39 -2.24 -0.86 -0.05 0.45 1.55 1.19 0.89
-3.16 -0.8 -0.26 -0.19 0.26 0.13 -0.04 -0.1 0.34 0.62 0.39 0.37
- -4.49 - - - -2.8 -0.78 -0.29 -0.44 1.58 1.99 1.45
-0.49 -0.14 -0.72 -0.47 -0.21 -0.76 -0.6 -0.23 0.32 0.65 0.47 0.91
-0.62 -0.04 -0.21 -0.29 -0.16 -0.37 -0.48 0.11 0.28 0.6 0.36 0.29
-1.64 -1.05 -1.23 -1.13 -0.45 -1.24 -0.98 -0.24 -0.0 1.14 1.27 1.13
-2.71 -0.89 -2.53 -1.09 -0.41 -1.49 -0.07 -0.65 0.55 1.29 0.59 1.35
-1.12 -0.77 -2.13 -1.39 -0.53 -0.53 -0.14 -0.8 -0.25 1.17 0.87 1.36
0.02 0.05 -0.19 -0.18 -0.09 -0.18 -0.43 -0.22 -0.03 0.25 0.32 0.43
- -1.07 -3.15 -5.25 -2.12 - -0.67 -1.02 -0.54 1.67 1.27 1.91
-1.22 -0.36 -0.71 -0.31 -0.75 -1.17 -0.45 -0.09 0.49 1.12 0.39 0.83
-0.6 -0.17 -0.87 -0.76 -0.75 -0.72 -0.38 -0.2 0.03 0.92 0.95 0.71
0.39 0.19 -0.59 -0.5 -1.08 -1.41 -0.29 -0.33 -0.23 0.5 0.63 0.93
-1.01 -0.39 -0.65 -0.13 -0.13 -0.32 -0.31 -0.1 0.17 0.69 0.54 0.62
-0.23 -0.35 -0.48 -0.4 -0.22 -0.16 0.13 -0.19 0.25 0.67 0.24 0.26
-1.01 -1.23 -0.78 -0.81 -0.66 -0.12 0.02 0.05 0.56 0.71 0.56 0.79
-0.72 -0.26 -0.49 -0.4 -0.03 -0.13 -0.28 0.07 0.58 0.78 0.15 0.0
-0.88 -0.52 -0.68 -0.59 -0.35 -0.18 -0.13 0.2 0.27 0.7 0.52 0.57
-0.59 -0.49 -0.82 -0.93 -0.29 -0.5 0.25 -0.56 0.13 0.57 0.64 0.99
-1.15 -0.6 -0.9 -0.43 0.15 -0.02 -0.3 -0.2 0.08 0.79 0.71 0.5
-0.34 0.08 -0.4 -0.61 -1.05 -1.04 -0.46 -0.58 0.27 0.59 0.62 1.09
-0.17 0.0 -0.15 -0.14 -0.08 -0.2 -0.29 -0.27 -0.04 0.3 0.3 0.48
-0.43 -0.32 -0.79 -0.27 0.07 -0.41 -0.23 -0.56 0.15 0.58 0.49 0.77
-3.2 -2.34 -1.78 -0.68 -0.76 -0.44 0.66 -0.01 0.63 1.01 0.74 0.72
-0.4 -0.99 -2.25 -1.32 -1.52 -2.04 -1.02 -0.37 0.16 1.34 1.2 1.23
-0.53 -0.61 -1.58 -1.31 -0.04 -0.86 -0.84 -0.38 0.45 1.01 0.72 1.03
-0.75 -0.35 -0.46 -0.26 -0.11 0.12 0.17 -0.02 0.52 0.38 0.15 0.13
-1.38 -0.67 -1.61 -0.77 -0.57 -1.15 -0.74 -0.46 0.12 1.1 1.03 1.24
-0.94 -0.17 -1.04 0.15 0.13 -0.47 -0.27 -0.32 -0.16 0.79 0.18 0.84
-0.13 0.09 -0.64 -0.98 -1.74 -1.38 -0.51 0.03 0.39 0.94 0.65 0.74
-1.18 -0.33 -0.33 -0.88 -0.76 -0.83 -1.05 -0.53 0.46 0.91 0.61 1.21

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.