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Heatmap: Cluster_175 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.09 -0.3 -0.64 -0.27 -0.21 -0.66 -0.28 -0.11 0.16 0.62 0.55 0.5
-0.15 -0.34 -0.69 -0.28 -0.2 -0.76 -0.49 -0.19 0.35 0.79 0.43 0.56
-0.25 -0.18 -1.17 -0.36 -0.08 -0.67 0.02 0.19 0.15 0.57 0.38 0.51
-3.43 -1.61 -1.67 -0.39 0.21 -0.27 -0.03 -0.46 0.21 0.92 0.63 1.15
-0.84 -0.54 -0.46 -0.24 0.05 -0.22 -0.16 -0.26 0.39 0.69 0.28 0.51
-1.24 -1.32 -1.24 -1.03 -0.01 -0.21 -0.03 -0.04 0.15 0.9 0.7 0.89
-0.93 -0.62 -0.51 -0.57 -0.06 -0.04 -0.2 -0.15 0.12 0.58 0.64 0.68
-0.55 -0.19 -0.47 -0.36 -0.09 -0.24 -0.24 -0.12 0.12 0.57 0.46 0.52
-0.67 -0.35 -0.59 -0.45 0.04 -0.11 0.04 -0.13 0.02 0.59 0.47 0.48
-0.52 -0.42 -0.87 -0.57 0.05 -0.18 -0.14 -0.15 0.3 0.74 0.41 0.47
0.35 -0.13 -1.22 -0.52 -0.13 -0.61 -0.29 -0.39 0.13 0.75 0.37 0.55
-0.29 -0.17 -0.83 -0.58 -0.37 -0.81 -0.39 -0.07 0.21 0.79 0.56 0.7
-0.5 0.02 -0.66 -0.25 -0.04 -0.51 -0.33 -0.07 -0.01 0.51 0.56 0.58
-0.58 -0.39 -0.92 -0.21 -0.26 -0.59 -0.15 0.03 0.6 0.64 0.29 0.53
-1.14 -0.6 -0.59 -0.09 -0.09 -0.05 0.02 0.01 0.28 0.64 0.27 0.47
-0.86 -0.75 -1.33 0.05 -0.29 -0.24 0.25 -0.11 0.34 0.9 0.27 0.4
-0.98 -0.84 -1.19 -0.58 -0.09 0.04 -0.19 0.06 0.2 0.73 0.59 0.7
-0.58 -0.2 -1.34 -0.5 -0.18 0.08 0.13 -0.28 0.13 0.7 0.34 0.6
-0.63 -0.32 -0.84 -0.37 -0.15 -0.25 -0.03 0.11 0.41 0.66 0.41 0.22
-2.64 -2.67 -2.61 -0.3 0.26 -0.15 0.41 0.21 0.51 1.03 0.6 0.19
-0.62 -0.33 -0.95 -0.89 -0.48 -1.14 -0.07 0.08 0.61 1.07 0.04 0.73
-0.93 -0.1 -0.89 -0.41 -0.3 -0.47 -0.01 0.03 0.27 0.79 0.31 0.61
-0.59 -0.9 -0.91 -0.41 -0.01 0.07 -0.07 0.06 0.09 0.49 0.63 0.55
-0.25 -0.23 -0.62 -0.27 -0.26 -0.63 -0.31 0.15 0.24 0.56 0.48 0.47
-2.18 -0.8 -1.04 -0.02 0.18 -0.16 -0.05 -0.0 0.3 0.75 0.35 0.64
-1.61 -1.04 -0.88 -0.45 0.15 -0.14 -0.31 -0.07 0.22 0.81 0.67 0.69
-0.44 -0.07 -1.3 -0.6 -0.3 -0.79 -0.08 -0.04 0.28 0.9 0.57 0.45
-0.48 -0.77 -1.31 -0.7 -0.07 -0.09 -0.15 -0.05 0.21 0.63 0.56 0.8
-0.58 -0.16 -1.63 -0.75 -0.66 -0.18 -0.15 -0.19 0.37 1.09 0.56 0.41
-0.98 -0.73 -1.04 -0.46 -0.07 -0.08 0.07 0.01 0.28 0.76 0.57 0.39
-0.65 -0.39 -1.67 -0.66 -0.21 -1.03 -0.14 -0.08 -0.03 0.96 0.61 0.99
-0.76 -0.21 -0.58 -0.2 0.06 -0.27 -0.29 -0.19 0.19 0.62 0.42 0.5
-0.31 -0.32 -0.88 -0.11 -0.25 -0.44 -0.21 0.12 0.37 0.64 0.32 0.37
-1.27 -0.69 -0.87 -0.46 -0.15 -0.19 -0.16 0.05 0.5 0.85 0.42 0.52
-2.15 -1.1 -0.82 -0.06 -0.03 -0.05 -0.14 -0.03 0.33 0.84 0.57 0.49
-0.64 -0.13 -0.38 -0.5 -0.15 -0.4 -0.36 -0.32 0.3 0.68 0.4 0.67
-0.77 -0.42 -0.95 -0.22 -0.08 -0.39 -0.22 -0.02 0.03 0.72 0.53 0.69
-2.9 -1.11 -0.81 -0.12 0.06 -0.13 -0.19 -0.08 0.29 0.84 0.54 0.74
-1.17 -0.18 -0.81 -0.17 -0.11 -0.24 -0.13 -0.31 0.32 0.78 0.45 0.47
-0.42 -0.29 -0.84 -0.32 -0.12 -0.44 -0.03 0.25 0.11 0.53 0.43 0.45
-0.56 -0.07 -0.68 -0.4 0.1 -0.28 -0.15 -0.01 0.28 0.63 0.18 0.37
-0.85 -1.02 -2.34 -0.53 -0.78 -1.41 -0.05 0.17 0.78 1.15 0.63 0.62
0.17 -0.15 -0.69 -0.81 -0.7 -0.53 -0.46 -0.06 0.25 0.59 0.59 0.67
-0.24 0.03 -0.86 -0.52 -0.17 -0.45 -0.21 -0.03 0.17 0.61 0.36 0.57
-0.16 -0.44 -0.97 -0.37 -0.12 -0.18 -0.23 -0.2 0.25 0.88 0.23 0.43
-1.12 -0.45 -0.89 -0.49 -0.07 -0.18 -0.07 0.12 0.24 0.64 0.6 0.51
-0.47 -0.03 -1.02 0.05 -0.07 -0.58 0.04 -0.28 -0.04 0.6 0.32 0.65
-0.3 -0.29 -0.77 -0.48 -0.31 -0.22 -0.26 -0.23 0.22 0.76 0.49 0.54
-0.65 -0.19 -0.9 -0.19 -0.21 -0.59 -0.07 0.08 0.33 0.69 0.42 0.41
-2.57 -0.69 -0.88 -0.06 0.14 -0.05 -0.3 -0.02 0.25 0.81 0.52 0.54
-0.56 -0.29 -0.53 -0.45 -0.28 -0.53 -0.44 -0.4 0.07 0.7 0.81 0.72
-0.44 -0.24 -1.18 -0.84 -0.15 -0.63 -0.24 -0.19 -0.06 0.56 0.83 0.96
0.2 0.04 -0.9 -0.62 -0.35 -0.58 -0.42 0.04 0.12 0.68 0.46 0.41
-0.84 -0.22 -0.99 -0.13 0.09 -0.42 0.27 0.24 0.2 0.71 0.11 0.13
-0.65 -0.75 -1.28 -0.21 -0.03 -0.95 -0.28 0.24 0.39 0.57 0.71 0.64
-0.11 -0.77 -1.39 -0.62 -0.32 -0.18 -0.48 -0.43 -0.08 0.82 0.86 0.83
-0.38 -0.33 -0.59 -0.45 -0.09 -0.34 -0.45 0.01 0.14 0.52 0.56 0.64
-1.24 -0.44 -1.62 -0.72 -0.5 -0.51 -0.12 0.08 0.43 0.98 0.64 0.71
-0.6 -0.07 -0.25 -0.44 -0.15 -0.23 -0.22 -0.02 0.27 0.55 0.29 0.4
-0.11 -0.32 -1.14 -0.76 -0.88 -0.91 -0.1 0.02 -0.14 0.87 0.7 0.88
-0.38 0.04 -0.5 -0.16 -0.2 -0.54 -0.44 -0.49 0.24 0.65 0.61 0.39
-0.98 -0.61 -0.97 -0.61 -0.03 -0.3 -0.09 -0.21 0.35 0.77 0.61 0.65
-1.11 -0.25 -0.71 -0.35 -0.15 -0.36 -0.07 0.07 0.03 0.61 0.55 0.68
-0.57 0.14 -0.5 0.08 0.22 -0.54 -0.44 -0.35 -0.04 0.51 0.26 0.58
-0.49 -0.28 -1.09 -0.3 -0.11 -0.58 -0.25 -0.04 0.25 0.74 0.39 0.7
-0.55 -0.12 -0.89 -0.57 0.09 -0.41 -0.19 -0.31 0.35 0.81 0.35 0.47
-0.24 -0.16 -0.68 -0.27 -0.03 -0.48 -0.3 -0.12 0.15 0.59 0.39 0.55
-0.3 -0.34 -1.2 -0.29 0.14 -0.37 -0.04 0.05 0.05 0.61 0.45 0.4
-1.5 -0.77 -0.91 -0.26 -0.02 0.0 -0.03 -0.37 0.26 0.7 0.54 0.73
-1.16 -0.8 -0.97 -0.28 -0.29 -0.42 -0.09 0.14 0.49 0.91 0.44 0.47
-1.39 -0.66 -0.65 -0.13 0.03 -0.17 -0.01 0.13 0.31 0.65 0.34 0.45
-1.35 -0.33 -0.94 -0.13 0.1 -0.44 -0.09 -0.11 0.23 0.73 0.43 0.61
-0.29 -0.32 -0.85 -0.23 -0.36 -0.69 -0.08 -0.01 0.2 0.62 0.4 0.71
-0.54 -0.3 -0.67 -0.4 -0.22 -0.47 -0.19 -0.19 0.23 0.7 0.52 0.63
-0.68 -0.66 -0.89 -0.2 0.0 -0.27 -0.07 -0.18 0.28 0.78 0.37 0.52
-0.21 -0.15 -0.92 -0.51 0.0 -0.31 -0.21 -0.12 -0.0 0.52 0.5 0.65
-0.5 0.0 -0.74 -0.05 0.03 -0.26 -0.38 0.12 0.12 0.45 0.34 0.38
-0.97 -0.65 -0.89 -0.39 -0.13 -0.12 -0.1 -0.04 0.26 0.72 0.57 0.56
-1.55 -0.73 -1.48 -0.58 -0.07 -0.24 0.1 0.16 0.04 0.86 0.74 0.61
-1.66 -0.76 -0.74 -0.36 0.09 -0.02 -0.2 -0.01 0.3 0.71 0.54 0.57
-1.02 -0.54 -0.62 -0.45 0.15 0.03 -0.17 -0.06 0.04 0.58 0.6 0.52
-1.42 -0.82 -0.62 -0.23 0.2 -0.01 -0.13 -0.11 0.22 0.61 0.52 0.53

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.