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Heatmap: Cluster_143 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-3.51 -0.54 -0.22 -0.19 0.51 0.2 -0.1 0.12 -0.16 0.33 0.62 0.28
-1.16 -0.65 -0.82 -0.07 0.51 0.56 0.36 0.05 0.2 0.31 -0.19 -0.12
-1.06 -0.29 -0.22 -0.12 0.2 0.19 0.07 0.05 -0.04 0.24 0.33 0.19
-2.72 -0.6 -0.28 0.22 0.56 0.12 0.03 -0.02 0.3 0.44 0.14 -0.09
-3.26 -1.15 -0.65 0.13 0.64 0.82 0.39 0.19 -0.23 0.11 0.08 -0.07
-1.22 -0.5 -0.29 0.17 0.3 0.14 -0.19 0.14 0.11 0.35 0.22 0.13
- -3.08 -2.57 -1.64 0.65 1.06 0.42 -0.12 0.28 0.81 0.33 0.33
-2.25 -0.39 -0.39 0.1 0.56 0.53 0.27 0.16 -0.09 0.13 -0.01 -0.11
-0.82 -0.28 -0.28 -0.18 0.31 0.52 0.02 0.11 -0.19 0.17 0.1 0.09
-1.91 -0.8 -0.5 -0.06 0.48 0.63 0.37 0.1 0.06 0.19 -0.0 -0.0
-2.04 -0.79 -0.58 -0.27 0.44 0.24 -0.07 0.13 -0.01 0.52 0.6 0.2
-1.66 -0.68 -0.47 0.07 0.45 0.78 0.31 0.16 0.15 -0.07 -0.11 -0.22
-2.12 -0.76 -0.8 -0.55 0.46 0.1 -0.08 0.21 0.3 0.63 0.44 0.3
-1.26 -1.73 -1.87 -0.92 0.66 0.87 0.66 0.22 0.33 0.43 -0.3 -0.13
-3.1 -0.76 -0.7 0.1 0.51 0.27 -0.01 0.04 0.14 0.58 0.25 0.23
-0.46 -0.36 -0.1 -0.15 0.02 0.3 0.06 0.29 0.02 0.07 0.12 -0.01
-2.26 -0.71 -0.62 0.26 0.8 0.43 0.21 -0.04 0.18 0.27 -0.13 -0.21
-0.23 -0.16 -0.22 -0.08 0.27 0.21 -0.08 -0.06 0.05 0.16 0.02 0.01
-2.04 -0.77 -0.53 0.09 0.65 0.25 -0.03 -0.01 0.08 0.48 0.21 0.11
-1.94 -0.91 -0.8 -0.41 0.27 0.31 0.03 -0.08 0.38 0.58 0.51 0.32
- -2.95 -3.65 -1.25 0.56 0.8 0.63 0.23 0.51 0.96 0.11 -0.04
-2.6 -1.94 -1.07 -0.1 0.44 1.24 0.5 0.4 -0.19 0.27 -0.52 -0.09
-0.66 -0.3 -0.34 -0.1 0.3 0.28 -0.01 0.01 -0.03 0.23 0.25 0.06
-1.83 -0.56 -0.07 -0.08 0.46 0.58 0.2 0.14 -0.45 0.07 0.23 0.1
-0.94 -0.51 -0.32 -0.63 0.31 0.54 0.2 0.54 -0.1 -0.01 -0.17 0.29
-2.27 -1.03 -0.61 0.15 0.68 0.78 0.31 -0.08 -0.06 0.11 -0.01 0.01
-0.99 -0.35 -0.6 -0.22 0.32 0.1 -0.17 0.09 0.11 0.46 0.37 0.21
-2.94 -0.64 -0.25 0.38 0.46 0.14 0.11 -0.28 0.36 0.59 -0.07 -0.07
-2.03 -0.58 -0.69 0.03 0.55 0.31 0.3 -0.1 0.03 0.45 0.02 0.23
-1.41 -1.88 -0.14 -0.86 -0.11 0.81 0.29 0.42 0.01 0.06 0.72 -0.08
-4.81 -5.28 - -2.35 0.36 1.01 0.35 -0.12 0.2 1.02 0.93 0.24
-4.42 -0.7 -1.04 -0.03 0.31 0.31 0.32 -0.03 0.24 0.78 0.19 0.17
-4.16 -0.63 -1.03 0.02 0.58 0.29 0.24 -0.13 0.01 0.62 0.08 0.46
-4.67 -3.18 -2.12 0.19 1.22 0.86 0.23 -0.07 0.34 0.42 -0.37 -0.27
-4.6 -2.75 -1.34 0.1 1.01 1.01 0.39 0.06 0.1 0.21 0.11 -0.63
-1.99 -0.93 -0.48 -0.18 0.7 0.78 0.22 0.3 0.18 0.15 -0.04 -0.59
-2.05 -0.86 -0.87 0.04 0.85 0.46 0.31 -0.04 0.06 0.16 0.2 -0.1
-1.42 -0.48 -0.39 0.01 0.38 0.47 0.37 0.11 0.03 0.31 -0.15 -0.11
-0.44 -0.28 -0.28 -0.26 0.3 0.46 -0.02 0.21 0.15 0.1 0.01 -0.24
-1.52 -0.23 -0.2 0.1 0.5 0.06 0.14 -0.07 0.14 0.32 -0.03 0.01
-2.3 -0.34 -0.42 0.13 0.37 0.06 -0.02 -0.07 0.19 0.43 0.14 0.37
-0.99 -0.4 -0.39 -0.1 0.21 0.1 -0.04 0.03 0.17 0.43 0.28 0.19
-2.86 -0.96 -0.67 -0.5 0.43 0.21 0.04 0.01 0.35 0.73 0.51 0.15
-1.19 -0.51 -0.66 -0.67 0.06 0.6 0.42 0.4 -0.11 0.42 0.05 0.13
-2.35 -0.49 -0.17 0.08 0.76 0.53 0.02 -0.01 -0.24 0.12 0.16 -0.08
-1.93 -0.62 -0.74 -0.15 0.53 0.22 0.02 0.07 0.12 0.59 0.26 0.17
-2.49 -1.46 -1.02 -0.09 0.7 0.85 0.45 0.29 -0.0 0.08 0.17 -0.28
-2.47 -0.71 -0.42 0.27 0.73 0.44 0.16 0.0 -0.01 0.3 -0.04 -0.11
-5.39 -3.33 -2.71 -0.61 0.7 0.99 0.77 0.22 0.25 0.79 -0.18 -0.34
-1.04 -0.22 -0.18 0.04 0.47 0.4 0.19 0.04 -0.21 -0.06 0.03 0.02
-3.67 -2.39 -1.0 0.22 0.97 0.82 0.24 -0.09 0.1 0.41 -0.14 -0.12
-1.7 -0.43 -0.45 -0.13 0.36 0.38 0.2 -0.0 0.04 0.37 0.02 0.3
-3.76 -0.64 -0.43 0.2 0.68 0.33 0.33 0.07 0.24 0.35 -0.17 -0.16
-2.21 -1.09 -0.61 0.12 0.59 0.42 0.19 -0.11 -0.09 0.49 0.24 0.2
-2.69 -0.44 -0.33 0.25 0.28 0.19 0.28 0.06 0.16 0.5 0.01 -0.04
-2.6 -0.75 -0.38 0.13 0.71 0.76 0.24 0.27 -0.3 -0.05 -0.11 -0.07
-4.27 -1.3 -0.62 -0.04 0.66 0.48 -0.21 -0.15 0.04 0.48 0.51 0.42
-2.51 -0.5 -0.35 0.29 0.6 0.01 -0.06 0.01 0.13 0.39 0.1 0.18
-6.01 -3.64 -2.18 0.22 1.32 0.8 0.21 0.29 0.21 0.28 -0.22 -0.53
-1.2 -1.04 -0.77 -0.07 0.62 0.46 0.03 0.1 0.17 0.37 0.19 -0.03
-1.01 -0.31 -0.37 0.15 0.33 0.0 0.11 -0.03 0.09 0.35 0.1 0.13
-1.53 -0.4 -0.1 -0.07 -0.11 0.48 0.09 0.24 0.06 0.45 0.19 -0.15
-0.72 -0.49 -0.23 0.01 0.55 0.34 0.33 0.14 -0.11 0.15 -0.19 -0.28
-0.49 -0.28 -0.46 -0.39 0.21 0.43 0.26 -0.08 0.09 0.21 0.06 0.08
-1.72 -0.57 -0.66 0.32 0.41 0.03 -0.13 -0.08 0.19 0.49 0.2 0.3
-1.04 -0.57 -0.95 -0.22 0.64 0.59 0.13 -0.04 -0.05 0.2 0.28 0.02
-2.57 -0.6 -0.56 0.12 0.63 0.22 -0.14 -0.13 0.4 0.54 -0.19 0.27
-2.82 -0.51 -0.65 0.35 0.5 0.2 0.21 0.06 0.37 0.21 -0.18 0.2
-3.39 -2.69 -0.96 -0.37 0.7 0.94 0.45 0.39 0.15 0.43 0.17 -0.6
-4.37 -0.89 -0.39 0.37 0.77 0.24 0.11 -0.1 0.19 0.42 0.03 -0.05
-3.1 -0.74 -0.47 0.16 0.33 0.29 0.09 -0.05 0.09 0.52 0.47 0.1
-1.71 -0.24 -0.02 -0.56 0.48 0.63 0.32 0.45 -0.06 -0.11 -0.11 -0.3
-0.82 -0.62 -0.78 -0.5 0.48 0.84 0.41 -0.05 -0.16 -0.05 0.01 0.19
-0.99 -0.56 -0.3 -0.21 0.27 0.27 -0.05 0.07 0.03 0.45 0.25 0.17
-1.73 -1.08 -0.84 0.0 0.4 0.51 0.2 -0.08 -0.03 0.36 0.11 0.57
-0.67 -0.5 -0.47 0.01 0.36 0.1 -0.04 0.17 0.09 0.3 -0.03 0.26
-2.33 -0.68 -0.42 -0.06 0.58 0.39 -0.02 0.05 0.03 0.38 0.34 0.07
-2.4 -1.03 -0.69 -0.54 0.62 0.75 0.78 0.17 0.12 0.36 -0.1 -0.62
- - -3.64 -0.15 1.1 1.2 0.74 -0.3 -0.48 0.07 0.32 0.11
-3.87 -0.6 -0.45 0.16 0.58 0.32 0.28 -0.22 0.21 0.36 0.1 0.12
-1.65 -0.23 -0.25 0.22 0.44 0.08 -0.17 -0.09 0.1 0.44 0.08 0.14
-3.97 -2.49 -2.64 -0.52 0.72 1.31 0.77 -0.32 -0.31 0.44 -0.01 0.16
-4.29 -2.8 -1.31 -0.04 0.9 1.12 0.7 -0.57 0.23 0.28 -0.31 -0.15
-0.19 -0.12 -0.24 -0.66 0.01 0.33 0.2 0.25 0.1 0.17 0.01 -0.11
-2.61 -1.11 -1.05 0.25 0.81 0.88 0.57 0.04 0.06 0.2 -0.6 -0.43

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.