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Heatmap: Cluster_72 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.41 0.21 0.03 0.39 0.11 -0.11 0.04 0.05 -0.01 -0.34 -0.62 -0.55
-0.3 0.11 0.08 0.48 0.5 0.28 -0.21 0.04 -0.15 -0.28 -0.44 -0.56
-0.2 0.0 0.24 0.04 -0.15 -0.1 0.04 0.28 0.17 -0.02 -0.05 -0.39
0.87 1.54 0.88 1.51 0.19 -1.95 -1.9 -1.46 -1.75 -2.74 -4.34 -4.2
0.42 0.76 0.05 1.08 0.61 -1.2 -1.08 -0.32 -0.23 -0.81 -0.85 -0.73
-1.85 0.46 1.03 1.11 0.82 -0.79 -0.5 -1.27 -0.33 -0.55 -0.81 -0.64
0.26 0.11 0.24 0.29 -0.03 -0.24 -0.09 -0.16 -0.03 -0.34 -0.14 -0.04
0.17 0.1 0.16 0.19 0.03 -0.09 -0.11 -0.06 0.08 -0.13 -0.27 -0.17
0.29 0.26 0.26 0.24 0.01 -0.17 0.02 -0.13 -0.0 -0.33 -0.39 -0.26
0.16 0.29 0.07 0.5 0.34 -0.18 -0.28 -0.18 0.04 -0.19 -0.63 -0.32
0.25 0.03 0.01 0.07 -0.07 0.04 0.16 0.26 0.11 -0.15 -0.3 -0.61
-0.11 -0.02 0.25 0.21 0.24 0.4 0.13 0.26 -0.04 -0.37 -0.5 -0.98
0.21 0.27 0.16 0.03 -0.07 0.01 0.29 0.06 -0.03 -0.18 -0.52 -0.5
0.59 0.12 0.08 0.47 -0.01 -0.15 -0.05 -0.32 -0.17 -0.24 -0.32 -0.38
-0.28 0.56 0.76 0.27 0.41 0.55 0.22 0.11 -0.62 -1.22 -1.44 -1.72
0.12 0.35 0.17 0.38 0.09 -0.03 0.18 0.14 0.15 -0.36 -0.86 -1.03
0.84 0.58 0.49 0.57 -0.18 -0.32 -0.04 -0.2 -0.55 -1.14 -0.73 -0.82
0.28 0.68 0.88 0.96 0.09 0.09 -0.87 -1.11 -0.68 -1.17 -1.2 -0.4
0.46 0.21 0.05 0.56 0.09 -0.39 -0.03 0.2 0.0 -0.53 -0.67 -0.57
0.44 0.2 0.11 0.74 0.32 -0.52 -0.3 0.31 -0.18 -0.6 -0.72 -0.72
0.42 0.2 0.13 0.01 -0.2 0.05 0.14 0.22 -0.14 -0.3 -0.25 -0.57
0.41 0.31 -0.34 0.85 0.53 -0.23 -0.22 -0.21 -0.17 -0.68 -0.65 -0.58
0.5 0.33 0.29 0.18 0.02 0.01 0.03 0.05 -0.06 -0.65 -0.52 -0.76
-0.07 -0.07 -0.06 0.2 0.01 0.11 0.15 0.14 0.06 -0.11 -0.06 -0.4
0.02 0.47 0.56 0.57 0.3 0.01 -0.2 -0.09 -0.38 -0.77 -0.65 -0.73
0.59 0.4 0.34 0.42 0.11 0.02 -0.08 -0.18 -0.32 -0.75 -0.67 -0.67
-0.28 -0.15 0.01 0.07 -0.3 -0.01 0.23 0.13 -0.02 -0.04 0.18 0.08
-0.12 -0.01 0.15 0.33 0.21 0.2 0.03 0.1 -0.07 -0.29 -0.25 -0.49
-0.47 -0.01 0.16 0.34 0.21 0.58 0.57 0.26 -0.03 -0.63 -1.05 -1.13
0.27 0.46 0.07 1.1 0.48 -0.83 -0.5 0.1 -0.06 -0.86 -1.09 -0.98
0.5 0.75 0.72 0.86 0.3 -0.52 -0.66 -0.22 -0.47 -0.89 -1.32 -1.44
0.49 0.53 0.41 0.62 -0.37 -0.79 -0.51 -0.23 -0.19 -0.23 -0.43 -0.14
1.25 0.95 0.6 0.92 -0.62 -1.04 -0.58 -0.72 -0.17 -1.55 -1.83 -1.41
-0.39 0.53 0.52 0.58 0.15 -0.0 -0.36 -0.33 -0.26 -0.52 -0.21 -0.36
0.53 0.36 0.27 0.2 -0.12 -0.0 -0.02 0.05 -0.24 -0.55 -0.45 -0.49
-0.22 -0.01 -0.03 0.04 0.01 0.11 -0.06 0.21 0.07 -0.02 0.02 -0.16
0.71 0.07 0.4 0.57 -0.16 0.01 0.25 -0.06 -0.45 -0.89 -0.65 -0.83
0.37 0.39 0.21 0.46 0.03 -0.03 -0.12 0.12 -0.28 -0.5 -0.59 -0.59
0.27 -0.13 0.01 0.41 0.01 0.01 0.07 -0.02 -0.28 -0.0 -0.27 -0.23
0.2 0.23 0.09 0.11 -0.25 -0.36 -0.01 0.19 0.16 0.0 -0.19 -0.34
0.46 0.39 0.15 0.04 -0.02 0.28 -0.05 -0.23 -0.21 -0.38 -0.41 -0.37
0.17 0.39 -0.02 0.78 0.5 -0.14 -0.61 -0.16 -0.21 -0.46 -0.58 -0.46
0.72 0.24 0.14 0.19 -0.18 -0.39 0.18 -0.03 -0.02 -0.57 -0.43 -0.39
0.84 0.52 0.4 0.34 -0.16 0.06 0.06 -0.08 -0.48 -1.12 -1.01 -0.76
-0.31 0.11 0.22 0.3 0.07 0.22 0.18 0.1 0.17 -0.31 -0.44 -0.66
0.36 0.22 0.06 0.08 -0.31 -0.02 0.21 0.35 0.2 -0.27 -0.46 -0.94
0.24 -0.13 0.08 0.14 -0.13 0.04 0.19 0.04 -0.13 -0.29 -0.05 -0.11
0.24 0.16 0.2 0.48 0.07 0.03 -0.05 0.1 -0.03 -0.43 -0.43 -0.74
0.99 0.95 0.86 1.05 -0.23 -0.29 -0.38 -0.59 -1.19 -2.06 -2.69 -1.99
0.07 0.1 0.34 0.26 0.08 0.22 0.21 0.08 -0.16 -0.66 -0.44 -0.49
0.39 0.64 -0.28 1.08 0.08 -0.94 -0.6 0.02 -0.15 -0.53 -0.63 -0.51
-0.2 0.2 0.18 0.56 0.08 -0.06 0.16 0.42 0.4 -0.27 -1.23 -1.63
-0.08 -0.01 0.01 0.35 0.24 0.41 0.52 0.37 -0.08 -0.73 -1.01 -1.05
0.1 0.11 0.1 0.21 0.02 -0.05 0.0 0.15 -0.06 -0.18 -0.18 -0.32
-0.08 -0.05 0.25 -0.08 -0.17 0.13 0.07 0.24 -0.01 -0.05 -0.05 -0.31
0.57 0.46 0.33 0.25 -0.12 -0.17 -0.03 -0.01 -0.32 -0.64 -0.48 -0.42
0.58 0.29 0.43 0.61 -0.15 -0.04 -0.04 -0.13 -0.33 -0.66 -0.53 -0.9
-0.13 0.02 0.07 0.38 0.12 0.18 0.25 0.3 -0.0 -0.25 -0.56 -0.81
0.53 0.54 0.32 0.71 0.12 -0.65 -0.22 -0.03 -0.09 -0.69 -1.0 -0.76
0.7 0.55 0.16 0.47 0.0 -0.48 -0.23 0.08 -0.09 -0.6 -0.79 -0.74
-0.14 0.03 0.11 0.03 0.06 0.27 0.11 0.11 -0.03 -0.19 -0.1 -0.4
0.14 -0.11 -0.23 0.2 0.04 0.24 0.19 0.16 0.07 -0.27 -0.19 -0.43
0.64 0.32 0.24 0.1 -0.24 -0.18 -0.15 0.11 -0.04 -0.33 -0.36 -0.58
0.42 0.33 0.08 0.29 0.04 -0.23 -0.17 0.06 -0.16 -0.37 -0.31 -0.25
-0.27 -0.02 0.26 0.1 0.02 0.19 0.1 0.29 -0.08 -0.22 -0.04 -0.51
-0.22 -0.11 0.02 0.12 0.11 0.2 0.07 0.17 -0.15 -0.14 -0.0 -0.13
0.16 0.09 0.1 0.23 0.08 -0.01 0.05 0.18 -0.06 -0.29 -0.25 -0.42
-0.18 -0.02 0.07 -0.02 -0.09 -0.06 0.12 0.13 0.06 -0.08 0.17 -0.15
0.49 0.53 0.66 0.67 0.38 -0.05 -0.3 -0.35 -0.73 -1.08 -1.02 -0.86
0.28 0.34 0.73 0.6 -0.16 -0.35 -0.06 -0.12 -0.37 -0.68 -0.33 -0.73
0.59 0.56 0.59 0.52 0.01 -0.34 -0.32 -0.27 -0.44 -0.85 -0.62 -0.49
-0.33 0.01 0.28 -0.03 -0.03 0.42 0.28 0.23 -0.01 -0.21 -0.34 -0.63
-0.12 0.19 0.15 0.23 0.16 0.21 0.05 0.05 -0.19 -0.37 -0.14 -0.42
-0.35 0.01 0.15 -0.64 -0.72 -0.28 0.12 0.59 0.78 0.38 -0.42 -0.56
0.03 0.23 0.23 0.19 0.15 0.11 0.19 0.08 -0.13 -0.42 -0.36 -0.59
0.33 0.19 0.01 0.41 0.16 -0.25 -0.14 0.03 -0.1 -0.18 -0.31 -0.41
0.09 0.22 0.34 0.33 0.06 -0.05 -0.15 0.04 0.03 -0.22 -0.41 -0.56
0.36 0.34 0.41 0.22 -0.15 -0.2 -0.06 -0.09 -0.18 -0.39 -0.29 -0.3
-0.25 0.02 0.23 0.46 0.38 0.25 -0.01 0.21 -0.3 -0.56 -0.27 -0.64
-0.23 0.26 0.53 0.45 0.24 0.31 0.14 -0.28 -0.43 -0.61 -0.42 -0.62
0.66 0.83 0.16 0.45 0.11 -0.97 -0.69 0.17 -0.39 -0.61 -0.5 -0.53
0.74 0.71 0.33 0.52 0.01 -0.81 -0.68 0.07 -0.28 -0.63 -0.73 -0.54
-0.29 -0.01 0.29 -0.19 -0.32 -0.01 0.28 0.26 0.16 -0.12 -0.04 -0.18
0.69 0.55 -0.06 0.95 0.38 -0.62 -0.35 -0.4 -0.16 -0.9 -1.13 -0.63
0.37 0.83 0.66 0.65 -0.7 -0.06 0.43 -0.29 -1.19 -1.92 -0.4 -0.79
-0.09 0.0 0.2 0.22 0.1 0.2 -0.1 0.06 -0.16 -0.28 0.06 -0.34
0.44 0.36 0.25 0.01 -0.04 0.04 -0.09 -0.01 -0.23 -0.36 -0.39 -0.27
-0.01 0.15 0.32 0.42 0.16 0.15 -0.03 0.09 -0.19 -0.55 -0.27 -0.61
0.09 0.0 0.1 0.31 0.06 -0.14 -0.09 0.05 -0.04 -0.14 -0.06 -0.21
0.27 0.26 0.42 0.42 0.13 -0.12 -0.03 -0.32 -0.25 -0.45 -0.49 -0.27
-0.3 0.07 0.13 0.07 0.07 0.41 0.11 0.2 -0.06 -0.24 -0.24 -0.46
1.03 0.73 0.47 0.64 -0.15 -0.94 -0.41 0.2 0.04 -1.08 -1.8 -2.04
-0.01 0.13 0.28 -0.03 -0.01 0.43 0.17 0.17 -0.0 -0.37 -0.37 -0.77
-0.12 -0.06 0.15 0.49 0.06 0.31 0.3 0.18 0.12 -0.56 -0.51 -1.03
0.13 0.23 0.41 0.21 0.03 -0.08 0.04 0.01 0.08 -0.26 -0.51 -0.58
-0.61 -0.01 0.1 0.51 0.28 0.45 0.41 0.3 -0.09 -0.5 -0.81 -1.03
0.14 0.27 0.31 0.37 0.02 -0.07 -0.11 -0.11 -0.02 -0.28 -0.39 -0.38
0.6 0.37 0.31 0.13 -0.24 0.08 -0.14 0.17 0.02 -0.47 -0.7 -0.8
- - 3.13 1.71 - - - - - - - -
1.3 1.81 1.01 0.99 -1.02 -4.36 -4.3 -3.61 -1.7 -2.74 -1.57 -0.77
0.33 0.25 0.29 0.53 -0.44 -0.47 -0.11 0.26 -0.05 -0.5 -0.3 -0.29
-0.49 -0.4 0.2 0.47 0.17 0.52 0.5 0.18 0.07 -0.48 -0.51 -1.26
0.41 0.33 0.29 0.21 0.17 -0.05 -0.05 -0.04 -0.14 -0.38 -0.62 -0.58
0.38 0.08 -0.06 0.3 0.2 0.12 -0.02 0.09 -0.19 -0.35 -0.34 -0.5
0.63 0.68 0.83 0.52 -0.15 -0.23 -0.38 -0.22 -0.59 -0.85 -1.06 -0.85
0.19 0.48 0.42 -0.01 -0.18 0.09 0.05 -0.18 -0.16 -0.31 -0.45 -0.28
0.37 0.34 0.16 0.71 -0.22 -0.27 -0.52 -0.06 -0.24 -0.51 -0.02 -0.3
0.13 0.3 0.33 0.05 -0.27 -0.06 -0.02 -0.13 -0.01 -0.13 -0.32 -0.03
0.43 0.26 0.25 0.17 0.05 0.05 0.01 0.13 -0.08 -0.4 -0.67 -0.67
0.53 0.08 0.27 0.25 -0.35 -0.03 -0.17 0.05 -0.45 -0.13 0.05 -0.43
0.26 0.15 0.18 0.26 0.01 -0.12 -0.03 0.21 0.01 -0.21 -0.36 -0.62
-2.5 -1.03 2.29 1.32 0.82 -4.37 -1.55 -1.72 -0.68 -2.14 -1.32 -2.05
0.87 0.38 0.29 0.23 -0.26 -0.3 -0.02 -0.33 -0.26 -0.64 -0.41 -0.3
0.4 0.18 0.09 0.36 0.2 0.18 0.06 -0.1 -0.34 -0.56 -0.38 -0.51
0.37 0.44 0.24 0.41 -0.13 -0.2 -0.03 0.26 -0.31 -0.64 -0.41 -0.55
0.25 0.1 -0.02 0.26 -0.03 -0.01 0.17 -0.18 0.04 -0.2 -0.26 -0.25
-0.07 0.08 0.12 0.3 0.12 -0.12 -0.18 -0.13 -0.18 0.06 0.05 -0.15
0.45 0.24 0.61 0.67 0.47 0.25 -0.42 -0.29 -0.49 -0.88 -1.09 -1.1
-0.07 0.11 0.18 0.11 0.16 0.22 0.1 0.07 -0.11 -0.27 -0.23 -0.44
0.38 0.38 0.6 0.53 -0.18 -0.23 -0.13 -0.06 -0.15 -0.6 -0.51 -0.81
0.28 0.59 0.4 0.14 0.07 -0.11 0.27 0.16 0.15 -0.61 -1.33 -1.35
-0.03 -0.11 0.14 0.29 -0.07 -0.16 0.01 0.18 0.12 -0.09 -0.05 -0.32
0.46 0.45 0.53 0.46 -0.23 -0.2 -0.13 -0.57 -0.39 -0.45 -0.37 -0.22
0.72 0.56 0.77 0.56 0.17 -0.37 -0.01 -0.18 -0.47 -0.98 -1.67 -1.4
-0.36 -0.29 -0.02 0.28 0.16 0.28 0.19 0.01 0.11 -0.12 -0.18 -0.25
0.16 0.24 0.34 0.24 0.08 -0.09 -0.11 -0.03 0.1 -0.23 -0.46 -0.49
0.69 0.66 0.37 0.69 0.11 -0.15 -0.33 -0.19 -0.35 -1.15 -1.21 -0.77
1.15 0.45 0.51 0.6 -0.37 -0.3 -0.49 -0.29 -0.36 -1.15 -1.15 -0.56
0.02 -0.13 -0.2 -0.0 -0.12 0.04 0.13 0.17 -0.06 -0.04 -0.01 0.15
0.15 0.01 0.13 0.18 0.13 0.05 0.11 -0.01 0.02 -0.18 -0.34 -0.38
0.46 0.31 0.25 0.15 -0.23 -0.04 0.12 0.16 -0.14 -0.47 -0.38 -0.62
0.83 0.57 0.2 0.6 -0.05 -0.63 -0.4 -0.07 -0.19 -0.68 -0.94 -0.47
0.21 0.06 0.18 0.39 -0.14 -0.06 0.11 0.07 -0.04 -0.32 -0.27 -0.42
0.62 0.45 0.17 0.53 0.03 -0.14 -0.09 0.0 -0.4 -0.54 -0.8 -0.65
0.46 0.1 0.02 0.08 -0.17 0.03 0.17 0.12 0.05 -0.37 -0.42 -0.32
0.74 0.41 0.21 -0.02 -0.27 -0.12 0.03 0.03 -0.16 -0.47 -0.47 -0.45
0.29 0.54 0.43 0.32 -0.15 -0.31 -0.09 0.21 -0.12 -0.47 -0.7 -0.59
-0.05 0.22 0.39 0.48 0.26 0.33 0.09 -0.01 -0.26 -0.69 -0.61 -0.92
0.65 0.76 0.21 0.83 0.24 -0.79 -0.88 -0.31 -0.26 -0.88 -0.71 -0.51
-0.01 0.38 0.12 0.58 0.72 -0.0 -0.27 -0.36 -0.29 -0.44 -0.69 -0.55
1.15 0.7 0.6 0.64 0.06 -0.48 -0.41 -0.53 -0.93 -1.1 -1.26 -1.06
0.47 0.83 0.86 0.97 0.16 -0.08 -0.03 -0.84 -1.05 -1.53 -1.76 -1.51
0.71 0.22 0.07 0.01 -0.16 0.02 0.12 0.01 0.01 -0.39 -0.49 -0.61
0.53 0.57 0.5 0.53 0.01 0.12 0.27 -0.21 -0.43 -1.11 -1.26 -1.22
0.55 0.45 0.37 0.33 0.05 -0.3 -0.11 -0.15 -0.15 -0.46 -0.73 -0.49
0.4 0.39 0.45 -0.01 -0.07 0.07 0.09 -0.09 -0.09 -0.36 -0.65 -0.63
0.64 0.91 0.47 1.67 0.22 -1.25 -1.21 -0.54 -0.34 -3.37 -2.9 -1.84
0.27 0.69 -0.39 1.01 0.45 -0.9 -0.74 -0.24 -0.12 -0.42 -0.71 -0.36
0.11 -0.04 -0.16 0.35 0.23 0.28 0.03 0.18 -0.13 -0.39 -0.22 -0.51
-0.38 -0.1 0.07 -0.23 -0.2 0.05 0.27 0.27 0.32 0.24 -0.15 -0.41
0.77 0.69 0.08 1.06 0.16 -0.6 -1.2 -0.25 -0.24 -1.03 -0.7 -0.93
0.44 0.0 0.41 0.25 -0.12 -0.15 0.1 0.02 -0.05 -0.53 -0.38 -0.35
0.96 0.48 0.24 1.16 0.14 -1.52 -0.54 0.18 -0.41 -1.53 -1.43 -0.99
-0.01 0.23 0.39 0.56 0.17 -0.46 -1.14 -0.18 -0.07 -0.11 0.01 -0.02
-0.44 0.35 0.47 0.56 0.02 -0.18 -0.61 -0.18 -0.03 -0.23 -0.16 -0.04
-0.13 0.48 0.76 0.68 0.3 -0.26 -0.55 -0.09 -0.45 -0.61 -0.62 -0.59
-0.07 0.21 0.43 0.21 0.1 0.37 0.29 0.15 -0.19 -0.54 -0.7 -0.99
-0.15 -0.06 -0.06 -0.02 -0.15 -0.02 0.11 0.19 0.15 0.09 0.1 -0.25
-0.14 0.07 0.16 0.11 -0.09 0.05 -0.07 0.04 -0.05 -0.1 0.08 -0.1
0.37 0.2 0.23 0.37 -0.1 -0.05 -0.15 -0.31 -0.15 -0.22 -0.45 0.0
0.16 0.27 0.09 -0.13 -0.35 -0.29 0.23 0.52 0.45 0.04 -0.64 -1.14
0.7 0.17 0.2 0.17 -0.18 0.08 0.19 0.13 -0.3 -0.58 -0.63 -0.57
0.47 0.35 0.26 0.2 -0.14 -0.21 -0.12 0.01 -0.1 -0.32 -0.35 -0.36
0.13 0.61 0.41 -0.06 -0.09 0.23 0.01 -0.39 -0.27 -0.31 -0.34 -0.36
0.95 0.27 0.45 0.47 -0.06 -0.08 0.13 -0.03 -0.23 -1.22 -1.37 -1.04
0.31 0.35 0.25 0.62 -0.0 -0.38 -0.49 0.01 -0.42 -0.6 0.01 -0.21
-0.5 -0.16 0.03 0.54 0.1 0.19 0.39 0.01 0.07 -0.18 -0.28 -0.64

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.