Heatmap: Cluster_123 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.16 -0.06 -0.3 -0.06 0.51 0.57 0.16 0.02 0.01 -0.16 -0.49 -0.48
-0.34 -0.13 -0.78 -0.05 0.49 0.15 -0.24 -0.09 0.22 0.43 -0.28 0.15
-1.39 0.06 -0.13 0.56 0.62 0.24 0.31 -0.13 -0.18 -0.1 -0.67 -0.21
-0.43 0.13 -0.37 0.11 0.34 -0.03 -0.19 -0.01 0.05 0.25 -0.07 0.02
-0.34 0.62 -0.34 0.48 0.67 0.33 0.03 -0.13 -0.15 -0.45 -0.92 -0.87
-0.78 -0.08 -0.29 -0.2 0.12 0.55 0.21 -0.02 0.18 0.36 -0.3 -0.19
-0.74 0.21 -0.06 0.05 0.17 0.21 -0.01 0.0 0.19 0.27 -0.41 -0.19
-0.87 0.14 -0.22 -0.27 0.31 0.31 0.01 -0.25 0.23 0.31 -0.15 0.02
-0.24 -0.02 -0.31 -0.05 0.09 0.05 0.07 0.44 0.4 0.16 -0.47 -0.46
-0.53 -0.1 -0.69 -0.59 0.44 0.48 0.57 0.26 -0.13 0.06 -0.32 -0.15
-0.18 0.55 -0.31 0.46 0.86 0.12 -0.24 -0.18 -0.52 -0.46 -0.56 -0.44
0.03 0.37 -0.1 0.5 0.69 0.14 -0.1 -0.16 -0.57 -0.4 -0.68 -0.44
-0.22 0.32 0.19 0.14 0.27 0.21 -0.13 0.02 -0.18 -0.12 -0.31 -0.4
-1.76 -0.23 -1.21 -0.4 0.53 0.42 0.76 0.1 0.46 0.16 -0.43 -0.19
-0.52 -0.0 -0.11 0.06 0.31 0.1 -0.05 0.05 0.11 0.2 -0.21 -0.13
-2.01 -0.29 -0.12 0.19 0.89 0.56 0.65 -0.4 -0.55 -0.07 -0.52 -0.17
-0.14 0.23 -0.3 0.24 0.61 0.18 0.06 0.1 -0.27 -0.26 -0.48 -0.39
0.02 0.17 -0.37 0.09 0.66 0.49 -0.27 -0.15 -0.23 -0.27 -0.34 -0.28
-0.48 0.03 -0.75 0.19 0.58 0.11 -0.3 -0.09 0.2 0.36 -0.25 -0.1
-0.47 -0.08 -0.49 -0.12 0.27 0.15 0.02 0.05 0.14 0.22 0.04 0.05
0.3 0.4 -0.23 -0.32 0.2 0.01 -0.07 0.22 -0.11 -0.04 -0.17 -0.43
-0.46 -0.23 -0.5 -0.18 0.61 0.65 0.12 0.18 -0.41 -0.21 -0.09 -0.07
-0.37 0.12 -0.17 0.36 0.48 0.36 0.26 0.2 -0.23 -0.1 -0.76 -0.82
-0.16 -0.28 -1.24 0.39 0.83 0.83 -0.19 -0.49 -0.57 -0.11 0.07 -0.41
-0.25 0.18 -0.12 0.16 0.32 -0.25 -0.16 0.01 -0.04 0.02 -0.01 0.04
-0.35 -0.27 -0.53 -0.1 0.76 1.21 -0.08 -0.21 -0.44 -0.35 -0.53 -0.46
-0.31 -0.11 -0.39 0.0 0.27 0.13 -0.09 0.05 -0.01 0.31 -0.1 0.08
0.09 -0.02 -0.33 -0.14 0.48 0.57 -0.18 -0.16 -0.13 -0.03 -0.23 -0.25
-0.45 0.13 -0.12 0.25 0.44 -0.02 -0.16 0.05 -0.01 0.08 -0.17 -0.23
-0.09 0.05 -0.04 0.1 0.33 0.0 -0.21 -0.02 -0.12 0.04 0.03 -0.16
0.25 0.52 -0.26 0.33 0.45 -0.01 -0.23 -0.19 -0.27 -0.39 -0.36 -0.3
-1.52 -0.33 -0.79 0.24 0.54 0.03 -0.02 -0.16 0.54 0.39 -0.06 0.02
-0.31 -0.18 -0.23 0.1 0.15 0.15 0.17 0.11 0.17 0.14 -0.27 -0.14
-0.53 -0.07 -0.41 -0.05 0.5 0.03 -0.15 -0.01 -0.06 0.38 -0.06 0.13
-1.36 0.13 -0.25 0.0 0.53 0.4 -0.01 0.07 -0.07 0.07 -0.19 -0.04
-0.46 -0.2 -0.2 -0.09 -0.02 0.26 0.23 -0.08 0.22 0.23 0.07 -0.16
-0.17 0.01 -0.18 0.13 0.41 0.32 0.17 0.24 0.21 -0.29 -0.63 -0.69
-0.01 0.13 -0.05 -0.0 0.43 0.48 -0.03 0.1 -0.19 -0.29 -0.46 -0.46
-0.06 -0.09 -0.12 -0.16 0.4 0.36 0.07 0.08 -0.25 -0.08 -0.3 -0.04
-0.51 -0.01 -0.67 0.14 0.15 0.04 -0.0 -0.03 0.06 0.3 0.04 0.2
-0.05 0.02 -0.09 0.19 0.32 0.1 -0.18 -0.09 -0.15 -0.15 -0.08 0.08
-1.0 0.11 -0.41 0.38 0.71 0.25 -0.03 -0.08 -0.06 0.28 -0.47 -0.45
0.06 0.31 -0.19 -0.05 0.56 0.22 -0.3 -0.01 -0.22 -0.18 -0.38 -0.11
-0.94 -0.07 -0.51 -0.06 0.47 0.33 0.09 -0.05 0.18 0.3 -0.24 -0.03
-5.0 -1.18 -1.75 0.26 0.7 1.09 0.99 0.01 0.3 -0.09 -1.15 -0.59
0.02 0.1 -0.35 0.29 0.48 0.12 -0.09 -0.12 -0.21 -0.03 -0.29 -0.16
-0.32 0.14 -0.04 0.05 0.33 0.32 0.09 0.04 -0.08 -0.18 -0.22 -0.34
-0.73 0.46 -0.32 0.36 0.63 0.23 -0.03 -0.08 -0.5 -0.01 -0.61 -0.09
-0.97 -0.05 -0.07 0.13 0.38 0.37 -0.16 0.12 -0.12 0.15 -0.09 -0.09
-0.53 0.12 -0.08 0.39 0.42 0.22 0.14 -0.22 -0.03 0.02 -0.49 -0.32
-1.23 -0.15 -0.41 0.13 0.61 0.16 -0.2 -0.3 0.14 0.54 -0.17 0.09
-0.05 0.34 -0.41 0.1 0.39 0.04 -0.12 -0.05 -0.21 0.11 -0.16 -0.19
0.36 0.58 -0.52 0.46 0.82 0.42 -0.11 -0.48 -0.56 -0.63 -0.95 -0.87
-0.04 0.26 -0.17 0.34 0.48 0.11 -0.23 0.08 -0.36 -0.2 -0.57 -0.04
-0.41 0.15 -0.5 0.18 0.68 0.53 0.01 0.09 -0.22 -0.1 -0.51 -0.53
-0.43 0.01 -0.34 -0.03 0.27 0.14 0.2 -0.01 0.04 0.19 -0.22 0.01
-0.74 -0.34 -0.53 -0.16 0.37 0.25 0.23 0.04 0.25 0.3 -0.01 -0.11
-0.88 0.31 0.03 0.26 1.2 0.96 0.43 0.17 -0.64 -1.41 -3.22 -2.65
-0.49 0.09 -0.27 0.13 0.28 -0.06 -0.17 -0.24 0.13 0.35 -0.07 0.09
-0.14 -0.02 -0.18 0.31 0.42 0.21 -0.27 -0.17 -0.21 -0.02 -0.08 -0.03
-0.97 0.06 -0.03 0.3 0.48 0.3 0.16 -0.22 -0.06 -0.05 -0.27 -0.18
0.03 0.19 -0.39 0.02 0.26 0.18 0.03 -0.14 -0.24 0.11 -0.18 -0.03
-1.35 -0.39 -0.35 0.46 0.54 0.58 0.22 0.41 -0.03 -0.32 -0.25 -0.68
-0.03 0.05 -0.16 0.16 0.2 0.05 0.01 -0.02 0.02 0.04 -0.31 -0.1
-0.53 0.12 -0.32 0.24 0.46 0.14 -0.23 0.07 -0.05 -0.05 -0.07 -0.04
-1.68 0.21 -0.01 -0.06 0.59 0.15 -0.28 0.27 -0.17 0.07 0.22 -0.25
-0.29 -0.04 -0.06 0.02 0.38 0.22 0.01 0.2 0.1 0.0 -0.31 -0.45
-1.32 -0.05 -0.35 0.33 0.5 0.24 0.05 -0.16 0.18 0.24 -0.33 -0.06
-0.4 -0.25 -0.21 -0.02 0.24 0.23 0.16 -0.02 0.03 0.2 -0.04 -0.08
0.32 0.22 0.0 -0.03 0.45 0.27 0.04 0.11 -0.22 -0.37 -0.65 -0.6
-1.27 -0.16 -0.38 0.37 0.61 0.56 -0.03 0.1 -0.15 -0.07 -0.18 -0.26
-1.33 -0.75 -0.9 -0.13 0.03 0.79 0.53 -0.08 0.33 0.41 0.05 -0.31
-0.86 -0.16 -0.25 0.11 0.4 -0.04 -0.1 -0.02 -0.02 0.27 -0.04 0.34
-0.19 0.03 -0.02 0.06 0.39 0.27 -0.07 0.22 -0.08 -0.22 -0.14 -0.44
-0.26 0.04 -0.23 0.24 0.39 0.22 -0.0 0.06 -0.05 -0.02 -0.36 -0.25
-0.01 -0.18 -0.96 0.06 0.75 0.68 0.63 0.12 -0.32 -0.58 -1.15 -0.46
-1.84 -0.37 -0.98 0.02 0.39 0.67 0.67 -0.16 0.23 0.44 -0.67 -0.17
-0.18 0.23 -0.5 -0.23 0.88 0.52 -0.13 0.05 -0.45 -0.17 -0.18 -0.63
-0.17 -0.11 -0.14 -0.06 0.31 0.34 -0.04 0.03 0.05 0.08 -0.21 -0.23
-0.45 0.01 -0.2 0.29 0.34 -0.02 -0.21 0.15 -0.07 0.14 0.0 -0.19
-0.34 -0.08 -0.01 -0.08 0.4 -0.0 -0.07 0.14 0.0 0.07 -0.06 -0.09
-2.69 -1.03 -0.23 0.59 1.0 0.8 0.35 0.17 -0.25 -0.64 -0.86 -0.29
-0.27 0.06 -0.07 0.18 0.26 0.08 0.03 0.03 -0.01 0.1 -0.22 -0.28
-0.91 -0.12 -0.21 0.25 0.3 0.27 0.11 0.13 0.12 0.09 -0.13 -0.27
0.33 0.53 -0.04 0.19 0.49 -0.22 0.09 -0.47 -0.58 -0.32 -0.43 -0.12
-0.1 0.16 -0.04 -0.07 0.47 0.24 -0.27 0.06 -0.27 0.02 -0.07 -0.36
-0.14 0.12 -0.2 0.09 0.32 -0.01 -0.1 0.03 -0.09 0.03 -0.17 0.03
-1.51 -0.42 -0.72 -0.14 0.83 0.64 0.59 -0.2 0.14 0.09 -0.34 -0.48
0.1 0.15 -0.34 0.12 0.17 -0.02 -0.17 0.06 0.0 -0.08 -0.09 0.02
0.48 0.11 -0.48 0.65 0.99 0.17 -0.23 -1.13 -1.14 -0.08 -0.88 -0.18
-0.12 0.1 -0.18 -0.02 0.21 0.39 0.08 0.12 -0.05 -0.28 -0.33 -0.07
-1.78 -0.26 -0.19 0.17 0.32 0.41 0.32 -0.09 0.19 0.17 -0.15 -0.1
-0.4 0.14 -0.11 0.36 0.42 0.16 -0.16 -0.17 -0.06 0.11 -0.55 -0.03
-0.21 0.3 -0.19 0.51 0.84 0.57 0.03 0.01 -0.39 -0.71 -1.08 -1.1
-0.2 0.37 -0.12 -0.12 0.37 0.17 -0.3 0.11 -0.19 0.05 -0.02 -0.35
0.1 0.01 -0.78 0.16 0.42 -0.01 0.08 -0.08 -0.15 -0.11 -0.13 0.18
0.06 0.17 -0.1 -0.08 0.16 0.11 -0.07 0.17 -0.04 -0.02 -0.16 -0.27
-0.96 0.09 -0.36 0.11 0.29 0.26 -0.03 0.1 -0.13 0.53 -0.35 -0.07
-0.5 0.56 0.04 -0.07 0.41 0.19 -0.2 -0.17 0.0 -0.0 -0.27 -0.36
-0.85 -0.48 -0.28 -0.07 0.2 0.32 0.32 0.01 0.28 0.13 -0.01 -0.02
-0.42 -0.16 -0.26 -0.26 0.29 0.51 0.11 -0.05 0.18 0.07 -0.13 -0.16
-0.89 -0.03 -0.06 0.13 0.33 0.06 0.26 0.12 -0.09 0.07 -0.21 -0.01
-0.58 -0.04 -0.51 0.09 0.36 0.34 0.31 0.15 -0.02 -0.12 -0.06 -0.28
-0.5 0.02 -0.21 0.18 0.28 0.34 0.24 0.26 -0.08 -0.07 -0.54 -0.25
0.16 0.35 0.05 0.79 1.05 0.8 0.06 -0.47 -1.19 -1.91 -2.16 -1.6
-0.21 0.27 0.02 -0.16 0.33 0.36 0.13 0.05 -0.14 -0.13 -0.25 -0.56
-0.76 0.06 -0.51 -0.36 0.54 0.75 -0.42 -0.25 -0.34 0.19 0.21 0.11
-0.02 0.17 -1.16 -0.04 0.33 -0.05 0.1 0.07 -0.04 0.28 -0.08 -0.01
-0.27 0.12 -0.12 0.16 0.45 0.25 0.1 0.24 0.03 -0.05 -0.65 -0.7
0.18 0.96 0.11 0.47 0.46 0.52 0.21 -0.05 -1.08 -1.32 -1.82 -1.44
-0.16 -0.21 -0.21 -0.01 0.21 0.24 0.04 0.3 0.22 0.02 -0.32 -0.3
-0.16 0.41 -1.15 -0.11 0.64 -0.09 -0.03 0.08 -0.45 -0.06 -0.05 0.27
-0.5 0.52 -0.36 0.55 0.55 0.3 -0.03 -0.16 -0.28 -0.56 -0.67 -0.13
-0.92 0.18 -0.53 0.26 0.38 0.25 -0.05 -0.12 0.15 0.14 -0.04 -0.16
-0.56 0.22 0.07 0.19 0.21 0.41 -0.04 -0.08 -0.26 0.06 -0.3 -0.21
-0.12 -0.01 -0.78 -0.45 0.45 0.75 0.26 -0.05 -0.04 -0.09 -0.23 -0.33
-0.82 0.02 -2.23 0.25 0.3 0.07 -0.1 0.17 0.13 0.75 -0.16 0.02
-0.32 -0.04 -0.45 0.39 0.05 -0.11 -0.01 -0.28 0.21 0.23 -0.19 0.27
-2.0 -0.36 -0.37 0.24 0.6 0.51 0.4 -0.1 0.05 0.34 -0.53 -0.26
-0.18 0.29 -0.51 0.48 1.3 0.27 -0.29 -0.37 -0.56 -0.66 -0.77 -0.66
-0.08 -0.15 -0.21 0.06 0.1 0.19 0.1 0.05 0.11 0.08 -0.23 -0.11
-1.25 -0.3 -0.31 0.3 0.42 0.32 0.05 -0.11 0.25 0.26 -0.17 -0.15
-0.12 0.24 -0.01 -0.04 0.36 0.26 -0.12 0.18 -0.24 -0.28 -0.11 -0.32
-0.06 0.47 -0.19 0.32 0.49 0.25 -0.29 -0.27 -0.42 -0.01 -0.52 -0.22
-0.84 -0.11 -0.51 -0.26 0.51 1.02 0.37 -0.02 0.04 -0.52 -0.73 -0.13
-0.56 -0.27 -0.12 0.2 0.15 -0.05 0.0 0.08 0.24 0.31 -0.06 -0.12
-0.43 -0.04 -0.54 0.15 0.17 -0.17 0.15 -0.06 0.23 0.29 -0.13 0.13
-0.82 0.06 -0.36 0.1 0.6 0.5 0.28 0.14 -0.34 -0.01 -0.55 -0.27
-0.34 0.15 -0.23 0.03 0.56 0.33 0.11 0.33 -0.02 -0.02 -0.62 -0.87
-0.66 -0.1 -0.54 -0.1 0.59 0.53 0.08 0.14 -0.14 0.02 -0.1 -0.24
-1.33 -0.29 -0.37 1.01 1.1 0.26 -0.2 -0.04 -0.36 -0.07 -1.83 -0.31
-0.46 0.02 -0.37 0.21 0.41 0.29 0.07 -0.13 -0.05 0.06 -0.11 -0.17
-0.14 0.13 0.07 0.13 0.4 0.32 0.04 -0.02 -0.16 -0.36 -0.34 -0.29
-0.37 -0.27 -0.53 -0.08 0.24 0.13 -0.01 0.15 0.24 0.36 -0.04 -0.09
0.08 0.11 -0.4 -0.08 0.22 0.43 -0.09 0.15 -0.29 -0.09 -0.07 -0.17
-1.38 -0.25 -0.67 0.07 0.56 0.39 0.25 -0.09 0.01 0.48 -0.29 -0.06
-1.56 0.2 -0.61 0.34 0.79 0.34 -0.31 -0.16 -0.38 0.09 0.03 0.06
-0.3 -0.1 -0.3 -0.01 0.33 0.18 0.13 -0.0 -0.04 0.14 0.02 -0.18
-0.08 0.31 -0.11 0.26 0.45 0.41 -0.17 -0.06 -0.4 -0.24 -0.39 -0.37
-1.88 0.02 -0.27 -0.24 0.96 0.64 -0.11 0.21 -0.12 -0.06 -0.32 -0.39
-0.5 -0.07 -0.33 0.12 0.38 0.16 0.19 0.12 0.14 0.22 -0.34 -0.39
-0.65 -0.4 -0.72 0.38 0.68 0.58 0.21 -0.33 -0.1 0.04 -0.22 -0.28
-2.06 -0.7 -0.44 -0.24 0.56 0.6 0.67 0.04 0.35 0.14 -0.34 -0.35
-1.24 -0.38 -0.31 0.44 0.97 0.95 -0.02 0.21 -0.33 -0.9 -1.06 -0.33
-2.16 -0.09 0.01 0.46 1.18 0.69 0.09 -0.54 -0.59 -0.6 -0.57 -0.28
0.05 0.29 -0.15 0.21 0.54 0.25 0.03 -0.07 -0.41 -0.32 -0.64 -0.19
-0.47 0.14 -0.33 0.34 0.55 0.03 -0.27 0.03 -0.08 0.05 -0.16 -0.14
-0.09 0.21 0.07 0.62 0.8 0.58 0.24 0.18 -0.76 -1.69 -1.32 -1.07
-0.6 -0.08 -0.38 0.01 0.41 0.39 0.16 0.31 -0.27 -0.13 -0.1 -0.08
0.12 0.13 -0.19 0.12 0.44 0.15 -0.3 -0.17 -0.25 -0.05 -0.09 -0.08
-0.06 0.23 -0.34 -0.4 0.34 0.39 -0.59 0.12 -0.26 -0.11 -0.08 0.35
-0.85 -0.03 -0.11 0.07 0.66 0.32 -0.2 0.04 -0.32 0.05 0.01 -0.14
-0.48 -0.07 -0.36 0.14 0.43 0.38 -0.03 0.01 -0.08 0.21 -0.28 -0.18
-0.43 0.27 -0.17 0.35 1.02 0.71 0.12 0.04 -0.56 -0.67 -1.39 -1.24

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.