Heatmap: Cluster_7 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.02 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.1 0.17 0.07
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.24 0.2 0.09
0.24 0.23 0.37 1.47 0.21 0.11 0.04 0.06 0.51 0.0 0.24 0.67
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0
0.11 0.07 0.04 0.09 0.02 0.04 0.0 0.03 0.02 0.08 0.15 0.04
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0
2.03 3.4 1.61 4.3 2.3 1.55 2.3 1.54 2.33 3.14 3.48 4.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.85 0.16 0.15 0.04 0.33 0.26 0.16 0.4 1.23 0.76 0.69
0.07 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.49 0.15 0.91 0.57 0.27 0.92 0.59 0.65 1.02 1.39 0.99
0.0 0.02 0.03 0.21 0.09 0.04 0.15 0.02 0.07 0.15 0.06 0.09
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.05 0.09 0.02 0.14 0.04 0.1 0.09 0.12 0.08 0.15 0.14
0.07 0.06 0.05 0.24 0.02 0.02 0.07 0.0 0.07 0.09 0.06 0.18
0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.03 0.05 0.05 0.0 0.19 0.0 0.0 0.13 0.26 0.24
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.25 1.85 2.14 2.98 2.31 2.8 3.13 2.62 2.88 3.04 2.07 2.06
0.07 0.04 0.12 0.22 0.14 0.08 0.05 0.0 0.02 0.14 0.11 0.06
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 0.43 0.17 1.05 0.4 0.34 0.32 0.22 0.13 0.29 0.52 0.32
0.03 0.19 0.07 0.19 0.19 0.05 0.48 0.19 0.07 0.08 0.43 0.43
0.0 0.0 0.0 0.18 0.02 0.0 0.05 0.0 0.04 0.06 0.0 0.02
0.0 0.02 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.06 5.37 3.57 6.28 5.45 6.34 5.49 4.23 4.89 4.87 4.6 5.0
0.07 0.0 0.02 0.34 0.05 0.0 0.03 0.05 0.16 0.27 0.17 0.14
0.0 0.0 0.0 0.14 0.06 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.02 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.37 0.49
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
0.03 0.04 0.0 0.48 0.02 0.0 0.08 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.05 0.0 0.12 0.08 0.02 0.03 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04
0.0 0.13 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04
0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.02 0.2 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
0.83 1.48 0.72 1.58 0.77 0.86 0.55 0.67 0.46 1.55 1.56 1.36
0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.32 0.5 0.0 1.23 0.09 0.0 0.3 0.09 0.0 0.48 0.69 0.5
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.84 1.01 0.47 2.76 0.59 0.76 0.88 0.35 0.99 0.99 0.35 1.16
0.0 0.02 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.07 0.05 0.0 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.04 0.0 0.0 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.04 0.12 0.07 0.25 0.21 0.16 0.36 0.19 0.02 0.04 0.17 0.04
0.27 0.14 0.04 0.19 0.07 0.1 0.09 0.17 0.02 0.16 0.2 0.19
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.05 0.02 0.1 0.11 0.02
0.0 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.91 0.1 0.0 0.26 0.09 0.43 0.34 0.0 0.17
0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0
0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.04 0.98 0.48 1.12 0.91 0.52 0.64 0.91 0.63 0.69 0.66 1.09
0.0 0.03 0.02 0.11 0.09 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.2 0.71 0.29 3.23 1.63 0.3 0.11 0.29 0.41 0.02 0.07 0.05
0.24 0.1 0.06 0.18 0.02 0.05 0.1 0.03 0.0 0.04 0.11 0.16
0.11 0.37 0.0 0.41 0.07 0.22 0.07 0.0 0.19 0.47 0.44 0.2
0.1 0.29 0.1 0.26 0.06 0.07 0.13 0.09 0.24 0.17 0.17 0.16
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0
6.86 10.77 11.24 17.4 12.85 14.41 13.75 11.45 10.3 12.87 9.63 10.91
0.0 0.04 0.2 0.42 0.29 0.43 0.23 0.12 0.11 0.13 0.08 0.22
0.1 0.08 0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.12 0.07 0.0
0.11 0.21 0.0 0.25 0.0 0.0 0.12 0.09 0.07 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)