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Heatmap: Cluster_52 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.42 -0.18 -0.66 -0.21 -0.0 -0.01 0.17 0.19 0.29 0.36 0.1 0.05
-0.18 -0.01 -0.18 -0.29 0.01 0.2 -0.16 0.31 0.08 0.23 -0.01 -0.12
-0.47 -0.21 -0.39 -0.01 0.19 0.22 0.2 0.23 0.02 0.06 -0.0 -0.03
0.15 0.08 -0.38 -0.22 0.33 0.24 0.04 0.04 -0.03 0.12 -0.14 -0.41
-0.62 -0.13 -0.49 -0.29 -0.19 -0.26 -0.12 -0.21 0.48 0.76 0.23 0.21
-1.08 -0.51 -0.5 -0.28 -0.27 0.39 0.04 0.47 0.08 0.38 0.31 0.2
-0.27 0.06 -0.36 -0.04 0.06 0.04 0.18 0.22 0.24 0.21 -0.23 -0.29
-0.43 0.15 -0.56 -0.18 0.14 -0.22 0.02 0.32 0.14 0.41 0.06 -0.15
-0.05 -0.03 -0.18 -0.13 0.09 -0.1 -0.12 0.11 0.12 0.2 0.06 -0.02
-0.66 -0.23 -0.31 -0.18 0.15 0.21 -0.23 0.36 0.13 0.4 0.13 -0.13
-0.29 -0.2 -0.19 -0.08 0.17 0.04 0.11 0.2 0.21 0.12 -0.09 -0.1
-0.67 -0.44 -0.74 -0.3 0.02 0.02 0.06 0.22 0.32 0.49 0.16 0.29
0.02 0.62 -0.61 -0.39 -0.02 -0.53 -0.4 0.79 0.22 0.36 -0.77 -0.28
-0.13 -0.02 -0.87 -0.12 0.42 -0.11 -0.19 0.13 0.05 0.3 -0.06 0.23
-1.41 -0.26 -0.63 0.44 -0.01 0.13 0.38 -0.22 0.44 0.38 -0.5 0.23
-0.15 0.23 -0.4 -0.14 0.16 0.13 -0.04 -0.09 -0.03 0.25 -0.03 -0.01
-0.23 -0.15 -0.62 -0.15 0.39 0.28 -0.35 0.15 0.28 0.28 0.06 -0.31
-0.25 0.11 -0.39 0.01 0.2 -0.09 -0.14 0.07 -0.0 0.29 0.06 -0.01
-1.68 -0.32 -0.82 -0.33 0.21 -0.85 0.38 -0.19 0.75 0.86 -0.3 0.41
-0.38 -0.15 -0.5 -0.02 0.14 0.16 0.02 0.27 0.11 0.21 -0.01 -0.03
-0.61 0.06 -0.4 -0.3 0.11 0.04 0.16 0.2 0.23 0.16 0.19 -0.12
-0.16 0.09 -0.44 -0.2 0.21 -0.08 -0.11 0.36 0.1 0.2 0.02 -0.18
-0.46 -0.23 -0.43 -0.03 0.05 0.1 0.17 0.22 0.28 0.23 -0.1 -0.02
-0.79 -0.13 -0.36 0.05 0.1 0.07 0.23 0.28 0.45 0.48 -0.39 -0.57
-0.62 -0.09 -0.36 -0.2 0.01 0.03 0.03 0.41 0.2 0.3 0.14 -0.16
-0.31 -0.02 -0.76 -0.36 0.11 -0.2 0.04 0.46 0.21 0.44 0.06 -0.09
-1.03 -0.14 -1.41 -0.23 0.22 -0.15 0.51 -0.21 0.48 0.47 -0.18 0.45
-0.49 0.06 -0.43 0.02 0.31 0.01 -0.07 0.17 0.02 0.14 0.0 0.06
-0.51 -0.23 -0.41 -0.38 0.17 0.18 0.1 0.2 0.13 0.29 0.09 0.09
-0.9 -0.27 -0.72 -0.26 0.15 -0.12 0.01 0.01 0.57 0.56 -0.05 0.29
0.03 0.29 -0.44 -0.17 0.2 -0.08 -0.14 0.33 0.11 0.16 -0.16 -0.35
-0.11 0.17 -0.68 -0.18 0.23 -0.09 0.11 0.11 0.18 0.38 -0.19 -0.22
-1.1 0.23 -0.55 -0.32 0.32 0.22 0.14 0.15 0.36 0.44 -0.27 -0.35
-0.74 -0.24 -0.8 -0.68 -0.13 0.22 0.29 0.33 0.25 0.48 0.07 0.23
-0.28 0.01 -1.31 -1.01 0.04 -0.11 0.21 0.51 0.33 0.55 0.08 -0.08
-1.05 -0.23 -0.77 -0.2 -0.02 0.37 -0.06 0.28 -0.01 0.31 0.42 0.24
-1.24 -0.23 -0.5 0.11 0.17 0.2 0.11 0.23 0.23 0.11 0.15 0.06
-0.16 0.17 -0.89 -0.21 0.21 -0.09 0.16 0.16 0.17 0.47 -0.15 -0.26
-1.96 -0.54 -1.28 -0.26 0.06 -0.18 0.43 0.2 0.67 0.7 -0.12 0.32
-0.12 0.17 -0.33 -0.04 0.14 0.01 0.03 0.02 0.16 0.07 -0.06 -0.11
-0.08 0.14 -0.49 -0.35 0.07 -0.16 0.04 0.15 0.12 0.37 0.09 -0.11
-0.01 0.18 -0.34 -0.32 -0.03 -0.08 -0.03 0.15 0.24 0.35 -0.15 -0.13
0.37 -0.01 -0.76 -1.5 -0.05 0.36 0.17 0.37 0.3 0.4 -0.11 -0.66
-0.27 -0.14 -0.22 -0.05 0.25 0.1 0.09 0.06 0.22 0.24 -0.26 -0.17
- -1.11 -4.73 0.37 -0.12 0.43 0.62 0.45 0.57 1.04 -0.16 -0.74
-1.13 -0.08 -0.66 0.24 0.16 0.21 -0.28 0.27 0.08 0.52 0.18 -0.23
0.14 -0.08 -0.36 -0.54 0.13 0.18 0.07 0.19 0.17 0.18 -0.08 -0.2
-0.5 0.1 -0.26 -0.28 0.02 -0.05 -0.2 0.22 0.1 0.38 0.22 0.01
-0.33 0.06 -0.62 0.09 0.32 0.02 -0.01 0.14 -0.01 0.29 -0.03 -0.18
-0.09 -0.02 -0.45 -0.17 0.33 0.12 -0.06 0.02 0.01 0.25 -0.1 0.02
-0.66 -0.11 -0.23 0.19 0.21 0.11 0.02 0.07 0.12 0.18 -0.06 -0.03
0.08 0.19 -0.52 -0.1 -0.18 -0.27 0.2 0.32 0.26 0.3 -0.31 -0.27
-0.07 -0.16 -0.34 -0.39 -0.2 0.07 0.27 0.33 0.25 0.33 0.01 -0.37
-0.35 0.04 -0.35 -0.28 0.05 -0.09 -0.17 0.34 0.22 0.53 -0.06 -0.19
-0.17 -0.07 -0.26 -0.23 0.16 -0.01 -0.26 0.12 0.06 0.28 0.16 0.08
-0.34 -0.16 -0.22 -0.25 0.05 0.15 0.18 0.06 0.26 0.26 -0.06 -0.09
-0.39 -0.03 -0.67 -0.5 0.07 0.06 0.13 0.15 0.13 0.45 0.12 0.11
-0.33 -0.05 -0.42 -0.02 0.33 0.14 0.13 0.19 0.04 0.23 -0.19 -0.25
-0.31 -0.03 -0.44 -0.07 0.16 0.06 0.13 0.24 0.13 0.23 -0.12 -0.16
-0.56 0.08 -0.46 0.1 -0.15 -0.04 -0.08 0.35 0.39 0.25 0.06 -0.26
-0.33 0.14 -0.28 -0.26 0.19 0.04 -0.09 0.24 0.08 0.32 -0.06 -0.18
-0.76 -0.09 -0.4 -0.2 0.02 0.01 -0.12 -0.23 0.29 0.62 0.1 0.29
-0.65 0.11 -0.23 -0.24 0.18 0.04 -0.17 0.45 -0.03 0.28 0.11 -0.16
-0.45 0.21 -1.22 -0.61 0.05 -0.29 0.07 0.38 0.25 0.6 0.22 -0.08
-0.34 -0.66 -0.78 -0.78 -0.03 -0.05 0.31 0.36 0.36 0.56 0.08 0.17
-0.44 -0.17 -0.65 -0.73 -0.06 0.0 0.15 0.49 0.47 0.38 0.15 -0.22
-0.07 -0.02 -0.89 -0.74 0.06 0.23 0.29 0.26 0.19 0.45 -0.06 -0.27
-1.07 -0.11 -0.25 0.09 0.16 0.25 0.62 0.22 0.15 -0.1 -0.52 -0.08
-0.17 -0.08 -0.37 -0.32 0.17 0.05 0.05 0.12 0.08 0.22 0.0 0.12
-1.15 -0.32 -0.4 0.05 0.07 0.17 0.26 0.13 0.26 0.24 0.21 -0.08
0.27 0.08 -0.45 -0.62 -0.16 0.19 -0.04 0.26 0.37 0.35 -0.1 -0.61
-0.17 0.18 -1.7 -0.13 0.4 -0.24 -0.07 0.03 0.05 0.49 0.09 0.15
-0.82 -0.2 -0.78 -0.06 -0.13 -0.01 -0.03 -0.09 0.44 0.64 -0.02 0.37
0.29 0.35 -0.56 -0.41 0.35 0.09 -0.02 -0.07 -0.07 0.25 -0.28 -0.27
0.09 0.84 -1.15 0.22 -0.28 -0.45 -0.5 0.56 0.15 0.6 -1.42 -0.33
-0.18 -0.12 -0.25 -0.21 0.16 -0.13 -0.16 0.23 0.1 0.22 0.1 0.11
-0.34 -0.04 -0.2 -0.17 -0.02 0.08 -0.07 0.37 0.02 0.14 0.16 -0.08
-0.63 -0.13 -0.96 -0.26 -0.19 -0.25 -0.16 0.16 0.29 0.8 0.37 0.13
-0.49 -0.02 -0.21 0.2 0.06 -0.0 0.07 0.06 0.14 0.28 -0.14 -0.11
0.09 0.11 -0.71 -0.24 0.31 0.38 0.19 0.04 -0.08 0.25 -0.36 -0.39
-0.39 -0.03 -0.3 -0.17 0.12 0.03 0.03 0.19 0.06 0.22 0.09 0.01
0.04 0.26 -0.44 0.12 0.11 -0.14 0.19 0.08 0.2 0.18 -0.36 -0.51
-1.48 -0.47 -0.32 -0.23 0.25 0.36 0.31 0.29 0.2 0.31 -0.08 -0.01
-0.9 -0.35 -0.66 -0.38 0.19 0.19 -0.12 0.32 0.27 0.51 0.18 0.08
-1.76 -0.21 -0.81 -0.1 -0.09 -0.01 0.19 0.15 0.4 0.78 -0.05 0.2
-2.08 -0.33 -0.66 -0.14 0.2 -0.03 -0.09 0.24 0.23 0.78 0.17 0.21
0.01 0.06 -0.44 -0.26 0.15 -0.02 -0.13 0.26 0.17 0.26 0.04 -0.28
-0.3 -0.0 -0.18 -0.01 0.17 -0.09 -0.08 0.11 0.05 0.24 0.08 -0.08
-1.15 -0.31 -0.77 0.1 0.36 0.46 0.31 0.03 -0.06 0.42 -0.23 0.01
-0.53 -0.02 -0.46 -0.25 -0.14 -0.13 0.18 0.32 0.37 0.42 -0.01 -0.1
-0.68 -0.22 -0.52 -0.08 0.15 0.09 0.0 0.15 0.18 0.45 0.02 0.1
-0.87 -0.67 -0.81 -0.22 0.38 -0.12 -0.05 0.48 0.67 0.54 -0.12 -0.23
-0.21 -0.09 -0.5 -0.2 -0.03 -0.12 -0.02 0.15 0.2 0.38 0.14 0.09
-0.8 -0.16 -1.0 -0.19 0.03 0.08 0.04 -0.18 0.51 0.69 -0.07 0.25
-0.42 -0.12 -0.38 -0.02 0.2 0.09 -0.18 0.39 0.32 0.26 -0.09 -0.35
0.03 0.35 -1.05 -0.3 0.32 0.12 -0.14 0.04 -0.13 0.24 -0.0 0.07
-0.5 -0.35 -1.58 -0.11 0.01 -0.07 0.28 0.36 0.31 0.93 -0.18 -0.42
-0.28 -0.14 -0.58 -0.16 0.26 0.12 -0.05 0.22 0.14 0.18 0.03 0.04
-0.17 0.02 -0.25 0.01 0.14 -0.12 -0.0 0.11 0.19 0.25 -0.13 -0.15
-0.21 0.16 -0.9 -0.08 0.24 -0.01 -0.1 0.12 -0.12 0.36 0.17 0.02
-0.24 -0.04 -0.45 0.0 0.21 -0.02 0.34 0.04 0.17 0.19 -0.2 -0.19
-0.96 0.33 -0.52 -0.07 0.02 0.0 -0.05 0.3 0.21 0.17 0.2 -0.1
0.12 -0.27 -1.44 -0.98 0.04 0.23 0.17 0.41 0.43 0.67 -0.05 -0.64
-1.88 -0.62 -0.29 0.01 0.39 0.37 0.34 0.34 -0.13 -0.01 -0.05 0.32
-0.59 -0.15 -0.13 0.08 0.29 0.17 -0.03 0.11 0.18 0.21 -0.11 -0.25
-0.77 -0.59 -0.73 -0.37 0.39 0.36 0.31 0.15 0.24 0.43 -0.15 -0.0
-0.47 -0.17 -0.26 -0.21 0.25 0.14 -0.02 0.28 0.14 0.28 0.04 -0.22
-0.43 0.13 -0.51 0.11 0.06 -0.08 0.13 0.2 0.16 0.24 -0.18 -0.03
-0.26 -0.35 -0.74 -0.41 0.15 0.09 0.13 0.34 0.43 0.46 0.04 -0.43
-0.92 -0.16 -0.53 -0.57 -0.04 -0.01 0.14 0.48 0.51 0.53 0.08 -0.26

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.