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Heatmap: Cluster_55 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.76 -0.17 -0.28 -0.38 -0.52 -0.09 0.23 0.37 0.56 0.34 0.3 -0.23
-0.75 -0.24 0.05 -0.45 -0.29 0.2 0.4 0.49 0.22 0.08 0.06 -0.27
-1.03 -0.82 -0.69 -0.1 -0.52 -0.2 0.16 0.4 0.71 0.52 0.25 0.18
-0.09 -0.26 -0.78 0.12 -0.22 0.03 0.07 0.44 0.54 0.42 -0.2 -0.71
-0.7 -0.26 -0.07 -0.1 -0.13 -0.11 0.01 0.3 0.23 0.24 0.28 0.02
-1.83 -1.26 -0.63 -0.43 -0.18 0.22 0.13 0.65 0.43 0.45 0.52 0.06
-0.23 -0.23 -0.13 -0.39 -0.4 -0.06 0.17 0.39 0.32 0.35 0.09 -0.18
-0.23 0.61 -0.5 0.29 -0.02 -0.25 0.42 -0.28 0.21 0.09 -0.53 -0.35
-1.55 -0.43 -0.27 -0.49 -0.22 0.03 0.24 0.18 0.45 0.52 0.39 0.08
-0.74 -1.86 -3.33 -0.66 -2.04 -2.22 -0.01 0.71 0.93 1.26 0.8 0.34
-1.37 -1.55 -2.32 -0.74 -1.51 -1.9 0.0 0.91 0.93 1.0 0.99 0.13
-0.08 -0.2 -0.26 -0.21 -0.11 -0.09 -0.01 0.36 0.22 0.29 0.05 -0.12
-1.14 -0.78 -0.28 -0.21 -0.46 0.0 0.17 0.4 0.64 0.59 0.22 -0.2
-0.94 -0.83 -0.73 -0.65 -0.24 0.2 0.3 0.56 0.47 0.48 0.42 -0.2
-1.73 -1.11 -1.41 -1.0 -0.28 -0.07 0.42 0.99 0.83 0.98 -0.07 -0.82
-0.9 -0.58 -0.53 0.03 -0.08 0.07 0.1 0.31 0.36 0.29 0.27 0.08
-0.29 -0.23 -0.18 -0.21 -0.05 0.09 0.13 0.37 0.17 0.07 0.14 -0.16
- -0.31 -1.42 - -0.01 -0.99 -0.8 1.29 -0.12 1.29 0.94 0.03
-2.17 -1.93 -1.01 0.15 -0.43 0.06 0.52 0.66 0.6 0.53 0.19 0.04
-0.2 -0.29 -0.6 -0.41 -0.09 0.04 0.15 0.52 0.29 0.22 0.19 -0.21
-1.6 -0.67 -0.93 -0.8 0.03 0.36 0.39 0.64 0.26 0.5 0.3 -0.11
0.31 0.37 -0.07 -0.88 -0.23 -0.37 -0.3 0.23 0.05 0.23 0.42 -0.3
-0.79 -0.69 -0.22 -0.92 -0.51 0.0 0.36 0.95 0.62 0.33 0.08 -0.63
-1.19 -0.57 -0.42 -0.05 -0.1 0.26 -0.03 0.53 0.3 0.33 0.32 -0.16
-1.15 -0.72 -0.18 -0.37 -0.08 0.27 0.38 0.18 0.29 0.45 0.17 -0.03
-0.08 0.03 -0.32 -0.36 -0.18 -0.61 -0.53 0.51 0.47 0.52 0.25 -0.32
-0.25 -0.21 -0.39 -0.49 -0.48 -0.53 -0.04 0.58 0.41 0.48 0.29 -0.0
-0.24 -0.15 -0.1 -0.26 -0.13 -0.06 0.17 0.17 0.16 0.19 0.17 -0.03
-0.02 -0.02 -0.09 -0.34 -0.21 -0.1 0.05 0.27 0.29 0.2 -0.03 -0.13
-0.59 -0.2 -0.67 -0.32 -0.17 -0.21 0.23 0.68 0.48 0.45 -0.08 -0.32
-0.65 -0.23 -0.69 -0.21 -0.19 -0.26 0.14 0.83 0.39 0.37 0.06 -0.34
-0.5 -0.34 -0.06 -0.34 -0.25 0.18 0.26 0.17 0.33 0.18 0.12 -0.03
-0.43 -0.26 -0.26 -0.16 -0.0 -0.16 -0.18 0.25 0.23 0.39 0.34 -0.03
-0.06 0.09 -0.67 -0.39 -0.57 -0.27 -0.01 0.68 0.12 0.43 0.18 -0.14
-0.41 0.0 -0.43 -0.43 0.02 0.28 0.07 0.2 0.2 0.14 0.06 0.05
-1.62 -0.88 -1.09 -0.63 -0.86 -0.23 0.5 0.99 0.85 0.36 0.49 -0.48
-0.45 -0.24 -0.2 -0.19 -0.11 0.04 0.11 0.36 0.19 0.2 0.16 -0.06
-0.46 -0.11 -0.52 -0.59 -0.18 0.0 0.01 0.39 0.27 0.45 0.23 0.04
-0.02 -0.35 -0.03 -0.23 -0.5 -0.57 -0.13 0.53 0.35 0.35 0.25 -0.11
0.24 1.01 -1.25 -2.42 -1.32 -2.36 -2.17 1.4 -2.48 1.16 0.39 0.03
-0.05 0.03 -0.14 -0.07 -0.37 -0.15 0.04 0.27 0.38 0.15 -0.05 -0.22
-0.64 -0.76 -0.49 -0.32 -0.09 0.33 0.36 0.34 0.3 0.31 0.19 -0.16
-0.61 -0.34 -0.21 -0.45 -0.29 0.03 0.02 0.27 0.5 0.51 0.19 -0.11
-0.9 -0.52 -0.35 -0.27 -0.3 -0.02 0.18 0.45 0.43 0.38 0.35 -0.09
-0.68 -0.43 -0.1 -0.09 -0.23 0.14 0.19 0.08 0.29 0.32 0.13 0.07
-0.96 -0.2 -0.03 -0.23 -0.08 -0.09 -0.28 0.16 0.24 0.53 0.33 0.1
-0.23 -0.3 0.01 -0.3 -0.31 -0.48 0.04 0.47 0.36 0.27 0.23 -0.13
-1.47 0.17 -1.93 -2.09 -1.03 0.15 -1.0 0.56 -0.53 1.08 1.24 0.36
-1.08 -0.31 -1.17 -0.12 -0.16 -0.63 -0.27 0.59 0.56 0.8 0.38 -0.05
-1.41 0.0 -0.6 -0.04 0.0 0.63 -0.08 0.18 0.62 0.42 -0.3 -0.59
-0.73 -0.44 -0.06 -0.44 -0.35 -0.01 0.32 0.71 0.47 0.31 -0.12 -0.41
-0.94 -0.15 -0.43 -0.89 -0.09 0.0 0.01 -0.08 0.58 0.42 0.16 0.54
-1.37 -0.33 0.02 -0.23 -0.25 -0.12 0.05 0.4 0.34 0.32 0.41 -0.0
- -2.54 -2.65 - -0.49 -2.22 -0.6 1.14 0.51 0.73 1.72 0.58
-0.47 -0.22 -0.35 -0.29 -0.19 -0.29 -0.06 0.42 0.28 0.32 0.4 0.06
-0.58 -0.5 -0.25 -0.31 -0.3 -0.26 -0.09 0.46 0.54 0.49 0.3 -0.11
-0.64 -0.2 -0.11 -0.07 -0.07 -0.03 0.08 0.25 0.24 0.33 0.18 -0.23
-1.05 0.03 -0.96 -2.14 -0.55 -0.47 -0.25 0.31 1.2 0.6 0.53 0.03
-0.29 -0.21 -0.15 -0.26 -0.14 -0.09 0.27 0.19 0.37 0.23 0.02 -0.13
-0.47 0.24 -0.03 0.07 -0.08 -0.13 0.21 0.26 0.38 0.28 -0.53 -0.62
-0.39 -0.25 -0.4 -0.46 -0.16 0.14 0.18 0.4 0.2 0.25 0.23 -0.07
-4.06 -1.34 -0.73 -0.45 -0.45 0.12 0.53 0.65 0.66 0.53 0.36 0.1
-1.72 -1.03 -0.78 -0.01 -0.47 -0.07 0.29 0.53 0.61 0.47 0.46 0.01
-1.51 -0.37 -0.1 -0.45 -0.35 0.18 0.3 0.42 0.39 0.41 0.23 -0.12
-0.09 -0.75 -0.63 -0.37 -0.23 -0.39 -0.13 0.62 0.25 0.53 0.44 -0.0
-0.27 -0.11 -0.08 -0.25 -0.31 -0.1 0.21 0.42 0.16 0.08 0.1 -0.03
-0.2 -0.12 -0.09 -0.36 -0.3 -0.12 0.08 0.39 0.38 0.25 0.06 -0.22
-0.62 -0.38 -0.31 -0.1 -0.12 0.11 0.14 0.25 0.27 0.24 0.18 0.04
-0.51 -0.2 0.11 -0.43 -0.53 -0.25 0.17 0.4 0.4 0.15 0.2 0.07
-0.92 -0.31 -0.13 -0.25 -0.39 -0.45 0.26 0.28 0.37 0.42 0.3 0.19
-2.01 -0.86 -0.56 0.04 -0.33 -0.12 0.24 0.39 0.67 0.63 0.18 0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.