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Heatmap: Cluster_127 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-1.01 -0.56 -0.35 -0.1 -0.11 0.31 0.46 0.47 0.34 0.19 -0.09 -0.25
-1.65 -1.19 -0.6 -0.37 -0.21 0.19 0.46 0.59 0.46 0.38 0.46 -0.2
-0.95 -0.5 -0.22 -0.2 -0.07 0.28 0.24 0.32 0.29 0.19 0.24 -0.15
-4.75 -1.28 -0.6 0.05 -0.01 0.54 1.06 0.73 0.49 0.18 -0.61 -1.04
-1.18 -0.53 -0.17 -0.35 0.11 0.32 0.34 0.45 0.27 0.13 0.14 -0.28
-0.83 -0.65 -0.04 -0.35 -0.13 0.37 0.39 0.33 0.22 0.01 0.24 -0.13
-0.46 -0.48 -0.62 -0.47 -0.02 0.3 0.25 0.5 0.35 0.22 0.06 -0.2
-1.28 -0.55 -0.11 0.03 0.09 0.33 0.32 0.45 0.07 -0.01 0.11 -0.16
-0.91 -0.87 -0.31 -0.07 -0.05 0.26 0.46 0.59 0.23 -0.0 0.18 -0.29
-0.59 -0.24 -0.04 -0.08 0.14 0.34 0.11 0.26 0.12 0.05 -0.01 -0.31
-1.7 -1.01 -0.85 -0.14 0.0 0.56 0.68 0.94 0.5 0.18 -0.51 -1.03
-1.2 -0.6 -0.44 -0.22 0.03 0.37 0.5 0.62 0.28 0.21 -0.03 -0.53
-1.67 -1.15 -0.55 -0.11 0.19 0.3 0.6 0.29 0.31 0.26 0.15 -0.02
-1.81 -0.89 -0.47 -0.5 -0.21 0.4 0.79 0.63 0.47 0.18 -0.12 -0.24
-2.69 -0.83 -0.33 -0.4 0.07 0.48 0.49 0.69 0.56 0.39 -0.12 -0.85
-0.85 -0.41 -0.08 -0.08 0.22 0.43 0.15 0.23 0.13 0.07 0.06 -0.27
-1.62 -0.74 -0.14 0.18 0.21 0.62 0.47 0.28 0.15 -0.02 -0.15 -0.43
-1.41 -0.83 -0.26 -0.3 0.12 0.49 0.45 0.45 0.29 0.17 0.03 -0.29
-1.38 -0.84 -0.4 -0.05 0.03 0.14 0.45 0.58 0.35 0.3 0.1 -0.35
-0.69 -0.06 0.01 -0.15 0.08 0.3 0.09 0.25 -0.05 -0.1 0.16 -0.05
-0.9 -0.39 -0.12 -0.1 0.18 0.29 0.24 0.35 0.1 0.09 0.12 -0.3
-2.76 -1.59 -0.75 -0.24 0.21 0.49 0.77 0.9 0.43 0.08 -0.29 -0.45
-1.69 -0.78 -0.34 -0.13 0.12 0.58 0.57 0.38 0.3 0.1 0.02 -0.44
-0.81 -0.39 -0.19 -0.11 0.15 0.19 0.22 0.34 0.21 0.09 0.04 -0.1
-2.19 -0.69 -0.1 -0.7 0.09 0.39 0.26 0.58 0.32 0.35 0.33 -0.4
-1.25 -0.52 -0.21 -0.1 0.09 0.38 0.38 0.44 0.24 0.14 -0.03 -0.35
-0.64 -0.55 -0.27 0.08 0.23 0.37 0.22 0.38 0.27 0.06 -0.13 -0.52
-3.09 -2.24 -1.26 -0.67 -0.03 0.62 1.05 1.05 0.65 0.29 -0.39 -1.28
-1.63 -0.77 -0.38 -0.12 -0.27 0.31 0.51 0.56 0.37 0.22 0.25 -0.34
-1.42 -0.44 -0.18 0.05 0.17 0.27 0.08 0.49 -0.04 -0.04 0.31 -0.01
-0.98 -0.75 -0.32 -0.26 -0.16 0.44 0.62 0.43 0.34 0.07 0.02 -0.32
-1.08 -0.88 -0.44 -0.11 -0.01 0.26 0.13 0.7 0.28 0.07 0.44 -0.32
-1.8 -0.77 -0.42 -0.12 0.22 0.72 0.48 0.51 0.27 0.11 -0.2 -0.57
-0.56 -0.35 -0.26 -0.09 0.1 0.26 0.17 0.21 0.1 0.04 0.17 -0.02
-0.97 -0.72 -0.28 -0.3 -0.08 0.61 0.72 0.74 0.33 -0.06 -0.48 -0.93
-2.45 -1.6 -0.62 -0.69 0.08 0.77 0.73 0.92 0.51 0.2 -0.23 -1.06
-0.27 -0.31 -0.3 -0.25 0.08 0.25 0.2 0.34 0.04 0.08 0.1 -0.15
-1.29 -0.64 -0.47 -0.11 0.08 0.33 0.36 0.36 0.31 0.25 0.09 -0.12
-0.36 -0.14 -0.06 -0.23 0.1 0.12 0.01 0.26 0.15 0.08 0.1 -0.16
-1.27 -0.56 -0.4 0.11 0.03 0.21 0.19 0.53 0.23 0.13 0.24 -0.24
-2.62 -1.54 -0.92 -0.37 -0.24 0.86 1.05 0.89 0.55 0.06 -0.5 -1.38
-3.37 -2.24 -1.09 -0.29 0.15 0.92 1.21 1.14 0.43 -0.35 -0.92 -2.18
-1.63 -1.24 -0.69 -0.23 -0.05 0.4 0.72 0.52 0.67 0.24 -0.2 -0.38
-1.22 -0.61 -0.21 -0.18 0.21 0.39 0.26 0.35 0.2 0.14 0.0 -0.03
-0.39 -0.38 -0.18 -0.21 0.09 0.42 0.14 0.38 0.11 0.05 -0.06 -0.25
-2.07 -1.1 -0.58 -0.44 0.08 0.23 0.48 1.0 0.37 0.12 0.19 -0.46
-1.63 -1.3 -0.51 -0.39 -0.18 0.46 0.86 0.83 0.39 0.02 0.03 -0.74
-1.39 -0.43 -0.04 0.04 0.17 0.21 0.03 0.38 0.11 0.09 0.27 -0.12
-2.11 -1.03 -0.69 -0.31 0.18 0.37 0.6 0.53 0.43 0.31 0.08 -0.28
-1.61 -0.94 -0.34 -0.21 0.12 0.52 0.46 0.66 0.22 0.08 0.03 -0.35
-0.4 -0.38 -0.22 -0.28 -0.1 0.07 0.29 0.56 0.47 0.06 -0.07 -0.44
-1.89 -0.87 -0.39 0.02 -0.19 0.35 0.56 0.74 0.41 -0.04 0.09 -0.43
-0.94 -0.54 -0.21 -0.01 -0.12 0.33 0.48 0.39 0.2 0.17 -0.08 -0.28
-1.08 -0.61 -0.21 -0.01 -0.04 0.32 0.38 0.5 0.24 -0.02 0.11 -0.27
-3.35 -2.41 -1.07 -0.8 -0.22 0.13 0.82 0.69 0.74 0.51 0.47 -0.2
-1.57 -0.88 -0.51 -0.17 0.01 0.29 0.34 0.52 0.37 0.25 0.3 -0.17
-2.0 -0.88 -0.63 0.14 0.31 0.09 0.16 0.84 -0.07 0.01 0.45 -0.13
-2.65 -1.21 -0.45 -0.04 0.22 0.55 0.18 0.78 0.07 0.15 0.24 -0.18
-1.05 -0.83 -0.37 0.0 -0.04 0.17 0.45 0.24 0.5 0.23 0.09 -0.19
-1.56 -0.73 -0.28 -0.12 0.05 0.13 0.29 0.71 0.31 0.1 0.31 -0.37
-2.95 -1.35 -0.66 -0.34 0.16 0.64 0.3 0.78 0.46 0.47 -0.12 -0.43
-1.1 -0.69 -0.5 -0.29 0.04 0.26 0.47 0.44 0.56 0.27 -0.02 -0.41
-2.58 -0.79 -0.28 0.01 0.2 0.65 0.46 0.48 0.19 0.11 0.06 -0.58
-0.63 -0.34 -0.19 -0.16 0.12 0.24 0.04 0.27 0.11 0.17 0.19 -0.09
-1.4 -0.77 -0.4 0.04 0.2 0.33 0.2 0.49 0.3 0.22 0.12 -0.3
-1.31 -0.81 -0.57 -0.14 -0.07 0.31 0.5 0.75 0.48 0.2 -0.06 -0.65
-2.07 -1.51 -0.58 -0.22 -0.16 0.16 0.48 0.75 0.49 0.5 0.23 -0.3
-1.89 -1.27 -0.59 -0.34 -0.15 0.43 0.76 0.55 0.54 0.36 0.02 -0.51
-1.42 -0.87 -0.37 -0.12 -0.01 0.2 0.58 0.52 0.47 0.21 -0.04 -0.33
-1.1 -0.72 -0.35 -0.28 0.0 0.32 0.39 0.49 0.28 0.17 0.24 -0.28
-0.87 -0.37 -0.13 -0.23 0.16 0.24 0.18 0.45 0.25 0.05 0.09 -0.28
-0.25 -0.3 -0.19 -0.25 -0.17 0.21 0.32 0.56 0.28 0.0 -0.1 -0.49
-0.45 -0.36 -0.14 -0.24 0.09 0.32 0.18 0.35 0.17 0.14 -0.03 -0.32
-2.37 -1.12 -0.58 -0.09 -0.01 0.41 0.58 0.62 0.43 0.14 0.14 -0.26
-0.91 -0.53 -0.31 -0.21 0.05 0.38 0.5 0.47 0.22 0.12 -0.08 -0.36
-0.73 -0.41 -0.2 -0.23 0.14 0.28 0.36 0.29 0.21 0.12 -0.05 -0.17
-3.65 -1.42 -0.1 0.06 0.51 0.77 0.56 0.56 0.3 0.15 -0.47 -1.22
-4.48 -2.68 -1.04 -0.38 0.13 0.64 0.66 0.65 0.29 0.27 0.51 -0.17
-2.76 -2.52 -1.55 -1.21 -0.23 0.53 0.69 1.02 0.61 0.37 0.42 -0.31
-1.61 -1.04 -0.36 0.02 -0.15 0.51 1.1 0.93 0.35 -0.29 -0.87 -1.43
-1.53 -0.64 -0.21 0.0 0.27 0.37 0.29 0.45 0.05 0.12 0.2 -0.34
-3.48 -1.6 -0.9 -0.28 -0.13 0.46 0.68 0.91 0.51 0.39 -0.0 -0.47
-2.89 -1.01 -0.37 0.02 0.04 0.41 0.49 0.65 0.32 0.16 0.16 -0.38
-2.9 -0.83 -0.29 -0.0 0.23 0.05 0.08 0.75 0.21 0.3 0.42 -0.31
-0.75 -0.73 -0.3 -0.29 -0.11 0.17 0.43 0.48 0.28 0.11 0.35 -0.31
-2.85 -1.62 -0.66 -0.17 -0.03 0.86 1.27 1.05 0.33 -0.52 -1.0 -1.87
-0.77 -0.32 -0.07 -0.04 0.2 0.26 0.07 0.33 0.01 -0.0 0.17 -0.16
-1.02 -0.7 -0.39 -0.19 0.09 0.21 0.12 0.48 0.28 0.27 0.3 -0.16
-0.89 -0.62 -0.36 -0.26 -0.22 0.23 0.42 0.65 0.32 0.07 0.24 -0.34
-1.88 -1.19 -0.62 -0.19 -0.03 0.51 0.93 0.93 0.36 -0.12 -0.3 -0.91
-0.71 -0.37 -0.1 -0.02 0.12 0.23 0.1 0.36 0.16 0.09 0.17 -0.38
-2.54 -1.57 -0.63 -0.38 -0.31 0.34 0.73 0.93 0.83 0.51 -0.26 -1.33
-1.71 -1.26 -0.59 -0.45 -0.13 0.7 0.73 0.65 0.42 0.15 0.02 -0.6
-2.33 -1.75 -1.2 -0.8 -0.07 0.44 0.94 1.04 0.75 0.34 -0.41 -1.02
-2.65 -1.57 -0.63 -0.19 0.09 0.47 0.87 0.52 0.57 0.36 -0.12 -0.78
-3.15 -1.17 -0.27 0.34 0.03 0.39 -0.1 0.69 0.31 0.13 0.33 -0.19
-0.94 -0.36 -0.08 -0.08 0.21 0.41 0.26 0.31 0.16 0.09 -0.14 -0.35
-1.88 -0.81 -0.35 -0.05 -0.07 0.47 0.37 0.46 0.25 0.18 0.27 -0.19
-1.99 -1.08 -0.48 -0.32 0.03 0.34 0.47 0.53 0.43 0.28 0.22 -0.1
-0.65 -0.39 -0.28 -0.42 -0.27 0.27 0.51 0.56 0.44 0.18 -0.09 -0.58
-1.42 -0.92 -0.35 -0.3 -0.07 0.51 0.69 0.47 0.4 0.15 -0.07 -0.42
-1.83 -0.63 -0.34 -0.01 0.06 0.11 0.29 0.54 0.35 0.27 0.17 -0.17
-1.99 -1.24 -0.53 -0.22 -0.05 0.47 0.94 0.91 0.61 0.19 -0.56 -1.78
-0.57 -0.22 -0.13 -0.07 0.08 0.26 0.18 0.39 0.08 0.01 0.04 -0.3
-0.74 -0.41 -0.22 -0.15 -0.0 0.31 0.33 0.2 0.03 0.1 0.24 -0.04
-0.55 -0.45 -0.19 -0.04 -0.1 0.19 0.35 0.47 0.33 0.07 -0.1 -0.36
-1.29 -1.12 -0.74 -0.16 0.05 0.18 0.13 0.84 0.44 0.28 0.24 -0.26
-0.64 -0.66 -0.33 -0.23 -0.07 0.42 0.36 0.56 0.28 0.09 -0.03 -0.39
-2.65 -1.38 -0.7 -0.61 -0.13 0.17 0.76 0.62 0.72 0.43 0.15 -0.31
-1.5 -0.74 -0.21 -0.4 0.06 0.4 0.46 0.62 0.38 0.26 -0.01 -0.64
-1.14 -0.69 -0.2 -0.06 -0.06 0.36 0.45 0.63 0.29 -0.09 0.04 -0.42
-1.66 -0.82 -0.32 -0.08 0.08 0.18 0.46 0.39 0.55 0.31 0.04 -0.38
-1.91 -1.06 -0.52 -0.39 -0.04 0.28 0.47 0.32 0.58 0.48 0.22 -0.12
-2.49 -1.44 -0.72 -0.4 -0.34 0.89 0.84 0.67 0.29 -0.07 0.19 -0.43
-0.6 -0.3 -0.11 -0.14 0.01 0.22 0.16 0.3 0.04 0.27 0.05 -0.14
-3.61 -1.27 -0.1 -0.05 0.52 0.9 0.56 0.54 0.07 -0.07 -0.32 -0.81
-2.26 -1.38 -1.23 -0.68 0.09 0.68 1.21 1.18 0.56 -0.06 -1.09 -2.19
-0.63 -0.41 -0.23 -0.15 0.06 0.14 0.16 0.35 0.14 0.19 0.16 -0.08
-2.56 -1.49 -0.58 -0.08 0.12 0.26 0.24 0.8 0.26 0.23 0.48 -0.18
-0.77 -0.47 -0.22 -0.27 -0.01 0.39 0.46 0.43 0.32 0.21 -0.12 -0.62
-1.72 -0.89 -0.37 -0.26 0.03 0.47 0.5 0.48 0.41 0.26 0.0 -0.32
-0.27 -0.24 -0.2 -0.2 0.04 0.2 0.14 0.32 0.14 0.12 0.02 -0.21
-3.24 -0.98 -0.4 0.16 0.41 0.92 0.52 0.5 0.25 -0.09 -0.34 -0.96
-4.06 -1.22 -0.42 0.03 0.05 0.39 0.51 0.68 0.12 -0.05 0.53 -0.18
-2.17 -0.47 -0.41 -0.07 0.16 0.39 0.42 0.39 0.28 0.09 0.06 -0.07
-0.86 -0.25 -0.18 -0.11 0.14 0.43 0.28 0.33 0.03 -0.0 0.08 -0.32
-2.05 -1.4 -0.59 -0.45 0.16 0.5 0.49 0.59 0.37 0.42 0.17 -0.36
-1.6 -1.97 -1.24 -0.5 -0.1 0.66 1.08 0.8 0.78 0.21 -0.59 -1.35
-1.34 -1.03 -0.49 -0.22 -0.09 0.24 0.52 0.48 0.39 0.37 0.02 -0.04
-1.3 -0.76 -0.3 -0.18 0.01 0.36 0.37 0.42 0.39 0.1 0.22 -0.26
-2.59 -2.76 -1.05 -0.59 -0.02 0.51 1.08 0.61 0.71 0.34 -0.18 -0.52
-2.15 -1.11 -0.53 -0.22 -0.22 0.65 0.68 0.37 0.39 0.13 0.09 -0.04
-0.65 -0.2 -0.07 -0.02 0.11 0.16 -0.06 0.23 0.07 0.09 0.14 0.01
-2.79 -0.97 -0.26 -0.04 0.2 0.56 0.58 0.45 0.41 0.11 -0.09 -0.49
-1.68 -0.81 -0.33 -0.02 0.13 0.13 0.12 0.75 0.17 0.12 0.46 -0.33
-0.97 -0.33 -0.11 -0.12 0.19 0.42 0.28 0.34 0.09 0.02 -0.05 -0.25
-1.98 -1.55 -0.68 -0.3 -0.04 0.84 1.06 1.18 0.36 -0.47 -0.79 -1.89
-4.7 -2.91 -0.96 -0.33 -0.06 0.9 0.94 0.64 0.44 0.04 0.11 -0.42
-0.64 -0.31 -0.23 -0.04 0.22 0.43 0.14 0.22 -0.05 -0.0 0.11 -0.14
-0.63 -0.34 -0.12 -0.15 -0.04 0.29 0.25 0.47 0.03 0.04 0.06 -0.18
-3.25 -1.76 -0.75 -0.12 -0.02 0.16 0.43 0.8 0.34 0.24 0.58 -0.05
-0.83 -0.15 -0.12 -0.12 0.3 0.43 0.25 0.29 -0.02 -0.01 -0.09 -0.33
-1.07 -0.63 -0.48 -0.17 0.01 0.4 0.67 0.65 0.32 -0.05 -0.25 -0.43
-0.99 -0.5 -0.57 -0.22 0.42 0.19 0.0 0.42 0.16 0.22 0.28 -0.09
-2.02 -0.83 -0.2 -0.12 -0.11 0.32 0.5 0.38 0.29 0.2 0.3 -0.16
-3.53 -1.25 -0.46 0.05 0.35 0.69 0.29 0.36 0.05 0.16 0.32 -0.1
-1.09 -0.7 -0.44 -0.05 0.19 0.17 0.19 0.55 0.2 0.17 0.23 -0.16
-1.09 -0.62 -0.16 -0.17 0.01 0.37 0.44 0.35 0.2 0.05 0.13 -0.18
-2.03 -1.22 -0.83 -0.05 -0.09 0.51 0.87 0.65 0.58 0.09 -0.3 -0.59
-1.45 -0.66 -0.33 -0.05 -0.12 0.15 0.49 0.85 0.21 0.09 0.04 -0.41
-2.31 -0.93 -0.15 -0.02 0.25 0.56 0.2 0.52 0.34 0.12 -0.02 -0.32
-1.64 -0.63 -0.12 0.02 -0.18 0.36 0.44 0.33 0.06 0.01 0.41 -0.1
-1.9 -0.81 -0.54 -0.15 0.11 0.09 0.18 0.68 0.22 0.26 0.49 -0.12
-1.52 -1.72 -1.12 -0.51 -0.31 0.53 0.96 0.81 0.66 0.13 -0.06 -0.74

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.