Heatmap: Cluster_48 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
- -0.68 0.46 -0.01 0.67 -0.05 0.05 -1.42 -0.96 0.84 0.1 0.73
-0.08 0.12 0.04 0.15 0.17 0.23 -0.13 -0.36 -0.14 -0.04 -0.1 0.04
-0.44 -0.07 0.23 0.75 0.4 -0.15 -0.76 -0.62 -0.34 -0.29 0.18 0.33
-0.57 0.24 0.19 0.21 0.27 -0.35 -0.55 -0.41 -0.47 0.25 0.42 0.24
-0.29 -0.04 0.42 1.44 0.53 -1.12 -1.28 -0.88 -1.43 -1.01 0.05 0.48
-1.01 0.3 0.34 0.48 0.16 -0.75 -0.97 -0.75 -0.53 0.17 0.39 0.74
-3.43 0.09 0.16 0.21 0.82 0.42 -0.63 -0.92 -0.53 -0.35 0.21 0.72
-2.8 -0.32 -0.06 0.35 0.91 0.44 0.05 -0.38 -0.65 -0.4 0.1 0.4
0.81 0.29 -0.44 0.5 0.24 -0.82 -0.53 -0.88 -0.33 -0.42 -0.07 0.48
-0.83 -0.01 -0.3 0.1 0.45 0.49 -0.51 -0.34 -0.44 0.12 0.4 0.22
-0.7 0.04 -0.21 0.14 0.5 -0.27 -0.57 -0.07 -0.22 0.24 0.33 0.3
-0.48 0.94 0.76 -0.1 -0.0 0.54 -1.05 -0.03 -1.17 -1.17 -1.1 0.54
-1.75 0.24 0.01 0.15 1.1 0.36 -0.36 -0.21 -0.21 -0.39 -0.01 -0.46
-0.25 -0.35 -0.25 0.15 0.09 -0.31 -0.64 -0.27 -0.18 0.22 0.56 0.64
-3.81 -0.88 -0.29 0.53 0.49 0.16 -0.11 -0.08 -0.1 -0.1 0.19 0.78
-0.52 0.29 -0.47 0.03 0.38 -0.71 -0.33 0.02 -0.25 0.42 0.22 0.36
-0.17 -0.03 -0.25 0.39 0.08 -0.44 -0.67 -0.62 -0.03 0.09 0.16 0.8
-0.18 -0.04 -0.02 0.0 -0.03 -0.53 -0.46 0.01 0.01 0.2 0.36 0.4
-3.38 0.44 -2.14 0.53 1.36 0.22 -0.08 -0.98 -0.06 -0.33 -0.39 0.22
-1.31 -0.28 -0.21 0.14 0.23 0.42 0.05 -0.22 -0.24 -0.03 0.13 0.57
-1.94 -0.11 -0.25 0.38 0.57 -0.07 -0.19 -0.72 -0.2 0.29 0.35 0.46
-0.78 -0.03 -0.33 0.31 0.54 -0.09 -0.05 -0.31 0.1 0.15 -0.1 0.17
-2.54 -0.42 -0.18 0.67 0.42 -0.08 -1.2 0.29 -0.89 0.38 0.7 0.25
- 0.47 1.51 -0.28 -0.04 -0.22 - - -0.1 0.68 - 1.36
-0.64 0.58 0.46 0.7 0.53 0.04 -1.08 -1.29 -0.64 -0.25 0.04 -0.01
-0.01 -1.48 -1.43 -0.1 0.41 0.53 -0.25 -0.47 -0.05 0.29 0.53 0.46
-0.49 -0.09 0.05 0.33 0.11 -0.23 -0.35 -0.05 -0.03 -0.01 0.07 0.44
-0.68 -0.2 0.01 0.25 0.29 -0.32 -0.68 0.08 -0.11 -0.05 0.31 0.55
-1.08 0.07 -0.18 0.4 0.3 -0.29 -0.4 -0.16 -0.14 0.21 0.29 0.36
-0.41 0.06 0.35 -0.02 0.25 0.24 -0.16 -0.43 -0.26 -0.25 -0.0 0.34
-0.53 -0.58 -0.25 0.18 0.44 0.34 -0.08 -0.23 -0.33 0.09 0.23 0.29
-1.21 -0.36 -0.89 -0.36 0.43 -0.97 -1.35 -0.52 -0.2 0.31 1.07 1.22
-1.38 0.11 0.02 0.95 0.55 -0.79 -1.45 -1.18 -0.36 0.24 0.33 0.62
- 1.05 -0.34 0.53 0.42 -2.65 -1.11 - 0.19 0.85 0.89 -0.07
0.05 0.16 -0.07 0.15 0.28 0.11 -0.07 -0.34 -0.14 -0.17 -0.11 0.03
-1.8 0.56 -0.05 -0.61 -0.11 0.42 -0.25 0.15 -0.06 0.11 -0.26 0.61
-0.47 0.09 -0.18 0.12 0.12 -0.15 -0.14 -0.17 -0.25 0.15 0.07 0.54
-0.4 -0.04 -0.57 0.64 0.44 -0.24 -0.83 -1.08 -0.08 0.29 -0.05 0.75
-0.52 0.16 0.05 -0.1 0.12 0.19 0.01 -0.32 -0.23 0.1 0.02 0.31
-0.0 0.19 -0.11 0.18 0.28 -0.13 -0.15 -0.52 -0.25 0.12 -0.11 0.28
-0.88 0.27 0.3 0.23 0.44 -0.06 -0.43 -0.64 -0.4 -0.0 0.23 0.28
-0.47 -0.21 -0.07 0.91 0.15 -0.57 -0.94 -0.58 -0.49 0.17 0.52 0.41
0.69 0.07 -0.66 0.26 0.58 -0.3 -0.48 -0.94 -0.34 -0.1 -0.13 0.41
-1.91 -0.05 0.6 0.36 0.25 0.03 -0.55 -0.39 -0.76 -0.48 0.43 0.73
-0.36 0.07 -0.1 0.1 0.28 -0.27 -0.66 -0.39 -0.24 0.14 0.35 0.58
-1.45 0.92 0.34 0.67 0.36 0.2 -0.9 -2.54 -0.68 0.3 0.22 -0.48
-0.39 -0.24 -0.25 0.22 0.24 0.17 0.09 -0.34 -0.21 -0.11 0.11 0.44
-0.64 -0.13 0.16 0.33 0.29 0.26 -0.01 -0.28 -0.26 -0.12 -0.05 0.17
-1.12 -0.41 -0.42 0.76 0.67 0.07 -0.5 -0.14 -0.54 -0.55 0.07 0.73
-0.7 0.14 0.39 0.21 0.21 -0.58 -0.92 -0.65 -0.57 0.1 0.24 0.93
-3.7 -1.58 -0.12 1.07 1.23 0.2 -0.71 -0.94 -0.96 -0.27 0.13 0.59
-0.25 0.48 -0.01 0.09 0.65 0.46 -0.57 -1.01 -0.62 -0.42 -0.36 0.49
-0.81 0.05 0.31 0.54 0.25 -0.35 -0.64 -0.39 -0.18 -0.01 0.1 0.46
-0.9 -0.0 -0.03 0.07 0.07 0.15 -0.29 -0.4 -0.25 0.32 0.06 0.65
-0.63 0.31 0.28 -0.08 0.24 -0.13 -0.18 0.14 -0.24 0.34 -0.53 0.11
-1.08 -0.17 -0.08 0.46 0.58 0.04 -0.21 -0.57 -0.06 0.03 -0.0 0.35
-1.38 0.22 0.4 1.02 0.45 -0.37 -0.62 -0.39 -0.25 -0.4 -0.35 0.21
-0.07 0.37 -0.13 0.41 0.18 -0.59 -1.06 -1.01 -0.8 0.1 0.18 0.97
0.99 - 0.37 -0.45 - 0.08 -1.28 -0.34 0.13 1.07 0.13 0.51
-0.49 -0.04 0.04 0.17 0.04 0.24 -0.19 -0.53 -0.17 -0.15 0.31 0.44
0.29 0.31 0.04 0.35 0.16 -0.37 -0.56 -0.64 -0.53 -0.22 -0.04 0.59
-0.72 -0.53 -0.62 0.26 0.59 -0.18 -0.23 -0.39 -0.26 -0.14 0.56 0.72
-2.39 -0.08 0.04 0.8 0.68 0.12 -0.73 -1.51 -0.73 -0.04 0.16 0.81
0.09 0.15 0.12 -0.08 0.12 -0.11 -0.21 -0.55 -0.2 -0.04 0.13 0.38
-0.13 -0.21 -0.29 0.38 0.19 0.07 -0.18 -0.25 -0.16 -0.03 0.17 0.26
-0.04 0.07 -0.56 0.32 0.35 -0.32 -0.67 -0.78 -0.49 0.27 0.32 0.67
-1.43 0.22 -0.14 0.81 0.61 -1.57 -1.74 -0.97 -0.89 0.39 0.48 0.92
-0.1 -0.05 -0.3 0.06 0.31 -0.02 0.03 -0.15 0.01 0.09 -0.04 0.08
-1.05 0.03 -0.18 -0.2 0.08 0.02 0.01 -0.16 -0.02 0.27 0.16 0.56
-0.96 0.03 0.13 0.11 0.36 -0.19 -0.43 -0.14 -0.08 0.29 0.12 0.29
-1.74 -0.04 -0.18 0.39 -0.21 -0.63 -0.02 -0.37 0.05 0.22 0.52 0.7
-0.28 -0.14 0.15 0.32 0.33 0.12 -0.1 -0.41 -0.31 -0.16 0.05 0.19
-0.48 0.21 -0.31 -0.08 0.2 0.41 0.11 -0.37 0.05 0.05 -0.22 0.17
-0.83 -0.12 0.05 0.27 0.34 0.04 -0.22 -0.23 -0.19 0.14 0.11 0.28
-0.71 0.78 0.39 -0.31 0.16 0.1 -0.78 0.03 -0.15 0.29 -0.66 -0.0
-0.12 0.14 -0.95 0.29 0.78 -1.01 -1.26 -1.07 0.61 0.76 -0.86 0.45
-0.44 -0.02 -0.04 0.56 0.18 -0.15 -0.97 -0.59 -0.56 0.31 0.39 0.48
-0.93 0.53 -0.03 0.22 0.53 -0.61 -1.09 -0.34 -0.48 0.15 0.4 0.48
-0.26 0.18 -0.28 0.03 0.22 -0.46 -0.6 -0.43 -0.24 0.21 0.39 0.66
-0.39 0.4 -0.23 0.06 0.17 -0.5 -0.85 -0.32 -0.46 0.11 0.5 0.68
-0.33 -0.05 0.27 1.05 0.58 0.11 -1.48 -0.78 -0.62 -0.44 -0.08 0.17
-0.12 0.1 0.34 1.16 0.28 -0.45 -1.2 -0.66 -0.52 -0.7 0.0 0.24
-0.28 -0.39 0.01 0.43 0.21 -0.37 -0.79 -0.77 -0.22 0.35 0.35 0.64
-0.26 -0.15 -0.12 0.03 0.19 0.2 0.05 -0.05 -0.29 -0.16 0.11 0.31
-0.59 0.44 0.12 0.3 0.44 -0.63 -1.24 -0.31 -0.3 0.11 0.27 0.4
-1.34 0.47 0.38 0.38 1.1 0.06 -1.11 -0.89 -0.65 -0.39 0.1 -0.06
-0.98 0.25 0.12 0.19 0.43 -0.39 -0.82 -0.38 -0.3 0.2 0.35 0.48
-1.27 0.41 0.15 0.2 0.51 -0.61 -1.17 -0.35 -0.54 0.27 0.6 0.35
-0.94 0.58 0.11 0.31 0.52 -0.79 -1.59 -0.15 -0.47 0.08 0.52 0.27
-1.18 0.01 0.04 0.69 0.38 -0.49 -1.02 -0.63 -0.33 0.23 0.36 0.58
-0.64 0.23 0.16 0.21 0.26 -0.75 -0.42 -0.46 -0.35 0.14 0.52 0.4
-2.16 -1.28 -0.36 0.15 0.83 0.28 -0.5 -0.44 -0.35 0.5 0.59 0.43
-4.85 -2.09 -0.36 0.31 1.0 0.46 -0.8 -0.93 -0.24 0.32 0.58 0.73
-1.67 -0.11 0.53 0.62 0.07 0.38 -0.8 -2.37 -2.5 0.33 1.16 -0.03
-0.84 -0.19 -0.0 0.5 0.73 0.32 -0.35 -0.51 -0.3 -0.08 -0.12 0.12
-1.03 -0.27 -0.17 0.12 0.42 0.23 -0.21 -0.34 -0.35 0.27 0.31 0.39
-1.01 0.46 -0.18 0.1 0.36 -0.28 -0.68 -0.44 -0.22 0.28 0.5 0.3
-0.6 0.54 0.39 0.25 -0.2 0.55 -0.92 -1.55 -0.94 0.13 0.03 0.63
-0.34 0.17 0.11 0.31 0.26 0.14 -0.06 -0.53 -0.17 -0.42 -0.13 0.33
-0.77 0.12 -0.22 -0.09 0.51 0.44 0.06 0.07 0.0 -0.17 -0.38 -0.01
0.53 - 1.58 - - - - - 0.08 1.45 - 1.92
-0.53 -0.03 -0.2 0.18 0.53 0.32 -0.05 -0.14 -0.05 -0.12 -0.27 0.05
-0.45 -0.25 0.05 0.22 0.32 0.14 0.24 -0.32 -0.22 -0.24 -0.17 0.37
-1.52 -0.1 -0.71 -1.16 0.48 0.78 0.2 -0.73 -1.28 0.1 0.48 0.94
-1.42 -0.44 -0.1 0.42 0.72 0.31 -0.59 -0.65 -0.77 -0.04 0.32 0.7
0.19 0.04 -0.17 0.08 0.13 0.09 -0.03 -0.06 -0.1 -0.0 -0.24 0.02
-1.93 0.25 -0.24 0.47 0.74 -0.08 -0.33 -0.99 0.07 0.2 -0.3 0.47
-0.8 -0.04 0.1 0.24 0.15 -0.12 -0.28 -0.07 -0.12 0.23 0.15 0.25
0.22 0.51 0.04 0.01 -0.39 -0.97 -0.3 -0.28 -0.09 0.1 0.13 0.45
-0.35 -0.26 -0.08 0.08 0.18 0.05 -0.16 -0.06 -0.13 0.23 0.13 0.24
-0.52 -0.46 -1.03 0.87 0.49 -0.71 -1.0 0.57 -1.04 0.2 0.57 0.18
-0.27 -0.03 0.09 0.29 0.39 -0.3 -0.93 -0.9 -0.5 0.07 0.44 0.68
-0.44 0.33 0.08 0.32 0.6 -0.11 -0.88 -0.47 -0.23 -0.01 -0.02 0.21
-0.17 0.14 0.35 0.97 0.19 -0.88 -0.96 -0.76 -0.7 -0.32 0.02 0.64

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.