Heatmap: Cluster_116 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.02 0.1 0.02 0.02 0.04 0.0 0.11 0.04 0.02
0.03 0.07 0.04 0.04 0.1 0.02 0.16 0.09 0.15 0.15 0.11 0.05
0.03 0.07 0.0 0.02 0.15 0.13 0.09 0.0 0.04 0.13 0.02 0.02
12.2 11.39 11.16 12.62 12.2 9.86 5.86 9.93 9.46 9.85 12.08 13.71
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.2 0.0 0.06 0.06 0.06 0.13
0.0 0.17 0.05 0.0 0.05 0.0 0.22 0.0 0.05 0.08 0.09 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.1 0.14 0.05 0.02 0.15 0.0 0.12
10.81 8.31 9.02 8.67 8.26 8.97 9.14 8.41 8.69 10.71 7.95 7.88
0.07 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.04 0.11 0.13 0.0 0.0 0.09
0.33 0.62 0.33 0.27 0.55 0.32 0.18 0.88 0.13 0.34 0.71 0.35
0.07 0.1 0.1 0.07 0.06 0.08 0.13 0.06 0.11 0.06 0.13 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.07 0.06 0.08 0.06 0.26 0.08 0.12 0.38 0.12 0.21 0.21 0.18
7.68 9.35 9.87 12.11 12.9 14.92 15.82 8.32 10.93 10.33 10.19 12.83
0.23 0.05 0.23 0.0 0.2 0.04 0.0 0.25 0.0 0.08 0.56 0.49
1.07 1.76 1.08 1.69 1.13 0.83 1.11 0.84 1.13 1.35 2.17 2.88
11.49 13.61 14.55 20.28 19.51 20.48 21.31 14.62 11.69 13.43 17.78 16.44
0.14 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.05 0.0 0.09 0.0
0.04 0.68 0.13 0.68 0.76 0.74 0.82 0.08 0.49 0.04 0.37 0.04
0.0 0.02 0.13 0.0 0.12 0.0 0.14 0.11 0.17 0.18 0.12 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.05
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.11 0.07
0.68 0.84 1.41 0.94 0.95 1.73 1.94 1.17 0.91 1.48 1.34 1.66
0.03 0.04 0.02 0.04 0.12 0.02 0.07 0.0 0.04 0.02 0.02 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.05 0.0 0.04 0.0
0.04 0.1 0.0 0.0 0.07 0.07 0.03 0.09 0.0 0.04 0.11 0.14
0.21 0.16 0.11 0.31 0.65 0.47 0.59 0.34 0.58 0.38 0.36 0.26
0.55 0.37 0.2 0.25 0.48 0.08 0.33 0.29 0.39 0.43 0.32 0.38
0.0 0.02 0.1 0.09 0.35 0.08 0.29 0.2 0.34 0.15 0.09 0.3
0.07 0.0 0.0 0.05 0.0 0.13 0.1 0.0 0.09 0.04 0.0 0.05
0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.09 0.0
0.07 0.32 0.29 0.24 0.33 0.15 0.19 0.24 0.09 0.23 0.27 0.11
0.0 0.05 0.07 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.07 0.11 0.04 0.0
0.29 0.94 2.21 1.91 1.6 1.53 1.22 0.84 0.86 1.76 1.61 1.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.07 0.07 0.0 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0
3.76 4.51 6.3 5.03 5.12 5.92 3.96 3.89 4.0 4.81 5.13 5.17
0.3 0.46 0.11 0.27 0.7 0.24 0.69 0.45 0.34 0.29 0.28 0.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.04 0.02 0.06 0.04 0.0
0.24 0.08 0.09 0.07 0.12 0.12 0.18 0.1 0.13 0.21 0.04 0.16
0.07 0.08 0.0 0.05 0.22 0.04 0.08 0.04 0.04 0.0 0.15 0.49
0.03 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.04 0.08 0.02
1.12 0.78 0.94 0.92 0.68 0.5 0.52 0.57 0.61 0.9 0.98 0.79
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.05 0.0 0.02 0.05 0.0 0.02 0.07 0.05 0.06 0.09 0.02
0.95 1.68 1.25 1.75 1.76 1.31 1.32 1.15 1.35 1.29 1.28 1.56
0.27 0.45 0.56 0.34 1.4 0.98 1.79 1.64 1.19 0.85 0.75 1.02
0.0 0.11 0.09 0.13 0.14 0.12 0.09 0.03 0.02 0.04 0.17 0.0
0.1 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.12 0.14
0.14 0.0 0.05 0.02 0.12 0.0 0.09 0.09 0.07 0.06 0.0 0.02
0.85 1.6 1.49 1.41 1.09 1.08 0.82 1.07 1.2 1.66 1.32 0.98
0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.03 0.02 0.04 0.02 0.05
0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.05
0.0 0.05 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.02
0.07 0.07 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.23 0.23 0.42 0.57 0.25 0.35 0.44 0.45 0.71 0.49 0.44
0.0 0.09 0.08 0.04 0.22 0.04 0.0 0.04 0.09 0.19 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19
0.07 0.27 0.13 0.0 0.05 0.0 0.24 0.11 0.04 0.08 0.17 0.15
0.52 1.05 1.16 1.43 1.27 1.2 1.15 1.27 1.39 1.59 1.37 1.6
0.1 0.04 0.0 0.13 0.12 0.1 0.0 0.07 0.07 0.11 0.02 0.02
0.13 0.0 0.18 0.13 0.2 0.04 0.0 0.1 0.04 0.0 0.25 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.02 0.02 0.06 0.17 0.07
4.61 6.88 9.28 8.88 7.44 7.3 6.79 8.87 10.51 9.32 8.05 7.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0
1.6 1.33 0.78 2.2 3.92 2.17 3.85 2.02 1.76 2.18 2.77 2.87
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.1 0.12
0.07 0.0 0.07 0.0 0.05 0.07 0.02 0.0 0.02 0.08 0.04 0.11
0.16 0.04 0.17 0.34 0.36 0.17 0.2 0.16 0.0 0.08 0.0 0.51
0.9 1.12 0.61 0.64 1.06 0.63 0.59 0.64 0.52 0.95 1.3 1.23
0.0 0.07 0.02 0.0 0.12 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.04 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.16 0.12 0.12 0.02 0.02 0.0
0.03 0.0 0.02 0.04 0.1 0.03 0.11 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0
0.33 0.46 0.23 0.7 0.39 0.35 0.44 0.29 0.42 0.41 0.59 1.03
0.65 0.68 0.33 0.7 0.43 0.36 0.37 0.71 0.53 0.72 1.41 1.72
1.14 1.46 1.14 0.83 1.68 0.83 1.09 0.81 1.06 1.74 1.99 1.98
0.26 0.31 0.27 0.42 0.42 0.53 0.21 0.34 0.24 0.6 0.51 0.9
0.0 0.02 0.04 0.02 0.09 0.0 0.0 0.07 0.09 0.04 0.07 0.07
0.03 0.02 0.04 0.0 0.06 0.08 0.02 0.05 0.02 0.06 0.13 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.0 0.0 0.2 0.08 0.29 0.08 0.31 0.37 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.19 0.09 0.46 0.84 0.46 0.72 0.78 0.11 0.04 0.15 0.41
0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.06 0.02
0.0 0.1 0.0 0.16 0.1 0.09 0.09 0.03 0.07 0.08 0.09 0.04
0.1 0.43 0.24 0.24 0.49 0.05 0.1 0.1 0.18 0.18 0.42 0.2
0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.08 0.0 0.07 0.0 0.06 0.14
0.0 0.19 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.21 0.0
0.35 0.64 0.36 0.35 0.43 0.3 0.27 0.25 0.34 0.48 0.47 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.1 0.0 0.05 0.04 0.02 0.0
0.93 1.01 1.3 1.1 1.04 1.78 1.39 0.86 0.63 1.92 1.36 1.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.06 0.07
0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)