Heatmap: Cluster_84 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.56 -0.2 -0.54 0.11 0.15 -0.59 -0.37 -0.03 0.11 0.59 0.33 0.38
-0.39 -0.55 -0.83 -0.35 0.17 -0.03 -0.08 0.18 0.15 0.48 0.27 0.39
-0.29 -0.18 -0.43 -0.33 -0.1 -0.71 -0.43 0.12 -0.12 0.4 0.83 0.46
-0.01 -0.17 -0.57 -0.21 0.09 -0.78 -0.42 -0.08 -0.28 0.57 0.65 0.44
-0.29 -0.03 -0.86 -0.49 -0.04 -0.88 -0.33 0.05 0.06 0.43 0.82 0.54
-3.16 -0.86 -0.61 -0.34 0.49 0.03 -0.07 0.51 -0.15 0.49 0.78 0.09
-1.17 -0.71 -1.24 -0.85 0.17 -0.27 0.37 0.63 -0.67 0.57 0.95 0.17
-1.39 0.11 -0.78 -0.08 0.07 -0.49 -0.53 0.31 0.03 0.5 0.78 0.21
-0.44 0.14 -0.41 0.02 0.17 -0.32 -0.27 -0.1 -0.05 0.25 0.3 0.4
-0.86 -0.19 -0.44 -0.07 0.22 -0.15 -0.4 -0.07 0.05 0.45 0.56 0.3
-0.66 -0.29 -0.29 -0.37 0.15 0.11 -0.2 0.19 0.16 0.38 0.22 0.22
-0.79 0.03 -0.33 0.01 0.2 -0.44 -0.48 0.18 -0.03 0.42 0.52 0.15
-1.19 0.17 -1.18 -0.27 0.43 -0.54 -0.53 -0.29 0.03 0.55 0.74 0.55
-0.95 -0.15 -0.51 -0.18 -0.0 0.05 0.05 0.13 0.18 0.39 0.23 0.28
-0.22 -0.22 -0.38 -0.16 -0.12 -0.36 -0.24 0.23 0.24 0.48 0.31 0.13
-0.32 -0.08 -0.44 -0.1 0.06 -0.54 -0.35 0.36 0.07 0.36 0.5 0.05
-1.89 -0.42 -0.24 -0.13 0.03 -0.08 -0.23 0.31 0.04 0.51 0.59 0.29
-1.71 -1.19 -0.96 -0.13 0.34 0.2 0.03 0.35 -0.01 0.58 0.63 0.12
-0.4 0.03 -0.26 -0.08 0.31 -0.1 -0.3 0.25 -0.09 0.26 0.22 -0.05
-1.88 0.17 -0.48 -0.15 0.4 -0.19 -0.07 0.24 -0.18 0.44 0.63 -0.2
-0.6 0.43 -0.37 -0.6 0.06 -0.64 -0.23 0.27 -0.82 0.36 0.61 0.53
-1.32 -0.88 -0.64 -0.2 0.36 0.06 0.1 0.25 -0.14 0.5 0.5 0.27
-0.84 -0.37 -0.14 -0.54 0.25 0.22 -0.09 -0.03 0.05 0.46 0.25 0.27
-1.17 -0.37 -0.88 -0.48 0.28 -0.15 0.04 0.64 -0.06 0.52 0.47 0.05
-0.31 -0.21 -0.44 -0.21 0.07 0.18 -0.06 0.12 -0.01 0.16 0.27 0.24
-0.81 -0.77 -1.56 -0.73 -0.11 0.24 -0.15 0.17 -0.43 0.26 1.19 0.62
-0.72 -0.67 -1.09 -1.02 0.24 -0.2 -0.15 -0.01 -0.99 0.29 1.37 0.61
-1.43 -0.67 -1.1 -0.16 0.42 -0.64 -0.38 -0.0 -0.24 0.74 0.87 0.63
-0.36 -0.11 -0.14 -0.18 0.07 -0.15 -0.22 0.2 0.01 0.3 0.34 0.07
-0.18 0.21 -0.69 -0.38 0.42 -0.26 -0.23 0.18 -0.27 0.13 0.42 0.2
-2.67 -0.48 -1.03 0.17 0.41 -0.85 -0.45 0.14 -0.07 0.85 0.69 0.52
-0.66 -0.08 -0.51 -0.19 0.09 -0.19 -0.39 0.34 -0.17 0.38 0.51 0.33
-0.47 0.11 -0.94 -0.16 0.24 -0.44 -0.34 -0.19 -0.1 0.63 0.45 0.44
-0.7 0.01 -0.56 0.14 0.17 -0.31 -0.32 -0.09 0.01 0.51 0.26 0.38
-1.76 -0.25 -0.66 -0.45 0.15 -0.14 -0.55 0.33 0.17 0.32 0.69 0.62
-0.76 -0.06 -0.69 -0.73 0.36 -0.31 -0.16 0.4 -0.87 0.19 1.04 0.23
-0.8 -0.38 -0.78 -0.37 0.18 -0.1 -0.01 0.2 -0.08 0.4 0.59 0.41
-1.04 -0.53 -0.43 -0.1 0.31 0.1 0.05 0.39 -0.03 0.22 0.39 0.06
-2.83 -0.35 -1.09 -0.17 0.43 -0.4 0.06 0.29 -0.16 0.7 0.52 0.49
-1.39 -0.25 -0.46 -0.56 0.39 0.34 -0.12 0.08 -0.26 0.35 0.33 0.55
-0.6 -0.14 -0.52 -0.1 0.11 -0.44 -0.37 0.03 -0.2 0.43 0.6 0.53
-2.62 -0.6 -0.49 -0.14 0.19 -0.41 -0.06 0.41 -0.01 0.6 0.72 0.29
-0.7 0.02 -0.29 -0.23 0.26 0.12 -0.11 0.14 -0.03 0.28 0.25 -0.01
-1.07 -0.11 -0.05 -0.2 0.26 0.23 -0.23 -0.16 0.12 0.29 0.2 0.23
-0.03 0.13 -0.95 -0.11 0.12 -0.48 -0.26 -0.06 -0.04 0.51 0.19 0.43
-0.75 0.15 -1.08 -0.17 0.1 -0.61 -0.26 -0.34 -0.09 0.6 0.63 0.65
-1.19 -0.81 -1.17 -1.42 -0.25 -0.15 0.07 0.16 -0.06 0.92 0.85 0.69
-0.25 -0.06 -0.67 -0.79 -0.3 -0.02 -0.19 0.14 -0.02 0.46 0.66 0.35
-0.81 0.1 -0.49 -0.14 0.24 -0.55 -0.59 0.25 0.07 0.51 0.54 0.13
-0.99 -0.02 -0.48 -0.39 0.04 -0.37 -0.37 0.43 -0.15 0.42 0.78 0.22
-0.1 0.04 -0.26 -0.47 0.07 -0.12 -0.18 0.03 -0.22 0.18 0.62 0.11
-0.28 0.07 -0.37 -0.31 0.18 -0.38 -0.43 0.0 -0.38 0.24 0.66 0.44
-0.46 0.24 -0.6 -0.22 0.16 -0.56 -0.2 0.03 -0.26 0.3 0.48 0.51
-1.12 -0.34 -0.44 0.12 0.18 0.02 0.0 0.13 0.12 0.26 0.37 0.14
-0.53 -0.14 -1.76 -1.01 -0.06 -0.41 -0.02 0.11 -0.54 0.4 1.17 0.65
-0.32 0.03 -1.4 -1.34 0.05 -0.26 -0.17 0.13 -1.23 0.19 1.3 0.61
-0.65 0.16 -1.1 -1.1 -0.19 0.07 -0.1 0.2 -1.24 0.06 1.25 0.54
-1.02 -0.46 -1.01 -0.68 0.3 -0.41 -0.07 0.32 -0.32 0.42 0.96 0.49
-3.73 -1.46 -0.82 -0.6 0.47 -0.15 0.02 0.48 -0.09 0.8 0.89 0.14
-1.96 -0.92 -0.5 -0.18 0.46 0.21 -0.01 0.25 0.05 0.45 0.45 0.19
-1.47 -0.05 -0.56 -0.33 0.24 -0.27 -0.26 0.17 -0.03 0.41 0.67 0.42
-2.03 -0.44 -0.19 -0.35 0.07 -0.08 0.04 0.14 0.19 0.7 0.29 0.31
-1.32 -0.43 -0.9 -0.28 0.37 -0.24 -0.23 0.21 -0.34 0.39 0.85 0.55
-1.59 -2.0 -1.72 -0.74 0.4 0.14 0.19 0.36 0.14 0.66 0.81 0.31
-1.52 -0.71 -0.24 -0.23 0.04 0.08 0.08 0.41 0.34 0.39 0.35 0.03
-0.47 0.11 -0.72 -0.16 0.38 -0.1 -0.25 -0.16 0.08 0.24 0.24 0.39
-1.65 -1.91 -0.82 -0.47 0.45 0.08 0.08 0.41 -0.4 0.3 0.99 0.44
-0.93 -0.46 -0.54 -0.23 0.4 -0.45 -0.04 -0.05 -0.19 0.38 0.7 0.5
-2.64 -0.34 -0.6 -0.13 0.3 -0.28 -0.28 0.51 -0.33 0.74 0.76 0.02
0.09 0.64 -0.35 -0.25 0.23 -0.76 -0.78 -0.23 -0.59 0.11 0.56 0.41
-0.4 -0.43 -0.41 -0.0 0.09 0.14 0.07 0.24 -0.16 0.09 0.39 0.1
-0.15 0.42 -0.63 -0.36 -0.04 -0.57 -0.23 0.12 -0.29 0.14 0.57 0.44
-0.6 -0.08 -0.59 -0.51 -0.18 -0.78 -0.12 0.31 0.12 0.4 0.72 0.43
-0.54 -0.25 -0.74 0.02 0.18 0.11 -0.35 0.16 0.04 0.36 0.21 0.35
-0.52 -0.15 -0.58 -0.54 0.17 0.22 0.03 0.22 -0.02 0.31 0.32 0.12
-0.76 -0.43 -0.62 -0.64 0.48 -0.0 -0.14 0.31 -0.38 -0.12 0.9 0.37
-0.6 0.27 -0.35 -0.26 0.31 -0.59 -0.23 -0.19 -0.34 0.09 0.63 0.57
-1.36 -0.45 -0.41 -0.23 0.37 0.1 -0.16 0.17 -0.08 0.46 0.49 0.22
-1.45 -0.31 -0.98 -0.22 0.46 -0.35 -0.13 0.24 -0.02 0.52 0.65 0.28
-0.5 -1.08 -2.49 - - -1.83 0.34 0.88 -1.11 0.84 1.69 0.82
-1.94 -0.04 -1.28 -0.13 0.52 -0.39 -0.42 -0.13 -0.45 0.82 0.7 0.54
-2.05 -0.46 -0.38 -0.39 0.13 0.04 -0.15 0.33 0.2 0.56 0.49 0.25
-0.13 0.07 -0.89 -0.16 0.05 -0.81 -0.26 -0.23 -0.07 0.47 0.55 0.58
-0.22 0.0 -0.65 -0.44 -0.26 -0.66 -0.3 0.6 0.32 0.36 0.42 0.12
-0.28 -0.05 -0.67 -0.52 -0.14 -0.59 -0.27 0.66 0.21 0.29 0.55 0.07
-1.68 -0.65 -0.73 0.02 0.24 0.3 0.04 0.12 0.17 0.52 0.32 0.15
-0.85 -0.37 -1.03 -1.04 -0.24 0.01 0.0 0.3 0.09 0.66 0.76 0.33
-2.7 -0.5 -0.65 -0.02 0.3 0.14 0.01 0.39 0.33 0.24 0.2 0.36
-0.9 -0.27 -0.31 -0.27 0.41 -0.08 -0.33 0.24 0.02 0.35 0.39 0.19
-0.25 -0.05 -0.58 -0.81 -0.14 -0.71 -0.43 0.23 -0.28 0.55 0.91 0.43
-0.08 -0.0 -0.47 -0.95 -0.63 -1.22 -0.15 0.44 -0.34 0.51 1.09 0.19
-0.81 0.13 -1.17 -0.3 -0.25 -0.8 -0.15 -0.1 -0.39 0.79 0.91 0.54
-1.1 -0.1 -0.11 0.12 0.39 0.11 -0.25 0.16 0.07 0.28 0.15 -0.22
-1.08 -0.35 -0.8 -0.25 0.13 0.11 0.2 0.32 0.09 0.31 0.38 0.2
-3.8 -0.94 -1.07 -0.44 0.27 -0.14 0.15 0.49 0.14 0.7 0.61 0.4
-0.63 -0.43 -0.76 -0.35 0.5 -0.46 -0.76 -0.25 -0.68 0.32 1.08 0.75
-0.8 0.12 -0.48 -0.59 -0.36 -0.89 -0.3 0.15 -0.14 0.54 0.89 0.59
-0.81 -0.24 -0.32 -0.15 0.24 0.08 -0.07 0.22 0.09 0.23 0.25 0.14
-0.07 0.2 -1.1 -0.71 -0.16 -0.72 -0.32 0.21 -0.1 0.57 0.8 0.27
-0.99 0.28 -1.05 0.1 0.31 -0.2 -0.16 0.07 -0.31 0.46 0.32 0.3
-1.07 0.04 -0.38 -0.18 0.34 -0.11 -0.44 0.17 -0.18 0.5 0.54 0.05
-0.56 0.3 -0.66 -0.47 0.08 -0.29 -0.04 0.23 -0.22 0.33 0.57 0.16
-0.59 -0.1 -1.33 -1.64 -0.08 -0.14 -0.0 0.4 -1.17 0.49 1.38 0.08
-0.77 -0.4 -1.21 -1.26 -0.09 -0.03 0.24 0.47 -0.48 0.43 1.02 0.3
-0.75 -0.63 -1.38 -0.78 -0.2 -0.11 0.2 0.31 0.14 0.64 0.63 0.49
-0.34 0.31 -0.23 -0.09 -0.09 -0.51 -0.29 -0.1 -0.03 0.25 0.32 0.44
-1.8 0.16 -1.38 -0.17 0.38 -0.77 -0.25 0.27 -0.02 0.67 0.51 0.46
-0.1 0.07 -0.9 -0.27 0.08 -0.46 -0.28 -0.11 -0.13 0.35 0.52 0.58
-2.24 -0.97 -1.33 -0.33 0.05 -0.59 -0.04 0.44 0.1 0.65 0.93 0.59
-1.84 -1.1 -1.35 -0.14 0.0 -0.29 0.12 0.32 0.31 0.62 0.57 0.61
-0.22 0.48 -0.32 -0.19 0.13 -0.69 -0.58 -0.03 -0.39 0.13 0.56 0.46
-0.58 0.24 -0.3 -0.6 0.13 -0.43 -0.09 -0.21 -0.37 0.18 0.75 0.52
-0.59 0.28 -0.52 -0.34 0.09 -0.5 -0.28 0.02 -0.26 0.41 0.56 0.47
-1.05 -0.39 -0.9 -0.18 0.27 0.15 -0.11 0.05 -0.25 0.29 0.43 0.72
-0.24 0.04 -1.04 -0.04 0.21 -0.7 -0.25 -0.04 -0.1 0.51 0.26 0.61
-1.69 -0.17 -0.5 -0.06 0.42 -0.2 -0.17 -0.04 -0.11 0.43 0.55 0.41
-1.33 -0.45 -1.14 -0.31 0.46 -0.05 -0.03 0.11 0.01 0.28 0.75 0.38
-1.66 -0.77 -0.76 -0.48 0.55 -0.02 -0.31 0.16 -0.05 0.57 0.74 0.36
-0.58 0.07 -0.55 -0.33 0.21 0.07 -0.21 0.13 -0.07 0.42 0.25 0.2
-0.48 0.18 -0.5 -0.09 0.13 -0.34 -0.32 -0.14 -0.01 0.45 0.31 0.39
-0.23 0.08 -0.87 -0.1 0.2 -0.39 -0.14 -0.16 -0.15 0.49 0.36 0.38
-0.94 -0.04 -0.3 -0.37 0.23 0.04 -0.29 -0.03 0.04 0.39 0.39 0.35
-0.43 -0.1 -0.59 -0.13 0.29 -0.01 -0.4 0.05 -0.13 0.29 0.43 0.33
-0.22 0.25 -0.34 -0.34 0.06 -0.6 -0.44 0.39 -0.19 0.17 0.42 0.36
-0.73 -0.33 -0.72 -0.58 -0.12 -0.08 -0.05 0.32 0.03 0.47 0.61 0.39
-2.71 -0.58 -0.23 -0.06 0.27 -0.14 -0.3 0.26 0.07 0.41 0.65 0.38
0.02 0.36 -0.42 -0.43 0.13 -0.43 -0.37 0.07 -0.43 0.19 0.53 0.31
-0.23 0.21 -0.4 -0.38 0.13 -0.55 -0.37 0.03 -0.34 0.29 0.64 0.4
-1.36 -0.38 -0.49 -0.49 0.7 -0.08 -0.11 0.4 -0.63 0.15 0.83 0.09
-1.18 -0.46 -0.71 -0.08 0.52 -0.09 -0.07 0.43 -0.24 0.09 0.76 0.01
-1.25 -0.33 -0.79 0.04 0.49 -0.25 -0.02 0.33 0.0 0.23 0.52 0.1
-1.14 -0.73 -0.67 0.08 0.29 0.11 0.09 0.31 0.15 0.27 0.35 0.1
-1.35 -0.39 -0.73 -0.28 0.45 0.36 0.02 0.25 -0.14 0.33 0.43 0.08
-1.52 -1.24 -1.04 -0.28 -0.07 0.04 0.03 0.32 0.35 0.68 0.45 0.5
-0.68 0.29 -1.66 -0.24 0.33 -0.62 -0.05 -0.5 -0.26 0.63 0.58 0.61
-3.31 -1.45 -0.64 -0.72 0.38 0.06 -0.23 0.34 0.05 0.74 0.9 0.31
-0.57 -0.17 -0.37 -0.29 0.05 0.15 0.05 0.31 0.03 0.21 0.2 0.13
-0.49 0.16 -0.58 -0.15 0.21 -0.42 -0.26 0.03 -0.2 0.39 0.46 0.35
-0.64 -0.22 -0.27 -0.07 0.17 0.03 -0.03 0.2 0.07 0.17 0.28 0.08
-1.15 -0.4 -0.22 -0.16 0.27 0.03 -0.17 0.21 0.19 0.38 0.3 0.12
-2.31 -0.7 -0.64 -0.3 0.37 0.04 0.03 0.33 0.1 0.53 0.51 0.25
-0.92 -0.35 -0.28 -0.18 0.32 0.14 -0.04 0.33 0.02 0.24 0.31 -0.06
-0.07 0.7 -0.6 -0.25 0.33 -0.83 -0.74 -0.25 -0.13 0.39 0.43 0.14
-0.6 0.07 -0.42 -0.05 0.23 -0.23 -0.35 0.01 0.03 0.43 0.27 0.24
-0.58 0.27 -0.45 -0.51 0.33 -0.61 -0.39 0.07 -0.13 0.57 0.43 0.29
-1.3 -0.16 -0.3 0.12 0.4 -0.32 -0.31 0.05 -0.19 0.51 0.41 0.27
0.15 0.48 -0.16 0.19 -0.18 -0.46 -0.16 -0.16 -0.18 0.04 0.21 -0.0
-0.83 -0.07 -0.6 -0.1 0.0 -0.15 -0.02 0.04 0.03 0.49 0.41 0.29
-0.8 -0.05 -1.39 -0.09 0.57 -0.64 -0.2 -0.79 -0.13 0.68 0.52 0.7
-0.59 0.04 -0.5 -0.4 -0.0 -0.47 -0.48 0.26 0.11 0.49 0.67 0.18
-0.93 -0.19 -0.39 -0.27 0.35 -0.13 -0.24 0.31 0.13 0.39 0.36 0.06
-1.09 -0.18 -0.12 0.03 0.3 -0.3 -0.38 0.27 -0.06 0.36 0.47 0.07
-0.51 -0.33 -0.43 -0.39 -0.07 -0.45 -0.39 0.17 -0.3 0.54 0.8 0.51
-0.42 -0.12 -0.42 -0.42 0.15 -0.73 -0.4 0.07 -0.67 0.29 1.07 0.45
-0.78 -0.49 -1.08 -0.47 0.25 0.09 -0.15 0.17 0.16 0.41 0.4 0.55
-0.32 0.05 -0.55 -0.04 0.07 -0.43 -0.29 -0.14 0.02 0.45 0.4 0.37
-0.37 0.02 -0.52 -0.12 0.13 -0.42 -0.31 0.05 0.16 0.47 0.2 0.34
-0.41 0.12 -0.38 -0.1 0.22 -0.21 -0.35 0.18 -0.08 0.37 0.32 0.02
-0.23 0.03 -0.47 -0.27 0.26 -0.51 -0.3 0.2 -0.32 0.14 0.59 0.38
-0.32 0.39 -0.47 -0.46 0.18 -0.27 -0.32 0.1 -0.18 0.23 0.43 0.27
-0.31 -0.45 -0.52 -0.1 -0.07 -0.31 -0.25 0.07 0.36 0.55 0.31 0.26
-0.39 0.04 -0.47 -0.39 0.15 -0.27 -0.33 0.04 -0.01 0.44 0.46 0.31
-0.88 -0.39 -0.61 -0.47 0.07 0.16 -0.24 0.06 0.14 0.58 0.49 0.34
-0.27 0.06 -1.16 -0.21 0.2 -0.74 -0.42 -0.1 -0.09 0.59 0.56 0.55
-0.31 -0.29 -0.65 -0.4 -0.53 -0.5 -0.25 0.13 0.46 0.62 0.56 0.34
-0.77 -0.09 -0.27 -0.13 0.32 -0.07 -0.13 0.27 -0.14 0.22 0.39 0.02
-0.54 0.27 -0.27 -0.54 0.57 -0.24 -0.11 0.23 -0.77 -0.0 0.8 -0.28
-0.91 -0.43 -0.37 -0.04 0.23 0.07 -0.09 0.18 0.19 0.21 0.33 0.18
-0.55 -0.2 -0.19 -0.22 0.2 0.06 -0.24 0.12 0.05 0.19 0.35 0.18
-0.85 -0.09 -0.07 0.01 0.26 0.03 -0.17 0.12 0.09 0.29 0.16 -0.07
-2.24 -0.65 -0.9 -1.13 0.01 -0.31 0.05 0.42 -0.32 0.8 0.89 0.66
-0.22 0.18 -0.35 -0.48 -0.16 -0.79 -0.54 0.34 -0.03 0.35 0.55 0.44
-0.5 -0.19 -0.67 -0.2 0.35 -0.04 -0.23 0.15 -0.09 0.44 0.3 0.26
-2.65 -0.99 -1.71 -0.93 0.61 0.47 -0.02 0.01 -0.23 0.9 0.69 0.35
-0.43 -0.13 -0.34 -0.38 0.02 0.06 -0.07 0.13 -0.03 0.36 0.28 0.26
-0.55 -0.22 -0.46 -0.31 0.35 0.22 -0.13 -0.05 -0.02 0.32 0.23 0.26
-0.43 0.26 -0.34 -0.38 -0.14 -0.48 -0.25 0.11 -0.23 0.49 0.52 0.34
-2.45 -1.69 -1.03 -0.29 0.49 0.31 0.19 0.35 -0.02 0.5 0.61 0.29
-1.32 -0.39 -0.69 0.04 0.01 -0.01 -0.14 0.2 0.2 0.57 0.46 0.17
-0.59 -0.34 -0.26 -0.24 0.15 0.1 -0.06 0.2 0.1 0.23 0.26 0.18
-0.83 -0.27 -0.07 -0.13 0.24 -0.03 -0.18 0.24 -0.12 0.31 0.31 0.16

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.