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Heatmap: Cluster_23 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
1.28 0.57 -1.0 -1.53 -6.26 -4.13 -1.58 0.07 -0.26 0.72 0.72 0.72
1.26 0.46 -0.47 -2.63 -4.04 -3.3 -0.95 0.09 0.0 0.57 0.68 0.6
0.79 -0.06 -0.15 -0.48 -1.48 -0.56 0.2 0.56 0.31 -0.19 0.05 -0.2
0.43 0.83 0.62 0.06 -0.62 -0.95 -0.67 -0.33 -0.04 -0.12 -0.18 -0.11
0.59 0.53 0.61 0.12 -0.33 -0.69 -0.45 -0.32 -0.22 -0.12 -0.34 -0.13
0.9 0.87 0.39 -0.8 -2.0 -2.62 -1.7 -0.57 -0.17 0.18 0.38 0.78
0.28 -0.02 0.0 -0.75 -1.01 -0.22 0.53 0.63 0.67 0.06 -0.62 -0.78
0.76 0.31 -0.17 -0.93 -1.45 -1.23 -0.52 0.02 0.19 0.22 0.36 0.64
0.39 -0.07 -0.3 -1.48 -1.05 -0.12 0.35 0.53 0.52 0.27 0.0 -0.32
0.44 0.16 -0.2 -1.11 -1.09 -0.49 -0.2 0.4 0.37 0.41 0.25 0.01
0.39 0.0 -0.07 -1.0 -1.13 -0.45 0.02 0.34 0.38 0.41 0.2 -0.02
0.41 0.37 0.03 -0.53 -0.85 -0.3 -0.06 0.15 0.09 0.41 -0.1 -0.14
0.96 0.49 -0.18 -1.32 -1.26 -0.97 -0.54 -0.07 -0.02 0.23 0.34 0.46
0.68 0.65 0.33 -0.42 -1.01 -1.03 -0.65 -0.13 -0.07 0.12 0.15 0.19
0.74 0.17 0.14 -0.51 -0.94 -0.49 -0.1 -0.18 -0.08 0.0 0.09 0.43
0.54 0.42 0.1 -0.47 -0.64 -0.41 -0.41 -0.01 -0.03 0.09 0.12 0.19
0.54 0.33 0.07 -0.44 -0.74 -0.34 0.2 -0.04 -0.03 -0.04 -0.06 0.12
0.42 0.49 0.28 -0.77 -1.43 -1.17 -0.3 0.07 0.31 0.47 0.1 0.11
0.11 0.31 0.43 -0.14 -0.5 -0.29 -0.04 0.23 0.26 -0.2 -0.16 -0.37
0.18 0.52 0.47 0.18 -0.13 -0.73 -0.79 -0.44 -0.18 -0.07 0.07 0.25
0.68 0.29 0.06 -1.06 -1.84 -1.38 -0.92 0.23 0.0 0.29 0.81 0.39
0.93 0.71 0.15 -0.58 -1.37 -1.62 -0.82 -0.04 -0.11 -0.02 0.21 0.44
0.43 0.68 0.69 -0.01 -0.35 -0.2 -0.44 -0.7 -0.3 -0.13 -0.27 -0.18
0.43 0.57 0.51 -0.04 -0.66 -1.08 -0.96 -0.61 -0.27 0.02 0.24 0.56
0.64 0.57 0.24 -0.88 -1.25 -0.97 -0.61 -0.01 0.06 0.21 0.24 0.36
0.82 0.89 0.64 -0.44 -0.81 -0.62 -0.6 -0.21 -0.24 -0.33 -0.33 -0.15
-0.05 0.07 0.22 -0.14 -0.18 -0.02 -0.15 0.22 0.11 -0.07 -0.03 -0.05
0.43 0.16 -0.06 -0.31 -0.23 -0.07 -0.1 -0.08 -0.16 -0.04 0.05 0.22
1.26 0.76 0.05 -1.21 -2.21 -2.29 -0.99 -0.2 -0.3 0.09 0.28 0.63
0.7 0.53 0.21 -0.85 -1.42 -0.94 -0.33 -0.03 0.12 0.12 0.17 0.32
0.68 0.72 0.42 -0.27 -0.93 -1.36 -0.75 0.08 0.08 0.08 -0.02 -0.13
1.36 0.51 -0.23 -2.79 -3.06 -1.98 -0.51 -0.25 -0.33 0.24 0.43 0.83
1.34 0.45 -0.16 -1.93 -2.97 -2.02 -0.87 -0.45 -0.1 0.32 0.39 0.86
0.2 -0.05 0.07 -0.77 -0.59 -0.36 -0.15 0.2 0.25 0.39 0.25 0.08
0.31 0.25 0.08 -0.53 -0.53 -0.34 -0.38 0.2 0.36 0.15 0.09 -0.03
0.77 0.89 0.62 -0.89 -1.72 -1.54 -0.7 -0.16 0.14 0.25 -0.04 -0.08
0.71 0.2 0.06 -0.76 -0.95 -0.38 0.06 0.1 0.17 0.12 0.08 -0.15
0.66 0.32 0.11 -0.88 -0.91 -0.44 -0.33 0.35 0.19 0.13 0.12 -0.18
0.58 0.38 0.12 -0.8 -1.25 -0.83 -0.28 -0.15 0.16 0.27 0.22 0.42
0.7 0.26 -0.02 -0.52 -0.85 -0.33 0.07 0.29 0.23 0.02 -0.23 -0.26
1.37 0.58 -0.54 -2.4 -3.32 -2.62 -0.94 -0.11 0.22 0.35 0.42 0.63
0.5 0.79 0.58 -0.01 -0.56 -0.98 -0.74 -0.13 -0.34 -0.23 0.03 0.02
0.61 0.52 0.33 -0.35 -0.97 -1.17 -0.52 0.01 0.11 0.14 0.06 0.14
0.63 0.62 0.27 -0.48 -0.88 -1.2 -0.78 -0.08 0.09 0.18 0.15 0.23
0.21 -0.08 -0.09 -0.99 -1.04 -0.04 0.35 0.56 0.46 0.27 -0.03 -0.56
0.73 0.53 0.3 -0.59 -0.78 -0.51 -0.36 -0.09 -0.1 0.05 0.01 0.04
0.78 0.45 0.24 -0.78 -1.5 -0.94 -0.32 -0.16 -0.03 -0.04 0.33 0.46
0.42 0.61 0.37 -0.7 -1.1 -0.89 -0.53 0.12 0.18 0.3 0.13 -0.05
1.24 0.4 -0.28 -1.57 -1.98 -1.71 -0.64 0.1 0.12 0.29 0.32 0.4
0.07 -0.05 -0.09 -0.13 -0.2 -0.0 0.27 0.03 0.28 0.12 -0.17 -0.22
0.29 0.32 0.15 -0.49 -0.6 -0.13 0.07 0.18 0.25 0.08 -0.17 -0.29
0.16 0.39 0.14 -0.53 -0.32 -0.26 -0.27 0.28 0.1 0.13 0.09 -0.2
0.82 0.28 -0.2 -0.4 -0.77 -1.01 -0.42 -0.12 0.18 0.1 0.23 0.32
0.72 0.85 0.77 -0.49 -1.51 -1.2 -0.44 -0.37 -0.02 -0.06 -0.16 -0.0
0.79 0.73 0.53 -0.05 -0.89 -1.51 -1.48 -0.89 -0.43 -0.07 0.24 0.62
0.52 0.0 -0.18 -1.13 -1.15 -0.59 -0.01 0.11 0.19 0.36 0.38 0.39
0.78 0.67 0.31 -0.22 -0.47 -0.65 -0.53 -0.06 -0.26 -0.28 -0.1 -0.03
0.56 0.77 0.58 -0.27 -1.28 -1.69 -1.0 -0.25 -0.14 0.1 0.3 0.3
-0.02 0.2 0.18 -0.11 -0.13 0.0 -0.01 0.21 0.07 -0.07 -0.11 -0.31
0.79 0.28 -0.01 -1.56 -1.63 -0.54 0.03 0.42 0.35 0.3 0.01 -0.23
0.88 0.19 0.02 -0.83 -0.81 -0.41 -0.02 0.21 0.11 0.1 -0.17 -0.09
0.41 0.38 0.13 -0.6 -1.44 -1.82 -1.21 -0.35 -0.07 0.42 0.69 0.88
0.69 0.33 0.19 -0.72 -1.57 -1.63 -0.95 -0.46 0.07 0.26 0.54 0.83
0.94 1.1 1.06 0.04 -1.4 -2.93 -2.68 -1.99 -1.14 -0.44 -0.03 0.8
0.78 0.13 -0.29 -0.92 -1.01 -0.64 -0.34 0.05 0.17 0.24 0.25 0.47
0.51 0.11 -0.09 -0.41 -0.6 -0.69 -0.44 0.12 -0.06 0.15 0.45 0.35
0.42 0.09 -0.15 -0.52 -0.55 -0.3 -0.13 0.22 0.04 0.1 0.31 0.13
0.86 0.38 -0.12 -0.8 -1.31 -0.81 -0.19 0.17 0.21 0.14 0.16 0.06
0.39 0.69 0.47 0.07 -0.23 -0.93 -0.95 -0.4 -0.36 -0.06 0.07 0.27
0.28 0.7 0.71 0.23 -0.38 -0.83 -0.74 -0.31 -0.06 -0.17 -0.21 -0.12
0.46 0.41 0.43 -0.1 -0.59 -0.81 -0.39 0.12 -0.01 -0.13 0.1 -0.06
0.78 0.2 0.01 -0.82 -0.65 -0.06 0.22 0.24 0.2 -0.07 -0.37 -0.41
0.72 0.59 0.12 -0.6 -1.06 -0.78 -0.5 -0.14 0.13 0.08 0.01 0.34
0.54 0.47 0.2 -0.19 -0.29 -0.44 -0.41 -0.05 -0.17 -0.06 -0.05 0.07
0.56 0.66 0.65 0.25 -0.5 -0.88 -0.79 -0.54 -0.15 -0.13 -0.2 -0.04
0.88 0.69 0.12 -0.93 -1.39 -1.09 -0.52 -0.12 0.07 0.11 0.1 0.33
0.95 0.92 0.52 0.31 -0.67 -1.72 -1.3 -0.65 -0.29 -0.34 -0.39 0.21
0.44 0.24 -0.34 -0.35 -0.33 -0.12 -0.09 -0.07 0.05 -0.0 0.09 0.24
-0.15 0.53 0.15 -1.99 -1.35 0.28 0.11 1.17 0.38 -0.58 -0.02 -1.3
0.09 0.18 0.18 -0.16 -0.2 -0.09 0.1 0.13 0.13 -0.06 -0.24 -0.15
0.34 0.28 0.32 0.06 -0.3 -0.41 -0.42 -0.39 -0.21 -0.06 0.06 0.37
0.65 0.03 -0.19 -1.02 -1.35 -0.72 -0.07 0.42 0.32 0.32 0.41 -0.11
1.02 0.85 0.59 -0.35 -1.21 -1.16 -0.45 0.04 -0.15 -0.27 -0.38 -0.41
0.59 0.49 0.2 -0.78 -1.06 -0.82 -0.36 -0.09 0.07 0.25 0.17 0.3
0.68 -0.06 -0.32 -1.15 -1.44 -0.68 0.07 0.64 0.51 0.23 0.09 -0.12
1.31 0.35 -0.13 -0.88 -2.07 -2.29 -0.83 -0.05 0.18 0.06 0.22 0.57
0.92 0.86 0.8 -0.07 -0.93 -1.3 -0.97 -0.37 -0.46 -0.37 -0.14 -0.05
1.0 1.39 0.89 -0.0 -0.9 -2.21 -2.06 -0.82 -0.92 -0.61 -0.42 0.06
0.83 0.41 0.14 -0.86 -0.85 -0.42 -0.08 0.01 0.02 0.07 0.03 -0.14
0.7 0.45 0.14 -0.79 -1.27 -0.79 -0.13 0.0 0.19 0.1 0.07 0.21
0.3 0.53 0.43 -0.05 -0.34 -0.54 -0.57 -0.32 -0.18 0.01 0.03 0.19
1.07 0.84 0.6 -0.54 -1.15 -1.3 -0.74 -0.25 -0.28 -0.16 -0.09 -0.06
0.76 0.7 0.41 -0.09 -0.75 -1.26 -0.91 -0.19 -0.11 0.06 0.03 0.0
0.56 0.82 0.64 -0.05 -0.61 -1.0 -0.98 -0.53 -0.35 -0.15 -0.03 0.28
0.5 0.84 0.63 -0.19 -1.02 -1.15 -0.8 -0.2 -0.0 0.05 -0.03 -0.03
1.36 1.28 0.53 -0.68 0.33 -1.71 -1.25 -1.7 -0.51 -0.3 -0.61 -1.08
0.51 0.75 0.37 -0.45 -1.32 -1.95 -1.26 -0.4 -0.11 0.31 0.38 0.64
0.23 0.2 0.08 -0.04 -0.27 -0.09 0.07 0.28 0.08 -0.16 -0.27 -0.25
1.11 0.46 -0.02 -0.76 -1.85 -2.56 -1.26 0.05 0.13 0.15 0.39 0.57
0.75 0.71 0.49 -0.48 -1.28 -1.06 -0.62 -0.09 -0.08 -0.01 0.08 0.12
0.77 0.45 0.5 -0.51 -0.95 -0.81 -0.42 -0.24 0.21 -0.08 -0.13 0.16
1.0 0.51 0.1 -1.3 -1.32 -0.93 -0.47 0.04 -0.08 0.07 0.22 0.33
0.54 0.64 0.38 0.09 -0.17 -0.47 -0.56 -0.53 -0.43 -0.22 -0.13 0.17
0.16 0.23 0.08 -0.1 -0.25 -0.31 -0.09 0.0 0.11 0.16 -0.06 -0.03
0.65 0.5 0.05 -0.86 -1.43 -1.11 -0.54 0.19 0.26 0.43 0.28 0.01
0.71 0.57 -0.13 -0.72 -1.42 -1.64 -0.76 0.33 0.14 0.54 0.37 -0.03
0.9 0.29 -0.43 -1.11 -1.8 -1.3 -0.36 0.23 0.17 0.26 0.45 0.45
0.86 0.16 -0.24 -0.39 -0.3 -0.53 -0.15 -0.19 -0.08 0.05 0.19 0.07
1.08 0.85 0.49 -0.57 -1.11 -1.0 -0.5 -0.16 -0.21 -0.29 -0.15 -0.25
0.77 0.68 0.52 -0.41 -1.24 -0.85 -0.31 -0.07 0.01 -0.19 -0.17 0.01
0.43 0.14 0.04 -0.7 -1.38 -0.66 -0.22 -0.05 0.02 0.34 0.34 0.6
0.76 0.5 0.05 -0.86 -1.46 -1.1 -0.42 -0.18 0.15 0.18 0.22 0.53
0.8 0.52 0.31 -0.88 -1.33 -0.84 -0.29 0.31 0.35 0.23 -0.18 -0.51
0.91 0.66 0.29 -0.35 -0.57 -0.9 -0.41 -0.09 -0.26 -0.07 -0.17 -0.08
0.41 0.58 0.37 -0.35 -0.83 -1.17 -0.66 -0.23 -0.14 0.13 0.23 0.53
0.64 0.58 0.38 -0.84 -0.93 -0.76 -0.35 -0.03 -0.11 0.04 0.11 0.24
0.58 0.55 0.23 -0.18 -0.09 -0.24 -0.29 -0.29 -0.25 -0.1 -0.26 -0.07
0.65 0.12 0.03 -0.75 -1.29 -1.54 -1.03 -0.18 0.41 0.33 0.5 0.68
0.48 0.27 0.01 -0.8 -1.38 -1.43 -0.53 0.1 0.16 0.43 0.42 0.58
0.98 0.32 -0.38 -1.07 -1.36 -0.92 -0.18 -0.01 0.23 0.16 0.29 0.31
1.51 0.9 0.9 -0.23 -1.98 -5.39 -3.4 -0.56 -0.59 -0.51 0.05 0.17
0.54 0.26 -0.31 -1.03 -0.74 -0.42 -0.13 0.07 0.13 0.16 0.25 0.42
0.62 0.49 0.24 -0.78 -1.23 -0.96 -0.48 -0.04 0.1 0.18 0.22 0.38
1.28 0.5 -0.17 -1.01 -2.55 -3.0 -1.33 -0.46 -0.15 0.42 0.36 0.87
0.68 0.54 0.31 -0.66 -1.21 -0.79 -0.2 -0.05 0.03 0.04 0.02 0.2
0.75 0.71 0.89 0.19 -0.72 -0.99 -0.94 -0.52 -0.23 -0.27 -0.22 -0.29
1.09 0.37 -0.4 -1.01 -1.93 -1.61 -0.44 0.39 0.26 0.2 0.18 0.27
0.71 0.53 0.34 -0.72 -1.36 -0.92 -0.31 0.02 0.05 0.01 0.13 0.23
0.66 0.42 0.25 -0.32 -0.79 -1.37 -1.08 -0.52 -0.21 0.16 0.36 0.75
1.09 1.31 0.68 -0.21 -1.24 -1.72 -1.28 -0.89 -0.66 -0.19 -0.48 0.03
0.67 0.31 0.14 -1.15 -1.54 -1.16 -0.72 -0.03 0.18 0.4 0.42 0.52
0.95 0.45 -0.21 -1.08 -1.32 -1.27 -0.43 -0.02 0.02 0.2 0.32 0.5
1.13 0.78 0.47 -0.37 -1.57 -1.9 -0.96 -0.09 -0.23 -0.21 0.09 0.14
1.09 0.34 0.0 -0.85 -1.61 -1.9 -0.73 -0.19 0.11 0.03 0.34 0.68
1.31 0.06 -0.63 -1.0 -2.07 -2.03 -0.22 0.56 0.48 0.26 0.15 -0.31
0.46 0.12 -0.09 -0.58 -0.46 -0.06 0.06 0.05 -0.05 0.02 0.04 0.24
0.59 0.9 0.91 0.31 -0.71 -0.93 -0.77 -0.59 -0.46 -0.42 -0.38 -0.19
0.68 0.95 0.96 0.1 -0.75 -1.6 -1.46 -0.96 -0.48 -0.07 -0.09 0.05
0.2 -0.1 -0.11 -0.62 -0.38 0.05 0.26 0.36 0.26 0.15 -0.06 -0.34
0.69 0.64 0.44 -0.28 -0.4 -0.59 -0.85 -0.43 -0.39 -0.05 0.1 0.17
0.94 0.65 0.36 -0.6 -1.48 -1.37 -0.78 -0.54 -0.32 -0.07 0.27 0.68
0.29 0.24 0.35 0.16 -0.18 -0.17 -0.02 -0.17 -0.12 -0.21 -0.22 -0.13
0.48 0.17 0.24 -0.44 -0.71 -0.36 -0.03 0.2 0.1 -0.03 0.12 -0.15
0.45 0.12 -0.09 -0.17 -0.16 -0.11 -0.09 -0.13 -0.15 -0.15 0.11 0.21
0.53 0.67 0.52 -0.04 -0.49 -0.88 -0.62 0.05 -0.17 -0.16 0.01 -0.27
0.4 0.0 -0.07 -0.94 -1.05 -0.33 0.04 0.42 0.33 0.31 0.18 -0.11
0.75 0.35 0.02 -1.16 -1.48 -0.89 -0.25 0.22 0.21 0.26 0.23 0.21
0.27 0.47 0.63 0.33 -0.05 -0.25 -0.26 -0.25 -0.31 -0.51 -0.37 -0.26
1.4 0.54 -0.12 -1.56 -2.14 -2.07 -1.13 -0.24 -0.21 0.19 0.43 0.62
0.44 0.49 0.19 -0.03 -0.4 -0.64 -0.35 -0.17 -0.12 -0.02 -0.11 0.27
0.54 0.46 0.25 -0.29 -0.47 -0.61 -0.69 -0.29 -0.23 0.05 0.19 0.41
0.67 0.54 0.27 -0.48 -0.92 -0.72 -0.34 -0.16 0.02 -0.12 0.07 0.29
0.51 0.57 0.35 -0.28 -0.57 -0.76 -0.71 -0.12 -0.12 0.0 0.18 0.19
0.76 0.46 0.35 -0.68 -1.23 -1.3 -0.27 0.54 0.04 -0.04 0.29 -0.54
0.61 0.85 0.64 0.06 -0.75 -1.19 -1.04 -0.62 -0.34 -0.12 -0.09 0.31

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.