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Heatmap: Cluster_160 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.13 -0.14 -0.21 -0.19 -0.08 -0.07 0.13 0.07 0.09 0.28 0.11 0.05
1.03 1.1 -0.42 -1.0 -0.28 -1.01 -0.07 0.19 -0.57 -0.38 -0.28 -0.18
1.1 0.75 -0.45 -0.61 -0.42 -0.66 -0.08 -0.02 -0.62 -0.15 -0.1 -0.01
-0.49 0.03 -0.66 -0.73 0.0 -0.48 0.07 0.07 0.45 0.51 0.46 0.08
0.64 0.3 -0.23 -0.24 0.04 -0.01 -0.05 -0.02 -0.03 -0.19 -0.26 -0.24
0.61 0.26 -0.22 -0.14 0.0 -0.21 -0.13 0.2 -0.0 -0.11 -0.35 -0.22
0.43 0.22 -0.31 -0.11 0.13 -0.03 -0.0 0.07 -0.04 -0.13 -0.22 -0.18
-0.93 -0.05 -0.84 0.04 0.02 -0.29 -0.18 -0.05 0.32 0.57 0.48 0.17
0.49 0.24 -0.3 0.02 -0.43 -1.01 -0.29 0.23 0.2 0.23 0.01 0.04
-0.41 0.09 -0.22 -0.18 0.06 -0.12 0.09 -0.11 0.05 0.36 0.03 0.19
-0.22 0.06 -0.42 -0.17 -0.17 -0.43 -0.3 0.12 0.29 0.45 0.28 0.17
0.68 0.36 -0.3 0.02 -0.12 -0.37 -0.25 0.01 -0.02 0.05 -0.18 -0.26
0.14 0.7 -0.39 -0.42 -0.14 -0.57 -0.14 -0.08 0.01 0.29 0.12 0.02
0.57 0.81 -0.29 -0.12 -0.33 -0.52 -0.17 -0.16 -0.31 0.02 -0.15 0.04
0.57 0.44 -0.23 -0.49 -0.29 -0.15 0.02 0.11 -0.11 -0.09 -0.17 0.04
-0.29 0.07 -0.86 -0.53 -0.06 -0.32 -0.18 0.19 0.1 0.64 0.28 0.35
0.1 0.44 -0.27 -0.35 -0.44 -0.56 -0.23 -0.01 0.27 0.42 0.14 0.07
-1.62 -0.26 -1.06 -0.71 -1.01 -0.71 -0.08 0.39 0.85 1.01 0.48 0.23
-0.43 -0.07 -0.74 -0.25 0.02 -0.24 -0.16 0.1 0.15 0.47 0.45 0.22
0.19 0.32 -0.25 -0.02 0.1 -0.2 -0.28 -0.31 -0.08 0.24 -0.09 0.18
-1.49 0.25 -0.72 -0.86 -1.0 -0.31 -0.48 0.11 0.62 1.18 0.35 0.16
1.03 0.91 -0.55 -0.71 -0.89 -0.82 -0.11 0.22 -0.19 -0.21 -0.2 -0.03
0.55 0.28 -0.08 -0.05 -0.47 -0.5 0.07 0.29 -0.06 -0.11 -0.06 -0.21
0.01 0.28 -0.48 0.01 0.09 -0.12 -0.21 0.19 0.26 0.19 -0.34 -0.1
-0.13 0.08 -0.12 0.05 0.07 -0.06 -0.02 0.12 0.08 0.09 -0.11 -0.08
1.02 0.8 -0.75 -0.08 -0.44 -0.81 -0.44 -0.02 -0.19 -0.17 -0.07 -0.07
0.2 0.41 -0.16 -0.02 -0.1 -0.34 -0.2 0.12 -0.04 0.16 -0.1 -0.09
0.63 0.69 -0.36 -0.7 -0.52 -0.66 -0.15 0.15 0.05 0.26 0.05 -0.27
0.89 0.3 -1.04 -0.14 -0.55 -0.36 0.61 0.42 -0.02 -0.22 -0.56 -0.57
1.0 0.24 -0.21 -0.57 -0.84 -0.77 0.06 0.6 -0.29 -0.07 -0.13 -0.16
-0.08 0.21 -0.41 -0.16 0.05 -0.04 0.2 0.43 0.14 0.08 -0.21 -0.47
0.4 0.3 -0.09 0.02 -0.58 -0.99 -0.33 -0.14 -0.03 0.45 0.13 0.24
0.05 0.26 -0.44 -0.36 -0.32 -0.31 -0.1 0.16 0.31 0.36 0.02 0.07
0.2 0.41 -0.23 -0.0 0.32 -0.02 -0.13 0.09 -0.2 -0.21 -0.3 -0.12
0.11 0.27 -0.56 0.06 0.21 -0.43 -0.11 0.19 -0.08 0.16 -0.01 -0.06
0.82 0.54 -0.29 -0.14 -0.09 -0.29 -0.54 -0.16 -0.17 -0.0 -0.17 -0.09
0.1 0.25 -0.2 0.17 0.13 -0.34 -0.21 0.13 -0.03 0.08 -0.07 -0.13
1.01 0.43 -0.05 -0.29 -0.48 -0.81 -0.26 -0.07 0.18 0.75 -1.64 -0.65
0.88 0.76 -0.4 -0.19 -0.21 -0.61 -0.31 -0.17 -0.36 -0.02 -0.18 -0.05
-0.79 -0.68 -2.02 -4.52 -2.55 -1.53 -0.44 -0.94 1.09 1.69 0.83 0.67
0.13 0.26 -0.34 -0.25 0.06 -0.24 -0.27 0.13 0.19 0.28 -0.22 0.07
0.51 -0.03 -0.48 -0.0 0.05 -0.24 0.27 -0.09 0.01 0.26 -0.63 0.02
-0.36 0.1 -0.35 -0.09 0.2 -0.07 -0.08 0.06 0.04 0.28 0.15 -0.02
-0.74 -0.12 -0.79 -0.74 0.09 0.06 0.47 0.05 0.02 0.3 0.44 0.23
0.78 0.57 -0.31 -0.42 -0.29 -0.36 0.1 0.46 0.12 -0.3 -0.6 -0.67
-0.21 0.11 -0.2 -0.41 -0.11 -0.17 -0.42 0.14 0.3 0.42 0.23 0.03
1.36 0.81 -0.57 -0.03 -0.25 -0.66 -0.45 -0.23 0.01 -0.65 -0.66 -0.57
-0.77 0.29 -0.38 -0.24 0.17 0.09 -0.28 -0.09 0.09 0.49 -0.01 0.23
-0.11 0.13 -0.2 -0.19 0.11 -0.13 -0.31 0.1 0.15 0.24 0.1 -0.01
-0.17 0.1 -0.7 -0.4 0.12 -0.16 -0.19 0.14 0.02 0.4 0.31 0.18
-0.06 0.2 -0.27 -0.24 -0.03 -0.28 -0.29 0.13 0.1 0.35 0.2 0.01
0.27 0.28 -0.3 -0.1 0.14 -0.11 0.05 0.34 0.02 0.01 -0.25 -0.63
0.12 0.29 -0.41 -0.74 -0.52 -0.49 0.28 0.18 0.42 0.23 0.13 -0.05
0.73 0.53 -0.38 -0.33 -0.29 -0.3 0.01 0.29 0.07 -0.08 -0.32 -0.52
-0.1 0.23 -0.87 -0.65 -1.1 0.15 -0.08 0.37 0.8 0.54 0.36 -1.27
0.04 0.18 -0.63 -0.21 -0.28 -0.35 -0.17 0.09 0.5 0.31 0.11 0.06
0.43 0.51 -0.35 0.07 0.21 -0.08 -0.18 -0.13 -0.18 -0.1 -0.28 -0.22
0.39 0.3 -0.55 -0.21 -0.4 -0.83 -0.18 0.01 0.5 0.24 -0.1 0.23
0.44 0.44 -0.21 -0.04 0.07 -0.28 -0.33 -0.07 -0.05 0.06 -0.09 -0.18
0.48 0.45 -0.05 -0.18 -0.06 -0.33 -0.31 -0.09 0.02 0.07 -0.16 -0.11
-0.79 -0.01 -0.57 -0.36 0.28 -0.08 -0.23 0.03 0.3 0.47 0.09 0.34
-0.05 -0.03 -0.33 -0.49 -0.16 -0.19 -0.22 0.23 0.25 0.37 0.19 0.16
0.26 0.29 -0.4 -0.12 0.23 -0.05 0.07 0.21 -0.07 -0.01 -0.21 -0.41
-0.3 0.11 -0.21 -0.2 0.03 -0.21 -0.07 -0.54 0.03 0.59 0.11 0.31
0.12 0.15 -0.1 0.04 0.06 -0.07 -0.17 0.17 -0.1 -0.01 -0.07 -0.08
0.37 0.01 -0.45 0.04 0.06 0.08 0.04 0.12 -0.02 0.06 -0.3 -0.19
0.8 0.56 -0.21 -0.32 -0.1 -0.33 -0.11 -0.05 -0.17 -0.21 -0.27 -0.12
1.06 0.79 -0.1 -0.53 -0.39 -0.55 -0.28 -0.15 -0.24 -0.21 -0.34 -0.18
0.23 0.55 0.04 -0.42 0.03 -0.87 -0.27 -0.3 0.03 0.42 0.06 -0.02
- -2.59 - - - -1.7 -0.96 0.77 1.26 1.69 0.94 0.82
1.33 0.84 -0.5 0.25 -0.45 -1.3 -0.43 -0.01 -0.01 -0.47 -0.74 -0.68
0.32 0.53 -0.28 -0.09 0.12 -0.53 -0.34 -0.06 -0.06 0.23 -0.22 0.03
-0.33 0.03 -0.61 -0.43 0.07 -0.2 0.03 0.34 0.18 0.5 0.12 -0.07
0.43 0.2 -0.39 -0.15 -0.0 -0.14 -0.11 0.04 0.09 0.17 -0.21 -0.11
0.22 0.23 -0.13 -0.14 -0.11 -0.4 -0.35 -0.13 -0.01 0.28 0.13 0.22
-0.06 0.18 -0.24 0.11 0.19 -0.0 -0.16 -0.0 0.07 0.19 -0.14 -0.24
0.32 0.27 -0.69 0.06 -0.37 -0.26 0.11 0.14 0.06 0.33 -0.17 -0.14
0.8 0.81 -1.16 -0.15 0.1 -1.06 0.27 -0.01 -0.45 -0.49 -0.22 0.14
0.09 0.08 -0.09 -0.3 -0.13 -0.14 -0.09 0.23 0.13 0.17 0.02 -0.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.