Heatmap: Cluster_19 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.77 1.0 0.61 0.52 0.58 0.35 0.45 0.44 0.5 0.71 0.6 0.69
0.85 1.0 0.63 0.38 0.27 0.2 0.21 0.33 0.3 0.33 0.28 0.4
1.0 0.76 0.56 0.75 0.48 0.28 0.37 0.43 0.49 0.42 0.34 0.53
0.54 1.0 0.54 0.71 0.39 0.25 0.23 0.37 0.26 0.22 0.31 0.33
0.88 1.0 0.63 0.6 0.54 0.41 0.47 0.43 0.58 0.55 0.54 0.78
0.87 1.0 0.39 0.19 0.18 0.06 0.12 0.26 0.2 0.21 0.28 0.34
1.0 1.0 0.86 0.74 0.4 0.46 0.64 0.58 0.5 0.49 0.51 0.59
0.78 1.0 0.42 0.8 0.58 0.37 0.38 0.39 0.41 0.49 0.49 0.86
0.85 1.0 0.62 0.6 0.65 0.49 0.5 0.67 0.5 0.64 0.72 0.79
0.62 1.0 0.43 0.38 0.18 0.07 0.12 0.17 0.24 0.31 0.28 0.42
0.82 1.0 0.63 0.54 0.56 0.59 0.48 0.46 0.61 0.61 0.43 0.45
1.0 0.92 0.51 0.61 0.57 0.31 0.43 0.38 0.42 0.43 0.36 0.5
0.76 1.0 0.61 0.76 0.68 0.45 0.54 0.54 0.53 0.61 0.45 0.63
1.0 0.91 0.66 0.64 0.72 0.62 0.63 0.6 0.69 0.74 0.79 0.73
1.0 0.85 0.2 0.17 0.02 0.0 0.06 0.04 0.1 0.22 0.08 0.2
1.0 0.9 0.46 0.54 0.37 0.33 0.39 0.53 0.62 0.46 0.38 0.51
0.63 1.0 0.42 0.38 0.42 0.2 0.13 0.22 0.22 0.33 0.35 0.48
0.9 1.0 0.53 0.43 0.41 0.33 0.28 0.4 0.31 0.3 0.3 0.39
0.81 1.0 0.44 0.63 0.56 0.3 0.26 0.25 0.42 0.6 0.53 0.49
0.76 1.0 0.33 0.32 0.33 0.25 0.2 0.21 0.33 0.3 0.23 0.33
0.92 1.0 0.64 0.71 0.68 0.41 0.45 0.52 0.48 0.64 0.62 0.78
1.0 0.81 0.16 0.07 0.12 0.0 0.0 0.07 0.13 0.39 0.71 0.48
0.96 1.0 0.43 0.71 0.43 0.3 0.45 0.45 0.56 0.59 0.47 0.59
0.85 1.0 0.41 0.65 0.57 0.31 0.34 0.42 0.39 0.43 0.36 0.54
0.97 1.0 0.64 0.81 0.51 0.27 0.48 0.67 0.49 0.38 0.42 0.7
0.71 0.98 1.0 0.67 0.42 0.45 0.56 0.52 0.58 0.43 0.47 0.5
1.0 0.79 0.66 0.81 0.6 0.63 0.6 0.54 0.57 0.54 0.57 0.52
0.56 1.0 0.54 0.73 0.55 0.3 0.32 0.21 0.28 0.45 0.54 0.81
0.8 1.0 0.24 0.52 0.41 0.18 0.23 0.22 0.35 0.51 0.55 0.94
0.73 1.0 0.24 0.33 0.16 0.11 0.24 0.26 0.34 0.5 0.33 0.49
1.0 0.66 0.24 0.26 0.18 0.12 0.07 0.34 0.4 0.33 0.31 0.51
1.0 1.0 0.69 0.77 0.63 0.55 0.64 0.55 0.77 0.87 0.6 0.83
0.67 1.0 0.56 0.33 0.29 0.14 0.25 0.26 0.28 0.26 0.26 0.38
0.83 1.0 0.56 0.5 0.27 0.14 0.26 0.37 0.36 0.4 0.47 0.69
1.0 0.98 0.57 0.68 0.54 0.35 0.38 0.51 0.52 0.53 0.46 0.46
0.5 1.0 0.36 0.77 0.43 0.22 0.16 0.33 0.36 0.65 0.6 0.72
1.0 0.96 0.66 0.63 0.63 0.53 0.56 0.61 0.52 0.59 0.54 0.64
0.69 1.0 0.18 0.33 0.08 0.03 0.06 0.18 0.34 0.39 0.38 0.57
0.52 1.0 0.29 0.49 0.3 0.22 0.06 0.09 0.06 0.13 0.07 0.28
0.89 1.0 0.31 0.47 0.39 0.31 0.32 0.31 0.29 0.41 0.35 0.65
0.62 1.0 0.53 0.52 0.26 0.16 0.24 0.26 0.28 0.21 0.21 0.39
0.95 1.0 0.53 0.66 0.44 0.46 0.43 0.38 0.49 0.58 0.3 0.44
0.91 1.0 0.39 0.43 0.18 0.05 0.06 0.19 0.11 0.12 0.14 0.3
1.0 0.82 0.32 0.61 0.32 0.24 0.2 0.28 0.37 0.47 0.34 0.65
0.96 1.0 0.46 0.56 0.66 0.46 0.37 0.46 0.34 0.4 0.46 0.62
1.0 0.98 0.37 0.8 0.49 0.27 0.43 0.42 0.64 0.47 0.36 0.47
0.96 1.0 0.9 0.62 0.73 0.73 0.68 0.75 0.71 0.74 0.68 0.55
0.84 1.0 0.66 0.9 0.59 0.34 0.45 0.51 0.63 0.71 0.75 0.9
0.88 1.0 0.29 0.57 0.51 0.19 0.29 0.27 0.32 0.48 0.48 0.89
1.0 0.73 0.23 0.25 0.14 0.13 0.3 0.38 0.67 0.55 0.47 0.67
1.0 0.99 0.49 0.67 0.38 0.24 0.52 0.43 0.67 0.56 0.61 0.63
0.59 1.0 0.39 0.51 0.33 0.21 0.25 0.3 0.33 0.37 0.39 0.48
0.97 1.0 0.48 0.71 0.52 0.41 0.47 0.46 0.52 0.66 0.78 0.81
0.78 1.0 0.45 0.55 0.39 0.41 0.31 0.29 0.26 0.35 0.5 0.34
0.48 1.0 0.32 0.5 0.42 0.31 0.2 0.24 0.27 0.2 0.2 0.24
0.82 1.0 0.31 0.47 0.45 0.24 0.33 0.3 0.37 0.43 0.4 0.44
0.73 1.0 0.49 0.73 0.49 0.28 0.4 0.34 0.46 0.65 0.49 0.77
0.67 1.0 0.46 0.51 0.37 0.21 0.2 0.38 0.32 0.64 0.54 0.6
0.65 1.0 0.53 0.46 0.52 0.37 0.33 0.41 0.36 0.46 0.51 0.69
1.0 0.83 0.49 0.84 0.59 0.39 0.51 0.41 0.51 0.48 0.47 0.66
1.0 0.85 0.61 0.61 0.57 0.44 0.41 0.48 0.62 0.6 0.44 0.66
1.0 0.95 0.54 0.51 0.32 0.38 0.47 0.33 0.29 0.37 0.29 0.31
0.95 1.0 0.68 0.76 0.72 0.56 0.61 0.63 0.56 0.59 0.56 0.71
0.94 1.0 0.76 0.75 0.67 0.5 0.6 0.64 0.68 0.79 0.67 0.76
0.95 1.0 0.21 0.56 0.21 0.06 0.22 0.12 0.25 0.53 0.35 0.41
0.81 1.0 0.47 0.83 0.42 0.15 0.18 0.3 0.39 0.45 0.61 0.71
0.96 1.0 0.65 0.74 0.69 0.52 0.55 0.68 0.64 0.6 0.61 0.87
0.76 1.0 0.48 0.61 0.67 0.41 0.32 0.31 0.38 0.39 0.34 0.37
1.0 0.83 0.42 0.64 0.41 0.15 0.25 0.34 0.28 0.13 0.18 0.28
0.97 1.0 0.29 0.54 0.41 0.24 0.37 0.34 0.73 0.74 0.39 0.75
0.84 0.88 1.0 0.61 0.86 0.78 0.83 0.68 0.69 0.61 0.63 0.49
1.0 0.83 0.53 0.4 0.34 0.28 0.29 0.29 0.34 0.36 0.39 0.41
0.98 1.0 0.54 0.7 0.77 0.68 0.78 0.62 0.57 0.64 0.59 0.81
1.0 0.96 0.35 0.54 0.27 0.24 0.41 0.51 0.55 0.49 0.42 0.64
1.0 0.85 0.3 0.74 0.36 0.07 0.17 0.35 0.32 0.3 0.29 0.39
0.7 1.0 0.44 0.42 0.25 0.2 0.19 0.39 0.46 0.57 0.59 0.58
1.0 1.0 0.22 0.32 0.1 0.02 0.07 0.2 0.23 0.26 0.23 0.41
1.0 0.83 0.32 0.5 0.47 0.3 0.38 0.35 0.44 0.56 0.48 0.61
0.7 1.0 0.29 0.61 0.24 0.19 0.06 0.16 0.38 0.54 0.49 0.67
0.62 1.0 0.33 0.64 0.48 0.13 0.26 0.26 0.52 0.53 0.33 0.55
1.0 0.94 0.57 0.26 0.28 0.29 0.3 0.56 0.41 0.28 0.35 0.46
0.8 1.0 0.62 0.46 0.48 0.45 0.55 0.52 0.4 0.52 0.68 0.47
1.0 0.78 0.4 0.59 0.37 0.23 0.33 0.4 0.47 0.48 0.42 0.52
1.0 0.87 0.47 0.52 0.38 0.23 0.31 0.39 0.47 0.4 0.33 0.52
1.0 0.96 0.27 0.67 0.06 0.01 0.05 0.18 0.23 0.11 0.32 0.61
0.99 1.0 0.34 0.7 0.55 0.32 0.37 0.38 0.45 0.47 0.36 0.65
0.89 1.0 0.44 0.63 0.57 0.35 0.43 0.5 0.46 0.4 0.45 0.68
0.69 1.0 0.31 0.08 0.09 0.06 0.04 0.09 0.06 0.03 0.03 0.04
0.57 1.0 0.43 0.48 0.37 0.47 0.31 0.15 0.16 0.2 0.09 0.12
1.0 0.92 0.28 0.12 0.12 0.16 0.35 0.3 0.45 0.44 0.29 0.58
0.88 1.0 0.35 0.09 0.06 0.08 0.13 0.29 0.28 0.34 0.23 0.26
0.79 1.0 0.35 0.36 0.0 0.0 0.0 0.24 0.16 0.0 0.17 0.0
0.86 0.96 0.43 0.97 0.67 0.45 0.44 0.54 0.7 0.66 0.69 1.0
0.87 1.0 0.47 0.69 0.46 0.3 0.2 0.24 0.32 0.43 0.41 0.57
0.68 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.91 0.92 0.36 0.82 0.4 0.11 0.17 0.32 0.51 0.58 0.6 1.0
1.0 0.94 0.82 0.75 0.74 0.88 0.73 0.77 0.56 0.71 0.5 0.58
0.9 1.0 0.46 0.77 0.43 0.19 0.16 0.19 0.16 0.11 0.09 0.17
1.0 0.9 0.61 0.6 0.64 0.61 0.57 0.64 0.86 0.81 0.67 0.77
0.8 1.0 0.25 0.55 0.39 0.17 0.22 0.29 0.39 0.43 0.39 0.57
0.83 1.0 0.29 0.43 0.46 0.18 0.22 0.36 0.32 0.42 0.48 0.55
0.61 1.0 0.22 0.31 0.41 0.14 0.2 0.34 0.19 0.32 0.47 0.49
0.89 1.0 0.47 0.8 0.51 0.24 0.18 0.22 0.27 0.26 0.31 0.45
1.0 0.98 0.28 0.17 0.08 0.02 0.02 0.15 0.2 0.18 0.27 0.57
0.98 1.0 0.38 0.33 0.18 0.29 0.35 0.35 0.45 0.4 0.4 0.47
0.95 1.0 0.72 0.77 0.65 0.6 0.69 0.84 0.66 0.67 0.73 0.67
1.0 0.88 0.49 0.55 0.52 0.45 0.4 0.57 0.57 0.58 0.46 0.4
0.8 1.0 0.54 0.27 0.06 0.0 0.02 0.07 0.11 0.15 0.23 0.47
0.91 1.0 0.42 0.62 0.52 0.34 0.47 0.47 0.43 0.56 0.55 0.66
0.77 1.0 0.74 0.5 0.43 0.25 0.36 0.28 0.19 0.21 0.31 0.45
0.65 1.0 0.4 0.29 0.41 0.23 0.31 0.39 0.26 0.27 0.3 0.43
0.62 1.0 0.2 0.16 0.27 0.24 0.25 0.32 0.15 0.22 0.4 0.46
1.0 0.88 0.42 0.65 0.52 0.28 0.31 0.4 0.42 0.36 0.27 0.4
0.99 1.0 0.37 0.62 0.52 0.27 0.33 0.36 0.3 0.23 0.23 0.32
1.0 0.98 0.63 0.61 0.58 0.47 0.41 0.49 0.66 0.87 0.65 0.71
0.44 1.0 0.14 0.17 0.19 0.05 0.0 0.0 0.05 0.04 0.16 0.18
1.0 0.56 0.27 0.03 0.27 0.15 0.27 0.22 0.39 0.45 0.34 0.45
0.79 1.0 0.68 0.97 0.54 0.28 0.4 0.51 0.5 0.66 0.67 0.8
0.7 1.0 0.34 0.56 0.28 0.2 0.36 0.35 0.62 0.65 0.52 0.64
0.8 1.0 0.4 0.54 0.34 0.17 0.55 0.53 0.57 0.49 0.57 0.58
0.92 1.0 0.23 0.2 0.08 0.03 0.06 0.15 0.17 0.09 0.1 0.15
0.9 1.0 0.41 0.81 0.44 0.24 0.33 0.37 0.53 0.38 0.3 0.45
0.94 1.0 0.54 0.57 0.57 0.24 0.3 0.38 0.48 0.51 0.46 0.71
1.0 0.85 0.29 0.39 0.14 0.08 0.3 0.36 0.41 0.5 0.42 0.48
1.0 0.98 0.5 0.57 0.5 0.27 0.31 0.31 0.4 0.45 0.34 0.46
1.0 0.82 0.36 0.49 0.34 0.15 0.3 0.37 0.42 0.51 0.54 0.68
0.98 0.99 0.55 1.0 0.44 0.14 0.39 0.54 0.51 0.52 0.42 0.61
0.98 1.0 0.59 0.97 0.42 0.11 0.23 0.4 0.46 0.38 0.5 0.62
0.93 1.0 0.7 0.51 0.27 0.32 0.37 0.43 0.44 0.48 0.49 0.58
0.99 1.0 0.66 0.72 0.69 0.58 0.64 0.78 0.68 0.64 0.6 0.63
1.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.97 1.0 0.46 0.87 0.46 0.16 0.16 0.19 0.19 0.15 0.17 0.33
1.0 1.0 0.83 0.79 0.72 0.52 0.61 0.6 0.66 0.71 0.67 0.8
0.95 1.0 0.17 0.27 0.12 0.03 0.14 0.14 0.18 0.33 0.41 0.53
0.95 1.0 0.42 0.69 0.72 0.35 0.4 0.49 0.51 0.51 0.59 0.73
0.82 1.0 0.33 0.43 0.29 0.13 0.15 0.26 0.32 0.27 0.21 0.24
1.0 0.93 0.3 0.63 0.36 0.22 0.23 0.35 0.39 0.5 0.43 0.59
0.98 1.0 0.53 0.66 0.48 0.29 0.41 0.32 0.56 0.49 0.53 0.69
1.0 0.82 0.53 0.77 0.42 0.22 0.31 0.3 0.31 0.24 0.21 0.36
0.72 1.0 0.44 0.54 0.3 0.19 0.31 0.47 0.53 0.33 0.36 0.55
0.88 1.0 0.47 0.76 0.46 0.19 0.3 0.3 0.41 0.43 0.34 0.55
1.0 0.85 0.55 0.61 0.55 0.34 0.47 0.5 0.45 0.59 0.43 0.43
1.0 0.94 0.67 0.66 0.63 0.51 0.5 0.6 0.52 0.52 0.48 0.57
1.0 0.81 0.33 0.75 0.18 0.04 0.13 0.21 0.17 0.05 0.21 0.45
0.7 1.0 0.27 0.19 0.12 0.06 0.15 0.13 0.25 0.36 0.37 0.57
1.0 0.89 0.64 0.79 0.69 0.48 0.53 0.51 0.59 0.56 0.46 0.58
0.3 1.0 0.12 0.4 0.33 0.11 0.06 0.11 0.18 0.24 0.08 0.34
1.0 0.71 0.37 0.63 0.36 0.13 0.16 0.16 0.31 0.34 0.25 0.35
0.75 1.0 0.31 0.48 0.42 0.18 0.29 0.35 0.36 0.47 0.44 0.62
0.84 1.0 0.56 0.64 0.55 0.28 0.47 0.38 0.31 0.33 0.39 0.59
0.79 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19
0.98 1.0 0.37 0.36 0.12 0.11 0.25 0.47 0.47 0.59 0.49 0.62
1.0 0.91 0.0 0.01 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.76 0.26 0.32 0.44 0.28 0.34 0.47 0.29 0.25 0.36 0.34
1.0 0.9 0.21 0.27 0.47 0.26 0.38 0.55 0.23 0.22 0.35 0.31

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)