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Heatmap: Cluster_88 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-2.31 -0.83 -0.89 -0.35 0.06 -0.05 0.32 0.48 0.74 0.72 0.08 -0.17
-2.5 -1.27 -0.71 -0.27 0.09 0.03 0.24 0.63 0.35 0.6 0.5 -0.08
-1.29 -1.2 -1.11 -0.73 -0.29 0.08 0.62 0.45 0.66 0.78 0.18 -0.18
-0.89 -0.92 -0.61 -0.28 0.06 0.04 0.08 0.48 0.43 0.48 0.29 -0.04
-0.76 -0.67 -0.38 -0.41 -0.0 -0.05 0.22 0.45 0.53 0.43 0.09 -0.14
-0.85 -0.66 -0.51 -0.26 -0.02 -0.04 0.07 0.42 0.26 0.44 0.41 0.08
-3.63 -1.23 -0.88 -0.22 0.0 0.33 0.17 0.29 0.67 0.71 0.28 0.08
-0.32 -0.51 -0.82 -0.3 -0.11 -0.01 0.28 0.52 0.44 0.39 0.02 -0.19
-0.87 -0.72 -0.65 -0.48 -0.25 0.25 0.34 0.38 0.49 0.41 0.18 0.06
-1.33 -1.33 -0.88 -0.42 -0.17 0.23 0.57 0.62 0.57 0.46 0.13 -0.21
-1.35 -0.87 -0.83 -0.44 -0.06 -0.1 0.36 0.54 0.57 0.65 0.1 -0.02
-2.14 -2.31 -1.75 -0.73 -0.62 0.12 0.77 1.03 0.9 0.75 -0.12 -0.47
-2.0 -1.61 -1.03 -0.62 -0.26 -0.18 0.29 0.95 0.74 0.74 0.34 -0.3
-1.44 -0.89 -0.74 -0.45 0.02 0.2 0.32 0.46 0.39 0.48 0.3 0.05
-1.27 -1.34 -1.15 -0.64 -0.24 -0.15 0.36 0.65 0.7 0.69 0.18 0.18
-0.6 -0.5 -0.31 -0.28 0.02 -0.11 0.11 0.22 0.42 0.3 0.35 -0.04
-0.59 -0.67 -0.49 -0.45 -0.12 0.15 0.44 0.47 0.52 0.3 -0.09 -0.17
-2.73 -1.21 -1.2 -0.05 -0.04 -0.16 0.46 0.54 0.55 0.82 0.27 -0.19
-2.33 -1.61 -1.05 -0.47 -0.19 0.01 0.45 0.66 0.59 0.71 0.38 -0.02
-1.47 -0.73 -0.64 -0.52 0.03 0.02 0.27 0.58 0.34 0.51 0.2 0.16
-1.43 -0.83 -0.66 -0.38 0.01 0.16 0.15 0.39 0.4 0.58 0.24 0.16
-1.59 -1.09 -0.74 -0.43 0.01 -0.06 -0.01 0.57 0.43 0.61 0.58 0.06
-3.74 -3.75 -2.31 -1.07 -0.65 -0.18 0.79 1.05 1.04 1.07 0.1 -0.66
-1.65 -0.89 -0.62 -0.36 0.03 0.21 0.12 0.17 0.47 0.6 0.4 0.13
-1.47 -0.69 -0.73 -0.45 -0.24 0.01 0.39 0.2 0.65 0.73 0.15 0.05
-1.71 -1.39 -0.88 -0.53 0.08 0.22 0.03 0.61 0.5 0.74 0.44 -0.21
-0.97 -0.88 -0.68 -0.41 -0.07 0.03 0.19 0.6 0.32 0.45 0.35 0.05
-3.58 -2.48 -1.05 -0.05 -0.39 0.12 0.79 0.47 0.78 0.58 0.11 0.04
-3.6 -3.36 -1.93 -0.54 -0.26 0.19 1.05 0.76 0.76 0.85 -0.02 -0.6
-0.95 -0.7 -0.68 -0.34 -0.01 0.04 0.24 0.56 0.43 0.56 0.07 -0.13
-0.55 -0.54 -0.59 -0.3 -0.08 0.01 0.08 0.31 0.45 0.45 0.22 0.01
-2.11 -2.49 -1.75 -0.89 -0.42 -0.13 0.54 0.83 0.94 0.87 0.26 -0.12
-0.61 -0.54 -0.63 -0.63 -0.04 -0.02 0.19 0.42 0.33 0.53 0.25 0.06
-1.17 -1.03 -0.76 -0.53 -0.13 -0.0 0.3 0.54 0.54 0.61 0.23 0.05
-4.14 -3.17 -1.45 -0.42 -0.02 -0.09 0.89 0.33 0.79 0.81 0.31 -0.07
-3.46 -1.69 -1.06 -0.81 -0.02 0.41 0.45 0.4 0.72 0.68 0.34 0.05
-0.85 -0.7 -0.6 -0.48 -0.04 -0.07 0.15 0.64 0.43 0.43 0.32 -0.12
-5.29 -2.42 -0.9 -0.54 -0.1 0.23 0.49 0.61 0.74 0.65 0.36 -0.01
-1.74 -2.21 -1.45 -0.71 -0.18 0.22 0.6 0.8 0.56 0.66 0.31 -0.15
-0.72 -0.55 -0.62 -0.26 -0.12 0.04 0.11 0.3 0.35 0.43 0.36 0.1
-2.87 -1.48 -0.92 -0.6 -0.21 0.05 0.28 0.58 0.72 0.83 0.41 -0.08
-1.29 -0.86 -0.73 -0.32 -0.07 0.03 0.47 0.61 0.63 0.48 -0.06 -0.23
-3.71 -2.13 -1.32 -0.68 -0.03 0.02 0.59 0.93 0.93 0.77 0.01 -0.63
-0.91 -0.8 -1.25 -0.61 -0.3 0.09 0.12 0.35 0.65 0.72 0.46 0.01
-1.92 -0.71 -0.92 -0.93 -0.28 -0.1 0.6 0.62 0.67 0.77 0.09 -0.13
-2.18 -1.09 -0.57 -0.37 0.04 0.11 0.3 0.77 0.55 0.48 0.2 -0.31
-2.04 -1.64 -1.37 -0.53 -0.16 0.05 0.76 0.62 0.7 0.71 0.15 -0.28
-3.49 -1.73 -0.96 -0.44 -0.32 0.13 0.61 0.65 0.71 0.62 0.38 -0.18
-2.31 -0.94 -0.69 -0.33 0.08 -0.05 0.14 0.42 0.65 0.68 0.25 0.06
-2.24 -1.47 -1.07 -0.24 0.04 0.13 0.42 0.64 0.64 0.6 0.12 -0.11
-0.83 -0.79 -0.62 -0.35 -0.02 0.16 0.19 0.34 0.38 0.47 0.25 0.06
-1.34 -0.91 -0.92 0.08 -0.06 -0.05 0.24 0.3 0.62 0.66 -0.07 0.11
-0.99 -0.8 -1.16 -0.39 -0.11 0.26 0.34 0.48 0.32 0.54 0.14 0.17
-5.1 -2.24 -0.77 -1.43 0.08 0.14 0.22 0.46 0.85 0.43 0.74 0.36
-1.81 -0.96 -0.82 0.05 -0.15 -0.02 0.45 0.39 0.52 0.53 0.18 0.03
-4.13 -1.45 -1.01 -0.01 -0.03 0.01 0.52 0.64 0.59 0.75 -0.08 -0.03
-0.63 -0.53 -0.55 -0.23 -0.11 -0.04 0.08 0.33 0.44 0.33 0.25 0.14
-1.68 -1.16 -1.05 -0.18 -0.15 0.02 0.67 0.72 0.71 0.54 -0.15 -0.44
-3.32 -1.99 -1.3 -0.97 -0.29 0.16 0.32 0.65 0.58 0.88 0.65 0.1
-1.46 -0.94 -0.75 -0.16 -0.09 -0.12 0.29 0.72 0.74 0.53 0.08 -0.46
-1.68 -1.0 -0.65 -0.49 -0.02 0.11 0.29 0.49 0.51 0.55 0.22 0.14
-2.26 -0.92 -0.65 -0.22 0.01 0.28 0.4 0.52 0.52 0.51 0.12 -0.24
-2.45 -1.7 -1.31 -0.88 0.06 -0.12 0.37 0.79 0.81 0.78 0.33 -0.25
-3.6 -3.4 -2.41 -0.8 -0.46 0.03 0.77 0.74 0.79 0.82 0.43 0.15
-2.82 -2.56 -1.87 -1.0 -0.06 -0.12 0.22 0.69 0.85 1.06 0.45 0.01
-3.48 -1.51 -1.49 0.04 0.07 -0.05 0.33 0.65 0.57 0.78 0.08 0.13
-0.74 -0.56 -0.45 -0.49 -0.14 -0.27 0.33 0.43 0.49 0.55 0.08 0.01
-2.25 -1.1 -0.4 -0.04 -0.26 0.1 0.35 0.49 0.7 0.59 -0.04 -0.14
-2.17 -1.51 -1.01 -0.65 -0.31 -0.5 0.23 0.78 0.91 0.89 0.3 -0.09
-2.8 -2.14 -1.02 -0.58 -0.14 0.12 0.52 0.62 0.71 0.7 0.35 -0.05
-2.39 -2.73 -1.57 -0.84 -0.16 -0.01 0.47 0.86 0.76 0.85 0.4 -0.23
-1.04 -0.39 -0.32 -0.15 0.05 0.04 0.24 0.27 0.2 0.31 0.22 0.06
-1.58 -0.9 -0.95 -0.36 0.11 0.14 0.31 0.38 0.35 0.59 0.38 0.04
-0.52 -0.49 -0.45 -0.23 -0.16 -0.17 0.13 0.31 0.49 0.48 0.12 -0.02
-1.95 -0.84 -0.83 -0.28 0.0 0.15 0.31 0.5 0.38 0.64 0.27 -0.05
-0.9 -0.64 -0.18 -0.3 0.1 -0.01 0.14 0.31 0.44 0.36 0.19 -0.08
-1.22 -1.32 -0.99 -0.73 -0.23 0.29 0.54 0.56 0.5 0.63 0.24 -0.11
-1.8 -0.9 -1.08 -0.29 -0.05 0.22 0.49 0.44 0.2 0.65 0.16 0.21
-1.58 -1.54 -0.92 -0.23 -0.3 -0.08 0.54 0.61 0.96 0.54 -0.1 -0.2
-1.36 -0.99 -0.72 0.05 -0.11 -0.41 0.27 0.46 0.57 0.55 0.23 0.1
-1.51 -1.02 -0.86 -0.58 -0.22 -0.25 -0.16 0.86 0.91 0.74 0.1 -0.16
-2.18 -1.0 -0.69 -0.51 -0.2 0.09 0.43 0.46 0.71 0.56 0.2 0.07
-2.53 -1.17 -0.74 -0.36 0.07 0.22 0.53 0.49 0.57 0.62 -0.02 -0.12
-3.68 -2.49 -1.77 -0.86 0.1 0.5 0.66 0.79 0.81 0.65 -0.01 -0.35
-1.99 -1.07 -0.68 -0.48 0.21 0.12 0.07 0.53 0.54 0.54 0.28 0.09
-2.22 -1.31 -0.68 -0.5 -0.15 -0.11 0.43 0.53 0.65 0.66 0.38 -0.03
-2.35 -1.6 -0.87 -0.5 -0.06 0.31 0.27 0.24 0.69 0.71 0.33 0.18
-1.92 -2.08 -1.74 -1.03 0.08 0.2 0.41 0.99 0.68 0.72 0.22 -0.34
-2.85 -1.94 -1.14 -0.22 -0.12 0.05 0.57 0.98 0.58 0.54 0.19 -0.36
-2.33 -1.25 -0.88 -0.16 -0.14 -0.04 0.48 0.7 0.66 0.59 0.2 -0.28
-1.96 -0.9 -1.03 -0.01 0.03 0.02 0.33 0.36 0.4 0.46 0.38 0.19
-2.26 -1.08 -0.77 -0.42 0.08 -0.04 0.14 0.71 0.35 0.65 0.39 0.09
-1.67 -0.82 -0.56 -0.42 0.05 0.2 0.17 0.44 0.36 0.56 0.23 0.14
-1.11 -0.5 -0.42 -0.27 0.05 0.1 0.11 0.33 0.41 0.42 0.14 0.06
-2.22 -1.48 -0.93 -0.44 -0.08 0.08 0.38 0.6 0.58 0.55 0.35 0.16
-2.37 -1.52 -1.04 0.09 -0.27 0.07 0.5 0.47 0.64 0.68 -0.05 0.13
-2.97 -2.84 -1.93 -1.27 -0.4 0.2 0.71 1.05 0.72 0.74 0.24 -0.08
-3.8 -4.1 -2.55 -1.31 -0.5 -0.13 0.77 1.16 0.96 0.81 0.27 -0.26
-3.3 -3.45 -2.0 -1.36 -0.58 -0.35 0.23 0.89 0.81 1.04 0.68 0.35
-1.8 -1.23 -0.92 -0.06 -0.13 -0.18 0.53 0.31 0.57 0.76 0.06 0.12
-1.55 -1.16 -1.0 -0.77 -0.53 0.1 0.27 0.76 0.7 0.71 0.12 0.16
-2.27 -0.83 -0.79 -0.35 0.08 0.2 0.55 0.58 0.57 0.54 -0.01 -0.36
-2.12 -1.15 -0.96 -0.63 -0.19 0.22 0.28 0.54 0.39 0.55 0.6 0.22
-1.3 -0.68 -0.69 -0.3 0.1 0.17 0.32 0.45 0.29 0.34 0.25 0.07
-1.97 -0.89 -0.76 -0.42 -0.04 -0.02 0.21 0.5 0.38 0.61 0.46 0.19
-0.39 -0.44 -0.5 -0.2 -0.34 -0.15 0.22 0.23 0.27 0.57 0.16 0.1
-1.63 -1.23 -0.84 -0.51 -0.18 0.08 0.39 0.71 0.73 0.62 0.14 -0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.