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Heatmap: Cluster_141 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.92 -0.58 -1.47 -0.51 -0.29 -0.55 0.01 -0.26 0.4 1.0 0.45 0.78
-1.29 -0.56 -0.83 0.27 0.05 -0.24 -0.07 0.02 0.47 0.79 0.08 0.18
-0.79 -0.4 -0.48 0.02 0.15 -0.1 -0.02 -0.11 0.01 0.46 0.35 0.39
-2.82 -1.14 -1.48 0.05 0.29 -0.46 -0.32 -0.2 0.17 0.92 0.84 0.67
-1.47 -0.54 -0.75 -0.17 0.28 -0.75 -0.29 0.16 -0.31 1.09 0.25 0.69
-1.15 -0.41 -1.15 -0.12 0.24 -0.49 0.1 -0.16 0.28 0.85 0.2 0.49
-0.73 -0.36 -1.22 0.11 -0.23 -0.67 -0.07 -0.26 0.33 0.73 0.36 0.73
-0.63 0.11 -0.72 0.15 0.15 -0.65 -0.49 -0.53 0.02 0.63 0.31 0.68
-0.71 -0.51 -0.92 -0.03 0.05 -0.29 -0.06 0.01 0.16 0.57 0.45 0.48
-1.56 -0.66 -1.34 0.04 -0.05 -0.23 -0.05 0.01 0.29 0.85 0.41 0.53
-0.55 -0.63 -1.45 -0.19 0.03 -0.79 -0.23 -0.49 0.34 0.77 0.62 0.82
-2.64 -0.46 -1.41 0.11 0.31 -0.53 -0.12 -0.27 -0.01 1.07 0.54 0.51
-0.95 -0.57 -1.44 -0.06 0.03 -0.49 0.07 -0.13 0.38 0.83 0.34 0.52
-2.14 -1.42 -1.32 -0.17 0.3 -0.41 -0.08 -0.02 0.08 0.92 0.48 0.89
-2.19 -0.16 -1.06 0.04 -0.13 -0.35 -0.07 -0.4 0.44 0.95 0.21 0.6
-0.83 -0.37 -0.91 0.34 0.2 0.18 0.06 -0.26 -0.04 0.48 0.18 0.27
-0.57 -0.1 -1.31 0.23 0.04 -0.72 -0.56 -0.63 -0.2 0.71 0.5 0.95
-0.71 -0.19 -0.79 -0.21 0.2 -0.13 0.02 -0.13 0.28 0.61 0.25 0.18
-1.26 -0.68 -1.64 -0.34 -0.28 -0.74 -0.38 -0.44 0.29 1.13 0.75 0.88
-3.88 -1.27 -1.15 0.27 0.05 -0.1 -0.11 -0.07 0.18 1.0 0.55 0.49
-1.96 -0.7 -1.15 0.01 0.13 -0.43 -0.32 0.1 0.49 0.67 0.43 0.69
-0.67 -0.3 -0.86 -0.07 0.18 -0.59 -0.18 -0.15 0.23 0.74 0.32 0.46
-0.55 -0.02 -0.69 0.22 -0.01 -0.89 -0.35 -0.52 -0.16 0.49 0.49 0.87
-2.27 -0.86 -1.18 -0.12 0.07 -0.29 -0.12 0.05 0.22 0.91 0.62 0.56
-0.92 -0.24 -0.72 -0.01 -0.24 -0.4 -0.35 -0.18 0.14 0.67 0.61 0.62
-1.33 0.11 -0.61 -0.16 -0.04 -0.35 -0.2 -0.27 0.1 0.77 0.33 0.57
-5.61 -2.51 -2.46 -0.17 -0.07 -0.53 -0.12 -0.47 0.69 1.38 0.55 0.81
-2.7 -1.53 -1.71 -0.56 0.45 -0.38 0.38 -0.63 0.34 1.17 0.02 0.93
-0.84 -0.57 -1.1 0.16 0.14 -0.63 0.14 -0.07 0.53 0.74 0.09 0.28
-1.73 -0.9 -1.26 -0.31 0.15 -0.37 0.16 0.3 0.23 0.95 0.42 0.34
-1.42 -0.37 -0.85 0.2 0.27 -0.33 -0.12 0.12 0.35 0.76 0.18 0.06
-2.41 -0.76 -1.61 -0.07 0.13 -0.53 -0.12 -0.06 0.19 0.93 0.68 0.7
-0.89 -0.68 -1.03 0.05 0.07 -0.17 0.02 0.01 0.15 0.62 0.3 0.55
-0.83 -0.11 -1.21 0.14 -0.15 -0.59 -0.14 -0.31 0.07 0.95 0.34 0.53
-0.76 -0.89 -1.14 -0.17 -0.01 -0.27 -0.12 -0.23 0.18 0.8 0.57 0.64
-1.44 -0.37 -1.89 -0.01 -0.2 -0.29 -0.13 -0.21 0.44 0.82 0.42 0.74
-1.07 -0.41 -0.83 0.15 0.31 -0.15 -0.09 -0.07 0.15 0.69 0.26 0.19
-1.61 -0.62 -1.05 -0.21 -0.31 -0.07 0.05 0.25 0.54 0.62 0.43 0.45
-1.09 -0.58 -1.35 0.24 0.33 -0.24 0.0 -0.21 0.39 0.88 0.07 0.16
-1.22 -0.47 -1.6 0.33 -0.25 -0.84 -0.5 -0.25 0.06 1.07 0.54 0.78
-1.0 -0.95 -1.29 -0.1 0.12 -0.39 -0.11 0.04 0.41 0.78 0.44 0.52
-2.64 -0.65 -0.89 0.24 -0.3 -0.79 -0.39 -0.3 0.54 1.02 0.43 0.75
-0.86 -0.44 -1.56 0.02 0.15 -0.11 -0.29 -0.91 0.17 0.85 0.35 0.83
-1.43 -0.42 -1.07 0.09 0.45 -0.47 -0.25 -0.35 -0.13 0.8 0.6 0.54
-0.6 -0.22 -0.66 0.15 0.17 -0.74 -0.12 -0.21 0.2 0.71 0.16 0.4
-0.95 -0.41 -0.93 0.01 0.24 -0.26 -0.17 -0.07 0.22 0.9 0.17 0.24
-0.34 -0.4 -0.73 0.09 -0.09 -0.41 -0.38 0.0 0.19 0.6 0.46 0.37
-0.54 -0.26 -0.89 0.22 0.27 -0.43 -0.19 -0.13 0.27 0.61 0.22 0.19
- -1.61 -3.77 -0.68 0.43 -0.49 0.09 -0.91 0.46 1.58 0.56 0.57
-0.83 -0.68 -1.22 0.12 0.29 -0.33 0.08 -0.17 0.31 0.63 0.21 0.47
-0.83 -0.49 -1.08 -0.25 0.29 -0.25 0.21 0.03 0.41 0.65 0.16 0.21
-2.06 -0.87 -1.14 0.37 0.39 -0.3 0.02 -0.01 0.27 0.71 0.26 0.38
-0.98 -0.5 -1.08 -0.23 0.25 -0.33 -0.34 -0.06 0.23 0.95 0.41 0.37
-3.4 -2.08 -1.14 0.23 0.39 -0.03 -0.23 -0.08 0.05 1.05 0.36 0.64
-0.94 -0.41 -0.95 -0.06 0.05 -0.3 -0.04 -0.2 0.34 0.8 0.27 0.42
-1.02 -0.22 -1.08 -0.22 -0.01 -0.38 0.12 -0.12 0.29 0.78 0.14 0.59
-1.08 -0.36 -0.95 0.23 0.06 -0.99 -0.12 -0.12 0.48 0.65 0.29 0.58
-2.11 -0.97 -1.08 -0.36 -0.44 -1.29 -0.25 -0.23 0.52 1.2 0.59 0.94
-0.81 -0.49 -0.82 0.22 -0.21 -0.45 -0.08 0.12 0.41 0.67 0.29 0.28
-3.27 -1.03 -1.79 -0.23 0.46 -0.56 -0.39 -1.09 0.49 1.06 0.52 1.04
-5.03 -2.48 -1.05 -0.17 0.4 -0.36 -0.33 -0.19 0.1 0.97 0.83 0.88
-4.3 -2.93 -1.61 -0.25 0.46 0.04 -0.13 -0.42 0.04 1.16 0.68 0.79
-2.03 -1.0 -0.69 0.4 0.22 -0.48 -0.23 -0.26 -0.05 0.56 0.58 0.86
-1.07 -0.34 -0.86 -0.05 0.37 0.17 -0.11 0.25 0.06 0.52 0.28 -0.03
-3.28 -1.76 -2.37 -0.18 0.35 -0.06 -0.21 -0.29 0.15 1.08 0.79 0.73
-0.33 -0.48 -1.26 -0.29 0.1 -0.43 -0.4 -0.27 0.19 0.87 0.54 0.52
-0.76 -0.37 -0.77 0.23 -0.15 -0.6 -0.26 0.05 0.21 0.67 0.5 0.36
-0.56 -0.18 -0.98 0.13 -0.06 -0.32 0.02 -0.08 0.36 0.73 -0.06 0.28
-0.54 -0.36 -0.58 0.03 0.25 0.01 -0.14 0.02 0.3 0.49 -0.03 0.15
-0.76 -0.28 -0.77 0.08 0.01 -0.67 -0.22 -0.05 0.08 0.71 0.44 0.52
-1.31 -0.57 -0.55 -0.16 0.35 -0.28 -0.17 -0.12 0.22 0.73 0.23 0.52
-1.65 -0.25 -1.29 -0.21 0.08 -0.98 -0.36 0.13 -0.06 0.82 0.79 0.75
-1.21 -0.32 -0.96 -0.11 0.18 -0.01 0.14 0.22 0.16 0.65 0.14 0.2
-4.01 -0.85 -1.97 0.14 0.05 -1.07 -0.19 -0.12 0.28 1.23 0.55 0.77
-0.78 -0.51 -1.25 -0.87 -0.27 -0.3 -0.2 -0.08 0.45 1.18 0.45 0.37
-0.7 -0.12 -1.38 -0.5 -0.41 -0.62 -0.16 -0.17 0.43 0.95 0.31 0.73
-0.45 -0.39 -0.66 -0.05 0.05 -0.03 -0.02 -0.07 0.24 0.46 0.32 0.2
-1.02 -0.54 -1.16 -0.21 -0.53 -1.39 -0.36 -0.4 0.44 1.06 0.73 0.83
-0.33 -0.17 -0.79 0.23 0.26 -0.32 -0.5 -0.38 0.05 0.53 0.18 0.56
-2.1 -0.44 -1.64 0.27 0.25 -0.75 -0.65 -0.42 0.35 1.13 0.38 0.65
-1.32 -0.06 -1.09 0.02 0.06 -0.87 -0.08 -0.06 -0.01 0.82 0.28 0.75
-0.37 -0.36 -0.99 -0.0 -0.22 -0.64 -0.47 0.09 0.09 0.54 0.65 0.65
-1.25 -0.64 -1.95 -0.53 0.23 -0.7 0.02 -0.37 0.06 1.22 0.57 0.64
-0.63 -0.19 -0.91 0.09 -0.13 -0.51 -0.07 -0.1 0.3 0.63 0.25 0.5
-0.41 -0.52 -0.83 0.15 -0.08 -0.46 -0.17 -0.37 0.09 0.7 0.05 0.86
-1.28 -0.5 -0.85 0.05 0.13 -0.43 0.06 0.01 0.43 0.75 0.23 0.26
-1.25 -0.82 -0.92 -0.29 -0.06 -0.4 -0.0 -0.21 0.48 0.89 0.28 0.7
-2.18 -0.94 -1.04 -0.27 -0.02 -0.23 0.18 0.11 0.23 0.85 0.5 0.59
-3.77 -2.32 -1.14 -0.11 -0.18 -0.91 -0.3 -0.42 0.48 1.09 0.87 1.02
-0.78 -0.49 -0.61 0.02 0.32 -0.14 -0.14 -0.21 0.24 0.6 0.26 0.27
-0.6 -0.22 -0.9 0.07 0.13 -0.49 -0.55 -0.15 0.05 0.75 0.49 0.45
-0.63 -0.21 -0.86 0.4 0.27 -0.67 -0.58 -0.14 0.07 0.76 0.02 0.53
-0.45 -0.27 -1.22 0.01 0.12 -0.74 -0.49 -0.09 0.15 0.87 0.45 0.45
-0.53 -0.21 -0.66 -0.03 0.1 -0.3 -0.23 -0.26 0.07 0.59 0.29 0.57
-0.46 -0.15 -0.52 0.13 0.1 -0.48 -0.52 -0.3 -0.16 0.58 0.49 0.57
-1.0 -0.53 -1.54 -0.41 0.43 -0.24 -0.16 -0.5 0.22 0.8 0.54 0.64
-0.73 -0.19 -1.11 0.01 0.06 -0.69 -0.51 -0.32 0.08 0.73 0.57 0.76
-1.26 -0.27 -0.99 0.14 0.09 -0.55 -0.36 -0.31 0.19 0.92 0.35 0.59
-0.99 -0.44 -1.66 0.12 0.16 -0.37 0.03 -0.16 0.6 0.7 0.23 0.31
-1.73 -0.92 -1.37 -0.29 0.2 -0.15 0.11 0.01 0.18 0.81 0.61 0.49
-3.37 -1.44 -1.46 0.19 0.65 -0.03 -0.68 -0.3 0.32 1.05 0.6 0.26
-1.52 -0.12 -0.32 -0.16 0.22 -0.25 -0.07 -0.21 0.13 0.71 0.21 0.4
-2.79 -1.36 -1.19 0.3 0.16 -0.63 0.04 -0.25 0.13 0.86 0.49 0.89
-1.63 -0.68 -0.87 0.27 0.16 -0.2 0.03 0.4 0.19 0.63 0.13 0.24
-1.8 -0.52 -1.02 0.34 0.44 -0.29 -0.0 -0.1 0.41 0.69 0.05 0.22
-3.62 -1.34 -1.55 0.23 0.16 -0.36 -0.26 -0.38 0.02 0.83 0.76 1.02
-2.48 -0.6 -1.31 -0.41 0.09 -0.33 -0.2 -0.24 0.14 0.5 0.96 0.98
-2.04 -0.48 -1.82 -0.85 0.18 -0.12 -0.09 -0.68 0.46 1.15 0.71 0.43
-1.66 -0.51 -1.38 0.35 0.38 -0.75 -0.28 -0.33 0.0 0.9 0.41 0.68
-2.05 -0.75 -0.72 0.12 0.09 -0.16 -0.29 0.23 0.37 0.65 0.51 0.31
-2.54 -0.51 -1.19 0.07 0.24 -0.6 -0.54 -0.42 0.09 1.06 0.53 0.83
-2.65 -0.86 -0.69 0.13 -0.17 -0.5 -0.37 -0.37 0.2 1.19 0.75 0.41
-2.72 -1.57 -2.41 -0.21 -0.29 -0.7 -0.1 -0.52 -0.0 1.29 1.13 0.82
-1.66 -0.79 -1.48 -0.03 0.44 -0.35 -0.15 -0.56 0.19 0.94 0.63 0.52
-0.66 -0.22 -0.55 0.22 -0.15 -0.72 -0.34 -0.45 0.08 0.6 0.37 0.82
-2.1 -0.76 -1.44 0.13 0.4 -0.79 -0.1 -0.14 -0.07 1.15 0.46 0.52
-1.47 -0.63 -1.28 0.16 0.11 -0.19 -0.11 0.07 0.46 0.79 0.14 0.41
- -2.48 -1.12 0.34 0.37 -0.13 -0.12 -0.88 0.46 0.9 0.61 0.74
-2.04 -0.58 -1.22 -0.04 0.12 -0.31 -0.06 -0.05 0.22 0.91 0.38 0.61
-2.86 -0.9 -1.12 -0.28 0.13 0.05 0.17 -0.09 0.33 0.67 0.66 0.5
-1.18 -1.0 -2.45 -0.32 0.31 -0.05 -0.23 -0.22 0.28 1.15 0.23 0.65
-0.93 -0.38 -1.05 -0.15 0.06 -0.24 -0.03 -0.18 0.25 0.64 0.37 0.61
-1.27 -0.31 -1.79 0.34 -0.05 -0.93 -0.53 -0.6 -0.11 0.96 -0.08 1.35
-1.31 -0.35 -0.39 0.09 0.13 -0.28 -0.1 0.19 0.45 0.54 -0.03 0.25
-0.75 -0.77 -1.74 0.07 0.11 -0.23 0.02 0.1 0.29 0.7 0.31 0.45
-0.93 -0.39 -1.23 0.19 0.06 -0.45 -0.05 0.01 0.41 0.7 0.17 0.39
-0.95 -0.17 -0.97 0.18 0.28 -0.44 -0.36 -0.09 0.2 0.74 0.36 0.23
-1.92 -0.83 -1.84 -0.3 0.32 -0.31 0.07 -0.24 0.18 0.99 0.34 0.81
-1.64 -0.42 -0.43 -0.04 0.14 -0.19 0.07 -0.15 0.47 0.67 -0.08 0.45
-1.27 -0.69 -1.18 0.18 -0.06 -0.59 0.22 -0.1 0.06 0.73 0.45 0.68

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.