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Heatmap: Cluster_17 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
3.17 - - - - - 1.6 - - - - -
-2.05 0.54 0.84 0.17 -0.67 -0.02 -0.13 -1.01 0.36 -0.15 -1.05 0.77
-0.67 0.11 0.75 -0.39 -0.05 -0.76 0.04 -1.64 0.51 -0.07 -0.22 0.76
3.49 - -4.08 -2.62 - -2.52 - - -4.61 -2.73 - -2.7
3.58 - - - - - - - - - - -
0.15 0.37 -0.34 -0.41 -0.15 -0.57 -0.25 0.53 -0.17 -0.17 0.49 0.02
-0.19 0.33 0.12 -0.46 0.14 -0.46 -0.34 0.14 -0.29 -0.18 0.66 0.07
-0.08 0.46 0.24 -0.67 -0.39 -0.54 0.11 0.4 -0.25 -0.25 0.58 -0.24
-0.29 0.75 -0.14 0.08 -0.64 -0.85 0.03 -0.19 -0.26 -0.54 0.56 0.53
0.83 0.42 0.13 -0.07 -1.32 -0.6 -0.07 0.19 0.23 -0.56 -0.04 -0.19
0.52 0.28 -0.32 -0.33 -0.21 -0.21 -0.2 0.04 -0.44 -0.7 0.6 0.33
0.26 0.22 0.01 -0.04 -0.33 -0.1 -0.05 -0.08 -0.05 -0.48 0.49 -0.11
0.39 0.28 -0.06 -0.01 -0.27 -0.0 -0.03 0.16 -0.24 -0.74 0.36 -0.21
0.1 0.53 -0.07 -0.04 0.05 -0.2 -0.54 -0.21 -0.37 -0.06 0.3 0.19
0.17 0.52 -0.07 -0.11 -0.04 -0.42 -0.64 0.11 -0.5 -0.2 0.54 0.13
0.35 0.65 -0.32 -0.34 0.09 -0.73 -0.73 0.14 -0.83 -0.18 0.73 0.12
0.37 0.77 -0.33 -0.35 0.17 -0.78 -0.91 0.09 -0.95 -0.28 0.8 0.06
0.49 0.68 -0.18 -0.32 0.13 -0.75 -0.6 -0.07 -1.0 -0.66 0.84 0.13
0.55 0.67 -0.12 -0.2 -0.1 -0.52 -0.62 -0.08 -0.68 -0.51 0.65 0.05
0.59 0.68 -0.05 -0.26 -0.23 -0.14 -0.71 -0.02 -0.38 -0.8 0.41 0.08
0.7 0.36 0.0 -0.22 -0.09 -0.19 -0.02 -0.19 -0.3 -0.64 0.24 -0.14
0.57 0.26 0.15 0.03 -0.2 -0.14 -0.33 -0.17 -0.3 -0.64 0.34 0.01
0.69 0.48 0.05 -0.18 -0.14 0.14 -0.35 -0.49 -0.25 -0.63 0.2 -0.11
0.65 0.34 0.11 -0.13 -0.28 0.02 -0.33 -0.14 -0.27 -0.59 0.25 -0.07
0.64 0.56 0.02 -0.28 0.05 -0.48 -0.36 -0.13 -0.63 -0.67 0.37 0.15
2.48 1.61 -0.1 1.28 - - - - - - - -
1.37 0.54 -0.03 -0.14 -0.39 0.34 -0.84 0.05 -1.16 -0.14 -1.06 -0.71
1.28 0.26 -0.22 -0.22 -0.62 -1.44 0.55 0.67 -0.4 -1.54 -0.74 -0.17
-0.25 0.51 -0.51 -0.4 0.26 -0.54 -0.43 0.21 -0.41 0.22 0.64 0.03
-0.25 0.65 -0.37 -0.44 0.34 -0.72 -0.65 0.29 -0.67 0.05 0.72 0.08
-0.18 0.24 0.05 -0.71 0.63 0.43 -0.41 -1.73 0.01 -0.61 0.33 0.5
-0.86 -0.58 -1.29 -0.89 -0.48 -0.31 -0.7 -0.59 -0.35 0.45 1.61 0.88
0.18 0.8 0.06 -0.37 -0.42 -1.11 -0.94 0.28 -0.57 0.2 0.4 0.28
0.22 0.8 0.13 -0.4 -0.41 -1.08 -0.87 0.03 -0.37 -0.14 0.7 0.19
0.37 0.53 -0.66 -0.7 -0.4 -0.85 -0.6 -0.51 -1.12 0.03 0.98 0.92
0.43 0.74 -0.58 -1.16 -0.28 -1.24 -0.7 -0.28 -2.12 -0.6 1.39 0.74
0.22 0.88 -0.83 -1.43 -0.25 -0.69 -0.92 -0.5 -1.82 -0.31 1.39 0.73
0.74 0.84 -0.7 -1.44 -0.42 -0.85 -1.13 -0.88 -2.25 -0.48 1.38 0.8
0.31 0.75 -0.3 -1.06 -0.51 -0.47 -0.97 -1.68 -0.86 -0.6 1.47 0.64
-0.06 0.59 -0.58 -0.89 0.06 -0.89 -1.2 -0.36 -1.4 0.18 1.36 0.52
0.0 0.33 -0.46 -0.48 -0.08 -0.66 -0.8 -0.32 -0.73 0.31 0.94 0.66
1.43 - - 0.81 - 0.87 2.52 - - - - -
3.18 - - - - - - - - - 1.56 -
3.58 - - - - - - - - - - -
0.22 0.26 0.1 -0.15 0.07 -0.09 -0.66 0.15 -0.21 -0.26 0.24 0.07
-0.44 0.82 -0.42 -1.27 0.78 -0.24 -0.83 -0.02 -1.09 -0.23 1.1 -0.39
-0.79 0.55 0.23 -0.53 0.79 -0.19 -1.28 -0.8 -1.8 -0.02 1.36 -0.6
-1.66 1.14 -1.08 -2.84 0.35 0.13 0.23 -0.18 -1.51 -1.85 1.65 -0.57
-0.49 0.33 -0.47 -0.04 0.58 -0.17 -0.39 0.17 -0.31 0.03 0.39 -0.12
-0.76 0.76 -0.47 -0.19 0.46 0.2 0.15 0.23 -0.8 -0.5 0.54 -0.83
-0.11 0.78 -0.27 -0.56 0.6 0.05 -0.3 0.23 -0.89 -0.36 0.4 -0.55
0.11 0.82 0.37 -0.37 0.51 -0.13 -0.27 0.1 -1.01 -0.98 0.46 -1.06
-0.24 0.81 -0.08 -1.07 0.47 -0.36 -0.18 -0.16 -0.93 -0.1 0.46 0.27
-0.3 0.87 0.04 -0.79 0.86 -0.14 -0.3 -0.32 -1.03 -0.39 0.54 -0.48
0.13 0.7 0.15 -0.43 0.6 -0.38 -0.35 0.02 -1.15 -0.47 0.77 -1.12
3.58 - - - - - - - - - - -
2.64 -1.63 - -0.84 -0.82 -1.86 1.69 - -1.75 - -0.89 -
3.58 - - - - - - - - - - -
-0.14 0.42 -0.23 -0.56 0.18 -1.46 -1.14 -0.63 -1.19 0.05 1.29 0.77
-0.52 0.3 -0.24 -0.29 0.05 -0.71 -0.22 0.19 -0.43 -0.11 0.68 0.57
-0.56 0.17 -0.16 -0.24 0.08 -0.59 0.02 0.24 -0.27 -0.07 0.49 0.43
-0.61 0.09 0.17 -0.14 0.12 -0.88 0.02 -0.08 0.02 -0.66 0.55 0.64
-0.44 0.2 -0.15 -0.3 0.48 0.03 0.02 0.36 -0.77 -0.42 0.52 -0.11
-0.32 0.13 -0.18 -0.06 0.24 0.26 0.02 0.33 -0.51 -0.59 0.52 -0.31
-0.24 0.13 -0.16 -0.15 0.31 0.29 0.15 0.13 -0.37 -0.56 0.41 -0.29
-0.36 0.07 -0.18 0.09 0.25 0.33 -0.06 0.36 -0.57 -0.43 0.47 -0.45
-0.23 0.06 -0.17 -0.05 0.16 0.23 0.13 0.29 -0.45 -0.46 0.46 -0.3
-0.41 0.01 -0.32 -0.01 0.11 0.42 0.16 0.33 -0.34 -0.32 0.37 -0.36
-0.31 -0.09 -0.31 0.01 0.32 0.23 0.04 0.23 -0.42 -0.5 0.55 -0.15
-0.55 -0.18 -0.16 0.16 0.39 0.12 0.04 0.3 -0.47 -0.43 0.48 -0.15
-0.34 -0.05 -0.11 0.04 0.27 0.21 0.14 0.3 -0.34 -0.54 0.43 -0.4
-0.4 0.03 -0.35 -0.02 0.32 0.24 -0.03 0.37 -0.56 -0.37 0.51 -0.19
-0.88 0.12 -0.23 0.07 0.29 0.25 0.06 0.25 -0.48 -0.31 0.55 -0.26
-0.59 -0.07 -0.32 0.04 0.44 0.08 -0.19 0.33 -0.5 -0.31 0.77 -0.33
-0.49 0.13 -0.3 -0.07 0.38 0.03 0.02 0.34 -0.46 -0.34 0.51 -0.2
-0.63 0.0 -0.28 -0.04 0.39 0.01 -0.08 0.38 -0.43 -0.2 0.53 -0.1
-0.75 -0.06 -0.24 -0.02 0.3 -0.02 -0.03 0.39 -0.44 -0.11 0.54 -0.02
3.58 - - - - - - - - - - -
3.58 - - - - - - - - - - -
1.81 - 0.63 -1.78 - 1.3 1.8 - -0.49 - - -
-0.36 0.27 -0.4 -0.55 0.05 -0.45 -0.02 0.04 -0.06 -0.23 0.66 0.48
0.37 0.8 -0.4 -1.39 -0.11 -1.35 -1.2 -0.28 -1.31 -0.25 1.26 0.69
0.06 0.73 -0.32 -0.67 -0.12 -1.15 -1.0 -0.16 -1.0 0.06 1.02 0.62
2.26 2.29 - - -0.55 - - 0.7 - - - -
1.87 1.05 1.74 -0.04 - -3.72 -1.38 0.54 - - -4.7 -
-0.23 0.49 -0.35 -0.43 0.33 -0.97 -0.44 0.16 -0.88 0.2 0.78 0.24
-0.28 0.46 -0.27 -0.23 0.28 -0.9 -0.61 -0.1 -0.48 0.15 0.75 0.35
-0.14 0.34 -0.1 -0.03 0.11 -0.74 -0.68 -0.02 -0.23 0.19 0.55 0.23
2.26 - - - -0.0 - 1.58 1.12 - 0.08 - -
0.14 0.68 -0.6 -0.99 0.26 -0.75 -0.97 -0.26 -1.03 -0.46 1.36 0.29
0.35 1.13 -0.66 -1.53 -0.05 -0.88 -1.09 -0.25 -1.34 -0.16 1.22 0.15
0.67 1.02 -0.61 -2.22 0.04 -0.72 -0.79 -0.22 -1.48 -0.68 1.16 0.28
0.33 1.17 -0.71 -1.47 -0.23 -0.63 -0.1 0.09 -1.97 -0.28 0.98 -0.02
0.16 0.86 -0.73 -1.16 0.22 -0.87 -0.64 0.09 -1.24 -0.16 1.09 0.21
0.0 -0.87 1.13 0.46 - -1.87 -1.56 -1.55 -0.48 0.33 0.68 1.24
0.09 0.3 -0.19 -0.26 -0.02 -0.64 -0.57 0.3 -0.29 0.08 0.55 0.17
0.03 0.1 0.09 0.0 -0.19 -0.1 -0.15 0.03 0.02 -0.06 0.04 0.15
0.34 0.85 -0.29 -0.66 0.15 -0.87 -0.79 0.1 -0.82 -0.31 0.79 0.1
-0.67 0.8 -0.62 -0.06 -0.28 -0.37 -1.26 0.25 -0.13 -0.13 0.85 0.25
0.32 0.49 -0.15 -0.29 -0.09 -0.58 -0.3 0.16 -0.36 -0.05 0.4 0.04
-0.1 0.56 0.02 -0.09 -0.12 -0.78 -0.64 0.15 -0.28 0.04 0.58 0.06
0.33 0.93 -0.28 -0.52 -0.07 -0.76 -0.65 0.05 -0.76 -0.41 0.73 0.13
0.36 0.86 0.21 -0.87 -0.46 -1.03 -0.82 0.49 -1.09 -0.06 0.58 0.12
-0.5 0.74 0.02 -0.4 -0.07 -0.89 -0.57 0.22 -0.42 0.1 0.7 0.11
0.14 0.62 -0.1 -0.35 0.07 -0.92 -0.52 0.33 -0.3 -0.0 0.45 -0.1
0.19 0.23 -0.03 -0.06 -0.2 -0.16 -0.56 0.06 -0.3 -0.3 0.4 0.39
-1.17 -0.13 0.14 0.21 -0.44 -0.11 -0.32 0.22 0.23 0.26 0.18 0.33
-0.73 0.11 -0.51 0.33 0.79 -0.06 -0.24 0.07 -0.39 -0.43 0.45 -0.15
-1.74 -2.07 -1.31 0.54 0.32 0.41 1.87 -0.52 -0.79 0.38 -0.72 -2.35
-0.49 0.62 -0.06 -1.05 -1.03 -0.83 -1.4 -0.18 -0.9 0.34 1.35 0.72
-0.06 0.83 -0.47 -1.8 -0.45 -0.62 -0.72 -0.54 -2.27 0.32 1.15 0.92
0.71 0.83 -1.01 -2.03 -0.2 -1.14 -1.22 -0.08 -1.68 -0.13 1.36 0.43
-0.04 0.91 -0.56 -0.83 0.26 -0.91 -0.86 0.04 -1.23 -0.06 1.0 0.27
-0.16 0.7 -0.57 -0.55 0.54 -1.51 -0.66 0.27 -1.44 -0.03 0.96 0.26
0.09 0.75 -0.25 -0.77 0.23 -1.06 -0.96 -0.05 -1.06 -0.05 1.01 0.3
-0.11 0.76 -0.34 -0.6 0.32 -0.93 -0.89 0.0 -1.09 -0.01 0.89 0.38
1.11 0.23 1.34 1.51 - - - 0.98 0.42 - - -
3.58 - - - - - - - - - - -
2.81 - 1.47 - 1.14 - - - - - - -
2.58 - 2.59 - - - - - - - - -
2.83 - - - - - - - - - - 2.29
1.71 0.18 0.96 0.46 0.4 -3.36 -1.96 -1.45 -0.68 -0.92 -1.73 -0.4
-0.21 0.11 -0.65 -0.98 -0.15 -1.25 -1.57 -0.97 -1.95 0.03 1.75 1.07
-0.52 0.51 -0.92 -1.1 -0.66 -1.41 -1.45 -0.89 -2.58 -0.22 2.02 0.93
0.05 0.25 -0.89 -1.09 -0.28 -1.29 -1.97 -0.81 -2.14 -0.14 1.82 1.03
-0.22 0.12 -0.97 -1.12 -0.37 -1.24 -1.79 -1.27 -1.83 0.02 1.94 1.03
-0.02 0.11 -0.93 -1.0 -0.34 -1.16 -1.52 -0.87 -1.96 0.08 1.66 1.2
-0.83 0.03 0.04 0.38 0.24 -0.4 -0.68 0.23 0.16 0.26 -0.35 0.34
1.03 -0.26 -1.55 - 0.04 1.19 - -1.52 -0.58 0.41 -0.58 1.3
-0.0 0.5 -0.39 -0.85 0.35 -0.6 -0.52 0.2 -1.37 0.08 0.89 0.26
2.58 - 2.59 - - - - - - - - -
-0.02 -0.12 -0.89 -1.05 -0.23 -1.11 -1.01 -0.01 -1.18 0.35 1.45 0.86
0.19 0.49 -0.71 -0.8 0.26 -1.63 -2.03 -0.49 -1.23 0.2 1.32 0.79
0.49 0.12 -0.26 -0.13 -0.37 -0.53 -0.04 0.16 0.03 -0.09 0.35 -0.04
-0.13 -0.18 -1.91 -2.45 -1.14 -1.64 -0.94 0.22 -1.49 0.22 1.84 1.13
2.93 - - -1.34 -1.45 - - -0.22 -0.38 -1.43 0.25 -1.23
- - - -0.03 -1.08 1.74 1.82 1.14 -0.94 -1.07 -1.05 -
0.87 0.9 1.13 0.08 -0.05 -0.48 -0.63 -1.41 -1.22 -0.78 -0.8 -0.37
3.58 - - - - - - - - - - -
2.14 - 0.57 1.59 - - - 0.78 - 0.45 - -
0.23 0.1 -0.17 -0.04 -0.44 0.19 -0.06 0.21 -0.23 -0.53 0.35 0.11
0.08 -0.13 -0.24 0.46 -1.1 0.3 0.03 0.2 0.08 -0.42 0.34 -0.22
0.25 0.35 0.04 -0.19 -0.52 -0.18 -0.08 0.17 -0.07 -0.49 0.38 -0.0
0.08 -0.28 -0.46 0.31 -0.42 0.25 0.06 0.51 -0.21 -0.47 0.33 -0.15
2.84 - - - - - 2.27 - - - - -
-1.34 -1.33 -0.72 0.78 -0.16 0.81 1.42 0.18 -0.21 -0.85 -0.7 -1.31
3.58 - - - - - - - - - - -
3.58 - - - - - - - - - - -
1.81 0.93 2.13 - - - - - - 1.15 - -
3.0 - 2.0 - - - - - - - - -
0.23 0.13 -0.01 -0.34 -0.26 -0.27 -0.22 -0.03 -0.2 -0.02 0.38 0.37
3.58 - - - - - - - - - - -
1.96 - - 0.82 0.93 - 1.39 0.01 -0.31 - - -
3.58 - - - - - - - - - - -
3.46 - - -0.0 - - - - - - - -
3.58 - - - - - - - - - - -
0.28 0.32 0.08 -0.05 -0.16 -0.44 -1.1 -0.12 -0.22 0.04 0.57 0.18
2.88 - - - - - 2.21 - - - - -
1.94 - - 1.45 - - 1.38 - 1.5 - - -
0.08 0.72 -0.35 -0.43 0.45 -0.81 -0.84 -0.12 -0.81 -0.08 0.8 0.14
-0.13 -0.02 0.14 0.34 -0.28 -0.12 -0.36 -0.41 0.13 0.02 -0.03 0.46
3.58 - - - - - - - - - - -
0.04 0.42 -0.08 -0.2 0.16 -0.49 -0.46 0.21 -0.34 0.07 0.29 0.04
3.11 - - - - - - 1.75 - - - -
3.17 - 1.59 - - - - - - - - -
-0.34 0.43 -0.54 -0.2 0.2 -0.39 -0.36 0.22 -0.58 0.14 0.59 0.23
1.75 0.87 - 2.15 1.25 - - - - - - -
-0.13 - - - - 0.31 2.26 - 0.42 0.28 - 1.32
3.58 - - - - - - - - - - -
3.23 0.47 0.33 - - - - - - - - -
2.08 0.16 0.86 - -0.01 - - 0.13 -0.04 -0.2 - -0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.