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Heatmap: Cluster_9 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.69 -0.48 -1.23 -0.42 0.0 0.27 0.13 0.17 0.6 -0.13 -0.25 -0.31
-1.39 -0.56 -0.73 -0.69 0.1 0.83 0.82 0.43 0.06 0.11 -0.07 -0.57
0.36 -0.64 -2.02 -1.77 -1.04 0.02 0.51 0.62 0.4 0.45 0.55 -0.12
0.33 -0.31 -0.82 -0.34 -0.93 -1.22 -0.35 0.58 0.67 0.47 0.35 0.14
-0.47 -0.38 -0.79 -0.58 -0.15 0.09 0.11 0.5 0.37 0.38 0.2 0.07
0.34 -0.0 0.03 0.05 -0.51 -0.85 0.02 0.49 0.59 0.12 -0.31 -0.72
-0.22 -0.07 -0.28 -0.08 -0.03 -0.21 -0.1 0.3 0.25 0.29 0.12 -0.15
0.05 -0.2 -0.78 -1.02 -0.09 0.65 0.7 0.59 0.21 -0.01 -0.41 -1.03
0.02 -0.12 -0.49 0.01 0.22 -0.08 -0.39 0.07 0.12 0.11 0.31 0.03
0.12 -0.04 0.07 0.14 -0.46 -0.77 0.16 0.24 0.3 0.17 -0.05 -0.22
0.06 -0.41 -1.33 0.18 -0.05 -0.86 -0.38 0.65 0.16 0.21 0.49 0.19
-0.79 -0.54 -0.88 -0.52 -0.8 -0.3 0.45 0.31 0.66 0.78 0.17 0.11
- -3.52 -2.99 -0.87 -0.02 0.71 0.81 0.75 0.67 0.81 -0.26 -0.01
-0.42 -0.23 -0.92 -0.39 -0.12 0.07 0.29 0.19 0.32 0.52 0.17 -0.05
1.31 -0.28 -0.33 -0.14 -2.08 -2.68 -0.91 0.34 0.29 0.19 0.3 0.27
-0.45 -0.39 -1.69 -1.15 0.14 1.08 0.77 0.65 0.28 -0.23 -0.5 -1.04
-0.02 -0.09 -0.34 -0.15 0.02 -0.01 0.15 0.32 -0.01 -0.08 0.13 -0.03
-0.67 -0.35 -0.57 0.3 -0.25 -0.28 0.04 0.4 0.51 0.46 0.03 -0.22
0.2 -0.2 -0.7 -0.59 -0.23 0.38 0.36 0.52 0.36 0.18 -0.29 -0.76
-0.14 -0.22 -0.65 -0.02 -0.08 -0.02 0.21 0.37 0.45 0.42 -0.34 -0.45
-0.33 -0.36 -0.51 0.01 0.12 0.01 0.21 0.57 0.25 0.11 -0.22 -0.21
-0.12 -0.15 -0.46 -0.52 -0.11 0.16 0.25 0.16 0.14 0.25 0.06 0.09
0.13 -0.4 -0.89 -0.43 -0.36 0.45 0.28 0.18 0.27 0.12 0.19 -0.09
0.53 -0.15 -0.55 -0.87 0.3 -1.09 0.54 0.34 -0.04 0.11 -0.3 0.19
0.29 -0.18 -0.46 -0.3 -0.25 0.01 0.45 0.24 0.22 0.17 -0.24 -0.29
-0.06 -0.23 -0.28 -0.38 -0.0 0.28 0.2 0.42 0.13 0.1 -0.04 -0.41
- -4.33 -2.85 -0.26 -0.64 0.42 0.85 0.69 0.53 1.13 0.26 -0.46
-0.8 -0.18 -0.23 -0.3 -0.06 -0.01 0.14 0.45 0.37 0.15 0.14 -0.07
-3.92 -3.68 -2.88 -0.85 0.11 0.34 0.33 0.79 0.54 0.83 0.77 -0.13
-0.8 -0.35 -0.97 -0.76 -0.19 0.21 0.22 0.51 0.21 0.39 0.32 0.27
-0.72 0.14 -0.28 0.18 -0.28 -0.2 0.13 0.19 0.48 0.24 -0.24 -0.02
0.03 0.01 -0.21 -0.11 0.04 -0.23 -0.18 0.17 0.2 0.11 0.02 0.08
-0.21 -0.06 -0.56 -0.13 0.08 0.12 0.08 -0.04 -0.31 0.28 0.28 0.24
-0.14 -0.33 -0.24 0.31 -0.02 -0.26 -0.04 0.32 0.12 0.03 0.14 -0.07
0.15 0.25 -0.63 -0.24 -0.09 -0.93 -0.05 0.84 0.47 0.3 -0.36 -0.75
-0.44 -0.02 -0.85 -0.11 0.0 -0.37 0.05 -0.01 0.37 0.55 0.03 0.28
-2.29 -3.05 -2.63 -0.62 -0.17 0.57 0.44 0.85 0.79 0.82 0.11 -0.39
-2.48 -2.95 -3.97 -1.8 -0.18 0.55 0.53 0.97 0.56 1.3 0.03 -0.69
-0.02 0.21 -0.38 0.14 -0.24 -0.18 -0.26 0.01 0.26 0.19 -0.17 0.25
-0.12 -0.08 -0.31 -0.01 0.05 -0.3 -0.22 -0.06 0.27 0.34 0.07 0.2
-0.13 -0.11 -0.56 0.23 0.03 -0.16 0.08 0.37 0.33 0.25 -0.33 -0.31
-0.06 -0.5 -0.6 -0.44 -0.02 -0.04 0.26 0.57 0.3 0.17 0.13 -0.25
-0.06 -0.23 -1.04 -0.74 -0.26 -0.55 0.23 0.82 0.09 0.31 0.33 0.11
-0.05 -0.28 -0.93 -0.54 -0.38 -0.33 0.21 0.55 0.39 0.27 0.25 0.14
0.09 -0.25 -1.13 -0.63 -0.94 -1.21 0.15 1.15 0.71 0.35 0.07 -0.4
-0.36 0.09 0.22 0.23 -0.48 -0.11 0.21 -0.26 0.26 0.07 0.34 -0.59
0.06 -0.39 -0.87 -0.43 0.01 0.27 0.51 0.48 0.23 0.16 -0.27 -0.41
-0.17 -0.57 -0.2 0.31 0.12 -0.47 0.32 0.47 0.22 -0.06 -0.05 -0.32
-0.04 0.05 0.01 0.08 -0.02 -0.29 -0.26 0.13 0.19 0.21 0.01 -0.16
0.42 0.03 -0.24 -0.37 -0.74 -0.73 -0.04 0.34 0.35 0.26 0.13 0.01
-0.29 -0.37 -0.28 -0.93 -0.34 0.25 0.32 0.39 0.51 0.33 0.13 -0.42
-0.7 0.39 - -0.21 -1.81 -1.85 -0.06 0.55 0.3 1.05 -0.1 0.99
-1.65 -0.96 -2.12 -0.6 0.13 -0.01 0.33 0.14 0.59 0.85 0.19 0.47
-1.57 -1.1 -1.94 -0.85 0.12 0.11 0.32 0.38 0.47 0.74 0.36 0.43
-1.69 -1.03 -2.09 -1.03 0.14 0.17 0.33 0.68 0.26 0.66 0.48 0.29
-0.03 -0.27 -0.67 0.31 0.03 -0.45 -0.04 0.53 0.34 0.05 0.02 -0.24
-0.41 -0.5 -0.63 -0.06 -0.11 0.3 0.49 0.72 0.43 0.05 -0.29 -0.94
0.23 -0.0 -0.46 0.37 -0.19 -0.05 0.04 0.19 0.23 -0.0 -0.31 -0.27
-0.02 -0.47 -1.09 -0.66 -0.16 0.48 0.58 0.72 0.31 0.11 -0.18 -0.84
-0.2 -0.41 -0.26 -0.1 -0.0 0.14 0.21 0.35 0.28 0.16 -0.03 -0.38
-1.46 -0.32 -0.6 0.09 -0.14 -0.06 0.34 0.5 0.44 0.42 0.03 -0.23
-0.08 -0.05 -0.69 0.15 -0.13 -0.34 -0.09 0.38 0.39 0.31 -0.08 -0.11
-0.09 0.02 -0.66 -0.54 0.12 0.18 0.3 0.27 0.05 0.27 0.13 -0.44
0.02 -0.25 -0.4 0.07 -0.24 -0.27 0.12 0.37 0.45 0.14 -0.2 -0.09
0.08 -0.2 -0.27 -0.32 0.05 -0.09 -0.02 0.29 0.1 0.23 0.2 -0.21
-0.04 -0.17 -0.35 -0.1 -0.16 -0.37 -0.25 0.41 0.42 0.1 0.07 0.16
-0.34 -0.33 -0.75 -1.11 -0.4 0.28 0.43 0.37 0.63 0.49 -0.14 -0.2
-2.79 -2.48 -1.44 -0.84 -0.22 0.24 0.84 0.99 0.63 0.44 -0.01 0.05
- -2.84 -2.3 -1.45 -0.89 -0.52 0.1 0.26 1.12 1.33 0.6 0.66
0.23 -0.04 -0.31 -0.05 -0.14 -0.25 -0.28 0.24 0.2 -0.09 0.18 0.15
0.43 0.04 -0.52 -0.27 -0.53 0.06 0.35 0.01 0.03 0.07 -0.31 0.28
0.05 -0.26 -0.9 -0.65 -0.21 0.37 0.65 0.3 0.24 0.36 -0.1 -0.74
0.35 -0.09 -0.54 0.26 -0.22 -0.4 0.17 0.27 0.26 0.09 -0.32 -0.18
0.46 0.5 -0.32 -0.1 -0.16 -0.64 -0.15 0.58 0.41 0.09 -0.71 -0.89
0.23 -0.04 -0.5 -0.14 -0.01 -0.07 -0.31 0.15 0.04 0.02 0.31 0.13
0.52 -0.03 -0.23 0.53 -0.19 -0.48 -0.36 0.26 -0.09 -0.19 0.07 -0.22
0.03 -0.08 -0.12 -0.37 0.05 0.26 0.08 0.22 0.13 0.03 -0.09 -0.27
-1.19 -0.44 -2.9 -0.82 0.11 -0.15 0.65 -0.04 0.12 1.06 0.12 0.42
-1.03 -0.45 -1.52 -1.2 -0.89 -0.51 -0.11 0.51 0.63 0.95 0.66 0.42
0.72 0.51 -0.43 0.16 0.17 -0.58 0.39 0.13 -0.51 -0.37 -0.58 -0.47
0.64 -0.04 -0.07 0.13 -0.04 -0.24 -0.27 0.28 0.3 0.05 -0.43 -0.87
-0.56 -0.3 -0.55 -0.42 -0.16 0.14 0.32 0.22 0.5 0.37 0.02 -0.08
-0.08 -0.21 -0.45 -0.28 -0.13 0.04 0.13 0.2 0.23 0.19 0.17 0.03
-0.14 -0.56 -0.68 -0.17 -0.04 0.19 0.24 0.39 0.48 0.26 -0.17 -0.29
-0.08 -0.61 -0.88 -0.13 -0.14 0.21 0.18 0.57 0.4 0.11 0.05 -0.27
-0.34 -0.18 -0.4 -0.04 0.2 -0.14 0.01 0.4 0.29 0.29 -0.23 -0.12
0.4 -0.03 -0.69 0.18 -0.12 -0.61 0.09 0.32 0.29 0.16 -0.15 -0.28
-0.54 -0.6 -1.01 -0.63 -0.07 0.42 0.59 0.61 0.36 0.17 -0.17 -0.18
-0.16 0.16 -0.4 -0.04 -0.18 -0.28 -0.12 0.43 0.23 0.06 0.1 0.01
0.22 -0.28 -0.41 -0.7 -0.16 0.45 0.55 0.41 0.1 -0.04 -0.12 -0.66
-1.37 -0.46 -0.36 -0.93 0.08 0.19 0.06 0.31 -1.06 0.56 0.35 0.9
-1.28 0.17 -1.21 -0.37 -0.15 -0.84 0.27 0.41 0.51 0.64 0.53 -0.26
0.08 -0.17 -0.41 -0.43 -0.1 0.25 0.28 0.25 0.28 0.23 -0.12 -0.45
0.44 0.07 -0.25 0.2 0.01 -0.21 0.14 0.11 0.19 0.04 -0.58 -0.48
0.39 0.1 -0.18 0.13 0.25 -0.5 -0.29 0.42 -0.05 -0.02 -0.31 -0.27
-0.06 -0.25 -0.56 -0.63 0.12 0.36 0.19 0.46 0.11 0.16 -0.02 -0.31
-0.8 -0.37 -0.53 -0.66 -0.32 0.24 0.4 0.23 0.58 0.56 -0.02 -0.17

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.