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Heatmap: Cluster_62 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.05 0.11 -0.01 0.06 -0.09 -0.1 0.01 0.34 0.12 -0.16 -0.09 -0.37
0.23 0.24 0.0 -0.18 0.23 0.07 -0.26 -0.37 0.19 0.11 -0.24 -0.2
0.03 0.28 -0.09 -0.11 0.21 0.03 -0.23 -0.16 -0.06 0.0 0.03 -0.02
0.24 0.07 -0.07 0.13 0.11 -0.14 -0.13 0.2 -0.01 -0.07 -0.08 -0.35
0.19 0.16 -0.1 -0.11 0.12 0.28 -0.03 0.17 -0.19 -0.3 -0.14 -0.18
0.3 0.36 -0.08 -0.14 0.03 -0.16 -0.34 0.18 0.02 0.14 -0.1 -0.42
0.05 0.3 -0.53 -0.02 0.71 0.48 0.41 0.26 0.05 -0.86 -1.36 -0.94
-0.47 0.05 -0.41 0.15 0.19 1.15 0.17 -0.04 0.59 -1.01 -0.86 -1.44
-0.15 0.04 -0.22 0.15 0.25 0.26 0.21 0.15 -0.03 -0.1 -0.32 -0.44
0.04 0.2 -0.13 0.35 0.19 0.0 -0.08 0.13 -0.24 -0.16 -0.19 -0.27
-0.65 0.1 0.06 0.18 0.08 -0.06 -0.02 0.3 0.15 0.12 -0.09 -0.42
0.62 0.15 -0.2 0.29 0.13 0.14 0.14 0.19 -0.07 -0.61 -0.74 -0.69
-0.46 0.18 0.06 0.21 0.38 0.34 0.18 0.21 0.01 -0.15 -0.81 -0.71
-0.04 0.32 0.04 0.4 0.5 -0.1 -0.11 -0.06 -0.19 -0.01 -0.54 -0.63
0.09 0.09 -0.05 0.14 0.01 0.22 0.11 -0.08 0.12 -0.0 -0.44 -0.35
0.21 0.11 -0.1 0.2 0.03 0.2 -0.22 0.18 -0.01 -0.18 -0.25 -0.31
-0.02 -0.03 0.03 0.11 0.06 -0.05 -0.05 0.22 0.06 -0.05 -0.02 -0.31
0.06 0.25 -0.51 -0.07 0.31 0.56 0.12 -0.12 0.08 -0.16 -0.59 -0.37
-1.49 0.2 0.09 0.58 0.86 0.55 -0.05 0.26 -0.6 -0.4 -0.78 -1.0
0.01 0.02 0.01 0.1 -0.03 0.14 -0.03 0.25 0.03 0.06 -0.23 -0.44
-0.27 0.21 -0.27 -0.1 0.29 0.24 0.23 -0.06 -0.08 -0.12 -0.11 -0.14
-1.35 -0.73 -1.16 0.79 1.3 0.64 0.0 0.41 0.23 -0.74 -1.01 -2.28
-0.03 0.07 -0.0 0.07 0.16 0.09 0.02 0.15 -0.06 -0.15 -0.19 -0.18
-0.12 -0.01 0.05 0.02 -0.14 -0.04 -0.08 0.21 0.16 -0.03 0.08 -0.16
0.01 0.62 -0.37 -0.86 0.08 0.82 0.07 0.47 -0.27 -0.19 -0.83 -0.7
-0.48 0.09 0.14 -0.04 0.3 0.31 0.26 0.28 0.11 -0.28 -0.41 -0.74
0.41 0.15 0.03 0.32 -0.17 -0.14 0.16 0.2 0.09 -0.24 -0.57 -0.63
0.08 0.01 -0.06 -0.06 0.14 -0.06 -0.14 0.25 0.06 -0.04 -0.1 -0.15
-0.2 0.17 -0.16 0.39 0.31 -0.02 0.14 0.28 0.18 -0.13 -0.7 -0.75
0.05 0.1 -0.11 -0.05 0.18 0.11 0.14 0.03 0.04 -0.04 -0.28 -0.25
-0.07 0.09 -0.08 0.1 0.14 0.04 -0.05 -0.03 0.01 0.12 -0.14 -0.16
-0.19 -0.24 -0.12 0.54 0.34 0.65 0.14 0.22 -0.21 -0.65 -0.42 -0.87
0.28 0.46 0.18 0.09 0.03 -0.03 0.17 0.53 -0.17 -0.64 -0.72 -0.99
-1.17 -0.15 -0.23 0.09 0.42 0.5 0.09 0.24 0.02 0.16 -0.24 -0.38
0.23 0.12 0.08 0.33 0.13 0.1 0.12 0.15 -0.12 -0.37 -0.48 -0.62
-0.21 0.21 0.05 0.2 0.37 0.22 0.02 0.12 0.0 -0.31 -0.57 -0.42
-0.18 -0.22 -0.92 0.48 0.82 0.57 0.08 0.45 0.11 -0.63 -0.86 -1.38
-0.42 0.09 -0.11 0.3 0.41 0.74 0.41 0.16 -0.2 -0.42 -0.99 -1.08
-0.07 0.39 -0.39 -0.42 0.46 0.76 0.06 -0.01 0.18 0.05 -0.9 -1.25
-0.29 0.09 -0.2 0.17 0.48 0.49 0.15 0.15 -0.24 -0.18 -0.38 -0.74
0.26 -0.01 -0.15 0.08 0.01 -0.08 -0.09 0.25 0.01 -0.1 -0.11 -0.16
-0.02 -0.0 -0.17 0.06 0.21 0.18 0.33 0.1 0.07 -0.06 -0.23 -0.7
0.38 0.2 -0.23 0.16 -0.02 -0.23 0.04 0.33 0.1 -0.28 -0.26 -0.45
-0.32 0.09 -0.22 -0.28 0.07 0.51 0.16 0.09 -0.01 -0.11 -0.05 -0.12
0.48 0.21 -0.06 0.27 -0.04 -0.27 0.01 0.24 -0.03 -0.28 -0.42 -0.42
0.29 0.19 -0.11 0.02 -0.02 0.11 -0.02 -0.01 0.03 0.06 -0.21 -0.47
0.19 0.13 -0.25 0.32 -0.09 0.16 0.19 -0.02 0.27 0.05 -0.74 -0.62
-0.07 0.5 -0.27 0.12 0.28 0.23 0.08 0.08 -0.46 0.05 -0.43 -0.49
-0.44 0.31 -0.22 -0.54 0.08 0.45 0.05 0.28 -0.16 0.16 -0.06 -0.26
0.14 0.28 -0.2 0.06 0.15 -0.07 -0.21 0.1 0.04 0.16 -0.26 -0.33
-0.12 0.29 -0.09 0.29 0.44 0.25 0.03 -0.07 -0.27 -0.13 -0.46 -0.49
0.08 0.07 -0.11 0.2 0.21 0.14 0.1 0.02 -0.04 -0.06 -0.34 -0.39
-0.46 -0.1 -0.09 0.44 0.34 0.26 0.07 0.05 0.02 0.07 -0.3 -0.68
1.01 0.31 0.22 0.29 -0.32 -0.27 0.37 0.28 -0.27 -1.22 -1.25 -0.9
0.1 0.08 -0.09 -0.18 0.08 0.02 0.06 0.11 0.1 0.06 -0.14 -0.25
-0.2 0.11 -0.09 0.03 0.02 -0.1 -0.11 0.33 0.13 0.08 -0.07 -0.22
0.41 0.3 -0.31 0.2 -0.02 -0.26 -0.19 0.3 0.17 -0.26 -0.35 -0.31
-0.02 0.15 -0.08 0.26 0.48 -0.13 -0.09 0.18 0.01 -0.05 -0.28 -0.78
0.26 0.33 -0.1 -0.1 0.14 -0.12 -0.34 0.26 -0.01 -0.25 -0.0 -0.26
-0.78 0.19 -0.68 0.04 0.48 0.65 0.06 0.37 -0.14 0.22 -0.36 -1.06
-0.34 0.23 -0.26 -0.21 0.29 0.52 0.19 0.14 -0.16 -0.47 -0.5 0.16
0.25 0.15 -0.07 -0.21 0.11 -0.03 -0.21 0.19 0.03 -0.11 -0.01 -0.18
-0.15 0.07 -0.03 0.07 0.22 0.29 0.18 0.19 0.12 -0.15 -0.5 -0.57
0.07 0.2 0.06 -0.18 -0.01 0.33 0.28 0.31 -0.07 -0.15 -0.56 -0.62
-0.13 0.08 -0.19 0.0 0.16 0.28 -0.05 0.39 0.07 -0.05 -0.26 -0.52
0.06 0.09 0.07 0.3 0.07 -0.01 -0.0 0.29 0.02 -0.28 -0.32 -0.52
-0.21 -0.01 -0.05 0.18 0.13 -0.04 0.06 0.26 0.1 0.01 -0.14 -0.41
-0.02 0.18 -0.29 0.23 0.24 -0.08 -0.01 0.15 -0.12 -0.08 -0.23 -0.08
0.41 0.21 -0.07 0.07 0.11 -0.2 -0.22 0.27 0.11 -0.51 -0.17 -0.26
0.0 0.05 0.03 -0.1 -0.0 0.16 0.03 0.17 0.02 -0.0 -0.15 -0.25
-0.14 0.27 -0.08 0.05 0.15 0.24 -0.11 -0.07 0.07 -0.05 -0.23 -0.2
0.23 0.19 -0.21 0.5 0.1 0.06 0.26 0.27 -0.13 -0.52 -0.74 -0.56
-0.07 -0.06 -0.08 0.19 0.42 0.35 0.02 0.14 -0.1 -0.2 -0.31 -0.59
-0.0 0.26 -0.06 -0.35 0.35 0.71 0.52 0.0 -0.06 -0.43 -0.83 -1.17
-0.55 0.02 -0.11 0.12 0.38 0.26 -0.0 -0.16 0.11 -0.08 -0.02 -0.18
-0.38 0.32 -0.25 0.13 0.33 0.39 0.11 -0.22 -0.0 0.06 -0.52 -0.31
0.17 0.11 0.02 -0.05 0.08 0.08 0.08 0.29 -0.11 -0.22 -0.2 -0.41
0.16 0.15 0.09 0.14 -0.02 -0.07 -0.01 0.23 -0.02 -0.29 -0.15 -0.33
0.5 0.26 -0.42 0.5 -0.12 -0.4 0.04 0.41 0.21 -0.07 -1.12 -0.71
0.48 0.42 -0.03 0.36 0.06 -0.14 0.08 0.34 -0.09 -0.6 -0.71 -0.96
-0.04 0.09 -0.09 0.19 0.28 0.01 -0.11 0.12 0.06 0.04 -0.2 -0.5
0.11 0.03 -0.12 0.18 0.08 0.01 0.11 0.14 0.03 -0.11 -0.26 -0.3
0.18 0.19 -0.45 -0.06 0.35 0.2 0.09 0.54 0.04 -0.52 -0.37 -0.73
0.16 0.11 -0.31 0.03 0.15 0.37 0.21 0.17 -0.16 -0.33 -0.24 -0.41

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.