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Heatmap: Cluster_51 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.49 0.58 0.21 -0.11 -0.02 -1.05 -0.55 0.08 -0.73 0.1 0.75 0.2
-0.45 0.4 0.13 0.01 -0.16 -0.91 -0.6 -0.17 -0.24 0.31 0.56 0.4
-0.94 -1.13 -1.14 0.4 0.48 -0.39 0.34 -0.06 -0.33 0.51 0.48 0.32
-0.02 -0.14 -0.44 -0.27 0.11 0.03 0.17 0.21 0.01 0.14 0.14 -0.07
-0.12 -0.16 -0.15 -0.3 0.12 0.21 0.06 -0.01 0.21 0.29 0.0 -0.31
0.13 -0.54 -0.46 -0.1 0.2 0.05 0.17 -0.21 0.05 0.31 0.19 -0.03
-0.11 0.01 -0.21 -0.12 0.05 -0.1 -0.15 0.04 0.02 0.28 0.13 0.08
0.19 0.33 -0.19 0.21 -0.64 -2.4 -1.43 -0.72 -0.73 0.66 0.82 0.85
-0.53 -0.02 0.24 -0.44 0.72 -0.14 -0.23 -0.42 -1.16 -0.06 0.28 0.71
0.3 -0.16 -0.11 -0.12 0.37 -0.29 -0.4 -0.43 -0.29 0.1 0.23 0.43
0.81 0.3 0.1 0.52 -0.41 -1.66 -1.38 -1.09 -1.15 0.05 0.46 0.8
-0.27 0.1 -0.19 -0.05 0.01 -0.12 -0.29 0.1 0.08 0.17 0.15 0.21
0.37 0.17 -0.29 -0.17 -0.25 -0.61 -0.43 -0.09 -0.15 0.3 0.28 0.42
0.27 0.01 0.28 0.56 -0.82 -0.75 -0.39 -0.59 -0.47 -0.18 0.59 0.48
0.1 0.24 0.15 0.33 0.09 -0.57 -0.63 -0.24 -0.31 0.02 0.19 0.25
-0.02 -0.07 -0.58 -0.02 0.12 -0.39 -0.15 -0.13 -0.33 0.46 0.4 0.32
-0.73 0.05 -0.26 0.17 0.64 -0.05 -0.2 -0.08 -0.73 -0.12 0.4 0.3
0.2 0.12 -0.55 0.2 0.19 -0.45 -1.0 -0.4 0.1 0.63 -0.09 0.32
-0.54 -0.63 -0.51 -0.17 0.02 0.07 -0.1 0.16 0.08 0.4 0.45 0.29
0.19 -0.13 -0.14 -0.04 0.03 -0.02 -0.18 0.07 -0.15 -0.05 0.01 0.32
-0.19 -0.08 -0.08 -0.09 0.08 -0.04 -0.17 -0.13 -0.02 0.12 0.25 0.26
0.05 0.25 -0.2 -0.39 0.15 -0.17 -0.37 -0.38 -0.25 0.26 0.33 0.39
-0.5 -0.32 -0.72 0.08 0.37 -0.16 -0.4 -0.26 0.04 0.26 0.63 0.35
-0.18 -0.19 0.06 -0.02 0.23 0.11 -0.42 -0.17 -0.27 0.09 0.24 0.32
-0.05 0.22 -0.02 0.49 0.16 -0.88 -0.61 -0.23 -0.55 0.02 0.18 0.57
0.64 -0.26 -0.86 0.38 0.44 -0.02 -0.33 -0.28 -0.6 -0.42 -0.02 0.48
0.32 0.02 -0.34 -0.18 0.06 -0.19 -0.26 -0.06 -0.07 0.09 0.11 0.33
-1.55 0.02 -0.23 -0.11 0.15 -0.83 -0.15 -0.48 0.15 0.68 0.41 0.61
-0.79 -0.28 -0.72 -0.02 0.13 -0.41 0.07 -0.2 0.03 0.61 0.38 0.47
-0.39 -0.58 -0.06 0.09 0.5 0.07 -0.05 -0.04 -0.67 0.41 0.24 0.01
0.23 0.03 -0.08 0.02 0.08 -0.0 -0.2 -0.32 -0.04 0.01 0.13 0.06
-0.98 -0.15 0.07 -0.03 0.39 0.51 0.27 0.28 -0.52 0.08 -0.06 -0.53
-0.76 -1.12 -0.89 0.08 -0.07 0.29 0.17 -0.07 0.34 0.44 0.11 0.48
0.1 0.26 0.18 0.36 0.2 -0.33 -0.58 -0.36 -0.25 -0.04 0.13 0.04
0.05 -0.07 -0.05 0.33 0.34 -0.6 -0.95 -0.82 -0.69 0.18 0.41 0.76
0.82 0.53 0.4 0.67 0.07 -1.35 -1.28 -1.03 -1.39 -0.36 0.09 0.41
0.39 0.13 0.04 -0.05 0.05 -0.26 -0.47 -0.44 -0.22 -0.02 0.1 0.44
-1.4 -0.58 -0.53 -0.25 -0.0 0.29 0.25 -0.0 0.03 0.54 0.32 0.37
0.38 0.01 -0.31 -0.14 -0.07 -0.33 -0.44 -0.51 -0.13 0.17 0.15 0.72
0.01 0.19 -0.37 0.36 0.22 -0.76 -0.42 -0.26 -0.23 0.27 0.18 0.35
-0.57 -0.12 0.12 -0.27 0.2 -0.29 -1.4 -0.17 -0.37 0.34 0.63 0.75
-0.07 -0.4 -0.27 -0.32 0.19 0.11 -0.02 0.02 0.08 0.25 0.17 0.1
0.53 0.25 0.04 0.66 0.35 -0.63 -0.73 -0.82 -0.87 -0.3 0.01 0.4
-0.08 0.26 -0.08 -0.17 0.19 -0.25 -0.52 -0.06 -0.1 0.23 0.2 0.17
-0.44 0.03 -1.28 -0.07 0.07 -0.09 -0.07 0.12 -0.45 0.43 0.59 0.33
-0.4 -0.52 -1.03 0.1 -0.11 -0.31 -0.03 -0.25 -0.11 0.79 0.52 0.42
-0.35 -0.32 -0.21 -0.18 0.07 -0.19 -0.08 0.48 0.06 0.27 0.24 -0.05
-1.0 -0.62 -0.51 -0.14 0.2 0.06 0.0 0.14 0.58 0.36 0.3 -0.08
0.01 -0.38 -0.49 0.07 0.17 0.22 0.15 0.03 0.03 0.23 -0.08 -0.15
-0.89 -0.3 -0.45 -0.09 0.47 0.09 -0.5 -0.36 -0.85 0.14 0.82 0.69
-0.89 -0.08 -0.38 -0.23 0.56 0.04 -0.66 -0.28 -1.49 -0.1 1.08 0.62
-0.42 0.14 -0.14 -0.48 0.22 -0.27 -0.62 -0.2 -1.75 -0.16 1.12 0.72
-0.58 -0.11 -0.37 -0.16 0.26 -0.27 -0.56 -0.45 -0.76 0.27 0.82 0.8
-0.69 -0.15 -0.36 -0.38 0.49 -0.11 -0.6 -0.17 -0.5 0.25 0.72 0.59
0.82 0.1 -0.16 0.06 -0.63 -1.21 -0.69 -0.17 0.2 0.11 0.12 0.41
0.67 0.12 -0.24 0.14 -0.46 -1.2 -0.81 -0.2 0.07 0.24 0.21 0.47
0.46 0.48 0.09 -0.32 -0.25 -0.38 -0.47 -0.24 -0.38 0.07 0.26 0.24
0.15 -0.36 -0.52 -0.01 0.02 0.13 0.36 0.05 0.13 0.25 -0.08 -0.37
0.17 0.26 -0.1 -0.03 -0.08 -0.6 -0.5 -0.04 -0.26 0.17 0.36 0.31
0.41 0.38 -0.02 0.11 -0.25 -1.02 -0.73 -0.43 -0.42 0.17 0.41 0.51
0.56 0.38 0.03 0.21 0.1 -0.74 -0.63 -0.21 -0.71 -0.21 0.3 0.22
0.66 0.35 -0.08 0.28 -0.13 -0.96 -0.76 -0.49 -0.69 0.11 0.29 0.41
-0.06 -0.05 -0.32 0.07 -0.02 -0.69 -0.66 -0.36 -0.44 0.17 0.58 0.88
0.33 -0.11 -0.26 -0.46 -0.35 -0.56 -0.52 -0.13 0.23 0.4 0.38 0.47
0.11 -1.29 -1.0 0.01 0.48 0.55 0.3 -0.64 -0.27 0.27 0.21 0.11
0.16 0.02 -0.4 -0.21 -0.05 -0.52 -0.46 -0.22 -0.11 0.42 0.41 0.49
0.28 -0.1 -0.58 -0.03 0.33 -0.24 0.1 -0.56 -0.24 0.4 0.05 0.2
-0.68 -0.19 -0.37 -0.08 0.27 0.13 0.01 0.23 0.24 0.22 -0.19 0.1
-0.85 -0.56 -1.89 -0.13 0.35 0.07 -0.17 0.16 -0.09 0.8 0.16 0.53
-1.57 -0.64 -0.69 -0.17 0.52 -0.38 -0.03 0.03 0.27 0.6 0.52 0.22
-0.15 -0.01 -0.41 0.04 0.18 -0.24 -0.09 0.1 -0.3 -0.02 0.26 0.42
-0.4 0.1 -0.47 0.1 -0.02 -0.24 -0.45 -0.06 -0.13 0.5 0.36 0.32
0.4 -0.72 -0.75 0.12 0.53 -0.29 -0.34 -0.53 -0.29 0.29 -0.06 0.71
-0.19 -0.7 -0.42 -0.13 0.11 0.05 -0.04 0.28 0.14 0.07 0.04 0.44
0.35 0.24 -1.11 -0.84 -0.02 0.41 0.23 0.42 -1.17 0.64 -0.31 -0.17
0.17 0.74 0.25 -0.21 0.03 -1.27 -0.86 -0.22 -1.96 -0.4 0.76 0.67
-0.07 0.68 0.38 -0.36 0.16 -1.0 -0.9 -0.21 -1.68 -0.57 0.78 0.71
-0.27 0.65 0.35 -0.36 0.22 -1.23 -0.87 -0.3 -1.36 -0.33 0.81 0.72
-0.14 0.65 0.05 -0.08 0.08 -1.33 -0.92 -0.31 -1.41 -0.46 1.02 0.7
-0.02 0.6 0.1 0.06 0.07 -1.02 -0.79 -0.35 -1.07 -0.19 0.66 0.62
0.25 0.53 0.12 0.16 -0.13 -0.85 -0.8 -0.43 -0.68 -0.08 0.41 0.57
-0.87 -0.2 -0.77 -0.02 0.19 -0.45 -0.03 -0.14 0.23 0.58 0.19 0.52
-0.23 -0.01 -1.72 0.26 0.28 -1.18 -0.23 -0.52 -0.34 0.69 0.5 0.71
0.56 0.28 0.07 -0.29 -0.23 -0.5 -0.64 -0.64 -0.14 0.11 0.16 0.58
0.08 0.67 0.26 -0.06 -0.32 -1.22 -0.97 -0.28 -0.56 0.15 0.59 0.41
0.28 0.5 0.29 -0.0 -0.48 -1.06 -1.02 -0.41 -0.34 0.16 0.51 0.45
-0.54 0.27 -0.94 0.04 0.06 -0.94 0.02 -1.55 -0.04 1.03 0.13 0.61
-0.04 -0.27 -0.28 -0.04 0.07 0.46 0.05 -0.06 -0.11 -0.03 0.01 0.1
-0.22 -0.19 -0.26 -0.28 0.26 -0.16 -0.05 0.18 -0.05 0.23 0.23 0.14
-0.08 0.32 -0.01 0.35 0.41 -0.55 -0.37 -0.13 -0.54 -0.33 0.09 0.36
0.16 0.26 -0.14 0.41 0.32 -0.49 -0.55 -0.36 -0.47 -0.12 0.04 0.44
0.08 0.01 -0.17 0.13 0.27 0.03 -0.09 0.07 -0.17 0.09 -0.03 -0.32
0.23 -0.28 -0.33 -0.18 0.16 0.06 0.17 0.25 -0.36 -0.11 0.19 0.01
0.05 -0.25 -0.38 -0.09 0.15 -0.04 0.04 0.05 0.07 0.13 -0.03 0.19
-1.11 -1.42 -1.0 -0.22 0.54 0.76 0.61 0.11 0.05 0.14 0.05 -0.19
-1.53 -1.55 -0.95 -0.1 0.27 0.71 0.34 -0.09 0.56 0.09 0.39 -0.04
-2.5 -1.17 -0.49 -0.11 0.09 0.98 0.27 -0.27 0.32 0.18 0.23 0.13
-3.62 -1.42 -0.52 -0.14 0.43 0.71 0.05 -0.7 0.53 0.56 0.2 0.31
-1.83 -1.39 -1.17 -0.45 0.41 0.37 0.36 -0.28 0.13 0.6 0.68 0.3
-1.31 -1.54 -0.71 -0.45 0.03 0.27 0.31 0.1 0.28 0.51 0.5 0.4
-0.99 -0.79 -0.42 -0.25 0.3 0.65 0.05 -0.24 0.18 0.33 0.24 0.1
-1.12 -0.99 -0.42 -0.19 0.22 0.57 0.22 -0.2 0.13 0.33 0.3 0.21

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.